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Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - 3.43 - - - - - 3.29 - - - - - 2.45 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.71 - - - 2.5 2.61 1.22 1.04 - - - 1.12 - - 0.92 - - 1.35 0.66 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.72 - - 1.98 - - - - - - 2.41 3.44 - - - - - - 1.37 - - - -
- - - 2.3 - - 0.64 2.24 - - 1.6 - 1.07 3.27 - - - - - - - - - - - -
- - - 2.65 - - - - - - - - - - 4.04 1.71 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
0.75 -1.12 -3.14 0.42 -1.89 2.33 -0.47 0.46 -0.77 -1.48 -1.8 -0.95 -0.83 -0.36 -0.5 0.4 0.37 0.47 0.24 -0.04 -0.9 -1.39 0.07 -0.47 -0.31 0.63
- - - - - - - - - 3.74 - - - 3.66 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.27 - - - 4.4 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.86 - - - - 1.75 - - - - - 3.69 2.61 - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.75 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.25 - - - - 2.06 - 1.48 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.48 3.2 - 2.27 1.48 - - - - - 2.68 - -
- - - - - - - - -0.28 - 0.92 1.01 - 1.68 2.2 1.43 1.94 -1.0 2.09 -0.78 - -0.8 - - -1.02 -0.91
-0.03 - 0.51 - -0.02 - - - - - 1.84 1.95 - 0.11 1.77 2.0 - -0.26 - 0.19 1.91 - -0.1 - - -
- 1.38 -0.64 -0.68 - -0.39 - -0.42 -0.65 -0.75 - -0.54 -0.74 - 2.08 -0.49 -0.44 - - -0.72 -1.08 0.55 1.53 2.29 -0.28 0.37
2.09 - - - - - - 2.42 - - - - - - 3.62 - - - - - - - 2.02 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - 1.85 - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
1.28 - 1.65 - 0.13 2.76 0.43 - 2.05 - - 0.52 0.86 0.77 - - - 1.09 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - 2.99 - - - - - - -
- - -0.41 - - 1.81 - - - - - - - 4.14 0.5 - - - - 1.44 - - - - - -
- - 1.25 - - - - 2.31 - - - - 2.97 - 2.97 - - - - - - - 0.59 - 0.58 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - 2.97 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- -0.47 - - - - 3.09 0.52 0.46 - 2.36 -0.51 -0.17 -0.25 1.63 - - - - - - -0.86 - - -1.28 1.22
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.27 -0.09 -2.54 0.57 0.1 0.11 -0.25 0.18 0.6 -0.45 -0.56 -0.86 0.01 1.97 -0.37 -0.05 -1.45 -0.94 0.08 -1.01 -1.29 0.12 -0.44 -2.94 0.84 0.44
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - - - 3.22 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.11 - - - 3.09 - 3.15 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.13 -0.2 -0.44 - - -0.56 0.7 -0.36 -0.55 - 2.33 2.83 - - -0.46 1.39 -0.16 - -1.11 - 0.66 -
- - - - - - - - - - - - - - 3.67 - 3.73 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.7 - 2.85 - - - 2.54 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - - 3.75 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.82 - 3.57 - - - - - - - - - - - -
1.93 - - - - - 2.9 1.26 1.36 - - - 1.67 - 2.73 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.03 - - - - - - - - 4.48 0.74 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.39 - - - 3.78 - - - - - - - 2.82 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.66 3.74 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.