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Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.78 -0.8 -0.64 -0.63 -0.24 -0.23 -0.21 -0.38 -0.07 -0.01 -0.18 -0.16 -2.26 -0.32 -0.08 -0.17 0.03 0.46 0.18 0.18 -0.1 0.58 1.87 0.83 -0.67 -0.36
-1.16 -0.87 -0.54 -1.08 -0.22 -0.14 -0.29 -0.54 0.07 -0.35 0.01 -0.39 -1.34 0.11 0.0 0.14 -0.45 0.12 0.68 -0.32 -0.65 -1.31 2.24 0.6 -0.45 0.21
-0.32 -0.13 -0.35 -0.19 -0.01 0.24 0.22 0.08 -0.03 -0.18 -0.21 -0.32 -0.48 -0.06 -0.09 0.02 -0.29 0.23 -0.22 -0.65 -0.19 0.65 0.68 0.35 0.32 0.04
-1.96 -0.89 -0.35 -0.41 -0.36 -0.3 -0.33 -0.47 -0.23 -0.11 -0.32 -0.36 -2.41 -0.12 0.12 0.27 -0.03 0.63 0.42 -0.08 -0.56 0.62 1.71 0.47 -0.0 0.17
-0.97 -0.21 -0.19 -0.93 -0.9 -0.66 -0.75 -0.43 -0.85 -1.16 -0.55 -0.75 -1.15 0.28 0.05 -0.25 -0.35 0.41 0.37 -0.25 -0.85 -0.45 2.37 -0.56 0.96 0.65
-2.69 -0.62 -0.6 -0.35 0.22 -0.09 -0.54 -0.87 -0.88 -0.74 -0.75 -1.3 -3.67 0.41 -0.41 0.18 -0.21 0.36 0.06 0.16 -1.35 -0.6 2.13 0.71 0.52 1.11
-1.29 -1.08 -1.3 -0.45 -1.01 -0.78 -0.45 -0.85 0.18 -0.21 -0.4 -0.55 -1.05 0.43 0.12 -0.13 -0.75 0.4 0.36 -0.6 0.42 0.27 1.56 0.71 0.58 0.89
-1.5 -0.02 0.21 0.11 -0.46 -1.5 -0.83 -0.54 -0.51 -0.23 -0.43 -0.5 -1.39 0.36 0.21 0.19 -0.35 0.53 0.41 0.01 -1.19 -0.9 1.71 0.48 0.23 0.81
-2.2 -2.91 -1.48 -0.82 -0.54 -0.42 -0.53 -0.55 -0.44 -0.07 -0.32 -0.54 -1.62 0.09 0.07 0.41 -0.11 0.01 0.16 -0.11 0.34 0.82 1.58 1.04 0.58 0.51
-0.48 -0.32 -0.46 -0.24 -0.21 -0.24 -0.11 -0.18 -0.09 -0.18 -0.15 -0.21 -0.7 -0.3 -0.19 -0.18 -0.28 0.29 -0.01 -0.24 0.21 0.45 1.51 0.49 0.15 -0.26
-0.82 -0.5 -0.81 -0.66 -0.54 -0.17 -0.36 -0.65 -0.39 -0.28 -0.37 -0.2 -1.09 0.16 0.22 0.38 -0.39 0.34 0.22 -0.7 -0.57 0.91 1.59 0.18 0.54 0.37
-0.25 -0.52 -0.46 -0.28 -0.33 -0.4 -0.2 -0.16 -0.22 -0.31 -0.06 -0.04 -0.29 -0.12 -0.42 -0.08 -0.36 0.06 0.03 -0.54 0.03 -0.48 1.29 1.05 0.58 0.35
-0.03 0.13 -0.05 0.05 -0.06 -0.21 -0.0 0.0 0.01 -0.16 -0.15 0.05 -0.32 -0.8 -0.64 -1.3 -0.1 -0.27 -0.26 -0.2 -0.45 0.27 1.47 0.71 -0.16 0.17
-0.46 -0.54 -0.63 -0.64 -0.43 -0.52 -0.39 -0.31 -0.34 -0.03 0.03 -0.17 -0.66 -0.03 -0.28 -0.08 -0.54 0.11 -0.26 -0.46 -0.01 0.65 1.82 0.31 0.47 0.25
-0.98 -0.91 -1.35 -0.81 -0.97 -0.83 -0.37 -0.78 -0.53 -0.32 -0.27 0.06 -0.73 0.39 -0.39 0.47 -0.1 0.4 0.07 -0.6 0.41 0.61 1.61 0.76 0.26 0.45
-0.31 -0.43 -0.12 -0.05 0.04 -0.1 -0.13 -0.19 -0.2 -0.1 -0.23 -0.14 -0.42 -0.23 -0.0 -0.14 -0.47 0.06 -0.22 -0.28 -0.42 1.09 0.91 -0.33 0.44 0.46
-0.84 -0.66 -0.82 -0.78 -0.21 -0.77 -0.18 -0.34 -0.84 -0.38 -0.63 -0.29 -1.01 0.12 0.33 0.1 -0.66 0.08 0.75 -0.43 -0.65 0.06 1.82 1.03 0.44 0.18
-2.43 -3.82 -3.05 -4.4 -3.21 -4.28 -4.17 -3.44 -2.82 -2.32 -2.65 -2.32 -2.88 -0.01 0.04 -0.52 0.37 0.3 -0.09 0.15 -1.1 0.48 2.61 1.55 1.97 1.22
-0.4 -0.83 -0.74 -0.33 -0.25 -0.27 -0.21 -0.18 -0.18 -0.18 -0.19 -0.15 -0.55 0.33 0.72 0.2 -0.39 0.36 -0.18 -0.49 -0.64 -0.19 1.74 0.08 0.04 -0.0
-0.7 -0.58 -0.64 -0.49 -0.58 -0.78 -0.2 -0.24 -0.08 -0.04 -0.23 -0.44 -1.04 0.35 -0.2 0.37 -0.34 0.31 -0.15 -0.43 0.11 0.45 1.22 0.67 0.41 0.68
-0.52 -0.3 -0.75 0.17 0.07 0.07 -0.07 -0.33 -0.24 -0.39 -0.16 -0.42 -0.91 -0.44 -0.11 -0.49 -0.43 0.31 0.09 -0.49 -0.33 1.26 1.12 0.15 0.51 0.16
-0.62 -0.56 -1.0 -0.02 0.11 -0.48 -0.11 0.25 -0.04 0.18 -0.28 -0.24 -1.85 0.09 -0.64 0.01 -0.09 0.29 -0.38 -0.31 -1.15 -0.72 1.92 0.29 0.72 0.1
-1.6 -1.18 -0.87 -0.83 -0.81 -0.83 -1.03 -1.05 -0.9 -0.33 -0.71 -0.25 -1.03 -0.08 -0.5 -0.03 -0.79 0.14 -0.05 -1.3 0.5 0.02 2.17 1.13 1.3 0.55
-1.35 -0.16 -0.61 -0.55 -0.1 -0.1 -0.14 -0.29 -0.02 0.18 -0.0 -0.34 -1.05 -0.68 -0.27 -0.75 -0.28 0.11 0.23 0.25 -0.4 -2.71 1.79 1.06 0.48 0.28
-0.94 -0.57 -0.65 -0.6 -0.25 -0.18 0.02 -0.33 -0.1 0.09 0.08 -0.01 -1.06 -0.06 -0.0 -0.28 -0.05 0.16 0.27 -0.38 -1.58 -1.01 1.53 0.95 0.66 0.47
-0.29 -0.27 -0.35 -0.33 -0.48 -0.5 -0.09 -0.34 0.03 -0.04 -0.09 -0.05 -0.48 -0.15 -0.34 -0.37 -0.41 0.15 -0.04 -0.45 0.2 0.28 1.13 0.73 0.61 0.32
-0.03 0.13 -0.33 -0.37 -0.4 -0.47 0.08 0.01 -0.14 -0.48 -0.57 -0.41 -0.41 -0.29 -0.42 -0.0 0.15 0.11 -0.01 -0.13 -0.15 0.59 1.11 0.74 0.21 -0.07
0.11 -0.01 -0.48 -0.4 -0.87 -1.11 -0.66 -0.21 -0.1 -0.23 -0.18 -0.37 -0.09 -0.38 -0.41 -0.42 -0.36 0.52 0.63 -0.76 -0.65 -0.01 1.91 0.42 0.34 -0.07
-0.3 -0.56 -0.43 -0.61 -0.34 -0.46 -0.52 -0.25 -0.1 -0.13 -0.15 -0.33 -0.55 -0.11 -0.07 0.0 -0.33 0.09 -0.08 -0.42 -0.01 -0.44 1.71 0.63 0.49 0.52
-0.19 -0.37 -0.38 -0.53 -0.55 -0.38 -0.43 -0.5 -0.57 -0.8 -0.69 -0.54 -0.48 -0.66 -0.42 -0.64 -0.21 0.29 0.09 -0.29 -0.08 0.91 1.37 1.05 0.6 0.78
-1.32 -1.17 -1.13 -0.78 -0.89 -1.57 -1.04 -0.4 -0.68 -0.96 -0.7 -1.45 -2.24 0.58 0.05 0.69 -0.79 -0.1 0.13 -0.32 -0.47 -0.1 2.58 0.14 0.89 0.61
-1.09 -0.85 -0.42 -0.42 -0.46 -0.4 -0.43 -0.58 -0.46 -0.4 -0.24 0.25 -0.88 -1.26 -1.04 0.67 -0.58 -0.17 -0.59 -0.55 0.14 0.05 1.82 1.46 0.6 0.25
-0.14 -0.44 -0.63 -0.39 -0.08 -0.44 -0.41 -0.57 -0.24 -0.06 0.06 0.25 -0.45 -0.95 -1.16 -0.95 -1.27 0.26 0.11 -0.39 0.56 0.69 1.86 0.65 0.02 -0.3
-2.36 -2.66 -2.76 -2.64 -2.97 -3.33 -2.6 -2.29 -1.97 -1.85 -1.64 -1.87 -2.7 -0.14 -0.47 -0.11 -0.23 0.74 0.54 -0.14 0.47 1.05 2.31 1.56 1.33 1.1
-0.21 -0.41 -0.42 -0.68 -0.33 -0.25 -0.27 -0.26 -0.33 -0.21 -0.21 -0.38 -0.57 0.01 -0.1 0.11 -0.26 -0.09 -0.06 -0.4 -0.04 1.01 1.35 0.27 0.06 0.55
-2.21 -2.09 -1.73 -0.94 -1.03 -1.43 -1.17 -0.7 -0.17 -0.43 -0.42 -1.1 -2.34 -1.73 -0.77 -1.05 -1.92 0.35 -0.04 -2.45 -0.02 1.78 2.62 1.09 0.92 0.13
-0.46 -0.24 -0.38 -0.25 -0.14 -0.14 -0.08 -0.11 -0.17 -0.35 -0.63 -0.85 -0.82 0.07 0.42 0.24 0.27 0.27 0.32 -0.16 -0.75 0.28 1.35 0.15 0.15 -0.01
-1.44 -0.92 -0.49 -0.3 -0.21 -0.14 -0.19 -0.13 -0.09 -0.07 -0.1 0.04 -1.52 0.02 -0.12 -0.01 -0.12 0.25 0.04 -0.23 0.0 0.02 1.59 0.46 0.37 0.27
-0.69 -0.53 -0.65 -0.87 -0.85 -0.58 -0.32 -0.17 -0.02 0.19 0.04 0.08 -0.52 -0.41 -0.32 -0.75 -0.43 0.65 0.29 0.19 0.08 0.02 1.34 0.58 0.43 0.5
-1.69 -1.09 -0.96 -0.81 -0.21 -0.27 0.11 -0.18 0.04 -0.4 -0.21 -0.42 -1.67 0.56 0.18 0.53 0.03 0.38 0.36 0.05 0.43 -0.12 1.68 -0.3 -0.33 0.03
-0.44 -0.03 -0.07 -0.39 -1.44 -2.03 -1.45 -0.66 -0.46 -0.19 -0.16 -0.14 -0.4 0.14 -0.21 0.31 -0.3 0.01 0.28 -0.04 -0.73 -0.49 1.96 0.26 0.76 0.59
-0.65 -0.62 -0.47 0.02 -0.11 -0.17 -0.24 -0.39 -0.14 -0.01 0.15 0.13 -0.89 -0.46 -0.62 -0.41 -0.73 -0.46 -0.02 -0.55 0.11 -0.12 1.69 0.98 0.17 0.52
-0.64 -0.82 -1.07 -0.76 -0.85 -1.13 -0.32 -0.43 -0.23 -0.29 -0.33 -0.24 -0.51 0.2 -0.09 0.13 -0.29 0.49 -0.05 -0.34 0.23 0.64 1.36 0.64 0.65 0.64
-2.53 -1.12 -0.02 -0.15 -0.49 -1.02 -0.46 0.13 -0.01 -0.15 0.02 -0.25 -2.85 0.07 0.01 -0.24 -0.36 0.56 0.53 -0.32 -1.44 -0.59 2.1 0.12 0.56 0.36
-3.41 -5.74 -4.21 -3.23 -3.56 -4.35 -3.76 -4.81 -3.23 -3.14 -3.11 -2.97 -3.58 -0.06 -0.85 -0.18 -0.5 0.35 -0.02 0.35 0.28 1.12 2.58 1.72 1.49 1.51
-0.71 -0.69 -1.22 -0.54 -0.58 -0.41 -0.52 -0.71 -0.78 -0.81 -0.36 -0.77 -0.77 0.36 0.39 0.24 -0.16 0.2 0.14 -0.64 -0.04 1.02 1.44 0.52 0.78 0.48
-0.49 -0.43 -0.86 -0.4 -0.37 -0.57 0.22 0.16 0.03 0.14 0.44 0.25 -0.9 -0.67 -0.42 -0.3 -0.4 0.2 0.23 -0.26 -2.58 -1.0 1.6 0.89 0.6 0.18
-1.78 -1.08 -1.24 -0.61 -0.53 -0.69 -0.42 -0.08 0.01 0.2 -0.07 -0.17 -2.09 0.15 -0.09 -0.02 -0.33 0.29 -0.53 -0.82 -0.22 0.79 2.13 0.51 0.13 0.18
-0.86 -0.25 -0.22 -0.44 -0.67 -0.53 -0.22 -0.21 -0.05 0.07 0.09 0.19 -0.86 -0.17 0.13 -0.04 0.06 0.01 0.22 0.18 -1.32 -0.43 1.66 0.55 -0.18 0.29
-1.11 -2.1 -2.95 -1.24 -0.98 -1.72 -1.66 -1.25 -1.02 -1.05 -0.81 -1.47 -1.06 -0.74 0.49 0.15 -0.64 0.89 1.12 -0.23 -0.85 0.3 2.27 1.43 0.41 0.65
-0.53 -1.31 -1.56 -1.41 -0.66 -0.23 0.45 0.24 0.22 -0.03 -0.09 -0.25 -0.48 0.03 -0.19 -0.3 0.0 0.37 0.16 -0.2 0.33 0.15 1.43 0.49 0.06 0.01
-0.42 -0.28 -0.31 -0.49 -0.52 -0.43 0.14 0.04 -0.01 -0.05 -0.31 -0.2 -0.65 -0.03 0.17 0.22 0.19 0.13 0.24 0.1 -0.78 -0.88 1.6 0.14 0.14 -0.08
-0.38 -0.55 -0.83 -0.56 -0.36 -0.56 -0.13 -0.47 -0.77 -0.86 -0.94 -1.16 -0.63 0.05 0.26 0.16 -0.21 0.3 0.25 -0.19 0.73 -0.21 2.06 -0.02 0.3 0.06
-0.3 -0.45 -0.45 -0.57 -0.25 0.15 -0.2 -0.54 -0.51 -1.39 -1.08 -1.08 -0.41 0.17 0.46 -0.03 -0.21 -0.28 0.33 -0.4 0.41 0.34 1.77 0.26 0.39 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.