Heatmap: Cluster_121 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g006090.3.1 (Solyc01g006090.3)
-1.01 2.29 -0.21 -0.11 0.31 -0.46 0.37 -0.1 -1.3 -1.06 1.43 1.17 1.7 1.24 -1.48 -2.43 -3.23 -9.41 -10.85 -1.53 0.58 -0.59 -0.11 -0.32 -0.51 -3.04 -0.2 -0.36 -0.45 -0.55 -0.41 -0.7 -2.27 -0.23
Solyc01g006170.3.1 (Solyc01g006170.3)
-1.1 2.06 -0.26 -0.16 -0.04 -0.28 0.47 0.12 -0.83 -1.14 1.32 1.39 1.23 1.26 -2.5 -3.54 -3.67 - -12.38 -0.76 1.05 -0.56 -0.04 -0.18 -0.44 -1.83 -0.03 -0.2 -0.48 -0.51 -0.27 -0.7 -1.87 -0.11
Solyc01g014850.3.1 (Solyc01g014850.3)
0.75 1.06 -0.4 0.18 -0.27 -0.52 1.17 -0.12 0.15 -0.48 0.13 0.24 0.32 0.42 -0.69 -1.17 -1.04 -7.0 -7.26 -0.52 -0.52 0.03 -0.04 -0.09 -0.25 -0.2 0.18 0.14 0.04 0.22 0.3 -0.07 -0.32 0.97
Solyc01g068150.3.1 (Solyc01g068150.3)
0.08 0.5 -1.04 -0.78 0.71 -0.01 0.78 -0.02 0.68 -0.06 0.87 0.62 1.4 1.05 -0.12 -0.3 -0.33 -8.31 - -1.1 -0.33 -0.22 -0.01 -0.13 -0.43 -1.07 0.18 -0.03 -0.21 -0.02 0.13 -0.45 -1.47 -0.79
Solyc01g073950.3.1 (Solyc01g073950.3)
-0.34 -0.3 -0.71 -0.61 1.08 0.18 0.84 -1.33 0.18 -0.21 0.9 0.37 1.77 1.73 -0.92 -0.97 -0.98 -5.93 -7.0 0.31 1.05 -0.74 -0.93 -0.85 -1.12 -0.23 -0.43 -0.56 -0.69 -0.63 -0.47 -0.67 -3.72 0.87
Solyc01g079710.3.1 (Solyc01g079710.3)
0.14 1.32 -0.69 -0.84 0.16 -0.14 1.15 -0.51 -0.25 0.38 1.16 0.66 1.54 1.04 -0.39 -1.1 -1.17 -7.88 -8.24 -1.49 -0.43 -0.12 -0.24 -0.34 -0.49 -0.36 -0.26 -0.39 -0.41 -0.17 -0.08 0.16 -1.73 -0.13
Solyc01g081500.3.1 (Solyc01g081500.3)
-1.18 0.24 -0.52 -0.36 0.87 0.29 1.28 -0.61 -0.06 -0.12 0.62 0.56 1.04 1.25 0.44 0.08 0.04 -10.25 -12.24 -0.66 0.21 -0.27 -0.4 -0.35 -0.47 -0.66 -0.1 -0.23 -0.29 -0.17 -0.09 -0.21 -2.17 -0.07
Solyc01g096760.3.1 (Solyc01g096760.3)
-0.01 1.49 -0.01 0.24 -0.11 -0.42 0.7 -0.17 -0.28 -0.51 0.97 0.89 0.83 0.77 -0.52 -0.61 -0.71 -5.42 -5.24 -0.3 -0.09 -0.36 -0.08 -0.05 -0.19 -0.19 -0.16 -0.15 -0.29 -0.23 -0.18 -0.27 -1.47 0.33
Solyc01g096920.3.1 (Solyc01g096920.3)
0.1 0.93 -0.74 -1.6 -1.02 -0.37 0.55 -0.29 0.45 -0.29 0.62 0.58 1.26 1.16 -0.14 -0.7 -0.87 -9.94 - -0.94 0.33 0.02 0.06 0.02 -0.21 -0.36 0.15 0.15 0.02 0.11 0.25 0.22 -2.24 0.35
Solyc01g096950.3.1 (Solyc01g096950.3)
-0.27 0.58 -1.38 -1.0 -0.77 -0.52 0.98 -0.51 0.21 -0.76 0.63 0.7 1.14 1.22 -0.09 -0.78 -0.62 -6.41 -5.94 -0.24 0.11 -0.01 0.2 -0.11 -0.36 -0.23 0.55 0.56 0.45 -0.02 0.27 -0.27 -1.55 -0.16
Solyc01g097500.3.1 (Solyc01g097500.3)
-0.88 -0.96 -1.93 -1.48 -1.28 -1.12 1.31 -0.56 0.48 -0.29 0.77 0.39 1.42 1.46 -0.43 -1.44 -0.98 -10.55 -11.14 -0.73 -0.44 0.23 0.17 0.16 -0.27 -0.48 0.81 0.68 0.36 0.54 0.63 0.48 -3.11 -0.83
Solyc01g100330.3.1 (Solyc01g100330.3)
-1.18 0.99 -0.13 0.25 1.6 0.61 1.25 -0.04 -0.22 -0.23 0.43 0.48 0.74 0.62 -0.08 -0.12 -0.24 -4.27 -4.2 -0.68 -0.58 -0.51 -0.2 -0.5 -0.81 -0.25 0.2 -0.21 -0.38 -0.23 -0.18 -0.65 -1.55 -0.7
Solyc01g100570.3.1 (Solyc01g100570.3)
-0.55 2.05 -0.49 -0.23 0.18 -0.36 0.43 -0.37 -0.79 -1.15 0.97 1.02 0.98 1.16 -0.95 -1.86 -1.84 -6.93 -7.9 -0.7 0.29 -0.27 -0.05 -0.2 -0.37 -0.88 0.19 -0.05 -0.17 -0.14 -0.04 -0.19 -1.0 0.27
Solyc01g102570.3.1 (Solyc01g102570.3)
-0.27 0.35 -0.79 -0.42 0.46 -0.22 0.99 0.02 -1.06 -0.27 1.15 1.0 1.2 1.04 -0.67 -0.85 -1.06 -3.91 -3.16 -0.09 1.2 -0.42 -0.09 -0.21 -0.37 -0.13 -0.05 -0.18 -0.32 -0.39 -0.24 -0.46 -2.22 -0.08
Solyc01g102585.1.1 (Solyc01g102585.1)
-0.43 0.74 -0.86 -0.19 0.75 -0.12 1.19 0.33 -0.26 -0.59 1.13 0.97 1.0 1.05 -0.86 -1.27 -1.39 -10.91 -12.12 -0.64 0.57 -0.34 0.17 -0.1 -0.39 -0.38 0.18 -0.08 -0.42 -0.25 -0.04 -0.67 -1.94 -0.13
Solyc01g103090.3.1 (Solyc01g103090.3)
-0.28 -0.5 -0.65 -1.42 1.69 0.6 0.53 -1.19 0.05 0.3 0.79 0.48 1.88 1.62 -0.32 -0.43 -0.64 -7.42 -7.48 -0.05 0.53 -0.92 -0.97 -1.02 -1.29 0.03 -0.65 -0.75 -0.94 -0.89 -0.77 -0.74 -4.41 0.68
Solyc01g104510.3.1 (Solyc01g104510.3)
0.18 0.33 -0.89 -0.41 0.01 -0.35 0.83 -0.31 0.22 -0.8 0.76 0.47 0.98 1.02 0.05 -0.42 -0.32 -5.08 -7.8 -0.51 -0.03 -0.03 0.25 0.06 -0.23 -0.0 0.31 0.19 0.04 0.01 0.11 -0.42 -1.1 0.08
Solyc01g104560.3.1 (Solyc01g104560.3)
-0.19 0.53 -0.77 -0.8 1.02 0.09 1.16 -0.25 0.07 0.11 1.28 0.64 1.66 1.37 -0.3 -0.48 -0.42 -12.39 -11.35 -1.31 0.05 -0.58 -0.5 -0.62 -0.86 -0.37 -0.44 -0.53 -0.69 -0.56 -0.35 -0.42 -2.79 0.06
Solyc01g109060.3.1 (Solyc01g109060.3)
0.36 0.39 -1.18 -1.41 0.45 0.26 0.63 -0.11 -0.58 -0.03 0.84 0.34 1.34 1.06 -1.07 -1.64 -1.6 -5.93 -4.97 -0.91 0.5 -0.21 -0.13 -0.32 -0.34 -0.27 0.34 0.06 -0.09 -0.11 0.11 0.2 -0.4 0.8
Solyc02g063280.3.1 (Solyc02g063280.3)
-0.75 2.07 0.0 -0.56 -0.1 0.01 -0.54 0.41 -0.41 -0.87 0.91 0.76 0.94 0.74 -1.43 -2.19 -2.61 - - -0.14 0.72 -0.22 0.08 -0.0 -0.27 -0.32 0.27 -0.06 -0.06 0.02 -0.23 -0.12 -1.28 -0.11
Solyc02g065790.3.1 (Solyc02g065790.3)
0.25 0.56 -0.29 -0.1 0.31 -0.05 0.54 -0.36 0.41 -0.02 0.56 0.55 1.29 1.14 -0.17 -0.51 -0.44 -4.03 -3.46 -1.18 -0.18 -0.26 0.06 -0.3 -0.54 -0.62 0.26 -0.1 -0.3 -0.2 0.03 -0.25 -1.77 0.51
Solyc02g069320.1.1 (Solyc02g069320.1)
-0.26 0.81 -0.72 -1.82 -1.4 -0.71 0.27 -0.54 -0.45 -0.02 0.43 -0.06 1.31 0.48 -0.17 -0.1 -0.56 -6.38 -6.36 -1.22 -0.34 0.32 0.52 0.4 0.22 -0.08 0.66 0.69 0.39 0.41 0.52 0.31 -1.78 0.1
Solyc02g078330.3.1 (Solyc02g078330.3)
-0.83 0.91 -1.17 -1.49 0.04 -0.26 0.68 -0.25 0.39 -0.95 0.75 0.92 1.54 1.38 0.02 -0.97 -0.99 - -9.24 -0.86 -0.09 -0.09 0.14 0.04 -0.31 -0.56 0.4 0.2 0.06 -0.15 0.07 -0.3 -3.57 0.13
Solyc02g078350.3.1 (Solyc02g078350.3)
-0.62 0.98 -0.91 -1.93 -0.26 -0.63 1.09 -0.35 0.13 -0.47 0.6 0.09 1.18 0.81 -0.8 -2.44 -2.23 -4.82 -6.65 -0.79 -0.06 0.39 0.5 0.51 0.21 -0.0 0.43 0.64 0.47 0.3 0.26 0.03 -2.42 -0.0
Solyc02g078610.3.1 (Solyc02g078610.3)
-0.59 0.72 -0.71 -0.09 0.81 0.31 0.63 -0.15 0.14 -0.09 0.84 0.82 1.14 1.05 -0.56 -0.9 -0.66 -5.94 -4.87 -0.46 0.23 -0.18 -0.08 -0.19 -0.45 -0.32 0.08 -0.05 -0.16 -0.16 -0.03 -0.19 -1.92 -0.23
Solyc02g081410.3.1 (Solyc02g081410.3)
-0.39 0.57 -1.09 -0.17 0.63 0.16 0.47 -0.09 0.21 -0.33 0.64 0.72 0.83 0.69 -0.96 -1.73 -1.52 -7.92 -8.85 -0.64 0.06 0.16 0.5 0.44 0.08 -0.12 0.45 0.26 -0.04 0.13 0.31 -0.1 -1.39 -0.06
Solyc02g081810.3.1 (Solyc02g081810.3)
-0.77 1.96 -0.73 -0.41 0.17 -0.3 1.14 -0.31 -0.63 -1.42 1.36 1.15 1.14 1.28 -2.51 -4.03 -3.97 -9.45 -11.22 -1.17 0.55 -0.39 0.21 -0.01 -0.32 -2.48 0.17 -0.12 -0.25 -0.39 -0.17 -0.54 -1.09 -0.01
Solyc02g082130.2.1 (Solyc02g082130.2)
-0.9 1.05 -0.84 -0.57 1.1 0.17 0.13 -0.81 -0.3 -1.22 1.7 1.56 1.54 1.9 -1.4 -1.76 -1.61 -3.85 -2.33 -0.07 0.42 -1.05 -0.7 -0.94 -1.15 -0.84 -0.59 -0.86 -0.86 -0.94 -0.68 -0.93 -1.71 0.31
Solyc02g083470.3.1 (Solyc02g083470.3)
-0.46 1.0 -1.03 -1.07 1.07 -0.03 0.15 -0.83 -0.37 -0.98 1.33 1.01 1.81 1.55 -1.18 -1.85 -1.95 -9.32 -9.27 -0.21 1.15 -0.7 -0.3 -0.43 -0.76 -0.86 -0.29 -0.38 -0.59 -0.52 -0.46 -0.58 -3.77 0.6
Solyc02g089280.3.1 (Solyc02g089280.3)
-0.01 1.42 -0.27 -0.17 -0.12 -0.14 0.4 -0.18 -0.9 -0.17 1.16 1.14 1.27 1.11 -0.42 -0.19 -0.35 -5.37 -5.27 -0.83 -0.11 -0.71 -0.2 -0.46 -0.65 -0.67 -0.3 -0.51 -0.67 -0.44 -0.3 -0.57 -0.06 0.5
Solyc02g089800.3.1 (Solyc02g089800.3)
-0.98 -1.35 -1.52 -0.95 1.82 0.72 0.43 -1.13 0.02 -0.02 0.72 0.76 1.36 1.49 -0.94 -1.25 -1.12 -2.82 -0.68 0.08 1.06 -0.7 -0.24 -0.47 -1.01 -0.25 -0.0 -0.28 -0.75 -0.54 -0.51 -0.75 -3.97 0.31
Solyc02g091450.2.1 (Solyc02g091450.2)
0.36 0.74 0.02 -0.38 -1.25 -0.65 1.46 -0.6 0.43 -1.0 0.74 0.6 0.83 0.89 -1.18 -1.74 -1.59 -9.91 -9.16 -0.75 -0.56 0.08 0.33 0.11 -0.08 0.18 0.35 0.09 -0.24 0.24 0.28 -0.08 -1.62 0.54
Solyc02g091960.3.1 (Solyc02g091960.3)
-0.9 -1.32 -1.09 -1.26 1.51 0.4 0.21 -0.96 -0.15 -0.62 0.77 1.38 0.99 1.68 -0.59 -0.96 -0.89 - - 0.01 1.09 -0.47 -0.19 -0.37 -0.78 -0.41 0.3 -0.09 -0.43 -0.24 -0.08 -0.49 -4.23 0.34
Solyc02g092390.3.1 (Solyc02g092390.3)
0.02 1.15 -0.82 -0.76 1.46 0.4 0.25 -0.55 0.15 -0.69 0.71 0.57 0.93 0.87 -0.82 -1.51 -1.53 -4.1 -4.65 -0.91 -0.05 0.14 0.07 0.02 -0.08 -0.67 -0.06 -0.06 -0.07 0.15 0.11 0.29 -1.29 -0.32
Solyc02g093510.3.1 (Solyc02g093510.3)
-0.89 1.52 -0.72 -0.07 1.07 0.04 -0.17 -0.61 0.09 -1.31 1.01 1.09 1.19 1.57 -0.86 -1.26 -1.21 -8.07 - -0.12 0.68 -0.58 -0.27 -0.47 -0.56 -0.78 -0.13 -0.39 -0.37 -0.44 -0.32 -0.5 -2.53 0.3
Solyc02g094490.3.1 (Solyc02g094490.3)
-0.52 1.21 -0.56 -0.59 0.01 -0.11 0.15 0.05 -0.21 -0.64 1.61 1.5 1.46 1.31 -1.17 -1.49 -1.55 -6.07 -7.23 -0.07 1.23 -0.69 -0.37 -0.48 -0.64 -1.14 -0.56 -0.74 -0.85 -0.7 -0.48 -0.83 -1.47 0.24
Solyc03g006177.1.1 (Solyc03g006177.1)
-0.73 0.41 -1.24 -0.55 1.31 0.47 1.24 -0.16 0.05 0.65 0.79 0.27 1.4 0.76 0.16 0.16 0.05 -4.7 -4.55 -1.06 0.43 -0.6 -0.31 -0.56 -1.03 -0.56 -0.28 -0.37 -0.45 -0.61 -0.4 -0.75 -2.75 -0.03
Solyc03g007170.3.1 (Solyc03g007170.3)
-0.98 2.25 -0.63 -0.01 0.63 -0.02 0.93 -0.1 -0.21 -1.37 0.95 0.98 1.17 1.31 -1.68 -3.2 -3.04 -8.58 -12.34 -2.14 0.7 -0.5 -0.03 -0.31 -0.63 -3.22 0.06 -0.22 -0.35 -0.45 -0.36 -0.81 -2.02 0.28
Solyc03g019800.3.1 (Solyc03g019800.3)
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Solyc03g032070.3.1 (Solyc03g032070.3)
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Solyc03g034080.3.1 (Solyc03g034080.3)
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Solyc03g045050.3.1 (Solyc03g045050.3)
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Solyc03g046350.3.1 (Solyc03g046350.3)
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Solyc03g058350.3.1 (Solyc03g058350.3)
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Solyc03g058380.3.1 (Solyc03g058380.3)
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Solyc03g083240.3.1 (Solyc03g083240.3)
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Solyc03g112820.3.1 (Solyc03g112820.3)
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Solyc03g115235.1.1 (Solyc03g115235.1)
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Solyc03g115240.3.1 (Solyc03g115240.3)
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Solyc03g115247.1.1 (Solyc03g115247.1)
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Solyc03g117940.3.1 (Solyc03g117940.3)
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Solyc04g024520.3.1 (Solyc04g024520.3)
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Solyc04g025300.3.1 (Solyc04g025300.3)
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Solyc04g074280.1.1 (Solyc04g074280.1)
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Solyc04g074570.1.1 (Solyc04g074570.1)
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Solyc05g018350.3.1 (Solyc05g018350.3)
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Solyc05g018490.3.1 (Solyc05g018490.3)
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Solyc05g032880.3.1 (Solyc05g032880.3)
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Solyc05g047420.3.1 (Solyc05g047420.3)
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Solyc05g053220.3.1 (Solyc05g053220.3)
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Solyc05g053770.3.1 (Solyc05g053770.3)
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Solyc05g054140.3.1 (Solyc05g054140.3)
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Solyc06g005140.3.1 (Solyc06g005140.3)
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Solyc06g010240.2.1 (Solyc06g010240.2)
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Solyc06g016750.3.1 (Solyc06g016750.3)
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Solyc06g053330.3.1 (Solyc06g053330.3)
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Solyc06g084483.1.1 (Solyc06g084483.1)
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Solyc08g067885.1.1 (Solyc08g067885.1)
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Solyc08g068820.3.1 (Solyc08g068820.3)
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Solyc08g074440.3.1 (Solyc08g074440.3)
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Solyc08g075400.3.1 (Solyc08g075400.3)
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Solyc08g076430.3.1 (Solyc08g076430.3)
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Solyc08g078610.3.1 (Solyc08g078610.3)
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Solyc11g072390.2.1 (Solyc11g072390.2)
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-0.81 0.43 -0.87 -1.04 1.14 0.72 1.4 0.05 0.53 -0.26 0.64 1.04 1.08 1.45 0.09 -0.31 -0.46 - -10.19 -1.15 -0.07 -0.91 -0.06 -0.62 -1.28 -0.88 -0.17 -0.56 -0.71 -0.8 -0.45 -1.14 -2.45 0.66
Solyc12g013790.2.1 (Solyc12g013790.2)
-1.1 0.56 -0.92 -0.56 1.83 0.49 0.96 -0.55 -0.64 -0.62 0.93 1.09 1.51 1.48 -0.77 -0.94 -0.97 -7.88 -12.32 0.03 0.76 -0.87 -0.57 -0.75 -0.81 -0.74 -0.39 -0.64 -0.65 -0.71 -0.43 -0.9 -1.97 -0.33
Solyc12g014090.2.1 (Solyc12g014090.2)
-0.04 0.14 -0.58 -2.29 0.04 -0.16 0.78 -0.68 0.43 0.44 0.66 -0.45 1.6 0.73 -0.15 -0.68 -0.76 -7.53 -10.13 -0.73 0.44 0.05 -0.1 -0.06 -0.27 0.28 0.14 0.24 -0.02 0.07 0.14 0.36 -3.01 0.25
Solyc12g017630.2.1 (Solyc12g017630.2)
-0.22 1.11 -1.11 -0.7 -0.78 -0.57 0.85 -0.05 -0.1 -0.43 1.28 1.25 1.67 1.37 -1.36 -1.95 -1.98 -9.65 -7.9 -0.53 0.67 -0.48 0.2 -0.11 -0.28 -0.42 0.04 -0.27 -0.37 -0.55 -0.47 -0.84 -1.73 0.24
Solyc12g088310.2.1 (Solyc12g088310.2)
-1.53 -3.01 -1.01 -3.82 1.2 -0.19 1.4 -1.41 0.12 0.02 0.86 0.82 1.73 1.51 -0.97 -1.4 -1.23 - - 0.54 1.16 -0.53 -0.63 -0.7 -0.93 -1.34 0.1 0.03 -0.04 -0.23 -0.17 -0.24 -5.42 0.45
Solyc12g098465.1.1 (Solyc12g098465.1)
-0.38 -1.45 -1.34 -1.05 2.38 0.6 0.72 -2.3 -0.64 0.02 0.85 0.44 1.43 1.17 -0.39 -0.61 -0.77 -2.09 -1.79 -0.07 1.13 -1.04 -0.96 -0.99 -1.08 -0.55 -0.84 -0.91 -0.99 -0.9 -0.94 -0.66 -4.47 1.0
Solyc12g099280.2.1 (Solyc12g099280.2)
-0.34 0.81 -1.09 -1.92 0.41 0.17 0.53 -0.84 -0.2 -0.16 1.51 0.98 1.83 1.28 -1.65 -3.02 -3.25 - - -1.58 0.43 -0.1 -0.2 -0.17 -0.26 -0.19 -0.2 -0.04 -0.16 -0.09 -0.06 0.29 -3.36 0.13
Solyc12g099890.2.1 (Solyc12g099890.2)
-0.37 1.32 -0.43 -0.31 0.07 -0.19 0.56 0.06 0.18 -0.66 0.88 0.68 1.06 0.89 -0.75 -1.05 -1.12 -7.98 -9.93 -0.89 0.34 -0.08 0.4 0.22 -0.13 -0.85 0.22 0.07 -0.05 -0.01 0.08 -0.22 -2.67 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.