Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000093.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000113.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.09	-	3.15	-	2.97	-	1.59	-	-	-	-	1.0	-
Cpa\|evm.model.tig00000117.7	-	-	1.81	-	-	-	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	-	-	-	-	-	1.3
Cpa\|evm.model.tig00000139.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000189.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.78	-	-	2.93	-	2.98	-	-	-	-	2.15	1.37	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000194.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.31	4.13	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000269.100	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000339.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000404.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000471.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000526.15 (PEX6)	1.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.28	2.22	1.3	1.28	-	-	-	2.88	-	-	0.72	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000630.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000788.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000842.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000857.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001029.6	-0.42	0.15	-2.91	0.22	-1.75	0.31	0.0	-1.07	-0.31	-0.08	-0.03	-0.91	-0.36	0.28	0.75	0.54	0.21	1.58	0.76	0.6	-2.72	-0.49	-0.72	-1.06	0.67	-0.89
Cpa\|evm.model.tig00001033.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001071.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001314.4	-	-	-	-	-	-	0.78	-	-	-	-	-	-	2.66	0.48	3.27	-	-	2.79	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020510.114	0.19	-0.47	-1.4	-0.67	-0.6	0.0	-1.28	-0.73	-1.15	1.2	0.05	-0.09	0.9	0.76	-1.45	1.01	-	0.15	0.7	1.35	-2.19	-0.91	-1.86	-	1.3	0.03
Cpa\|evm.model.tig00020539.25	-	-	1.79	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	3.27	-	2.65	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020567.12	2.07	-	-	-	-	1.02	1.21	-	2.05	0.89	1.02	-	1.44	1.84	-	-	-	0.26	-	0.92	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020710.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020801.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.45	1.21	2.13	-	-	-	-	4.06	-	-	-0.61	-	-0.62	-
Cpa\|evm.model.tig00020805.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020902.117	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.85	2.16	-	-	3.97	-	-	-	-	-	-	-	-	1.14	-
Cpa\|evm.model.tig00020918.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020927.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020996.40 (SDG23)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.1
Cpa\|evm.model.tig00020996.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020996.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021017.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021070.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.93	-	-	3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021098.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021247.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021294.10	-	-	0.94	-	-	2.7	-	-	-	-	0.87	-	-	-	-	3.83	-	-	-	-	-	-	0.57	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021294.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021318.41	-	-	-	-	-	1.95	-	-	1.98	-	-	-	-	1.77	-	3.15	-	1.19	-	1.85	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021332.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021339.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021619.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021795.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.7	-	-	-	-	3.7	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.