Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000042.208 (ADL2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000042.259	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000042.261	2.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.22	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000057.141	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000114.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.33	-	-	2.88	-	3.1	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000123.32	-	-	-	0.89	-	-	3.2	0.09	-	-	-	-	-	-0.29	-	-0.23	-	0.13	-0.13	-	0.87	1.16	2.06	-	-0.74	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000123.33	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000128.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000133.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.45	3.92	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000147.70	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000180.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000189.6	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000215.42	-	-	-	2.37	-	2.3	-	-	-	-	-	3.4	-	-	-	2.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000217.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.69	-	4.29	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000217.50	-	-	-	2.42	0.34	-	1.44	1.46	0.42	-	-	1.55	0.87	-	-	-	0.67	1.48	1.23	0.11	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000331.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000339.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000383.74	1.98	2.34	-	-	0.16	-	2.63	-	-	1.53	-0.98	-	-	-0.32	-	-	-	0.57	0.83	-	-	0.51	-	-0.3	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000404.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000411.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000443.2	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000471.1	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000489.21 (ORF158)	2.88	-	-	-	-	-	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.64	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000514.15	-0.38	1.73	-	0.01	-	-	2.11	0.82	-	2.04	-	1.61	1.63	-	-0.16	-	0.16	-	-	1.35	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000540.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000545.6	-	-	-	-	-3.57	0.89	4.02	2.34	1.28	-	-	-	-	-2.5	-	-4.3	-	-	-	-4.6	-	-	-3.65	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000622.2	-	-	-	-	-	-	3.07	2.92	-	2.88	-	-	-	-	-	-	-	1.42	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000622.5	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000629.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000630.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000743.21	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000823.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000946.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000983.2	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001001.30	1.54	-	-	-	-	-	2.88	-	-	-	0.77	1.95	0.74	-	-	0.74	1.81	0.3	-	-	-0.14	-	-	-	0.23	-
Cpa\|evm.model.tig00001024.1 (MRP9)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001126.8	-	-	-	-	-	-	1.77	-	1.75	-	-	-	-	-	-	-	-	3.8	-	-	-	-	-	1.66	1.09	-
Cpa\|evm.model.tig00001128.29	0.36	-	-	-	-	-	0.68	1.79	0.66	0.55	-	3.58	-	1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.57	-	0.16
Cpa\|evm.model.tig00020510.80 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	3.03	-	3.59	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020515.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.118	-	-2.78	-	-	-	-2.46	-	-2.15	-2.37	-	-2.35	-	-	-0.12	-2.44	-2.22	0.2	2.86	2.54	-1.58	-1.21	-2.61	-2.73	-	-	3.08
Cpa\|evm.model.tig00020553.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.48	-	-	-	1.39	-	-	3.47	-	-	-	-	1.54	-	-	-	-	-	2.48	-	1.11	-	-	-	-	0.76	-
Cpa\|evm.model.tig00020563.55	-	-	-	-	-	-	4.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.04	-	-	-	-	-	-	1.11
Cpa\|evm.model.tig00020616.86	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020693.5	-	1.01	0.52	-0.11	1.39	-	2.53	1.88	-	-1.15	-	-	-	-	1.13	-	-	1.99	0.17	-	-2.05	-1.46	-	-0.17	-	-1.57
Cpa\|evm.model.tig00020703.17	-	1.02	-	0.72	-	-	0.97	-	-	-	1.76	0.86	-	1.12	-	-	1.0	3.04	-	-	-	-	-	0.67	-	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020734.44 (HMG)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.106	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020824.26	-	-	-	-	-	-	3.42	1.78	-	-	-	2.86	-	-	-	-	-	2.21	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020824.45	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020829.10	-	0.14	-	-	-	-	3.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.7	-	-	2.82	1.08	1.23	-	-	-0.61
Cpa\|evm.model.tig00020849.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020855.14	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020855.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020878.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.48	-	-	-	-	-	-	3.92	2.39	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020904.14	-	-	-	-	-	-	3.78	-	-	-	-	-	-	2.17	-	-	-	-	-	1.96	-	1.94	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020936.14	-	-	-	-	-	-	3.65	-	-	-	-	3.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020936.18	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020941.26	0.35	-	-	-	-	-	3.38	2.55	-	-	1.63	-	-	-	0.41	-	-	1.5	-	-	-	-	0.28	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020952.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020961.146	1.0	-0.26	0.18	0.62	-	-1.39	-0.95	-1.38	-	0.12	0.11	-	-	0.89	1.83	-0.51	-	1.95	-	1.85	-	-0.72	-0.78	0.82	-1.05	-
Cpa\|evm.model.tig00021037.38	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021038.38	-	-	1.57	1.36	0.53	-	1.79	-	-	2.1	-	-	-	-0.25	0.25	-	2.38	-	0.27	1.02	-	-	-	-	-0.28	-
Cpa\|evm.model.tig00021045.4	-	-	-	-	-	-	4.49	-	1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.36	-
Cpa\|evm.model.tig00021070.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021071.10	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021096.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.35	-	-	2.69	-	-	-	3.38	-	2.02	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021108.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021111.18	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021222.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021245.1	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021246.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021254.16	-	-	-	-	-	-	3.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.56	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021257.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021282.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021290.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021318.15	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021332.1	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021339.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021366.13	-	2.61	2.6	-	-	-	2.82	-	-	-	-	-	2.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021441.22	-	-	-	3.13	-	-	3.06	-	-	-	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021518.21	-	-	-	-	-	-	4.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.75	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021587.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021587.7	-	2.44	-	-	-	-	3.64	-	-	2.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.87	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021589.49	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021591.3	-	-	-	-	-	2.75	-	-	-	-	-	2.6	-	-	-	2.44	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021603.2 (AGC1.5)	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021680.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021742.25	-	-	-	-	-	-	3.34	3.1	-	-	-	-	-	-	-	2.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021758.12	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021758.21	-	1.99	-0.35	-	0.12	-	3.01	-	-	-0.63	-	2.33	0.31	-	-	1.97	-	-	-0.94	-	-1.57	-	-1.24	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021763.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.