Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.53 0.29 0.22 0.21 0.15 0.18 0.3 0.37 0.35 0.35 0.41 0.48 0.58 1.0 0.38 0.38 0.33 0.51 0.38 0.29 0.03 0.25 0.15 0.29 0.54 0.48
0.35 0.12 0.13 0.37 0.25 0.24 0.41 0.36 0.26 0.18 0.15 0.13 0.18 1.0 0.13 0.64 0.13 0.23 0.27 0.2 0.13 0.16 0.34 0.36 0.41 0.26
0.6 0.4 0.28 0.25 0.12 0.09 0.14 0.24 0.13 0.2 0.25 0.3 0.51 0.94 0.11 0.16 0.13 0.19 0.2 0.15 0.29 0.38 0.17 0.35 1.0 0.71
0.64 0.42 0.38 0.42 0.35 0.27 0.43 0.39 0.3 0.31 0.34 0.35 0.69 0.71 0.46 0.62 0.41 0.41 0.34 0.27 0.04 0.26 0.25 0.35 1.0 0.68
0.51 0.34 0.5 0.52 0.68 0.51 0.72 0.66 0.69 1.0 0.92 0.75 0.69 0.99 0.27 0.77 0.41 0.73 0.61 0.5 0.15 0.84 0.64 0.84 0.78 0.81
0.22 0.08 0.06 0.16 0.16 0.15 0.27 0.33 0.38 0.35 0.33 0.25 0.2 1.0 0.26 0.31 0.19 0.26 0.18 0.17 0.03 0.65 0.18 0.13 0.47 0.35
0.13 0.12 0.13 0.22 0.29 0.22 0.21 0.23 0.18 0.25 0.28 0.24 0.16 1.0 0.08 0.42 0.11 0.35 0.18 0.13 0.13 0.55 0.35 0.26 0.56 0.47
0.21 0.12 0.14 0.21 0.15 0.13 0.18 0.19 0.15 0.17 0.23 0.16 0.18 0.59 0.2 0.39 0.11 0.2 0.09 0.1 0.02 0.03 0.21 0.08 1.0 0.41
0.61 0.32 0.17 0.17 0.12 0.15 0.3 0.39 0.17 0.22 0.26 0.27 0.61 0.74 0.29 0.56 0.2 0.22 0.12 0.07 0.03 0.22 0.06 0.13 1.0 0.27
0.57 0.26 0.26 0.21 0.3 0.34 0.54 0.55 0.39 0.43 0.39 0.39 0.53 1.0 0.56 0.85 0.43 0.39 0.35 0.42 0.01 0.08 0.12 0.1 0.58 0.58
0.32 0.22 0.16 0.2 0.13 0.08 0.17 0.22 0.18 0.26 0.32 0.28 0.36 1.0 0.31 0.43 0.3 0.24 0.21 0.19 0.13 0.29 0.46 0.3 0.42 0.28
0.61 0.36 0.29 0.37 0.41 0.41 0.67 0.68 0.53 0.53 0.58 0.49 0.72 0.67 0.45 0.46 0.25 0.32 0.23 0.28 0.03 0.29 0.36 0.2 1.0 0.51
0.64 0.48 0.42 0.46 0.53 0.55 0.69 0.71 0.57 0.6 0.62 0.55 0.63 1.0 0.54 0.88 0.64 0.54 0.43 0.44 0.1 0.56 0.54 0.6 0.9 0.63
0.71 0.43 0.39 0.42 0.39 0.31 0.47 0.55 0.51 0.62 0.63 0.64 0.78 1.0 0.49 0.64 0.43 0.5 0.36 0.4 0.15 0.37 0.66 0.37 0.7 0.6
0.55 0.45 0.45 0.62 0.58 0.51 0.54 0.57 0.51 0.46 0.48 0.49 0.6 0.61 0.5 0.61 0.43 0.54 0.44 0.26 0.05 0.42 0.39 0.38 1.0 0.55
0.58 0.43 0.54 0.67 0.61 0.69 0.79 0.67 0.81 0.58 0.65 0.68 0.67 1.0 0.54 0.88 0.52 0.63 0.57 0.45 0.18 0.83 0.4 0.64 0.75 0.64
0.25 0.12 0.08 0.16 0.12 0.1 0.37 0.32 0.27 0.37 0.41 0.31 0.26 0.86 0.12 0.22 0.19 0.17 0.06 0.09 0.09 0.17 0.49 0.53 1.0 0.44
0.72 0.33 0.2 0.33 0.27 0.15 0.31 0.36 0.2 0.28 0.38 0.4 0.79 0.52 0.28 0.71 0.26 0.19 0.14 0.11 0.06 0.61 0.24 0.19 1.0 0.54
0.58 0.27 0.23 0.22 0.22 0.27 0.42 0.47 0.42 0.42 0.38 0.35 0.54 1.0 0.4 0.62 0.34 0.48 0.41 0.34 0.04 0.17 0.28 0.28 0.42 0.38
0.29 0.27 0.28 0.35 0.31 0.31 0.4 0.44 0.3 0.33 0.34 0.29 0.39 0.86 0.34 0.82 0.35 0.34 0.27 0.21 0.05 0.18 0.22 0.18 1.0 0.39
0.43 0.31 0.36 0.39 0.31 0.26 0.35 0.36 0.4 0.25 0.25 0.25 0.45 0.69 0.52 0.57 0.41 0.37 0.31 0.26 0.02 0.27 0.21 0.18 1.0 0.49
0.41 0.34 0.36 0.38 0.29 0.31 0.53 0.64 0.62 0.72 0.71 0.67 0.5 1.0 0.36 0.68 0.48 0.5 0.4 0.43 0.14 0.35 0.61 0.45 0.74 0.59
0.4 0.17 0.13 0.08 0.18 0.3 0.14 0.17 0.27 0.25 0.25 0.21 0.33 1.0 0.25 0.44 0.19 0.31 0.42 0.38 0.03 0.1 0.17 0.06 0.54 0.5
0.34 0.23 0.18 0.42 0.48 0.22 0.46 0.64 0.55 0.48 0.62 0.45 0.38 0.54 0.2 0.46 0.21 0.21 0.23 0.23 0.02 0.12 0.55 0.41 1.0 0.4
0.35 0.16 0.18 0.21 0.28 0.44 0.61 0.51 0.36 0.33 0.25 0.16 0.31 1.0 0.54 0.76 0.28 0.24 0.2 0.22 0.01 0.22 0.27 0.16 0.69 0.47
0.51 0.21 0.19 0.17 0.14 0.15 0.28 0.3 0.3 0.38 0.31 0.37 0.48 1.0 0.25 0.53 0.27 0.38 0.28 0.33 0.05 0.07 0.17 0.16 0.48 0.41
0.41 0.59 0.68 0.7 0.69 0.47 0.77 0.85 0.86 0.8 0.77 0.78 0.42 1.0 0.4 0.71 0.57 0.66 0.61 0.5 0.12 0.45 0.73 0.47 0.87 0.88
0.56 0.36 0.35 0.49 0.46 0.37 0.54 0.6 0.47 0.51 0.57 0.48 0.55 0.73 0.33 0.7 0.36 0.31 0.33 0.28 0.03 0.39 0.26 0.23 1.0 0.46
0.42 0.14 0.1 0.13 0.09 0.09 0.17 0.25 0.26 0.3 0.4 0.28 0.4 1.0 0.44 0.19 0.14 0.2 0.21 0.11 0.16 0.47 0.63 0.53 0.54 0.39
0.33 0.2 0.22 0.24 0.3 0.34 0.48 0.54 0.44 0.38 0.43 0.25 0.3 1.0 0.46 0.64 0.22 0.29 0.24 0.29 0.03 0.34 0.46 0.37 0.62 0.55
0.3 0.25 0.35 0.41 0.45 0.49 0.69 0.61 0.67 0.97 0.88 0.71 0.37 1.0 0.35 0.55 0.46 0.59 0.46 0.34 0.17 0.75 0.91 0.74 0.84 0.67
0.03 0.0 0.04 0.12 0.08 0.15 0.33 0.46 0.44 0.35 0.39 0.31 0.12 1.0 0.34 0.74 0.16 0.19 0.24 0.09 0.11 0.76 0.2 0.18 0.52 0.31
0.46 0.24 0.26 0.17 0.26 0.33 0.41 0.48 0.45 0.33 0.51 0.45 0.46 1.0 0.34 0.44 0.26 0.3 0.25 0.1 0.06 0.13 0.43 0.2 0.65 0.38
0.66 0.48 0.44 0.69 0.47 0.34 0.46 0.57 0.31 0.37 0.47 0.51 0.97 0.8 0.38 0.68 0.28 0.38 0.33 0.25 0.09 0.42 0.23 0.52 1.0 0.58
0.1 0.12 0.17 0.2 0.19 0.16 0.27 0.32 0.33 0.33 0.38 0.39 0.14 1.0 0.23 0.51 0.18 0.2 0.22 0.14 0.21 0.19 0.34 0.2 0.47 0.41
0.3 0.11 0.14 0.17 0.07 0.05 0.13 0.23 0.2 0.27 0.35 0.33 0.26 1.0 0.17 0.25 0.09 0.28 0.19 0.14 0.05 0.43 0.03 0.08 0.32 0.25
0.96 0.4 0.19 0.19 0.24 0.46 0.61 0.56 0.49 0.43 0.47 0.35 0.93 1.0 0.49 0.62 0.23 0.48 0.44 0.35 0.18 0.18 0.44 0.23 0.55 0.57
0.68 0.32 0.28 0.19 0.11 0.1 0.25 0.35 0.23 0.37 0.34 0.35 0.75 1.0 0.09 0.18 0.31 0.32 0.22 0.29 0.0 0.05 0.01 0.03 0.57 0.31
0.74 0.49 0.63 0.67 0.54 0.41 0.6 0.72 0.66 0.7 0.69 0.66 0.84 0.78 0.65 0.72 0.61 0.56 0.59 0.46 0.25 0.5 0.54 0.52 1.0 0.67
0.61 0.22 0.22 0.3 0.23 0.15 0.28 0.36 0.34 0.38 0.42 0.44 0.59 1.0 0.14 0.36 0.19 0.29 0.29 0.22 0.17 0.16 0.2 0.24 0.49 0.5
0.47 0.21 0.22 0.22 0.16 0.11 0.24 0.31 0.21 0.31 0.31 0.34 0.43 1.0 0.12 0.31 0.19 0.3 0.24 0.23 0.14 0.15 0.17 0.18 0.36 0.33
0.67 0.39 0.39 0.36 0.26 0.23 0.37 0.45 0.39 0.42 0.42 0.43 0.61 1.0 0.21 0.5 0.3 0.39 0.35 0.33 0.06 0.28 0.24 0.29 0.7 0.6
0.64 0.26 0.17 0.15 0.07 0.04 0.2 0.28 0.24 0.24 0.34 0.26 0.55 1.0 0.13 0.56 0.15 0.17 0.14 0.11 0.03 0.14 0.11 0.07 0.7 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)