Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.69 - 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - 2.87 - - 2.97 - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.09 - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - -
- - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
0.71 - - - - - 1.17 3.76 0.84 - - 2.13 - - - - - 0.13 - - - - 0.34 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.71 4.08 - - - - - - 1.35 - - - - - - - - - - -
- 3.46 - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.15 - 3.32 - -0.21 - 0.93 2.6 - - - - 0.25 - - 1.22 - - 1.45 - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.58 - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.