Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.69	-	-	2.24	-	-	-	-	3.71	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.79	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000073.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000076.18	-	-	3.26	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.91	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000093.183	-	-	-	-	-	3.87	-	3.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000101.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000114.65	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000189.43	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000219.98	-0.97	-0.03	-	-0.62	-0.32	-3.1	-1.89	-0.28	-0.63	-1.11	-0.26	-2.91	0.01	1.64	-0.08	-0.92	-0.22	-0.24	-0.35	0.56	0.45	-0.02	-	2.9	-1.62	-3.58
Cpa\|evm.model.tig00000334.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000342.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000342.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000545.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000605.40	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000630.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000764.4	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000792.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	4.28	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000826.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001049.28	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.35	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001128.24	-	-	-	-	-	-	-	3.3	-	-	-	3.51	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001177.8	-	-	-	-	-	2.18	0.37	-	-	-	-	0.03	-1.18	-	1.0	-	1.07	-1.22	-	1.35	2.01	-	-	2.87	-1.69	-
Cpa\|evm.model.tig00001525.14	-	1.44	1.19	0.27	-0.11	0.2	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	0.33	-	2.07	1.02	-	-	-	-	2.59	0.55	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020510.102	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020510.107	-	-	-	-	-	-	-	4.16	-	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020564.28	-1.31	-4.26	-	-	-	-	-	-4.18	-4.27	0.92	2.17	2.24	-1.19	-4.98	-4.48	-	-4.42	-5.14	-	-4.72	1.11	0.12	-5.05	3.17	-2.23	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020564.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	2.33	2.32	-1.74	-	-2.26	-	-	-2.32	-2.18	-	1.37	-2.57	-2.55	3.28	-	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020564.30	-1.93	-	-	-	-	-	-	-1.85	-0.98	1.09	2.1	1.42	-0.38	-	-	-	-1.83	-	-	-	1.41	-	-0.03	3.29	-1.74	0.12
Cpa\|evm.model.tig00020660.45	-	-2.59	-	-	-	-	-	-	-	-4.6	-4.55	-	-	-	-2.25	-	-0.15	-0.28	-1.39	-	2.42	0.61	-0.02	3.16	1.23	2.1
Cpa\|evm.model.tig00020693.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020693.48	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020753.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020805.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020904.141	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020912.70	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020934.56	-	-3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.94	-	-	-	-	-	-	1.33	-	-3.43	4.43	-0.73	-0.08
Cpa\|evm.model.tig00020934.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.61	-	-	-	-0.8	-	-	-0.41	-4.21	-4.33	4.51	0.6	-1.93
Cpa\|evm.model.tig00020936.13	3.6	-	-	-	-	-	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020952.40	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021037.24	-	-	-	-	-	-	-	1.99	2.09	-	-	-	-	0.29	-	-	-	1.35	2.37	0.5	1.16	-	-	2.0	0.26	-
Cpa\|evm.model.tig00021038.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021044.4	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021045.7	-	-	-	-	-	-	-	3.64	-	-	3.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021070.41	-	-	-	-	1.09	-	1.59	3.01	1.38	-	-	-	-	-	1.14	-	-	-	2.03	-	-	-	-	-	-	1.97
Cpa\|evm.model.tig00021070.83	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021098.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021135.48	-	-	-	-	1.22	-	-	-	-	3.24	1.04	-	-	1.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.26	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.46	-	-	-	-	-	1.7	2.0	4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.22
Cpa\|evm.model.tig00021144.8	-	-	2.46	-	2.13	-	-	-	-	-	-	-	-	1.64	-	-	-	1.48	-	-	-	-	-	3.35	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021145.3	-	-	-	-	0.94	-	-	4.26	-	-	0.76	-	-	-	-	-	-	-	1.68	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021293.4	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.18	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021294.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021326.9	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021357.60	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021504.12	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021532.21	-	-	-	0.69	1.44	-	-	-	0.87	-	-	-	-	-	0.65	-	-	2.61	-	-	-	-	1.23	3.13	0.07	-
Cpa\|evm.model.tig00021534.9	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021572.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.9	-	-	-	-	2.96	0.69	0.08	-	-	3.13	-	2.29
Cpa\|evm.model.tig00021682.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.