Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - 0.23 - - - - - 0.16 - - - - - - - - - - 1.83 4.05 1.48 - -0.34 -
- - - - - 4.37 - - - - - 1.69 - - - - - 1.05 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.88 - - - - 2.83 0.95 0.63 - 0.63 1.69 0.85 - - 2.18 - - 0.2 0.39 - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.56 - - 4.33 -
- - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - - 2.83 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
3.38 - - - - - - 2.14 - 1.84 - - - - - - - - - 2.92 - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.69 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.41 - 0.91 - - 0.84 - - - - - - - 0.58 1.86 - 0.09 - 0.45 1.86 2.79 - - 1.54 -
- - - - - - - - - - 1.82 - - - 1.8 - - - - 3.66 - 2.67 - - - -
- - - - - - 2.78 - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - 3.46 -
- - - - 2.05 - - - - - - - 2.75 - - - - - - - 2.36 - - - 3.32 -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - 3.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
-0.64 0.66 -1.31 0.67 0.16 - 0.28 -0.79 -1.27 -0.8 -0.73 -0.63 -1.92 -0.67 -2.4 -0.81 -1.34 -0.06 0.98 - - 0.74 0.91 - 2.6 1.04
- - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - 3.7 -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.49 2.4 - - - - 3.46 - - - - 2.04 -
-0.14 -0.63 -1.02 -3.01 -1.56 -0.72 1.49 -0.5 -0.15 -0.39 -1.13 -0.98 -0.38 -0.5 -0.09 0.99 -0.05 0.91 1.02 2.44 -1.07 -3.48 -0.56 -2.48 -0.71 -
- - - - - 3.92 - - 2.56 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
1.91 - - - - - - - - - - - 1.17 - - - - 1.11 0.42 3.56 -0.21 - - 1.38 - 0.27
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
2.73 - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - - -
- - - - 2.3 - - 2.81 - 2.51 - - - - - - - 1.85 - 2.27 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.04 -1.27 0.23 -0.13 0.8 1.53 -1.47 -0.51 0.26 -0.55 -0.41 -3.07 -2.33 -0.36 0.52 -0.18 0.38 0.12 0.84 -0.1 -2.68 -1.06 -1.69 -1.0 1.46 0.51
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
1.0 - - - - 1.21 - - - - - - - 0.72 - - 1.53 1.74 - 3.79 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.32 1.02 - 0.17 -0.16 3.05 1.55 0.16 0.61 -1.5 - -0.36 - -0.03 -0.62 1.1 1.1 - -1.52 -1.77 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 1.86 3.98 - - - -
- - - - - 4.28 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 1.05 - - - 1.52 - 1.06 - 0.42 3.21 3.07 - - - - - -
- - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - 4.02 - - - - - -
-1.03 0.55 0.15 -1.09 0.17 1.32 -0.72 -0.37 - -0.24 0.14 - -1.77 -0.09 1.06 1.17 -0.02 0.85 0.28 -0.51 -0.07 -0.49 0.82 - -1.2 0.46
- - - - 1.68 1.5 - - 1.48 - 1.42 - - 1.33 - - - - - - - - 2.7 - 2.46 -
- - - - -0.31 2.39 0.68 -1.22 0.6 -1.16 - - - - - -0.05 -0.0 1.32 1.17 1.14 - - -1.77 - 1.96 1.51
- - - - 2.17 3.05 - - - - - - 2.41 - - - - 2.56 - - 0.99 - - - - -
- - - 0.22 - - 0.15 - - - 0.1 - - -0.03 0.05 - 1.92 2.01 0.13 1.99 0.2 -0.12 - - 2.52 -
- - - - - 3.01 - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - - 3.38 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 2.54 - - 4.12 -
- - - - 1.94 - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - 2.37 2.35 3.12 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.02 - 3.37 1.28 - - - 1.49 0.03 - - 0.86 - - - 0.59 - 1.15 - - - 0.89 -
- - - 1.77 - 3.08 - 0.59 - - 1.63 - - - - - - - - - 1.37 - -0.0 0.98 -0.3 1.66
2.29 - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - 3.42 1.21 1.76 - - - -
- - - - - - - 1.98 2.0 - 1.92 - - - - - - - - 3.22 0.97 1.56 - - - -
1.06 -0.58 -0.49 -1.94 0.11 -0.48 0.35 0.41 -0.57 -0.24 -1.99 -0.06 0.57 0.03 -0.51 0.61 -1.99 -0.32 0.39 -1.29 0.89 -3.35 0.1 0.5 1.41 -0.84
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 3.53 - - - - - -
- - 2.25 - - 1.26 - - 2.3 1.2 - - - - - - - 1.1 1.17 2.51 - - - - 0.63 -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.16 2.7 - - 2.48 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.27 - 2.26 - - - - - - - - - 1.78 3.02 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
0.49 -1.55 1.23 0.8 -2.1 -0.66 - 1.42 0.2 1.13 -0.25 - 0.95 0.9 -0.89 -0.07 -0.08 -0.36 - 2.1 -0.2 - - -1.9 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.18 - - 1.84 - - - - 2.0 2.42 - - - 2.47 1.58
- - - - - 3.58 - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - -
- - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - 3.69 - -
- - 0.79 -0.71 1.49 0.22 0.41 - -0.8 -0.88 - 0.3 - - - - 0.77 0.66 1.95 2.53 -0.78 - -0.45 0.81 - -
- - - - - - - - - - 2.88 - - - - - - - 2.8 3.55 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- -0.25 - - - - - 0.39 0.52 - -0.49 -0.4 - -1.08 0.25 1.57 - - -0.57 2.21 1.9 1.43 - 0.4 1.7 -
-0.0 - - 0.26 - - - - - - 0.31 - - 0.72 - 1.84 1.54 -0.44 1.64 2.98 -0.68 1.05 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - 2.58 - - - - 2.72 - - 3.75 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - - 3.13 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- 1.14 1.79 - 1.27 - - - - - - 1.67 - 0.98 1.47 - - - - 2.37 - - - - 2.27 -
4.56 - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.41 - 3.15 - - - - - - - - - - 2.7 -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.64 - - - - 2.56 - 2.53 - - - - - - - - - - - 3.02 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - 0.79 - - - 1.83 0.76 1.95 - 0.8 - - - 0.7 - 0.12 - - 1.1 1.64 - - 2.1 0.21
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.59 -0.95 -0.87 -0.7 1.87 0.62 1.35 1.23 -0.29 0.24 -1.43 -2.64 -0.46 0.61 -0.45 0.49 1.06 0.97 -0.03 -2.98 -0.58 -2.05 -2.64 -1.4 -1.48
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - -
- - 2.44 - - 3.34 - - - - 2.4 - - - - - - - 2.37 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- -0.63 - - -0.53 2.75 - -1.56 - -0.65 -1.58 - 0.07 -0.95 - -1.6 0.62 1.51 2.0 - -2.57 -1.98 -0.5 -0.47 -2.2 2.09
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.33 - 2.64 1.42 1.38 - - 1.32 1.27 - - - - - - - - - - 2.82 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - 1.9 - 2.33 - - - 2.55 2.04 -
- - - - - 1.35 - - 1.14 - 1.03 - - - 4.01 - - 0.95 - - 0.16 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - 4.66 - - - - - - -0.57 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.12 - - - 0.01 - - - 2.9 - - - 1.53 - - - 3.37 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - 3.41 -
- - - 2.65 - 1.72 0.34 - -0.13 -0.16 - 0.99 -0.22 - - - - -0.65 - 2.73 0.2 1.08 - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 2.16 2.18 - 2.91 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.89 - - - - - - - 1.9 - - 1.56 - - - - 1.49 2.14 1.56 1.67 - 1.19 -
0.67 0.04 -0.68 -0.83 - - - -0.7 -0.86 -1.02 -0.94 - 0.26 1.25 0.88 - - -1.45 -0.08 2.57 1.01 1.64 - - -1.58 0.9
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.