1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - 2.83 - - - - - - 4.24 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.5 -0.26 -0.55 -0.48 -1.06 -1.82 -1.18 -1.13 -1.55 -1.8 -1.59 -1.36 -0.55 0.97 0.04 -1.17 -0.72 2.18 1.17 2.6 -0.19 -0.99 -3.2 -0.98 -1.32 -3.37
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - 2.85 3.55 - - - - - -
- - - - - - 2.99 - - - - 0.73 - 1.28 - - - - 3.38 - - 0.25 - 1.25 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - 3.66 - - - - - - -
- - - 1.41 - 2.23 0.4 - 0.44 - - - 0.29 - - 0.54 - 2.18 3.13 - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.69 - - - - - - - - 4.29 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
0.53 -0.04 -0.19 0.15 -0.44 -1.42 -0.55 -0.46 -1.0 -1.01 -0.38 -0.38 0.4 0.57 -0.53 -1.31 -1.36 1.89 0.63 2.04 -0.68 -1.14 -2.01 -0.48 -0.74 -2.09
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
0.15 0.51 0.31 0.21 0.01 -0.53 -0.9 -0.92 -1.56 -1.47 -1.29 -0.99 0.09 0.65 0.28 0.07 -0.15 1.55 0.56 1.96 -1.49 -1.13 -2.5 -0.67 -0.8 -1.24
-0.65 -0.17 0.22 -0.03 0.12 -0.14 0.44 -0.12 -0.22 -0.18 -0.19 -0.98 -0.77 0.81 1.0 0.98 1.01 -0.38 0.55 1.01 -1.72 -1.3 -2.17 -0.84 -1.72 -0.8
0.26 0.64 0.97 0.4 -0.7 -1.27 -0.44 -0.41 0.07 0.22 0.24 -0.14 -0.08 0.94 0.92 0.93 0.4 0.21 0.59 0.91 -4.01 -5.9 - -1.94 -6.26 -1.99
-1.75 -1.02 -0.34 -0.24 0.04 -0.05 0.12 -0.15 0.23 0.69 0.56 0.24 -1.9 1.18 1.25 1.13 0.99 -0.03 0.42 0.45 -4.99 -4.73 -1.52 -1.18 -2.89 -1.44
- - - - - - 1.22 2.23 1.06 0.9 - 1.11 - - - 1.0 - - - 3.44 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - 2.56 - - - -
0.17 -0.83 -0.37 -0.16 -0.46 -0.54 -0.55 -2.79 -1.98 -3.11 - -2.89 -2.6 1.36 1.07 1.3 1.36 -0.55 1.95 1.14 -1.94 -1.04 -3.38 -0.81 -0.31 0.11
-0.54 -0.57 0.1 -0.16 0.18 0.03 0.8 0.42 0.21 0.14 -0.58 -0.75 -0.95 0.43 0.53 0.86 1.06 0.24 0.64 1.04 -3.64 -1.91 -1.56 -1.28 -1.62 -1.05
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - 3.96 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.35 - - - - - 4.39 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
0.03 -1.09 0.33 - -0.96 - -0.46 -0.64 -0.68 - 0.28 - - 0.84 0.16 1.65 -0.43 0.79 1.29 2.76 - -0.06 - - -0.31 -
- - - - - - - -0.45 - - - - - - - - - - 4.56 - - -0.87 - - - 0.11
- - - - - - - - - - - - - -1.08 - - -2.46 - - 4.66 -3.41 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - 1.13 - - - 1.2 - - - 1.0 - - 4.2 - 0.17 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - -0.62 - - -0.3 - -0.41 -0.31 - - 1.9 -0.41 -0.34 1.85 -0.91 3.14 2.24 - - - - - -
- - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.49 - - 3.88 - - - - - -
- - 1.98 - - - - - 1.8 - - - - 1.59 - - - - - 3.96 - - - - - -
0.78 0.66 - - - - - - - - - - - 0.5 - - - 2.05 1.88 2.49 0.15 1.29 1.57 - 0.41 -
- - - - - - 2.12 1.94 - 2.83 - - - - - - - - 3.06 - - - - - 1.24 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
0.11 - - - - - - - - - - - - 1.18 - 2.02 - 0.99 -0.82 3.79 - - 1.15 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - 2.28 -
- - - - -0.58 - - - - - - - 0.11 0.87 1.59 - 0.82 -0.82 2.96 2.41 - - - 1.13 - 0.85
- - - - - -1.1 - - - - - - - 0.63 - 0.85 1.39 1.47 2.21 2.71 0.26 - 0.1 0.5 - 0.98
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - 4.27 - - - - - - -
2.9 - - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - -
-3.08 -0.35 0.52 -0.02 -0.06 -3.16 -1.0 -3.18 -3.02 0.14 -0.59 - - 1.61 1.75 1.51 1.92 -0.34 0.71 1.37 -3.51 -2.39 - -1.18 - -1.69
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.