Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000056.16	-2.43	-0.06	0.58	-0.13	1.06	0.76	-0.88	-2.17	0.07	0.78	0.65	1.06	-1.45	-0.36	-0.66	0.4	-1.48	0.9	0.13	-0.38	-1.54	-0.82	-2.64	-0.25	0.13	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000114.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000123.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000249.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000254.54	-	-	-	2.4	-	-	-	1.34	-	-	-	-	-	-	-	1.46	-	2.54	0.96	-	-	2.6	-	-	0.7	-
Cpa\|evm.model.tig00000382.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000403.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	2.3	-
Cpa\|evm.model.tig00000404.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.11	-	-	3.8	-	-	-	2.96
Cpa\|evm.model.tig00000411.12	1.88	3.14	-	-	-	-	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.6	-	-	-	-	-	-	1.51	-
Cpa\|evm.model.tig00000411.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000411.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000411.7	-	-	-	-	-	-	-0.48	-	-	2.0	1.1	-0.4	-	-	-	0.99	-	3.17	-	-0.57	-	-0.74	-0.87	0.11	-1.1	2.0
Cpa\|evm.model.tig00000523.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.64	-	-	-	-	-	3.76	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000654.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000806.19	-	-	-	-	-	-	-	-0.41	-0.31	2.35	2.0	-0.9	-1.26	-	-	-	-	2.12	1.42	2.17	-	0.58	-	-	0.45	-4.82
Cpa\|evm.model.tig00000850.8	0.46	0.69	-	-1.99	-	-	-1.62	-1.85	-	-	-	-	-	1.53	-	1.4	0.72	-	-0.09	-	1.55	3.07	-	-1.17	-1.74	0.96
Cpa\|evm.model.tig00000912.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.52	-	-	-	3.86	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001027.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001254.18	-	-	-	-	-	-	-	1.49	1.46	-	-	-	-	-	1.38	-	1.7	1.8	-	-	-	3.22	-	-	0.86	-
Cpa\|evm.model.tig00001415.11	0.49	-	1.1	-	-0.97	-0.71	-0.26	0.68	-	1.58	0.94	-1.69	0.81	-0.5	-	-0.82	-0.98	0.54	-	-0.45	-3.72	-2.18	0.84	-	1.01	1.94
Cpa\|evm.model.tig00020516.12	-	-	-	-	-	3.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.06	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020528.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020531.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.47	-	3.9	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020539.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020539.24	-	-	1.92	-0.16	-0.41	-	0.34	-	-	-	-	-	-	-	-	1.35	-	1.14	-	-	-	3.8	-	-	-0.79	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.236	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.04	-	-	-	-	-	0.2	1.45	-	-	1.14	4.09	0.92	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020556.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.52	4.53	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020560.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020567.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020660.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.09	-	-	-	-	-	-	-	4.13	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020824.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.71	-	-	-	-	-	-	-	3.21	-	-	-	2.54	2.14	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020849.2 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.22	3.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.73	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020902.21	-1.17	-1.25	-0.71	-2.09	-0.25	-1.08	-1.58	-2.11	0.29	-3.22	0.7	-1.48	0.37	1.2	0.6	1.03	-0.73	1.02	-3.52	-2.39	0.4	1.02	0.6	0.9	-0.26	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020904.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.8	-	-	4.25	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020911.5	1.01	-	-	-	-	-	-	-	1.3	-	2.91	-	-	-	-	-	-	3.05	-	-	-	-	2.52	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020941.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020956.1	1.54	1.54	1.63	-	1.11	-	-	-	-	-	1.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.15	0.74	-	-	0.9
Cpa\|evm.model.tig00020995.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.89	-	3.41	2.99	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021221.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	-	-	-	-	-	-	3.69	-
Cpa\|evm.model.tig00021339.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021535.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021591.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021687.20	-	-	-	-	2.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.47	-	-	3.13	2.65	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021746.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021760.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021762.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.