Heatmap: Cluster_274 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g008680.3.1 (Solyc00g008680.3)
0.74 0.16 0.62 1.04 0.55 -0.07 -0.15 -0.24 -0.21 -0.42 -0.24 -0.07 -0.27 -0.17 -0.13 -0.4 -0.37 -1.2 -1.02 -0.06 -0.64 -0.04 0.16 0.06 0.02 0.23 0.07 -0.1 -0.19 -0.07 0.07 0.01 -0.47 0.51
Solyc01g021600.3.1 (Solyc01g021600.3)
2.94 -1.35 3.5 -0.88 -2.75 -2.57 -8.42 -3.0 -3.37 -3.97 -2.72 -2.43 -2.68 -0.65 -4.48 -3.05 -2.41 -7.12 -9.11 -4.55 -3.22 -3.01 -3.15 -2.59 -3.39 - -0.74 -2.0 -0.78 -2.34 -1.57 -1.54 -2.03 3.13
Solyc01g058140.3.1 (Solyc01g058140.3)
0.06 -0.55 -1.42 -1.27 -0.08 0.21 0.16 -0.68 0.04 0.42 0.56 -0.15 1.19 0.56 0.27 0.02 0.34 -5.08 -4.89 -0.63 -0.33 0.04 0.01 -0.01 -0.07 0.55 0.51 0.22 0.07 0.18 0.14 0.52 -1.5 0.09
Solyc01g067720.3.1 (Solyc01g067720.3)
0.57 0.06 1.48 1.81 -0.08 -0.54 -0.94 -0.16 0.44 -0.11 -0.67 -0.65 -0.27 -0.85 0.31 -0.02 0.05 -2.62 -3.89 -0.78 -0.68 -0.02 -0.1 -0.02 -0.02 0.02 -0.06 -0.15 -0.2 -0.11 -0.02 0.04 -2.28 0.77
Solyc01g068330.3.1 (Solyc01g068330.3)
0.41 1.22 -0.16 -0.21 -0.02 -0.11 1.12 -0.22 0.26 0.24 0.37 0.04 0.92 0.51 -0.16 -0.41 -0.25 -5.86 -5.26 -0.86 -0.08 -0.27 0.16 -0.03 -0.34 0.2 -0.09 -0.17 -0.36 -0.26 -0.1 -0.1 -2.27 0.28
Solyc01g087870.3.1 (Solyc01g087870.3)
0.67 -0.4 0.96 2.44 -0.41 -0.63 0.16 -0.64 0.2 0.23 -0.43 0.03 -0.27 0.05 0.89 0.5 0.65 -3.22 -2.83 -2.16 -1.73 -0.63 -0.09 -0.55 -1.09 -1.87 0.32 -0.06 -0.38 -0.17 -0.06 -0.75 -2.48 -0.05
Solyc01g090230.3.1 (Solyc01g090230.3)
1.16 -0.64 2.17 0.81 0.33 -0.41 -0.11 -0.9 -0.19 -0.06 -0.29 -0.48 0.04 -0.11 0.02 -0.14 0.02 -3.92 -4.12 -0.94 -0.04 -0.21 -0.39 -0.33 -0.47 0.11 -0.36 -0.32 -0.39 -0.24 -0.19 0.13 -2.38 0.95
Solyc01g096910.3.1 (Solyc01g096910.3)
0.51 0.68 0.67 1.03 0.06 -0.01 0.87 0.0 0.33 0.16 0.51 0.36 0.62 0.48 0.21 -0.19 0.08 -4.55 -3.56 -0.78 -0.35 -0.44 -0.3 -0.53 -1.02 0.1 -0.23 -0.61 -0.88 -0.49 -0.3 -0.58 -1.44 0.54
Solyc01g098160.3.1 (Solyc01g098160.3)
0.71 -0.24 0.89 0.87 -0.12 -0.21 0.8 -0.55 0.32 -0.29 0.36 0.14 0.71 0.35 -0.25 -0.33 -0.27 -6.68 -6.05 -0.12 0.21 -0.45 -0.14 -0.18 -0.44 0.22 -0.3 -0.18 -0.27 -0.38 -0.34 -0.59 -1.59 1.14
Solyc01g099330.3.1 (Solyc01g099330.3)
1.66 3.26 -3.5 -0.02 -1.25 1.08 -3.82 -1.16 -3.65 -1.41 0.88 0.64 1.04 0.69 -5.54 - - - - -3.86 -3.82 -4.35 -0.59 -2.3 -3.09 -2.27 -0.48 -1.14 -1.53 -4.25 -2.65 -3.44 -2.07 2.62
Solyc01g109050.2.1 (Solyc01g109050.2)
0.69 1.91 0.0 0.93 -0.42 -1.14 0.15 -2.4 -0.62 -0.47 0.45 -0.29 0.27 -0.36 0.04 -0.41 -0.28 - - -1.59 -0.54 -0.96 -0.28 -0.72 -0.91 -1.57 0.05 -0.04 0.39 -0.39 -0.38 -0.07 -2.81 2.4
Solyc01g111890.3.1 (Solyc01g111890.3)
0.54 -0.8 1.02 0.36 0.18 -0.33 1.07 -0.33 0.2 0.51 0.44 -0.4 0.57 0.04 0.63 0.73 0.58 -5.06 -4.32 -1.95 0.26 -0.44 -0.36 -0.47 -0.77 -0.31 -0.12 -0.25 -0.46 -0.37 -0.3 -0.29 -2.37 0.75
Solyc01g112250.3.1 (Solyc01g112250.3)
1.16 -0.09 1.05 1.44 0.22 -0.46 -0.52 -0.92 0.05 -0.46 0.12 -0.39 0.07 -0.41 -0.58 -0.71 -0.65 -3.02 -2.57 -0.34 -0.31 -0.07 -0.0 0.0 -0.19 -0.11 0.24 0.17 -0.02 0.02 0.02 -0.06 -1.18 1.16
Solyc02g036330.3.1 (Solyc02g036330.3)
0.5 -0.58 -1.05 -1.31 -0.03 0.07 0.15 -0.57 0.21 -0.04 0.04 -0.08 0.44 0.45 0.33 0.14 0.14 -6.49 -7.24 0.06 0.12 0.04 -0.01 0.11 0.16 0.98 0.17 0.28 0.16 0.12 0.1 0.27 -1.43 0.46
Solyc02g062810.3.1 (Solyc02g062810.3)
-0.41 1.0 0.75 1.46 -0.26 -0.38 -0.19 -0.01 -0.5 -0.28 0.04 0.21 0.17 0.34 0.31 -0.05 0.23 -4.04 -2.99 -0.58 -0.16 -0.22 0.07 -0.0 -0.16 -0.02 0.06 0.01 0.0 -0.21 -0.16 -0.14 -2.0 0.43
Solyc02g069230.3.1 (Solyc02g069230.3)
0.53 -0.33 0.18 -0.23 -0.04 -0.28 0.71 -0.94 0.31 0.13 0.18 -0.05 0.66 0.5 0.17 0.07 0.12 -11.47 -10.75 -0.16 0.21 -0.01 -0.01 0.06 -0.12 -0.38 0.06 0.09 0.09 -0.01 0.06 0.22 -1.65 0.76
Solyc02g077120.3.1 (Solyc02g077120.3)
1.27 - 1.57 -3.55 2.2 0.11 0.28 1.51 1.3 0.33 -0.84 -2.56 - -4.35 -2.18 -2.74 -1.83 - -5.68 -3.69 -2.01 -0.44 -1.94 -1.25 -0.89 -0.51 -3.06 -2.1 -2.24 -0.77 -1.06 -0.99 0.44 2.84
Solyc02g077130.2.1 (Solyc02g077130.2)
1.65 - 1.3 -4.12 0.93 0.13 -0.34 1.71 1.31 0.01 -1.68 -1.19 - - -1.74 -0.97 -1.49 - -4.51 -2.05 -2.31 -0.48 -0.82 -0.56 -0.24 0.54 -1.24 -1.5 -1.44 -1.43 0.29 -0.83 0.15 2.74
Solyc02g080290.3.1 (Solyc02g080290.3)
1.29 -4.19 2.45 -1.01 0.12 0.38 1.08 0.12 0.91 0.17 -0.72 0.31 0.53 0.58 -2.9 -3.45 -2.72 -1.54 -2.11 -2.72 -1.03 -0.19 -0.9 -0.8 -1.0 -1.95 -1.72 -1.19 -1.08 -0.16 0.22 0.1 -0.97 1.56
Solyc02g080340.3.1 (Solyc02g080340.3)
0.19 0.26 0.41 1.12 -0.21 -0.6 1.03 -0.48 0.54 0.04 -0.61 -1.1 0.15 -0.22 1.02 0.55 0.58 -0.45 -1.59 -1.01 -0.1 -0.37 -0.22 -0.22 -0.32 0.09 -0.18 -0.01 -0.08 -0.37 -0.32 -0.35 -3.67 0.28
Solyc02g080470.3.1 (Solyc02g080470.3)
-0.31 0.36 0.67 1.03 0.4 0.08 0.26 -0.16 0.06 -0.33 -0.02 -0.21 0.18 0.19 0.46 0.21 0.22 -0.86 -1.46 -0.59 -0.17 -0.2 0.16 -0.02 -0.26 -0.16 0.22 0.03 -0.1 -0.13 -0.0 -0.3 -3.26 0.07
Solyc02g087900.3.1 (Solyc02g087900.3)
-0.54 0.1 0.19 0.42 0.92 -0.08 1.07 -0.65 -0.24 -0.3 -0.26 -0.34 0.01 -0.12 0.05 -0.08 -0.08 -4.09 -4.67 -0.27 0.41 -0.21 0.08 0.07 0.01 0.65 0.19 0.2 0.1 -0.07 -0.09 -0.03 -2.23 0.86
Solyc03g006510.3.1 (Solyc03g006510.3)
0.56 -0.01 1.06 1.28 0.94 0.14 -0.0 -0.66 0.46 -0.87 0.36 0.62 0.68 0.89 -0.46 -0.73 -0.49 -8.47 -11.07 0.29 0.3 -0.6 -0.57 -0.58 -0.62 0.26 -0.7 -0.74 -0.73 -0.58 -0.57 -0.66 -1.1 0.62
Solyc03g025150.3.1 (Solyc03g025150.3)
-0.19 -0.41 -0.41 -0.2 0.45 -0.01 1.01 -0.76 0.33 -0.03 0.14 0.13 0.4 0.18 0.09 0.22 0.13 -2.79 -3.3 -0.03 0.34 -0.03 0.09 0.13 -0.13 0.34 -0.04 0.14 0.12 -0.07 -0.04 0.08 -3.09 0.58
Solyc03g033460.3.1 (Solyc03g033460.3)
0.89 0.16 1.88 1.14 0.43 0.12 0.56 -0.52 0.19 0.29 0.03 -0.59 0.51 -0.08 0.3 0.38 0.37 -4.77 -4.06 -1.11 -0.81 -0.61 -0.63 -0.82 -0.96 -0.29 -0.76 -0.78 -0.96 -0.5 -0.38 -0.52 -1.72 0.85
Solyc03g046207.1.1 (Solyc03g046207.1)
1.01 -0.58 -0.26 -0.48 -0.73 -0.59 0.78 -0.46 0.6 0.62 0.34 0.04 0.45 -0.84 0.39 0.01 -0.16 -1.45 -1.7 -1.32 -0.13 0.47 -0.04 0.03 -0.06 -0.4 0.04 0.14 -0.17 0.24 0.56 0.51 -3.27 0.35
Solyc03g093460.3.1 (Solyc03g093460.3)
0.08 -0.04 1.88 0.69 -0.24 0.25 0.06 0.36 0.27 0.3 0.76 0.09 0.13 -0.38 0.65 0.74 0.79 -5.79 -6.52 -5.26 -2.08 -1.15 -0.5 -0.9 -1.73 -3.32 0.15 0.12 -0.26 -0.94 -0.6 -1.89 -0.18 1.33
Solyc03g097280.3.1 (Solyc03g097280.3)
-0.15 1.23 -0.36 -0.16 0.11 0.17 0.48 0.04 0.8 0.22 0.32 0.07 0.71 0.4 -0.11 -0.17 -0.22 -8.18 -8.39 -0.87 -0.24 -0.17 0.28 0.03 -0.37 0.18 0.22 0.1 -0.13 -0.18 -0.03 -0.2 -2.24 0.12
Solyc03g097290.3.1 (Solyc03g097290.3)
0.14 1.04 0.22 -0.01 0.44 0.38 0.72 0.32 0.05 -0.18 0.32 0.23 0.65 0.63 0.03 -0.25 -0.22 -7.94 -8.35 -0.33 -0.36 -0.38 -0.13 -0.34 -0.58 0.42 -0.08 -0.22 -0.3 -0.42 -0.29 -0.32 -1.38 0.61
Solyc03g098150.3.1 (Solyc03g098150.3)
-0.13 -0.11 -0.16 0.26 1.25 0.45 0.73 -0.55 0.32 -0.22 0.26 0.14 0.75 0.7 0.09 0.01 -0.05 -4.59 -5.12 -0.61 -0.18 -0.54 -0.2 -0.32 -0.71 -0.15 0.21 0.05 -0.33 -0.25 -0.11 -0.44 -2.59 1.07
Solyc03g114890.3.1 (Solyc03g114890.3)
3.22 -0.93 0.82 2.43 -0.89 -1.28 -0.17 -3.67 -0.26 -0.5 -0.56 1.15 -2.95 -3.32 0.92 0.92 0.47 -4.39 -5.09 -4.72 -4.55 -4.16 -0.45 -0.98 -2.1 -2.24 -5.71 -3.92 -1.73 -5.65 -4.02 -2.34 -3.21 1.37
Solyc03g115680.3.1 (Solyc03g115680.3)
0.29 -0.94 0.19 0.02 0.59 -0.3 0.99 -0.25 0.39 0.62 0.61 0.07 0.53 0.08 0.58 0.43 0.45 - - -0.38 -0.18 -0.43 -0.12 -0.23 -0.76 0.45 -0.26 -0.29 -0.56 -0.45 -0.23 -0.62 -3.56 1.04
Solyc04g007060.3.1 (Solyc04g007060.3)
2.26 0.24 0.44 1.34 -0.17 -0.31 -1.57 -0.99 -0.65 -0.52 0.52 0.14 -0.71 -1.17 -0.73 -1.36 -0.84 - - -2.02 -1.14 0.42 0.2 0.16 -0.06 -1.59 -0.21 -0.19 -0.31 0.28 0.34 0.13 -1.29 1.58
Solyc04g011350.3.1 (Solyc04g011350.3)
1.38 -2.43 2.39 1.9 0.02 -0.72 -1.12 -0.37 -0.33 -0.48 -1.58 -0.92 -1.96 -1.71 0.16 -0.6 -0.43 -4.08 -4.86 -1.15 -1.19 -0.39 0.46 0.25 -0.03 -0.28 0.26 -0.04 -0.54 -0.25 -0.19 -0.93 -1.77 1.27
Solyc04g011990.2.1 (Solyc04g011990.2)
2.24 0.53 0.83 3.04 0.61 -1.52 -3.6 -2.99 - -0.47 -2.37 -3.46 - - -1.09 -0.26 -1.25 - - -0.86 - -0.91 -0.82 0.47 0.97 - -0.43 0.61 0.79 -1.05 -1.72 -0.83 -2.97 1.36
Solyc04g049450.3.1 (Solyc04g049450.3)
1.41 0.45 0.97 2.62 -0.17 -0.75 -0.99 -0.88 -0.12 -0.75 -1.11 -0.55 -0.43 -0.28 0.28 -0.65 -0.67 -12.38 -12.44 -2.16 -2.03 -0.06 -0.07 -0.05 -0.22 -2.07 0.44 0.2 0.14 0.07 0.11 -0.09 -2.19 0.39
Solyc04g074790.2.1 (Solyc04g074790.2)
2.03 0.45 1.73 0.16 -0.89 -0.1 -0.14 -0.65 0.12 -0.02 0.06 -0.2 0.64 -0.35 -1.26 -1.59 -1.59 - - -1.7 -0.99 -0.07 -0.29 -0.4 -0.45 -1.41 -0.51 -0.45 -0.83 -0.23 -0.04 -0.37 -0.41 1.96
Solyc04g076380.3.1 (Solyc04g076380.3)
0.38 -0.45 -0.71 0.24 0.37 -0.16 0.48 -1.03 0.27 0.25 0.15 -0.48 1.19 0.37 0.25 -0.05 0.0 -6.51 -6.54 -0.68 0.19 0.11 0.11 0.25 0.1 0.21 -0.02 0.04 0.07 -0.04 0.03 0.18 -1.69 0.39
Solyc04g080790.3.1 (Solyc04g080790.3)
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Solyc05g005870.3.1 (Solyc05g005870.3)
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Solyc05g006540.3.1 (Solyc05g006540.3)
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Solyc05g007110.2.1 (Solyc05g007110.2)
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Solyc05g009540.3.1 (Solyc05g009540.3)
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Solyc05g009740.1.1 (Solyc05g009740.1)
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Solyc05g012130.3.1 (Solyc05g012130.3)
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Solyc05g014640.3.1 (Solyc05g014640.3)
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Solyc05g052850.3.1 (Solyc05g052850.3)
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Solyc06g009330.3.1 (Solyc06g009330.3)
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Solyc07g052830.3.1 (Solyc07g052830.3)
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Solyc07g053980.3.1 (Solyc07g053980.3)
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Solyc08g006420.3.1 (Solyc08g006420.3)
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Solyc08g077800.3.1 (Solyc08g077800.3)
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Solyc08g077920.3.1 (Solyc08g077920.3)
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1.99 -0.61 0.56 0.87 0.74 -0.12 -0.69 -0.55 0.43 0.65 -1.77 -2.1 -1.19 -1.95 0.88 0.95 1.08 -4.87 -5.0 -0.18 -1.87 -0.34 -0.82 -0.43 -0.42 0.5 -0.98 -0.75 -0.82 -0.3 -0.31 0.08 -1.59 1.0
Solyc11g064920.2.1 (Solyc11g064920.2)
0.89 -1.01 1.74 0.89 1.11 -0.22 -1.34 -1.77 -0.77 0.43 -0.87 -0.8 -1.13 -1.21 0.47 0.62 0.65 -2.87 -1.31 -1.02 -1.04 -0.06 -0.43 -0.12 0.15 -1.02 -0.14 0.03 0.29 -0.14 -0.22 0.23 -2.02 1.17
Solyc11g065910.1.1 (Solyc11g065910.1)
3.08 - -0.75 -3.14 -3.43 -0.23 0.83 - - - 0.4 0.85 0.78 0.88 2.18 1.61 1.24 - - -0.89 0.06 -3.61 -5.04 -2.98 -5.14 - -2.69 -3.67 -2.36 -4.69 -2.06 -3.82 -5.83 1.5
Solyc11g066500.2.1 (Solyc11g066500.2)
-0.17 -0.07 0.23 0.52 1.22 0.38 1.06 -0.47 0.69 0.34 0.51 -0.32 0.12 0.04 0.14 0.03 -0.01 -9.58 -8.38 -0.22 -0.02 -0.51 -0.01 0.07 -0.4 0.48 -0.24 -0.37 -0.65 -0.63 -0.34 -0.52 -3.86 0.64
Solyc11g066730.2.1 (Solyc11g066730.2)
0.34 -0.84 1.4 0.41 1.28 0.4 1.0 -0.6 -0.02 -0.15 0.07 -0.72 0.84 0.45 0.23 -0.09 0.03 -5.83 -6.89 -1.23 -1.46 -0.76 -0.5 -0.71 -1.16 -0.71 -0.0 -0.33 -0.36 -0.43 -0.39 -0.47 -2.03 1.65
Solyc11g070100.2.1 (Solyc11g070100.2)
1.09 -0.19 -0.23 -0.02 0.28 -0.57 1.33 -0.64 -0.09 -0.28 0.05 -0.19 -0.05 -0.27 -0.58 -0.66 -0.77 -4.37 -5.55 0.05 0.47 0.34 -0.17 -0.06 -0.0 0.14 -0.09 0.04 -0.08 0.33 0.33 0.63 -2.61 0.92
Solyc11g071600.2.1 (Solyc11g071600.2)
3.79 -4.58 3.18 1.21 -0.61 0.71 -7.57 -5.16 -2.32 -2.91 -6.91 -5.01 - - -1.8 -2.19 -1.95 - - -3.04 -3.52 - - -6.38 -9.15 -1.73 - -7.64 -7.49 - -7.92 -8.06 -6.13 2.25
Solyc12g010015.1.1 (Solyc12g010015.1)
1.32 -0.5 0.44 -1.05 -1.46 -0.31 -0.92 -0.14 -0.37 0.63 0.87 -0.19 -0.15 -1.05 0.65 0.65 1.32 - -9.05 -0.06 -1.47 0.18 -0.55 -0.15 -0.33 0.12 -0.35 -0.04 0.06 0.08 0.21 0.45 -0.89 0.56
Solyc12g019460.2.1 (Solyc12g019460.2)
1.26 -0.51 0.88 -0.14 -0.08 -0.22 0.24 -0.93 0.06 -0.08 -0.42 -0.59 -0.13 -0.27 0.08 0.14 0.17 0.83 0.41 -0.77 -1.15 -0.31 -0.34 -0.29 -0.25 0.18 -0.36 -0.21 -0.19 -0.24 -0.28 -0.13 -1.21 1.12
Solyc12g042200.2.1 (Solyc12g042200.2)
-0.32 0.92 -0.59 0.32 0.28 0.33 0.25 0.32 0.06 -0.01 0.41 -0.06 1.24 0.65 0.01 -0.16 -0.31 -3.25 -5.14 0.28 0.99 -0.56 -0.14 -0.29 -0.43 0.58 -0.41 -0.58 -0.7 -0.7 -0.62 -0.48 -1.5 0.22
Solyc12g062280.2.1 (Solyc12g062280.2)
0.28 0.46 0.27 1.09 1.26 0.07 0.78 -0.33 0.51 0.24 0.38 0.09 0.3 0.16 -0.25 -0.9 -0.57 -8.73 -9.86 -0.9 -0.63 -0.21 0.13 -0.07 -0.52 0.02 0.12 -0.14 -0.44 -0.2 0.04 -0.3 -1.94 0.29
Solyc12g099910.2.1 (Solyc12g099910.2)
-0.77 0.07 -0.34 -0.14 0.43 -0.02 0.1 -0.59 -0.22 0.39 0.22 0.14 0.71 0.51 1.33 1.07 0.86 -2.87 -2.81 -0.05 0.57 -0.49 -0.32 -0.35 -0.66 0.55 -0.34 -0.3 -0.43 -0.56 -0.48 -0.39 -3.99 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.