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Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.84 -0.38 -0.51 -0.24 -0.64 -1.14 -0.28 -0.39 -0.25 0.31 0.39 0.48 -0.79 0.42 -0.13 0.5 0.04 0.54 0.02 0.12 -1.9 0.05 0.59 0.25 0.4 0.59
-0.73 -0.59 -0.46 -0.07 -0.02 -0.3 0.14 0.17 0.35 0.33 0.48 0.1 -0.3 0.22 0.04 0.92 -0.05 0.66 0.85 0.07 -2.38 -0.25 -1.18 -0.71 -0.69 0.04
-0.58 -0.3 -0.43 -0.49 -0.58 -0.95 -0.07 -0.06 0.15 0.56 0.49 0.34 -0.48 0.59 0.0 -0.32 0.3 0.53 0.53 0.3 -2.83 0.23 -1.76 0.17 0.25 0.49
-1.39 -0.58 -0.93 -0.56 -0.23 -0.26 0.09 0.07 0.5 0.66 0.45 0.07 -1.53 0.17 -0.23 0.11 0.07 0.25 0.47 0.34 -2.06 0.77 -1.29 0.22 0.52 0.35
-0.62 -0.29 -0.03 0.19 -0.03 -0.38 -0.16 0.0 -0.02 0.21 0.27 0.32 -0.68 0.33 0.0 0.04 -0.22 0.4 -0.03 -0.18 -0.56 0.17 -0.99 0.25 0.21 0.64
-4.31 -1.1 -0.31 -0.0 -0.04 0.15 0.32 0.26 0.52 0.61 0.68 0.83 -3.46 0.56 0.2 0.43 0.08 0.23 0.31 0.08 -4.23 -1.93 -0.76 0.44 -0.57 0.36
-1.27 -0.47 -0.03 -0.16 0.1 -0.04 0.22 0.18 0.3 0.46 0.2 0.16 -0.99 0.49 0.45 0.46 0.2 0.2 0.73 0.32 -2.12 -0.67 -0.88 -0.61 0.02 -0.22
-0.46 0.38 -0.04 -0.1 -0.39 -0.45 0.02 0.02 0.31 0.29 0.2 -0.08 -0.6 0.11 -0.2 0.03 -0.13 0.36 0.31 0.18 -2.72 0.93 -0.86 -0.0 0.26 -0.04
-0.96 -0.34 -0.24 -0.17 -0.03 -0.13 0.09 0.06 0.17 0.3 0.33 0.44 -1.03 0.37 0.11 -0.05 0.05 0.45 0.23 0.1 -0.75 -0.13 0.08 0.03 -0.35 0.2
-0.28 -1.1 -0.94 -0.36 0.14 0.08 0.2 -0.1 -0.06 0.33 0.56 0.61 -0.0 0.21 -0.39 0.35 0.05 0.44 0.51 -0.1 -4.06 -0.19 -1.42 0.33 0.27 0.31
0.02 0.09 0.15 -0.08 -0.05 0.05 0.16 -0.11 0.27 0.28 0.08 0.02 -0.03 0.05 -0.1 0.04 -0.37 0.01 0.01 -0.15 -3.41 1.07 -0.78 0.05 0.0 -0.21
-1.62 -0.36 0.01 0.1 0.07 0.01 -0.15 0.14 -0.17 0.23 0.56 0.58 -2.04 0.26 -0.82 0.41 -0.16 0.82 -0.13 -0.25 -1.1 0.16 -0.56 -0.75 0.55 0.73
-4.34 -2.76 -1.75 -0.86 -0.6 -0.74 -0.4 -0.27 0.61 0.73 0.8 0.15 -2.78 0.1 0.36 -0.02 0.27 -0.15 -0.43 -0.55 -3.01 1.17 -0.44 1.26 0.78 0.87
-1.18 -0.65 -0.45 -0.42 -0.35 -0.82 -0.11 -0.34 -0.33 0.35 0.22 0.04 -1.35 0.13 0.01 -0.08 0.33 0.65 0.09 0.3 -1.35 0.32 0.6 0.87 0.06 0.61
-0.96 -0.61 -0.53 -0.38 -0.33 -0.6 0.05 -0.14 -0.21 0.48 0.27 0.25 -1.09 0.18 0.14 -0.2 0.27 0.53 -0.02 0.24 -1.4 0.17 0.35 0.37 0.48 0.55
-0.72 -0.37 -0.11 -0.09 -0.05 -0.08 0.21 -0.01 0.15 0.51 0.58 0.49 -0.73 0.11 0.01 -0.18 0.23 0.14 -0.06 0.1 -1.59 -0.23 -0.1 0.01 -0.04 0.35
-0.86 -0.3 -0.17 -0.09 0.03 0.2 0.21 0.01 0.12 0.56 0.5 0.55 -0.57 0.05 0.27 -0.14 0.23 0.25 0.33 0.27 -2.15 -0.72 -0.95 0.21 -0.42 0.17
-0.38 -0.19 -0.39 -0.5 -0.46 -0.6 -0.34 -0.34 0.13 0.46 0.6 0.58 -0.06 0.88 -0.06 -0.25 -0.09 0.29 0.3 -0.12 -1.18 -0.1 -1.62 0.57 0.06 0.37
-1.6 -1.81 -0.68 -0.26 0.05 0.07 0.14 0.22 0.56 0.69 0.48 0.31 -1.07 0.52 0.19 0.25 0.1 0.55 0.57 0.15 -1.74 -0.87 -0.42 -0.43 -0.01 0.21
-0.27 0.02 0.09 0.18 0.16 0.32 0.58 0.32 0.61 0.0 0.21 0.15 -0.46 -0.11 -0.02 0.14 -0.06 0.52 0.76 -0.08 -3.52 -0.34 -1.24 -0.75 -1.49 0.06
-0.18 -0.15 -0.78 -0.87 -0.72 -0.79 0.23 0.1 0.36 0.69 0.46 0.34 -0.2 0.53 -0.35 -0.48 0.15 0.58 0.28 0.23 -2.9 0.09 -0.35 -0.15 0.16 0.39
-0.01 -0.05 -0.09 -0.02 -0.05 0.07 0.27 0.05 0.23 0.05 0.21 0.26 -0.06 -0.14 0.21 0.38 -0.12 0.51 0.28 -0.17 -2.31 -0.12 -0.38 -0.12 -0.29 -0.16
-0.85 -0.32 -0.37 -0.26 -0.09 -0.32 0.09 -0.3 0.44 0.58 0.56 0.45 -0.51 0.77 0.19 0.41 0.39 0.14 0.25 0.25 -3.39 -0.69 -1.36 0.0 -0.19 0.07
-0.92 -0.76 -0.38 -0.22 0.0 0.17 0.53 0.01 0.4 0.07 0.31 0.42 -0.73 0.24 0.21 -0.05 -0.1 0.34 0.44 0.12 -2.51 -1.44 0.06 0.38 -0.32 0.57
-0.12 -0.29 -0.39 -0.14 -0.26 -0.18 -0.07 -0.03 0.37 0.54 0.24 0.06 -0.08 0.62 0.59 0.5 0.06 -0.03 -0.1 0.04 -2.99 0.18 -0.81 -0.14 -0.08 -0.13
-0.5 -0.1 -0.19 -0.32 0.2 0.06 0.04 -0.15 0.11 0.28 0.29 0.03 -0.84 0.57 0.19 0.39 0.04 -0.08 0.17 0.08 -2.5 0.36 -0.43 0.47 -0.11 -0.18
-0.44 0.09 0.08 -0.01 -0.4 0.13 0.11 0.44 0.53 0.33 0.21 0.37 -0.57 0.22 0.43 0.23 0.08 0.4 0.15 -0.26 -3.65 -0.82 -0.64 -0.21 -0.25 0.04
-0.56 -0.31 -0.04 0.03 0.08 0.01 -0.06 -0.11 0.17 0.24 0.21 0.12 -0.57 0.51 0.48 0.95 -0.03 -0.05 -0.18 -0.24 -3.88 -0.3 -0.31 0.12 0.03 0.18
0.14 0.06 0.13 0.14 -0.08 -0.3 -0.12 -0.0 -0.21 -0.07 0.16 0.38 0.19 -0.06 0.33 0.23 -0.21 0.51 0.34 -0.31 -2.06 -0.15 -0.19 0.04 -0.17 -0.1
-0.1 0.09 -0.33 -0.3 -0.24 -0.33 0.01 0.22 0.44 0.31 0.22 -0.01 -0.23 0.37 -0.28 -0.44 -0.31 0.28 0.01 -0.33 -0.95 0.81 -1.01 -0.02 0.44 0.24
0.13 0.19 0.24 0.07 -0.34 -0.67 0.27 0.38 0.22 0.43 0.52 0.44 0.14 -0.36 -0.47 -0.36 -0.5 -0.14 0.01 -0.67 -3.32 0.93 -0.6 -0.37 0.41 -0.11
-1.04 -0.4 -0.67 0.0 0.18 -0.47 0.12 0.03 0.57 0.5 0.44 0.45 -0.68 0.12 -0.32 -0.46 -0.56 0.45 -0.29 -0.81 -2.32 0.86 -1.08 0.63 0.53 0.48
-0.15 -0.14 -0.43 -0.41 -0.27 -0.62 0.18 0.24 0.34 0.46 0.3 0.12 -0.21 0.08 -0.25 -0.14 0.09 0.46 0.29 0.24 -2.69 0.49 -1.49 0.08 0.28 0.3
0.07 -0.07 -0.19 -0.29 -0.5 -0.51 -0.01 -0.09 -0.17 0.16 0.4 0.35 0.08 0.23 0.08 0.46 -0.02 0.37 0.21 0.01 -1.74 -0.67 -0.11 0.68 -0.32 -0.03
-1.89 -1.85 -0.65 -0.26 0.13 0.06 0.2 -0.12 0.13 0.54 0.5 0.43 -1.45 0.25 -0.04 -0.28 0.26 0.7 0.78 0.5 -2.09 -0.85 -0.36 0.39 -0.25 0.52
-2.83 -2.89 -1.22 -0.27 -0.62 -1.13 -0.49 -0.01 0.24 0.45 1.05 0.32 -4.26 0.72 0.03 0.24 -0.35 0.33 -1.45 -1.42 -1.94 1.46 -0.02 0.2 1.02 0.96
-0.59 0.38 0.21 -0.24 -1.31 -1.66 -0.97 -0.44 -0.04 0.44 0.5 0.54 -0.2 0.75 0.55 0.28 0.3 0.19 0.15 0.2 -3.42 -1.51 -0.13 0.42 -0.27 0.55
-0.82 -0.15 -0.32 -0.17 0.04 -0.16 0.27 0.17 0.41 0.35 0.25 0.04 -0.87 0.03 -0.39 -0.3 -0.01 0.35 0.2 0.12 -1.67 0.65 -0.65 0.18 0.2 0.41
-0.63 -0.42 -0.56 -0.52 -0.58 -0.59 0.07 0.05 0.07 0.3 -0.07 -0.31 -0.91 0.33 -0.05 0.15 0.23 0.24 -0.04 0.13 -2.05 0.12 0.52 0.66 0.67 0.66
-4.38 -1.01 -0.42 -0.33 -0.34 -0.04 0.45 0.04 0.9 0.56 0.32 0.25 -3.82 0.62 0.47 0.71 0.26 0.42 0.45 0.14 -5.49 -0.18 -1.7 -0.39 0.42 0.07
-0.75 -0.24 -0.63 -0.46 -0.3 -0.93 -0.14 0.08 0.07 0.41 0.3 -0.1 -0.61 0.74 -0.04 0.03 -0.19 0.5 0.15 -0.05 -1.35 0.49 -1.4 0.5 0.47 0.74
-1.61 -1.3 -1.3 -0.78 -0.55 -0.6 -0.0 0.24 0.77 0.82 0.83 0.39 -1.22 0.3 -0.49 -0.03 -0.64 0.21 0.11 -0.46 -1.34 0.72 -0.6 0.58 0.67 0.53
-0.74 -0.63 -0.72 -0.28 -0.19 -0.46 -0.05 0.18 0.41 0.51 0.6 0.5 -0.51 0.18 -0.13 -0.17 -0.01 0.11 -0.05 0.11 -2.53 0.51 -0.48 0.26 0.33 0.51
-3.17 -1.94 -0.79 -0.23 -0.08 -0.07 0.24 -0.09 0.26 0.7 0.78 0.55 -2.93 0.24 -0.39 -0.41 0.47 0.61 0.54 0.49 -4.43 -0.87 -0.5 0.31 0.42 0.76
-2.36 -1.13 -0.44 -0.17 -0.02 -0.38 -0.17 -0.73 -0.65 0.39 0.11 0.14 -1.08 0.14 -0.5 0.28 0.73 0.33 0.14 0.45 -1.13 0.94 -0.12 0.2 0.42 0.75
-2.05 -0.86 -0.13 0.29 0.08 -0.25 -0.04 -0.49 -0.24 0.56 0.39 0.38 -1.03 0.48 -0.99 0.09 0.64 -0.02 0.04 0.31 -2.08 0.76 -0.0 -0.11 0.22 0.35
-0.03 -0.38 -0.33 -0.44 -0.07 0.07 0.05 -0.21 -0.08 0.22 0.33 0.52 0.06 0.33 -0.01 0.19 -0.26 0.37 0.2 -0.08 -1.78 -0.14 -0.14 0.17 -0.19 0.32
-0.77 -0.21 0.1 -0.21 -0.44 -0.68 -0.3 -0.09 -0.04 0.21 0.36 0.23 -0.45 0.65 0.7 0.6 0.18 0.22 0.08 0.03 -1.82 -1.23 -0.75 0.28 0.4 0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.