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Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.43 -0.17 -0.38 0.35 1.01 0.96 0.4 0.45 -0.91 -1.23 -1.12 -1.77 -1.13 -2.0 -1.35 -0.74 -0.62 0.4 0.28 -0.04 -2.76 0.53 0.23 0.1 1.49 0.55
-2.86 -2.1 -0.67 0.01 0.07 0.24 1.12 1.08 0.71 -0.09 -1.2 -2.05 -4.47 -1.51 -0.46 -0.17 0.43 1.02 0.69 0.74 -2.65 -1.28 -0.38 -0.54 1.31 0.07
-1.79 -0.06 -0.01 0.25 0.4 0.31 0.39 0.44 -0.34 -0.56 -0.64 -1.25 -2.51 -0.34 -0.13 0.3 0.19 0.79 0.64 0.55 -2.78 -0.28 0.35 -0.29 0.75 0.09
0.05 0.15 0.05 0.43 0.83 0.84 0.77 0.76 -0.73 -0.19 -0.44 -0.31 -0.15 -0.99 -0.04 -0.52 -0.29 0.24 0.17 0.37 -4.58 -1.39 -0.87 -0.83 0.37 0.22
-1.8 -0.27 -0.27 0.42 0.98 1.18 0.62 0.42 -0.62 -0.11 -0.25 -0.41 -2.09 -1.24 -0.84 -0.52 -0.08 0.61 0.16 0.2 -3.9 -0.91 0.48 -0.85 0.9 0.44
-1.45 -1.2 -0.17 0.34 0.23 0.15 0.86 0.76 0.63 -0.05 -0.67 -1.04 -1.92 -0.38 -0.18 0.4 0.17 0.53 0.18 -0.2 -2.43 0.27 -0.16 -0.1 0.59 0.14
-1.19 -0.59 -0.7 0.46 1.1 1.06 0.98 0.84 -0.79 -0.62 -0.99 -2.06 -2.81 -1.39 -1.0 -0.54 -0.41 0.23 0.51 0.28 -0.96 0.66 -0.11 -0.93 0.85 0.4
-0.82 -0.51 0.04 0.39 0.17 -0.15 0.43 0.42 -0.04 -0.25 -0.08 -0.25 -1.45 -0.29 -0.24 0.17 0.13 0.47 0.48 0.19 -1.81 -0.04 -0.19 0.25 0.44 0.29
-1.47 -1.42 -0.98 -0.02 -0.09 -0.18 0.81 0.55 0.43 -0.28 -0.69 -1.15 -2.08 -0.49 -0.44 -0.06 0.07 0.11 0.13 -0.51 -1.02 0.91 0.52 0.17 1.4 0.43
-2.15 -1.59 -0.72 0.41 0.6 0.52 1.45 1.01 0.91 -0.01 -0.52 -1.0 -3.2 -0.72 -0.2 0.12 0.02 0.27 0.2 0.02 -5.24 0.51 -0.85 -1.36 0.6 -0.36
-0.57 -0.21 -0.02 0.03 0.53 0.47 0.23 0.18 -0.22 -0.23 -0.5 -0.75 -0.92 -0.17 0.33 -0.11 0.22 0.5 0.55 0.52 -3.21 0.66 0.02 -0.6 -0.04 -0.14
-1.52 0.04 0.13 0.7 1.02 1.05 0.74 0.38 -0.49 -0.57 -0.45 -0.65 -2.83 -0.58 -0.56 -0.49 -0.31 0.57 0.12 -0.22 -2.19 -0.24 0.16 -0.16 0.45 0.26
-1.45 -0.37 -0.15 0.17 0.6 0.5 0.53 0.3 -0.6 -0.74 -0.78 -1.12 -2.1 0.0 0.18 -0.02 0.25 0.48 0.53 0.33 -2.39 -0.05 0.03 -0.2 0.68 0.71
-1.29 -0.62 0.12 0.26 0.32 0.34 0.67 0.82 -0.21 -0.05 -0.07 -0.9 -2.24 -0.33 -0.09 0.05 -0.53 0.35 0.51 0.5 -4.09 -1.31 0.29 -0.12 0.69 0.55
-3.24 -0.72 0.03 0.56 0.57 0.61 0.94 0.93 -0.42 -1.29 -2.34 -2.69 -4.32 -1.51 -0.67 -0.49 0.52 0.91 0.87 0.58 -3.31 -1.82 -0.68 -1.75 1.49 0.96
-2.33 -1.68 -0.63 0.16 0.02 0.21 1.26 0.99 0.77 -0.51 -0.93 -1.89 -3.13 -0.44 -0.7 0.07 -0.48 -0.14 0.06 -0.55 -2.68 1.22 0.3 -1.1 1.38 0.43
-3.01 -2.36 -0.78 -0.41 -0.61 -0.04 1.07 0.73 0.54 -0.11 -1.64 -2.62 -2.85 -1.05 -0.53 -0.14 -0.16 0.77 0.26 -0.13 -1.05 0.68 -0.02 0.45 1.83 0.24
-2.32 -1.36 -0.96 0.21 0.3 0.88 0.9 0.58 0.7 -0.55 -0.53 -0.78 -3.29 -0.62 -1.24 -0.84 -0.51 -0.73 -0.32 -0.74 -0.96 0.94 0.32 0.04 1.77 0.21
-2.85 -1.55 -0.34 0.24 0.4 0.46 1.15 1.0 0.58 0.02 -0.26 -0.65 -2.66 -0.27 -0.52 0.35 0.37 0.34 0.03 0.07 -1.61 0.11 -0.48 -0.34 0.39 -0.26
-0.96 -0.53 -0.47 0.16 0.6 0.73 0.75 0.64 -0.29 -0.24 -0.3 -0.54 -1.09 -0.75 -0.29 -0.43 0.19 0.57 0.56 0.68 -2.96 -0.66 0.18 0.01 0.24 -0.04
-2.37 -1.11 -0.32 -0.81 -0.12 0.65 1.1 0.52 0.88 -0.09 -0.27 -0.45 -2.99 0.37 -0.06 0.49 0.17 0.42 0.41 0.42 -1.69 -3.28 -0.47 -0.89 1.03 -0.13
-1.72 -0.31 -0.57 -0.06 0.54 0.72 0.35 0.27 -0.67 -0.63 -0.78 -0.79 -2.2 -0.35 -0.08 0.37 0.11 0.8 0.48 0.29 -2.74 -0.18 0.54 0.51 0.48 0.32
-1.68 -0.62 0.15 0.34 0.31 0.35 0.83 0.51 -0.41 -0.7 -0.45 -0.72 -2.82 -0.54 -0.26 0.28 0.26 -0.1 0.05 0.26 -3.06 -0.16 -0.04 -0.13 1.31 0.69
-0.42 0.07 -0.09 0.53 0.94 0.91 0.69 0.65 -1.2 -0.41 -0.58 -0.8 -0.79 -0.67 -0.39 0.44 0.23 0.32 0.4 0.33 -4.24 -2.08 -0.65 -0.34 0.48 -0.05
-1.2 -0.85 -0.29 0.22 0.37 0.56 1.21 0.95 0.56 -0.43 -0.95 -1.22 -1.9 -0.98 -0.39 0.01 0.15 0.66 0.32 0.02 -2.57 -0.11 -0.21 -0.7 0.77 0.11
-2.17 -1.06 -0.48 -0.06 0.11 0.08 1.06 0.75 0.42 -0.34 -0.97 -1.19 -2.36 -0.3 0.1 0.25 0.26 0.63 0.64 0.27 -2.97 0.22 0.11 -0.07 0.62 0.02
-1.23 -0.22 0.24 0.32 0.78 0.96 0.7 0.34 -0.75 -1.51 -1.93 -2.21 -1.56 -0.59 -0.07 0.71 0.88 0.93 0.62 0.64 -2.69 -2.01 -2.26 -2.16 0.95 0.16
-1.08 -0.5 -0.73 0.82 1.12 0.86 1.24 1.02 -0.58 -0.3 -0.93 -1.74 -2.51 -0.25 -0.44 -1.41 -0.15 0.41 0.48 0.49 -1.63 -1.56 -0.08 -1.49 0.4 0.4
-2.86 -1.25 -0.39 -0.09 0.72 0.71 1.05 0.69 0.13 -0.2 -0.28 -1.15 -3.34 -0.91 -0.76 -0.01 0.31 0.78 0.69 0.36 -2.05 -0.23 -0.16 -0.35 0.91 -0.31
-0.66 -0.21 -0.24 0.38 0.57 0.58 0.42 0.05 -0.53 -0.24 -0.11 -0.48 -1.15 -0.18 -0.38 -0.44 0.16 0.27 0.25 0.17 -2.73 -0.7 0.11 0.41 0.88 0.42
-0.74 -0.58 -0.03 0.02 0.11 0.5 0.98 0.66 0.7 -0.04 -0.37 -0.56 -1.18 -0.06 -0.01 0.39 0.18 0.48 0.21 0.22 -3.23 -1.18 -0.35 -0.54 0.32 -0.26
-2.7 -1.59 -0.58 0.35 0.56 0.91 1.37 1.11 0.77 -0.22 -0.99 -1.62 -2.65 -1.17 -0.73 0.04 -0.24 0.19 0.07 -0.17 -2.84 0.07 -0.07 -0.58 1.06 0.03
-1.5 -0.89 -0.39 0.04 0.19 0.02 0.76 0.69 0.39 -0.11 -0.65 -1.07 -1.78 0.07 0.09 -0.16 0.27 0.75 0.5 0.49 -1.93 -0.97 -0.61 -0.17 0.8 0.52
-2.72 -2.37 -0.86 0.4 0.02 0.07 1.15 1.05 0.9 0.24 -0.55 -1.23 -3.28 -1.11 -0.73 0.2 -0.12 0.3 0.05 -0.26 -1.86 0.19 0.75 -0.53 1.19 -0.19
-1.38 -0.34 -0.41 0.59 0.98 0.86 0.75 0.46 -0.77 -0.44 -0.38 -0.9 -1.92 -1.41 -0.75 -0.52 -0.34 0.47 0.09 0.04 -1.58 0.21 -0.25 0.14 1.03 0.5
-1.05 -0.78 -0.63 -0.01 0.39 0.59 0.76 0.75 0.38 0.01 -0.42 -0.93 -1.5 -0.13 0.03 0.14 0.05 0.42 0.27 0.27 -1.92 0.18 0.2 -0.9 0.11 0.24
-3.22 -1.22 -0.16 0.47 0.8 1.09 0.86 0.73 0.22 -0.61 -1.26 -1.41 -4.71 -1.08 -0.5 -0.06 -0.36 0.92 0.66 0.38 -2.73 -0.52 -0.74 -0.16 0.42 0.85
-1.26 -0.25 -0.18 0.18 0.75 0.57 0.33 0.29 -0.61 -0.42 -0.75 -1.13 -1.79 -0.13 0.19 -0.02 0.36 0.64 0.66 0.47 -1.83 -1.61 -0.52 0.24 0.51 0.67
-1.12 -0.11 -0.28 -0.14 0.59 0.91 0.57 0.5 -0.46 -0.61 -0.87 -1.08 -1.25 -0.5 -0.21 0.66 0.84 0.46 0.83 0.69 -2.84 -2.54 -1.08 -1.32 1.23 -0.87
-2.15 -1.26 -0.95 -0.33 0.06 0.15 1.31 0.86 0.59 0.22 -0.47 -1.07 -3.51 -0.62 -0.06 0.27 0.37 1.23 0.75 0.41 -1.2 -0.73 -1.28 -1.55 0.62 -0.23
-1.19 -0.6 -0.24 0.41 0.89 1.17 0.79 0.93 -0.59 -0.69 -1.13 -2.75 -3.18 -1.03 -0.67 0.3 0.14 0.74 0.91 0.49 -3.83 -0.89 -0.33 -1.17 0.89 -0.16
-0.76 -0.25 -0.31 -0.12 0.35 0.56 0.64 0.86 -0.51 -0.83 -1.04 -1.18 -1.64 0.39 -0.61 0.49 0.06 0.93 0.5 0.55 -1.47 -1.95 0.09 -1.61 0.68 0.48
-0.26 -0.12 -0.3 0.05 0.33 0.08 0.4 0.43 0.34 0.12 0.14 -0.03 -0.92 -1.0 -0.26 0.42 -0.05 0.42 0.1 0.0 -4.93 0.15 -0.02 0.09 0.55 -0.42
-3.18 -2.63 -0.68 -0.19 0.06 0.04 1.31 1.06 0.71 -0.15 -1.15 -1.93 -4.2 -1.31 -0.3 -0.14 0.28 0.46 0.62 0.48 -1.53 -0.5 0.94 -0.67 1.06 -0.07
-0.41 -0.27 -0.02 0.33 0.67 0.8 0.84 0.76 -0.65 -0.23 -0.26 -0.35 -0.65 -0.76 -0.11 -0.05 0.38 0.22 0.31 0.41 -3.75 -0.46 -0.42 -1.03 0.31 -0.31
-2.02 -1.34 -0.84 -0.37 -0.29 0.1 0.9 0.49 0.39 -0.57 -0.66 -1.11 -2.51 -0.8 -0.58 -0.18 -0.22 0.37 0.18 -0.14 -1.79 1.15 0.63 0.57 1.35 0.27
-1.6 -0.61 -0.5 -0.04 0.41 0.64 0.11 -0.3 -1.08 -0.31 -1.41 -0.68 -1.91 0.25 0.43 0.16 0.59 0.87 0.78 0.27 -2.33 -0.16 0.41 0.44 0.09 0.33
-3.14 -0.18 -0.51 0.18 0.58 0.18 0.52 0.5 0.3 -0.0 0.14 -0.27 -3.37 -0.8 -0.09 -0.32 -0.14 1.06 0.79 0.13 -4.73 -0.75 -0.33 0.65 0.28 0.13
-0.89 -0.52 -0.25 0.22 0.42 -0.0 0.89 0.59 -0.18 -0.53 -0.63 -1.1 -1.32 -0.63 -0.27 0.35 0.47 0.45 0.13 0.37 -3.94 -0.06 -0.72 -0.58 1.34 0.35
-2.19 -1.54 -0.18 -0.62 0.4 1.01 1.5 0.94 1.01 -0.63 -1.86 -1.98 -2.74 -0.93 -0.82 0.6 0.18 -0.31 0.42 0.08 -1.34 -1.43 -0.95 -0.08 1.22 -0.01
-2.97 -1.11 -0.35 0.13 0.69 0.99 0.63 0.61 -0.23 -0.09 -0.12 -0.02 -3.07 -0.21 -0.09 -0.24 0.12 0.68 0.43 0.64 -4.93 -2.15 -0.26 -0.45 0.7 0.43
-0.39 -0.74 -0.04 0.07 0.27 0.34 0.81 0.61 0.39 -0.24 -0.52 -0.65 -0.62 -0.34 -0.13 0.14 0.25 0.52 0.43 0.31 -2.69 -2.02 -1.33 -0.26 0.83 0.38
-1.58 -0.9 -0.32 0.15 0.08 -0.26 1.01 0.82 0.38 0.07 -0.39 -1.11 -1.79 -0.36 -0.04 0.19 0.42 0.72 0.45 0.65 -2.65 0.13 -0.28 -0.43 0.09 -0.03
-2.71 -2.34 -1.96 0.44 0.59 0.1 1.74 1.65 1.05 -0.18 -2.1 -1.62 -5.13 -2.27 -1.11 -0.87 -0.57 1.24 0.94 0.43 -0.74 -4.85 -3.34 -2.34 1.18 -0.51
-1.0 -0.58 -0.4 0.02 0.36 0.12 0.53 0.49 0.3 0.12 -0.23 -0.73 -1.31 -1.11 -0.66 0.96 -0.4 0.54 -0.02 -0.01 -3.2 0.71 -0.25 0.09 0.78 0.07
-1.9 -5.5 -2.02 0.44 0.35 0.64 1.43 1.38 1.52 0.71 -0.29 -2.18 - -5.67 -2.67 -2.3 -0.92 0.23 0.02 -1.2 -4.52 0.01 -4.59 -2.3 2.21 -0.05
-1.74 -1.0 -0.34 0.2 0.33 0.62 1.35 0.98 1.0 0.22 -0.16 -1.0 -1.79 -0.61 -0.27 0.14 -0.11 0.14 0.17 -0.11 -2.85 -0.59 -0.18 -0.54 0.29 -0.28
-2.53 -1.25 0.05 0.57 0.55 0.52 1.36 0.94 0.87 -0.11 -0.79 -0.93 -2.23 0.06 0.02 0.33 0.15 0.63 0.14 0.12 -4.7 -1.21 -1.51 -1.34 0.05 0.0
-1.76 -0.43 -0.41 0.09 0.77 0.82 0.86 0.57 -0.2 -0.96 -1.1 -1.94 -2.48 -1.14 -0.22 -0.02 0.31 0.82 0.84 0.51 -2.01 -0.45 0.47 -0.33 0.5 -0.03
-1.53 -0.27 -0.45 -0.2 0.52 0.62 0.5 0.23 -0.29 -0.39 -0.58 -0.88 -2.31 -0.27 0.17 0.22 0.24 0.6 0.67 0.37 -2.53 0.11 0.41 0.13 0.41 -0.04
-2.31 -1.57 -0.51 0.12 0.59 0.9 1.4 1.01 0.59 -0.49 -1.15 -1.91 -3.01 -0.83 -0.45 0.27 0.17 0.38 0.43 0.2 -2.03 0.07 -0.2 -0.93 0.61 -0.05
-0.82 -1.03 -1.09 -0.18 0.14 -0.04 1.05 0.72 0.54 -0.36 -0.37 -0.43 -0.65 -0.6 -0.51 -0.43 -0.7 -0.05 -0.36 -0.94 -1.23 1.13 0.28 -0.13 1.15 0.57
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-4.95 -0.91 -0.32 0.28 0.3 0.35 0.31 0.12 0.24 0.03 0.09 -0.46 -3.95 -0.63 0.07 -0.34 -0.08 1.23 0.55 0.26 -2.5 0.11 -0.17 0.2 0.99 -0.31
-0.89 -1.4 -0.86 -0.12 0.05 0.14 0.92 0.85 0.69 -0.17 -0.72 -1.3 -1.16 -0.86 -0.53 -0.16 -0.16 -0.03 -0.01 -0.28 -1.76 0.55 0.11 0.23 1.49 0.21
-2.44 -1.64 -1.43 0.08 0.38 0.82 1.6 1.22 1.02 -0.29 -0.64 -1.64 -3.18 -0.45 -0.74 0.25 -0.25 0.53 0.08 -0.08 -1.95 -0.17 -0.51 -0.68 0.86 -0.69
-2.12 -0.35 -0.69 0.28 0.9 1.15 1.31 1.24 -0.42 -0.76 -1.28 -2.25 -3.77 -1.01 -0.56 -0.33 0.42 0.66 0.78 0.64 -3.91 -1.92 -0.47 -1.36 0.84 -0.35
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-0.78 -0.25 -0.16 0.36 0.38 0.57 0.52 0.44 0.18 -0.0 -0.19 -0.16 -0.96 -0.4 -0.5 0.76 -0.52 -0.03 -0.2 -0.22 -2.92 0.19 -0.11 0.1 0.52 0.17
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0.15 0.37 0.12 0.67 0.99 0.8 0.73 0.75 -0.64 -0.26 -0.36 -0.75 -0.68 -1.6 -0.98 -1.22 -0.03 0.25 0.4 0.36 -5.32 -0.36 -1.21 -0.62 0.6 -0.08
-2.74 -3.15 -1.11 -0.46 0.23 0.29 1.37 1.07 1.14 0.48 -0.31 -1.19 -3.57 -1.19 -0.08 -0.15 0.48 0.54 0.4 0.29 -3.45 -0.07 -0.24 -0.87 0.71 -0.34
-3.59 -3.18 -1.78 -0.68 -0.35 -0.19 0.72 0.62 0.57 -0.2 -1.55 -3.03 -4.46 -1.11 -0.15 0.88 0.77 1.34 1.02 0.9 -2.96 0.46 -1.99 -2.06 1.3 0.47
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-1.56 -1.46 -0.42 -0.16 -0.28 0.02 0.69 0.58 -0.45 -0.24 -0.82 -1.05 -2.08 -0.2 0.26 0.38 0.64 0.8 0.78 0.44 -3.56 0.67 0.24 -0.4 0.55 0.05
-3.32 -3.34 -1.45 0.31 0.34 0.59 1.54 1.13 1.44 0.35 -1.17 -2.72 - -2.11 -1.46 -0.55 -0.24 0.17 0.68 0.66 -3.17 -1.04 -1.19 -2.19 1.62 0.0
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-0.98 -0.34 -0.39 0.59 1.37 1.18 0.98 0.94 -1.25 -1.3 -1.91 -3.05 -2.57 -0.7 -0.13 0.01 0.37 0.41 0.39 0.48 -4.32 -0.05 -0.95 -2.78 0.68 0.23
-3.03 -2.51 -1.01 -0.62 -0.77 -0.5 1.28 0.99 0.32 0.02 -1.07 -1.86 -3.1 -1.28 -0.4 0.25 1.2 1.17 0.9 0.89 -2.71 0.37 -0.37 -1.39 0.57 0.01
-1.61 -0.8 -0.16 0.41 0.23 0.45 1.08 1.03 0.38 -0.8 -0.65 -1.25 -1.61 -0.37 -0.29 0.02 -0.1 0.38 0.18 0.1 -2.72 0.34 -0.39 -0.51 0.79 0.34
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-2.45 -0.1 0.41 0.59 0.59 0.07 0.61 1.05 -0.17 -0.75 0.33 -0.9 -4.7 0.6 -0.79 -1.29 0.17 -1.0 -0.77 -0.28 -2.0 -1.05 -1.2 -3.99 1.97 0.93
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- -3.98 -1.35 -0.16 -0.26 -0.09 1.41 1.44 1.07 0.53 -1.18 -1.52 -4.72 -2.28 -1.35 -0.61 -0.15 0.94 -0.18 -0.01 -3.61 -0.73 -0.15 -0.87 1.81 0.62
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.