1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_77 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.75 0.36 1.0 0.22 0.23 0.13 0.1 0.16 0.18 0.22 0.43 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.35 0.09 0.16 0.01 0.0 0.0 0.12 1.0 0.17 0.8 0.71 0.76
0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.04 0.02 0.08 0.06 0.1 0.09 0.02 0.09 0.01 0.07 0.14 0.01 0.01 0.03 0.01 0.68 0.07 0.11 1.0 0.55
0.11 0.11 0.0 0.12 0.09 0.0 0.06 0.14 0.11 0.04 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.42 0.13 0.27 1.0 0.39
0.19 0.36 0.32 0.29 0.2 0.14 0.19 0.25 0.27 0.4 0.43 0.41 0.31 0.53 0.34 0.67 0.52 0.31 0.26 0.3 0.2 0.71 0.51 0.97 1.0 0.82
0.03 0.02 0.04 0.06 0.08 0.06 0.08 0.04 0.04 0.1 0.07 0.07 0.05 0.4 0.47 1.0 0.86 0.79 0.53 0.35 0.55 1.0 0.12 0.26 0.7 0.48
0.07 0.06 0.08 0.1 0.12 0.11 0.1 0.08 0.09 0.13 0.14 0.12 0.06 0.51 0.58 1.0 0.69 0.56 0.37 0.23 0.56 0.99 0.16 0.41 0.73 0.51
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.09 0.09 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.03 0.09 1.0 0.03 0.27 0.76 0.48
0.22 0.24 0.24 0.28 0.29 0.18 0.23 0.28 0.31 0.47 0.64 0.58 0.3 0.61 0.64 1.0 0.89 0.4 0.4 0.36 0.65 0.62 0.62 0.92 0.91 0.62
0.24 0.2 0.2 0.28 0.26 0.16 0.23 0.24 0.34 0.44 0.56 0.5 0.27 0.53 0.62 0.87 0.73 0.31 0.38 0.34 0.63 0.89 0.61 1.0 0.96 0.71
0.02 0.05 0.04 0.05 0.05 0.06 0.05 0.04 0.09 0.09 0.09 0.1 0.04 0.23 0.91 0.63 1.0 0.09 0.11 0.17 0.23 0.6 0.08 0.52 0.69 0.68
0.04 0.07 0.07 0.09 0.11 0.12 0.09 0.06 0.12 0.15 0.19 0.17 0.07 0.26 1.0 0.74 0.8 0.12 0.15 0.21 0.44 0.77 0.13 0.66 0.88 0.76
0.08 0.1 0.12 0.12 0.15 0.17 0.18 0.13 0.22 0.28 0.27 0.28 0.12 0.21 0.9 0.59 1.0 0.17 0.18 0.28 0.13 0.33 0.18 0.64 0.68 0.59
0.03 0.05 0.06 0.15 0.23 0.38 0.48 0.39 0.17 0.16 0.12 0.06 0.03 0.08 0.44 0.95 0.19 0.07 0.13 0.1 0.05 0.92 0.36 0.07 1.0 0.63
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.06 0.24 0.11 1.0 0.43 0.28 0.32 0.64 0.01 0.39 0.36 0.08 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.41 0.4 0.78 0.0 0.04 0.04 0.13 0.29 0.04 0.33 0.3 1.0
0.24 0.1 0.07 0.06 0.04 0.03 0.05 0.09 0.22 0.3 0.39 0.46 0.39 0.0 0.0 0.0 0.22 0.01 0.02 0.2 0.01 0.42 0.09 0.43 1.0 0.8
0.09 0.12 0.08 0.07 0.14 0.17 0.14 0.15 0.07 0.22 0.16 0.17 0.09 0.1 0.09 0.06 0.14 0.43 0.31 0.1 0.01 0.65 0.19 0.39 1.0 0.5
0.03 0.14 0.19 0.24 0.29 0.29 0.33 0.28 0.4 0.46 0.49 0.4 0.05 0.45 0.87 0.82 1.0 0.23 0.24 0.3 0.42 0.52 0.43 0.92 0.98 0.8
0.02 0.07 0.09 0.07 0.17 0.14 0.15 0.15 0.04 0.05 0.11 0.05 0.03 0.49 1.0 0.59 0.73 0.11 0.12 0.04 0.04 0.53 0.13 0.32 0.56 0.32
0.02 0.06 0.09 0.07 0.18 0.15 0.18 0.17 0.04 0.05 0.11 0.06 0.03 0.49 1.0 0.53 0.73 0.09 0.12 0.05 0.04 0.39 0.13 0.22 0.43 0.3
0.03 0.07 0.1 0.12 0.19 0.19 0.26 0.18 0.13 0.1 0.1 0.07 0.05 0.38 1.0 0.41 0.52 0.05 0.11 0.04 0.03 0.32 0.08 0.2 0.4 0.2
0.04 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.07 0.09 0.07 0.08 0.01 0.01 0.01 0.06 0.02 0.02 0.05 0.0 0.98 0.01 0.09 1.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.58 0.4 1.0 0.24 0.27 0.15 0.08 0.38 0.2 0.23 0.61 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.58 0.26 0.9 0.18 0.09 0.0 0.0 0.23 0.2 0.14 1.0 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.78 0.34 1.0 0.04 0.21 0.1 0.05 0.11 0.18 0.37 0.37 0.25
0.42 0.4 0.42 0.39 0.36 0.23 0.29 0.36 0.3 0.53 0.61 0.55 0.44 0.7 0.66 0.99 1.0 0.27 0.42 0.47 0.23 0.7 0.21 0.6 0.62 0.69
0.37 0.44 0.34 0.33 0.4 0.16 0.29 0.35 0.26 0.43 0.55 0.55 0.49 0.65 0.54 0.98 1.0 0.28 0.32 0.4 0.39 0.74 0.24 0.73 0.93 0.79
0.19 0.19 0.17 0.17 0.22 0.1 0.13 0.17 0.14 0.26 0.27 0.29 0.17 0.37 0.34 0.6 0.56 0.25 0.24 0.25 0.33 0.91 0.36 0.67 1.0 0.67
0.33 0.45 0.42 0.52 0.47 0.23 0.27 0.34 0.36 0.43 0.54 0.56 0.41 0.46 0.46 0.78 0.73 0.28 0.3 0.35 0.24 0.79 0.38 0.77 1.0 0.67
0.38 0.31 0.3 0.42 0.39 0.26 0.28 0.33 0.32 0.43 0.55 0.6 0.48 0.4 0.4 0.53 0.48 0.16 0.25 0.29 0.31 0.73 0.34 0.97 1.0 0.69
0.39 0.4 0.35 0.43 0.4 0.25 0.32 0.33 0.33 0.48 0.57 0.66 0.5 0.6 0.62 0.81 0.78 0.23 0.31 0.42 0.33 0.69 0.35 0.78 1.0 0.81
0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.31 0.13 0.83 0.03 0.0 0.0 0.16 0.03 0.06 0.35 0.68 1.0
0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.04 0.25 0.09 0.48 0.08 0.01 0.0 0.18 0.02 0.09 0.73 0.63 1.0
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.09 0.4 0.14 0.62 0.03 0.02 0.01 0.13 0.12 0.1 0.68 0.52 1.0
0.26 0.37 0.37 0.42 0.35 0.16 0.19 0.28 0.28 0.34 0.38 0.42 0.32 0.39 0.49 0.68 0.75 0.35 0.38 0.4 0.25 0.5 0.28 0.5 1.0 0.69
0.2 0.35 0.44 0.49 0.57 0.27 0.18 0.21 0.23 0.27 0.29 0.28 0.28 0.64 0.39 0.98 0.69 0.34 0.29 0.43 0.67 0.67 0.3 0.6 1.0 0.88
0.19 0.33 0.33 0.36 0.36 0.2 0.21 0.25 0.28 0.35 0.4 0.44 0.28 0.38 0.58 0.67 0.68 0.31 0.35 0.32 0.15 0.84 0.22 0.54 1.0 0.65
0.18 0.29 0.32 0.34 0.31 0.14 0.18 0.23 0.24 0.35 0.35 0.35 0.22 0.5 0.73 0.95 0.96 0.43 0.44 0.43 0.12 0.91 0.26 0.44 1.0 0.68
0.26 0.27 0.23 0.19 0.18 0.06 0.07 0.11 0.1 0.19 0.24 0.3 0.25 0.72 0.54 1.0 0.95 0.26 0.27 0.23 0.13 0.83 0.2 0.36 0.71 0.48
0.35 0.37 0.33 0.32 0.26 0.11 0.12 0.16 0.16 0.27 0.34 0.47 0.46 0.82 0.71 1.0 0.97 0.23 0.29 0.3 0.09 0.77 0.17 0.42 0.53 0.43
0.18 0.27 0.27 0.32 0.23 0.09 0.15 0.21 0.19 0.27 0.28 0.27 0.21 0.4 0.41 0.69 0.74 0.41 0.32 0.37 0.26 0.54 0.29 0.43 1.0 0.65
0.09 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.08 0.44 0.51 0.66 0.7 0.29 0.0 0.0 0.01 0.46 0.02 0.02 0.16 0.0 0.6 0.06 0.39 1.0 0.78
0.22 0.08 0.06 0.06 0.06 0.1 0.19 0.22 0.73 0.88 0.98 1.0 0.33 0.02 0.01 0.07 0.43 0.07 0.07 0.26 0.04 0.98 0.16 0.83 0.95 0.83
0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.09 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.01 0.03 1.0 0.57
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.09 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.91 0.01 0.07 1.0 0.64
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.08 0.1 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.07 0.02 0.65 0.03 0.26 1.0 0.64
0.24 0.2 0.14 0.16 0.25 0.24 0.38 0.37 0.31 0.28 0.28 0.23 0.29 0.48 0.99 0.75 1.0 0.61 0.47 0.42 0.48 0.08 0.38 0.71 0.71 0.51
0.08 0.15 0.14 0.13 0.12 0.09 0.14 0.14 0.17 0.22 0.25 0.23 0.13 0.32 0.88 0.6 1.0 0.28 0.29 0.27 0.65 0.46 0.33 0.51 0.54 0.49
0.11 0.24 0.22 0.18 0.24 0.14 0.21 0.27 0.23 0.35 0.53 0.46 0.22 0.34 0.76 0.65 0.99 0.35 0.23 0.24 1.0 0.81 0.58 0.79 0.8 0.59
0.15 0.14 0.13 0.13 0.14 0.17 0.17 0.17 0.26 0.31 0.38 0.43 0.24 0.36 1.0 0.52 0.79 0.31 0.31 0.27 0.4 0.56 0.2 0.64 0.53 0.45
0.24 0.16 0.14 0.19 0.14 0.09 0.1 0.21 0.15 0.09 0.18 0.19 0.19 0.4 0.98 0.2 0.63 0.12 0.38 0.3 0.19 0.75 0.31 0.45 0.81 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.17 1.0 0.15 0.62 0.1 0.13 0.17 0.2 0.96 0.38 0.77 0.91 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 1.0 0.31 0.94 0.1 0.08 0.08 0.62 0.33 0.03 0.45 0.89 0.5
0.02 0.04 0.05 0.05 0.06 0.06 0.04 0.03 0.04 0.05 0.06 0.05 0.03 0.14 0.65 0.39 1.0 0.23 0.16 0.2 0.72 0.18 0.28 0.5 0.54 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)