Heatmap: Cluster_227 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g217960.1.1 (Solyc00g217960.1)
0.63 0.06 0.46 0.3 0.6 0.18 0.02 0.06 0.32 0.31 0.38 0.58 0.27 0.49 0.54 0.64 1.0 0.0 0.0 0.76 0.37 0.16 0.11 0.16 0.15 0.79 0.15 0.15 0.21 0.16 0.16 0.17 0.16 0.67
Solyc01g067010.3.1 (Solyc01g067010.3)
0.53 0.0 0.09 0.01 0.2 0.65 0.1 0.11 0.33 0.69 0.57 0.59 0.29 0.49 0.55 0.71 1.0 0.0 0.0 0.92 0.65 0.18 0.16 0.18 0.13 0.74 0.17 0.22 0.27 0.12 0.1 0.21 0.16 0.8
Solyc01g087980.3.1 (Solyc01g087980.3)
1.0 0.01 0.07 0.04 0.06 0.06 0.0 0.01 0.01 0.04 0.06 0.17 0.08 0.31 0.12 0.1 0.13 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.39
Solyc01g088440.2.1 (Solyc01g088440.2)
0.31 0.09 0.36 0.12 1.0 0.24 0.13 0.13 0.19 0.14 0.27 0.27 0.03 0.09 0.11 0.1 0.17 0.0 0.0 0.2 0.1 0.09 0.13 0.12 0.06 0.16 0.07 0.05 0.06 0.06 0.1 0.04 0.03 0.35
Solyc01g098805.1.1 (Solyc01g098805.1)
0.68 0.03 0.17 0.13 0.28 0.08 0.16 0.07 0.19 0.11 0.38 0.42 0.24 0.6 0.24 0.24 0.13 0.0 0.0 0.31 0.1 0.66 1.0 0.69 0.18 0.37 0.38 0.27 0.14 0.06 0.62 0.17 0.0 0.52
Solyc01g104725.1.1 (Solyc01g104725.1)
0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.05 0.06 0.01 0.2 0.29 1.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.11 0.12 0.11 0.04 0.08 0.12 0.24 0.03 0.06 0.09 0.1 0.08 0.15 0.0 0.11
Solyc01g104740.3.1 (Solyc01g104740.3)
0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.03 0.02 0.0 0.01 0.07 0.01 0.3 0.08 1.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.24 0.16 0.02 0.03 0.05 0.04 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.13
Solyc01g107170.2.1 (Solyc01g107170.2)
0.93 0.01 0.18 0.11 0.01 0.24 0.0 0.0 0.04 0.27 0.34 1.0 0.13 0.67 0.1 0.09 0.13 0.0 0.0 0.74 0.18 0.01 0.02 0.04 0.02 0.64 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.74
Solyc01g109190.1.1 (Solyc01g109190.1)
1.0 0.03 0.09 0.08 0.13 0.11 0.35 0.0 0.28 0.15 0.07 0.03 0.0 0.1 0.22 0.14 0.26 0.0 0.0 0.19 0.13 0.28 0.24 0.34 0.15 0.51 0.21 0.18 0.2 0.08 0.29 0.22 0.14 0.23
Solyc01g109250.2.1 (Solyc01g109250.2)
1.0 0.09 0.13 0.47 0.7 0.28 0.01 0.05 0.19 0.13 0.13 0.24 0.07 0.21 0.03 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.06 0.18 0.1 0.1 0.06 0.01 0.03 0.04 0.08 0.11 0.15 0.2 0.05 0.91
Solyc01g112000.3.1 (Solyc01g112000.3)
1.0 0.05 0.1 0.12 0.11 0.12 0.0 0.08 0.03 0.06 0.26 0.5 0.07 0.28 0.05 0.07 0.05 0.14 0.0 0.11 0.22 0.1 0.09 0.09 0.06 0.04 0.07 0.08 0.11 0.06 0.11 0.07 0.1 0.58
Solyc02g070040.1.1 (Solyc02g070040.1)
1.0 0.02 0.09 0.06 0.16 0.08 0.02 0.05 0.12 0.12 0.34 0.7 0.06 0.09 0.25 0.16 0.32 0.0 0.0 0.04 0.04 0.15 0.33 0.25 0.08 0.03 0.04 0.05 0.05 0.08 0.14 0.09 0.05 0.64
Solyc02g082610.1.1 (Solyc02g082610.1)
1.0 0.09 0.12 0.05 0.01 0.06 0.04 0.07 0.06 0.56 0.29 0.58 0.24 0.63 0.39 0.34 0.4 0.01 0.0 0.16 0.08 0.22 0.35 0.3 0.19 0.1 0.24 0.24 0.12 0.22 0.29 0.28 0.06 0.86
Solyc02g091180.1.1 (Solyc02g091180.1)
1.0 0.06 0.09 0.06 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.02 0.06 0.08 0.06 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.07 0.09 0.02 0.02 0.04 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.37
Solyc03g026270.3.1 (Solyc03g026270.3)
1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
Solyc03g026280.3.1 (Solyc03g026280.3)
1.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.05 0.08 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.04 0.01 0.01 0.43
Solyc03g093535.1.1 (Solyc03g093535.1)
1.0 0.01 0.18 0.1 0.16 0.83 0.0 0.15 0.18 0.02 0.04 0.1 0.05 0.69 0.07 0.11 0.16 0.0 0.0 0.22 0.44 0.18 0.28 0.47 0.19 0.36 0.03 0.06 0.16 0.04 0.13 0.14 0.07 0.48
Solyc03g093540.1.1 (Solyc03g093540.1)
0.37 0.0 0.04 0.03 0.22 0.73 0.0 0.11 0.04 0.03 0.05 0.23 0.11 1.0 0.03 0.03 0.05 0.0 0.0 0.1 0.18 0.06 0.1 0.13 0.06 0.11 0.02 0.02 0.03 0.01 0.05 0.05 0.04 0.31
Solyc03g093550.1.1 (Solyc03g093550.1)
0.59 0.01 0.1 0.09 0.32 0.53 0.0 0.18 0.13 0.09 0.56 0.78 0.36 1.0 0.14 0.19 0.32 0.0 0.0 0.21 0.22 0.33 0.93 1.0 0.41 0.12 0.16 0.14 0.2 0.1 0.18 0.22 0.09 0.78
Solyc03g093560.1.1 (Solyc03g093560.1)
0.31 0.01 0.08 0.03 0.19 0.16 0.0 0.01 0.04 0.04 0.41 0.45 0.55 1.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.23 0.16 0.11 0.3 0.29 0.09 0.41 0.05 0.05 0.07 0.05 0.09 0.13 0.0 0.73
Solyc03g112340.1.1 (Solyc03g112340.1)
0.91 0.03 0.19 0.08 0.1 0.18 0.04 0.02 0.18 0.42 0.31 0.51 0.72 0.85 0.08 0.08 0.18 0.04 0.03 0.57 0.23 0.09 0.13 0.14 0.07 1.0 0.06 0.07 0.12 0.05 0.07 0.07 0.04 0.78
Solyc03g116490.1.1 (Solyc03g116490.1)
0.48 0.02 0.23 0.09 0.25 0.31 0.0 0.08 0.2 0.92 0.17 0.23 0.53 0.37 0.55 0.85 1.0 0.11 0.26 0.71 0.42 0.22 0.13 0.19 0.26 0.93 0.13 0.21 0.27 0.21 0.17 0.38 0.38 0.56
Solyc03g120740.1.1 (Solyc03g120740.1)
0.37 0.45 0.83 0.44 0.98 0.38 0.35 0.29 0.4 0.28 0.58 0.77 0.62 0.77 0.25 0.2 0.32 0.03 0.03 0.91 1.0 0.5 0.29 0.39 0.49 0.3 0.3 0.34 0.37 0.41 0.48 0.41 0.11 0.47
Solyc04g018110.1.1 (Solyc04g018110.1)
0.2 0.02 0.04 0.16 0.15 0.3 0.15 0.06 0.25 0.24 0.51 0.56 1.0 0.66 0.3 0.29 0.57 0.0 0.0 0.9 0.46 0.34 0.35 0.4 0.25 0.29 0.17 0.22 0.26 0.29 0.35 0.34 0.05 0.37
Solyc04g078640.2.1 (Solyc04g078640.2)
0.26 0.03 0.11 0.06 0.04 0.16 0.0 0.04 0.05 0.14 0.14 0.12 0.52 0.41 0.06 0.08 0.14 0.0 0.0 0.57 0.27 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.14 0.68
Solyc05g007900.2.1 (Solyc05g007900.2)
0.5 0.01 0.15 0.03 0.75 0.14 0.1 0.05 0.13 0.32 0.06 0.43 0.35 0.8 0.22 0.45 0.34 0.0 0.0 1.0 0.4 0.32 0.45 0.55 0.43 0.25 0.43 0.66 0.44 0.45 0.17 0.42 0.05 0.52
Solyc05g052040.1.1 (Solyc05g052040.1)
0.29 0.03 0.14 0.1 0.1 0.12 0.0 0.01 0.01 0.03 0.44 0.53 0.53 0.72 0.05 0.09 0.27 0.0 0.0 0.21 0.13 0.04 0.08 0.08 0.03 0.11 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.04 0.06 1.0
Solyc05g052410.2.1 (Solyc05g052410.2)
0.1 0.02 0.04 0.02 0.21 0.17 0.03 0.03 0.02 0.11 0.03 0.47 0.11 1.0 0.05 0.09 0.16 0.0 0.01 0.59 0.17 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1
Solyc06g074620.3.1 (Solyc06g074620.3)
1.0 0.09 0.08 0.06 0.04 0.04 0.02 0.01 0.04 0.13 0.05 0.06 0.05 0.13 0.23 0.33 0.35 0.0 0.0 0.38 0.1 0.05 0.03 0.05 0.04 0.15 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.05 0.02 0.48
Solyc07g053550.2.1 (Solyc07g053550.2)
0.6 0.03 0.28 0.05 0.16 0.12 0.02 0.02 0.08 0.11 0.15 0.43 0.8 0.8 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 1.0 0.13 0.05 0.07 0.04 0.03 0.74 0.08 0.08 0.1 0.03 0.03 0.03 0.02 0.62
Solyc07g055190.3.1 (Solyc07g055190.3)
0.45 0.07 0.08 0.05 0.09 0.24 0.16 0.06 0.18 0.46 0.78 0.85 0.63 1.0 0.37 0.45 0.64 0.59 0.4 0.47 0.33 0.13 0.16 0.15 0.13 0.09 0.09 0.07 0.11 0.13 0.13 0.12 0.19 0.47
Solyc08g041860.1.1 (Solyc08g041860.1)
0.95 0.16 0.27 0.3 0.07 0.22 0.14 0.07 0.14 0.18 0.4 0.43 0.33 0.64 0.38 0.37 0.4 0.01 0.0 0.72 0.23 0.59 0.67 0.66 0.4 0.2 0.29 0.32 0.33 0.41 0.52 0.41 0.13 1.0
Solyc08g079700.2.1 (Solyc08g079700.2)
0.46 0.03 0.3 0.1 0.19 0.08 0.24 0.04 0.06 0.13 0.62 0.81 0.37 1.0 0.27 0.31 0.35 0.0 0.0 0.48 0.16 0.1 0.27 0.25 0.14 0.07 0.12 0.14 0.1 0.09 0.08 0.08 0.04 0.51
Solyc08g080540.3.1 (Solyc08g080540.3)
0.15 0.02 0.06 0.02 0.41 0.06 0.49 0.02 0.07 0.09 0.05 0.35 0.21 1.0 0.07 0.09 0.09 0.05 0.04 0.38 0.28 0.11 0.21 0.22 0.13 0.15 0.17 0.18 0.11 0.12 0.07 0.09 0.01 0.3
Solyc09g074240.1.1 (Solyc09g074240.1)
0.39 0.06 0.32 0.28 0.36 0.3 0.31 0.24 0.25 0.29 0.54 0.66 1.0 0.82 0.14 0.14 0.18 0.0 0.0 0.25 0.33 0.33 0.32 0.33 0.25 0.27 0.51 0.43 0.34 0.38 0.38 0.24 0.12 0.54
Solyc10g009110.1.1 (Solyc10g009110.1)
0.29 0.01 0.06 0.02 0.06 0.16 0.01 0.01 0.05 0.07 0.26 0.52 0.28 1.0 0.07 0.04 0.05 0.04 0.07 0.1 0.17 0.2 0.26 0.25 0.15 0.08 0.07 0.08 0.12 0.1 0.18 0.18 0.01 0.51
Solyc10g009120.2.1 (Solyc10g009120.2)
0.36 0.01 0.05 0.01 0.03 0.1 0.0 0.0 0.05 0.02 0.32 0.57 0.3 1.0 0.06 0.03 0.04 0.05 0.05 0.12 0.29 0.24 0.29 0.26 0.16 0.05 0.08 0.08 0.14 0.12 0.19 0.19 0.01 0.91
Solyc10g079755.1.1 (Solyc10g079755.1)
0.39 0.06 0.23 0.21 0.43 0.67 0.37 0.16 0.43 0.43 1.0 0.97 0.96 0.68 0.54 0.64 0.66 0.0 0.0 0.42 0.56 0.44 0.44 0.48 0.4 0.32 0.34 0.42 0.42 0.48 0.39 0.46 0.23 0.92
Solyc10g081040.1.1 (Solyc10g081040.1)
0.23 0.01 0.08 0.01 0.03 0.08 0.04 0.01 0.05 0.03 0.34 1.0 0.25 0.93 0.04 0.02 0.03 0.0 0.0 0.26 0.1 0.15 0.31 0.24 0.08 0.11 0.07 0.05 0.06 0.05 0.17 0.06 0.01 0.4
Solyc10g085590.1.1 (Solyc10g085590.1)
0.97 0.1 0.21 0.2 0.1 0.15 0.22 0.1 0.21 0.16 0.22 0.26 0.28 0.41 0.23 0.21 0.23 0.02 0.03 0.56 0.21 0.24 0.32 0.31 0.2 0.3 0.26 0.24 0.2 0.18 0.21 0.17 0.13 1.0
Solyc11g012980.1.1 (Solyc11g012980.1)
0.09 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.32 0.16 1.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.15
Solyc12g009240.1.1 (Solyc12g009240.1)
1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.26 0.15 0.45 0.11 0.07 0.13 0.0 0.0 0.05 0.0 0.16 0.48 0.43 0.07 0.01 0.11 0.07 0.04 0.02 0.16 0.03 0.0 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)