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Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.05 -0.08 -0.23 -0.14 -0.41 -0.41 0.43 0.37 0.11 0.17 0.05 0.04 -0.15 -0.1 -0.43 -0.13 0.34 -0.07 0.48 -0.18 -0.09 0.16 0.17 -0.39 0.22 -0.3
-0.29 -0.28 -0.52 -0.4 -0.57 -1.24 0.27 0.17 -0.31 0.1 -0.1 -0.3 -0.56 -0.08 -0.47 -0.24 0.37 0.31 0.53 -0.27 0.46 0.63 0.52 -0.0 0.63 -0.09
-0.04 -0.34 -0.54 -0.57 -0.88 -1.14 -0.03 0.25 -0.55 -0.21 -0.18 -0.37 -0.55 -0.04 -0.61 -0.25 0.36 0.15 0.39 -0.37 0.5 1.19 0.37 0.25 0.79 -0.03
-0.65 -0.53 -0.34 -0.75 -0.91 -1.2 -0.61 -0.12 -1.0 -0.21 -0.56 -0.57 -1.08 -0.21 -0.12 -0.27 0.36 0.01 0.35 -0.16 0.49 1.5 0.9 -0.23 1.2 0.3
-0.39 -0.39 -0.26 -1.07 -1.25 -1.32 -0.02 -0.08 -0.73 -0.59 -0.32 -0.78 -1.25 -0.09 -0.36 -0.01 0.08 -0.08 0.09 -0.72 1.02 0.98 1.2 -0.9 1.32 0.69
-0.3 -0.81 -0.87 -0.98 -1.2 -1.16 -0.72 -0.54 -1.14 -0.79 -0.63 -0.24 -1.13 0.19 0.0 0.24 0.28 -0.54 -0.32 -0.35 0.78 1.53 0.38 -0.08 1.87 0.09
0.0 -0.77 -0.43 -1.16 -0.79 -1.07 -0.71 -0.76 -1.14 -0.82 -1.08 -0.77 -0.9 0.13 0.52 0.28 0.24 -0.33 -0.3 -0.05 1.76 1.26 0.12 -0.27 0.84 0.45
0.03 -0.16 -0.3 -0.43 -0.69 -0.74 -0.7 -0.56 -0.74 -0.4 -0.78 -0.33 -0.49 0.36 0.47 0.17 0.25 -0.5 -0.17 0.05 1.43 0.85 -0.09 -0.05 0.71 -0.1
-0.04 -0.14 -0.52 -0.7 -0.75 -0.84 -0.79 -0.87 -1.04 -0.71 -0.9 -0.48 -0.78 0.07 0.33 -0.16 0.17 -1.13 -0.59 -0.15 1.71 1.35 0.25 -0.36 1.14 0.36
-0.09 -0.23 -0.44 -0.72 -0.79 -0.99 -0.65 -0.63 -0.84 -0.7 -0.88 -0.52 -0.54 0.37 0.5 0.06 0.31 -0.52 -0.3 0.0 1.56 1.18 0.06 -0.27 0.76 0.18
0.13 -0.11 -0.24 -0.54 -0.76 -1.09 -0.47 -0.41 -0.93 -0.76 -0.48 -0.14 0.0 0.53 0.68 0.34 0.53 -0.3 -0.32 0.32 1.32 0.58 -0.45 -0.81 0.44 -0.16
3.55 - - - - - - - 3.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.13 - -0.94 -1.01 -0.78 -0.2 -1.95 -3.17 -1.97 -0.01 -1.53 -1.38 - 0.05 -2.15 -2.04 -1.97 1.21 0.72 -0.9 2.15 0.48 0.92 0.22 1.42 1.55
-0.59 -1.46 -1.48 -1.43 -0.81 -1.44 -1.52 -0.97 -1.62 -0.75 -0.89 -1.37 -1.71 0.37 -0.36 0.41 -0.72 0.42 -0.35 -1.54 1.05 2.24 1.39 0.1 0.87 0.61
-0.52 -1.72 -0.5 -0.77 -0.83 -1.12 -2.2 -1.14 -1.31 -0.5 -0.33 -1.2 -1.85 0.45 -0.62 1.0 -1.94 0.11 -0.17 -1.19 0.84 2.22 1.11 0.11 0.73 0.44
-0.28 -1.07 -1.77 -1.85 -1.17 -0.76 -0.35 -1.23 -2.35 0.04 -0.38 -1.8 -2.88 0.18 0.08 0.21 -0.93 0.59 0.11 -1.57 1.42 1.76 1.38 -0.5 0.46 0.95
-0.72 -0.73 -0.45 -0.57 -0.5 -0.66 -0.14 -0.21 -1.03 -0.57 -0.63 -0.66 -1.21 0.76 0.26 0.63 0.27 0.37 -0.04 0.24 0.76 0.81 1.04 -0.67 0.33 -0.1
-0.73 -0.58 -0.43 -0.49 -0.56 -0.56 -0.15 -0.38 -0.89 -0.37 -0.93 -0.81 -1.45 0.67 0.25 0.44 0.09 0.1 -0.05 0.09 0.74 1.01 1.07 -0.37 0.58 0.16
-0.5 -0.54 -0.31 -0.49 -0.28 -0.33 0.04 -0.33 -0.73 -0.38 -0.72 -0.58 -1.25 0.59 0.27 0.35 0.14 0.05 0.05 0.07 0.66 0.87 0.92 -0.77 0.54 0.05
-0.76 -0.61 -0.32 -0.48 -0.48 -0.7 -0.11 -0.45 -1.0 -0.36 -0.95 -0.96 -1.36 0.65 0.42 0.47 0.28 0.1 -0.03 0.21 0.79 0.99 0.9 -0.77 0.85 -0.2
-0.63 -0.6 -0.47 -0.51 -0.52 -0.58 0.04 -0.5 -0.87 -0.49 -0.69 -0.79 -1.28 0.64 0.25 0.35 0.27 -0.25 -0.07 0.2 0.62 0.81 1.16 -0.1 0.67 0.13
-0.8 -0.72 -0.58 -0.55 -0.47 -0.4 -0.01 -0.44 -0.64 -0.54 -0.91 -0.75 -1.27 0.44 0.07 0.16 -0.13 -0.06 -0.22 -0.06 0.89 1.37 1.08 -0.51 0.82 0.2
-0.67 -0.9 -0.46 -0.38 -0.47 -0.67 -0.03 -0.45 -0.79 -0.39 -0.71 -0.66 -1.4 0.71 0.22 0.4 0.24 -0.13 0.02 0.28 0.77 0.49 1.1 -0.29 0.67 0.25
-0.81 -0.59 -0.5 -0.48 -0.26 -0.6 -0.0 -0.29 -0.84 -0.38 -0.59 -0.8 -1.48 0.71 0.34 0.5 0.34 0.25 0.11 0.22 0.59 0.71 1.04 -0.64 0.45 -0.14
-0.87 -0.95 -0.53 -0.64 -0.58 -0.75 -0.22 -0.56 -0.99 -0.64 -1.02 -1.09 -1.52 0.36 0.04 0.28 -0.11 -0.11 -0.22 -0.12 0.96 1.31 1.33 0.38 0.8 0.25
-0.46 -0.42 -0.2 -0.17 -0.14 -0.35 0.27 -0.12 -0.58 -0.08 -0.39 -0.43 -1.07 0.82 0.39 0.6 0.33 0.08 0.18 0.21 0.07 0.39 0.39 -0.28 -0.08 -0.53
-0.91 -0.73 -0.52 -0.54 -0.52 -0.64 -0.15 -0.6 -0.86 -0.36 -0.94 -0.78 -1.4 0.45 0.03 0.26 0.19 -0.16 0.04 0.07 0.83 1.04 1.31 0.22 0.46 0.28
-0.57 -0.61 -0.08 -0.34 -0.06 -0.52 0.13 -0.18 -0.66 0.13 -0.3 -0.67 -1.01 0.88 0.45 0.76 0.53 0.13 0.27 0.37 0.17 0.25 0.48 -0.81 -0.48 -0.51
-0.68 -0.52 -0.44 -0.33 -0.38 -0.68 0.05 -0.24 -0.73 -0.3 -0.51 -0.69 -1.15 0.41 0.03 0.26 -0.08 -0.01 -0.06 -0.04 0.73 0.92 1.18 -0.1 0.6 0.03
-0.67 -0.57 -0.37 -0.32 -0.26 -0.76 0.15 -0.22 -0.64 -0.11 -0.44 -0.61 -1.17 0.49 0.12 0.39 0.08 0.02 0.17 0.08 0.54 0.76 1.0 -0.21 0.39 -0.08
-0.72 -0.57 -0.38 -0.28 -0.34 -0.78 0.26 -0.3 -0.6 -0.05 -0.31 -0.54 -1.14 0.3 -0.04 0.32 -0.03 0.07 0.16 0.03 0.61 0.75 1.02 -0.03 0.43 0.0
-0.32 -0.21 -0.09 0.07 0.19 0.12 0.5 0.09 0.0 0.17 -0.06 -0.13 -0.53 0.16 -0.05 0.15 -0.17 -0.04 0.18 -0.03 0.08 -0.06 0.49 -0.68 -0.15 -0.28
1.09 0.91 -2.99 -0.94 0.28 0.37 0.1 0.29 0.5 0.4 1.43 1.01 0.06 -3.15 -1.49 -2.85 -2.76 0.67 -0.83 -1.78 0.76 -3.38 - -0.88 0.56 0.08
0.09 -0.3 -0.63 -0.95 -0.99 -1.54 -0.71 -0.47 -0.9 -0.39 -0.51 -0.49 -0.91 0.15 -0.05 0.3 0.66 0.57 0.45 -0.07 1.19 0.51 0.85 -0.39 0.7 -0.05
0.08 0.01 -0.44 -0.36 -0.68 -0.83 -0.46 0.12 -0.05 -0.1 0.27 0.05 -0.65 -0.23 -0.67 0.01 0.27 0.11 0.46 -0.42 1.45 0.19 0.23 -0.57 0.3 -0.35
0.08 -0.07 -0.35 -0.51 -0.91 -1.18 -0.12 -0.25 -0.37 -0.26 -0.35 -0.29 -0.61 -0.24 -0.37 -0.05 0.24 -0.22 0.1 -0.34 0.97 0.6 1.15 0.11 0.77 -0.09
0.05 0.06 -0.18 -0.28 -0.89 -1.33 -0.22 -0.26 -0.22 0.03 -0.12 -0.05 -0.5 -0.23 -0.49 -0.22 -0.08 0.1 0.32 -0.59 1.06 0.77 0.58 -0.63 0.92 -0.11
0.66 0.57 0.42 0.09 -0.49 -1.67 -0.0 0.37 0.51 0.34 0.56 0.45 -0.38 -0.86 -0.37 0.32 0.21 0.36 -0.3 -0.21 0.41 -0.9 -0.92 -1.64 -0.14 -0.69
0.38 0.36 0.09 0.0 -0.18 -0.42 0.34 0.22 0.14 0.31 0.11 0.22 0.03 -0.2 -0.27 -0.01 0.22 -0.2 0.3 -0.09 0.02 -0.52 -0.02 -0.89 -0.25 -0.47
0.2 -0.16 -0.55 -0.69 -1.31 -1.36 -0.59 -0.43 -0.76 -0.34 -0.6 -0.39 -0.99 0.02 0.08 0.4 0.62 0.44 0.53 0.01 1.1 0.31 0.81 -0.52 0.65 -0.0
0.72 0.2 -0.24 -0.96 -0.54 -1.5 0.13 0.12 -0.67 0.06 -0.02 -0.31 -0.74 0.14 -0.97 0.26 0.4 0.68 0.65 -0.02 1.03 -0.19 0.3 -1.52 0.31 -0.86
-0.28 -0.14 -0.34 -0.86 -1.22 -1.47 -0.38 -0.34 -0.52 -0.16 -0.29 -0.55 -1.32 -0.23 -0.65 -0.05 0.06 0.13 0.15 -0.38 1.42 0.34 1.08 0.52 0.97 0.22
0.15 -0.32 -0.27 -0.45 -1.25 -1.42 -0.2 -0.15 -0.35 -0.37 -0.43 -0.51 -0.62 -0.19 -0.17 0.21 0.38 0.29 0.15 -0.22 0.96 0.61 0.85 0.21 0.65 -0.2
0.2 0.16 -0.04 -0.19 0.24 -0.15 0.44 0.02 -0.01 0.44 0.07 0.1 -0.37 0.4 0.08 0.4 -0.06 -0.27 -0.1 -0.14 -0.39 -0.35 -0.44 -0.28 -0.68 0.18
0.38 0.1 0.03 -1.43 -0.53 0.75 1.09 0.34 0.52 0.42 0.08 -0.34 -0.98 -0.28 -0.34 -2.49 -1.56 0.32 1.03 0.04 0.92 -2.06 -0.83 -1.11 -0.17 -0.19
0.22 0.11 0.0 0.08 0.24 0.18 0.43 0.44 0.17 -0.03 -0.31 -0.31 0.17 -0.39 0.02 -0.11 -0.22 0.32 0.26 -0.01 -0.2 -0.39 -0.22 -0.78 -0.03 -0.34
-0.37 -0.29 -0.36 -0.15 0.21 0.38 0.38 0.19 0.31 0.19 0.05 -0.25 -0.32 0.09 0.22 0.01 -0.1 -0.04 0.06 -0.16 0.17 -0.05 0.23 -0.53 -0.22 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.