Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
-0.14 -0.07 -0.15 -0.09 0.04 -0.24 0.51
0.41 0.23 -0.25 0.08 -0.04 -0.81 0.08
Cba_g00483 (PBD1)
0.17 0.04 0.04 -0.0 0.29 -0.86 0.07
0.46 0.55 -0.22 -0.42 -0.11 -1.39 0.32
Cba_g01013 (MEE51)
0.0 0.09 -0.18 -0.26 0.32 -0.42 0.29
Cba_g01123 (AAT3)
0.16 0.47 -0.28 -0.15 0.04 -0.55 0.08
Cba_g01216 (GTE3)
0.12 0.27 -0.04 -0.1 -0.03 -0.25 -0.02
0.16 0.1 -0.18 -0.18 -0.01 -0.81 0.57
0.2 0.06 0.17 -0.16 0.16 -0.94 0.2
-0.12 0.27 -0.08 -0.02 0.28 -1.35 0.41
0.04 0.06 -0.05 -0.12 0.4 -0.96 0.27
0.31 0.18 -0.07 -0.03 0.05 -1.01 0.21
-0.15 -0.09 -0.16 -0.29 -0.07 -0.28 0.73
Cba_g02521 (RFNR2)
0.23 0.28 -0.01 -0.06 0.12 -0.79 -0.01
Cba_g03048 (NLA)
-0.52 0.47 -0.54 -0.53 -0.14 -1.87 1.23
Cba_g03088 (EYA)
0.05 0.11 0.06 0.1 -0.06 -0.45 0.11
Cba_g03119 (ACS1)
0.21 0.18 -0.22 -0.13 0.12 -1.03 0.44
-0.04 0.03 0.07 -0.12 0.23 -0.33 0.09
Cba_g03337 (LOX4)
-0.04 0.1 0.04 0.14 0.11 -1.44 0.46
Cba_g03583 (ATRER1A)
0.33 0.45 -0.27 -0.16 0.13 -1.02 0.08
0.06 0.03 -0.21 -0.1 -0.02 -0.57 0.57
Cba_g03859 (PHF1)
-0.02 0.32 -0.24 -0.03 -0.15 -0.36 0.32
Cba_g04382 (ADK1)
0.04 0.15 -0.09 -0.12 0.03 -0.51 0.34
-0.11 0.11 -0.39 -0.12 -0.01 -0.35 0.62
0.44 0.49 -0.24 0.0 -0.2 -1.79 0.29
Cba_g04494 (AIP2)
0.05 0.25 -0.14 -0.08 0.13 -0.36 0.08
0.16 0.07 -0.32 -0.19 -0.13 -0.31 0.53
Cba_g05013 (HYD1)
0.16 -0.06 0.09 -0.0 0.08 -1.08 0.4
Cba_g05189 (UGT85A7)
0.29 0.2 -0.32 -0.11 -0.38 -0.58 0.55
0.34 0.33 -0.31 -0.12 0.09 -0.81 0.15
-0.11 0.16 -0.19 -0.21 0.12 -0.97 0.7
Cba_g06267 (UBA2A)
0.23 0.48 -0.24 -0.06 0.1 -0.77 -0.04
-0.33 0.4 -0.29 -0.15 -0.29 -1.28 0.94
-0.02 0.19 -0.15 0.02 0.05 -0.58 0.32
Cba_g06993 (YLS8)
0.13 0.29 -0.12 -0.03 -0.02 -0.23 -0.09
Cba_g07305 (RAB8C)
-0.12 0.27 -0.0 -0.05 0.25 -1.6 0.48
Cba_g07368 (APX2)
-0.2 0.12 -0.06 -0.03 0.15 -0.4 0.31
Cba_g07406 (UBC15)
0.06 0.32 -0.01 -0.02 0.01 -0.35 -0.1
-0.12 -0.13 -0.15 -0.2 0.16 -0.27 0.54
0.17 0.2 -0.17 -0.1 -0.05 -0.33 0.19
0.22 0.2 -0.07 -0.03 0.09 -0.82 0.16
Cba_g08136 (FKP1)
-0.05 0.65 -0.35 -0.21 0.03 -1.2 0.43
Cba_g08569 (PIS2)
0.16 0.28 -0.1 0.1 0.18 -1.05 0.06
-0.14 0.22 -0.14 -0.02 0.1 -0.41 0.27
Cba_g08702 (QSOX2)
0.2 0.22 -0.21 -0.14 0.03 -0.56 0.28
Cba_g08716 (GER2)
-0.1 -0.11 0.01 0.03 0.16 -0.54 0.38
Cba_g09002 (VTC2)
0.1 0.26 -0.13 -0.0 -0.11 -1.16 0.53
Cba_g09466 (HHP4)
0.42 0.52 -0.12 -0.33 -0.21 -2.63 0.57
Cba_g09650 (NHL8)
0.29 0.42 -0.1 -0.08 0.07 -1.57 0.23
-0.39 0.36 0.02 0.05 0.14 -1.58 0.56
0.12 0.31 -0.18 -0.09 0.04 -0.99 0.41
Cba_g10452 (MPK4)
0.23 0.48 -0.22 -0.06 -0.12 -0.47 -0.03
-0.2 0.37 -0.72 0.15 -0.44 -1.87 1.08
Cba_g10589 (CSN6A)
0.36 0.35 -0.22 -0.08 -0.05 -0.88 0.18
0.35 -0.07 -0.1 -0.18 0.21 -1.49 0.53
-0.25 -0.06 0.08 -0.01 0.23 -0.66 0.43
Cba_g11131 (VMA10)
0.18 0.06 -0.01 0.02 0.29 -1.14 0.19
-0.01 0.07 -0.06 -0.02 0.16 -0.34 0.14
Cba_g11295 (FAB1B)
-0.05 0.12 -0.28 -0.23 0.1 -0.75 0.68
-0.03 0.03 -0.52 -0.3 0.2 -1.1 0.91
0.52 0.38 -0.41 -0.11 -0.44 -1.03 0.44
Cba_g11717 (WIN2)
0.13 0.25 -0.22 -0.07 -0.21 -0.64 0.49
Cba_g12447 (ABP)
0.21 0.4 -0.19 -0.13 0.22 -1.11 0.15
Cba_g12736 (GDI1)
-0.02 -0.17 -0.03 -0.01 0.13 -0.51 0.44
-0.31 0.15 0.2 0.11 0.15 -1.61 0.5
Cba_g13674 (CI51)
0.24 0.39 0.02 -0.2 -0.23 -0.37 -0.01
Cba_g14020 (PBB2)
0.15 0.16 -0.01 -0.11 0.31 -0.77 0.04
Cba_g14265 (IDH1)
-0.06 0.18 -0.37 -0.2 -0.08 -0.08 0.46
Cba_g14385 (IIL1)
-0.01 -0.15 -0.15 -0.25 0.19 -0.22 0.44
0.19 0.61 -0.43 -0.23 0.08 -1.37 0.37
-0.32 -0.24 0.11 0.13 0.24 -0.86 0.53
Cba_g14992 (KU70)
0.21 0.09 -0.11 -0.29 0.29 -0.97 0.38
Cba_g15059 (HTA9)
-0.25 0.11 -0.11 -0.14 -0.04 -0.06 0.39
Cba_g15432 (YDA)
-0.22 0.2 0.15 0.15 0.06 -0.79 0.21
-0.35 0.1 0.08 0.14 0.12 -1.09 0.51
Cba_g15701 (UBC9)
-0.42 0.4 0.11 0.01 0.41 -1.77 0.29
Cba_g15891 (PHT4;3)
0.16 -0.34 -0.25 -0.0 -0.25 -1.08 0.96
-0.08 0.05 0.11 -0.07 0.31 -1.03 0.33
0.31 0.42 -0.07 -0.11 -0.17 -0.73 0.08
-0.24 0.12 0.05 -0.05 0.08 -0.66 0.45
Cba_g16667 (CAD1)
-0.12 0.31 -0.04 0.17 0.05 -1.14 0.32
Cba_g17097 (TOPP4)
0.07 0.27 -0.24 -0.11 -0.08 -0.45 0.37
-0.25 0.19 -0.06 -0.08 0.06 -0.24 0.29
Cba_g17237 (APA1)
0.1 0.03 -0.0 -0.09 0.26 -0.8 0.27
Cba_g17284 (RD21)
0.06 0.16 -0.24 -0.12 0.08 -0.62 0.44
Cba_g17285 (RD21)
0.49 0.49 -0.35 -0.29 -0.3 -0.87 0.31
Cba_g17507 (IDH-V)
-0.12 0.11 0.08 0.03 0.12 -0.37 0.09
Cba_g18059 (PAP29)
0.28 0.21 -0.04 -0.08 0.09 -0.81 0.11
0.08 0.84 -0.18 -0.38 -0.69 -2.61 0.77
-0.19 -0.07 -0.12 0.12 0.07 -0.47 0.48
-0.06 0.4 0.07 0.07 -0.13 -2.29 0.59
0.08 0.46 -0.25 -0.42 0.06 -0.94 0.5
Cba_g19527 (CSY2)
0.26 0.44 -0.15 -0.04 0.04 -1.27 0.16
-0.25 0.22 -0.03 0.13 -0.28 -0.7 0.57
0.41 0.32 -0.18 -0.35 -0.16 -0.76 0.35
0.14 0.2 -0.06 -0.17 0.04 -0.6 0.28
Cba_g20633 (ATG8F)
0.18 0.2 -0.08 -0.05 0.12 -0.65 0.11
0.39 0.11 -0.16 0.03 -0.19 -1.18 0.47
-0.14 0.02 -0.1 -0.14 0.02 -0.27 0.48
0.25 0.22 -0.14 -0.19 0.02 -0.61 0.25
Cba_g22215 (SEC22)
-0.24 0.17 -0.12 -0.0 0.07 -0.51 0.44
Cba_g23072 (ADF11)
-0.02 0.01 -0.01 -0.04 0.28 -0.36 0.06
0.39 0.33 -1.13 -0.61 -0.09 -1.46 1.01
Cba_g23327 (ORG4)
0.38 0.43 0.05 -0.2 -0.1 -0.97 0.0
-0.17 0.15 -0.05 -0.02 0.09 -0.3 0.23
Cba_g24005 (Hop2)
-0.11 0.07 -0.06 -0.0 0.17 -0.51 0.3
0.04 0.43 -0.52 -0.13 -0.19 -1.14 0.75
Cba_g25277 (PHT3;1)
-0.01 0.16 -0.14 -0.08 0.2 -0.56 0.27
Cba_g25321 (XTR4)
-0.5 0.41 0.09 0.46 -0.36 -4.73 0.78
Cba_g25374 (FKBP15-1)
-0.34 -0.17 -0.05 -0.09 0.2 -0.97 0.81
0.28 0.11 -0.1 0.06 -0.04 -1.08 0.36
Cba_g26016 (B5 #4)
0.05 0.35 -0.7 -0.0 -0.45 -1.06 0.9
0.03 0.19 -0.04 0.0 0.01 -0.45 0.18
0.15 0.41 -0.31 -0.04 -0.03 -0.31 0.0
Cba_g27126 (IP5PII)
-1.49 0.44 0.02 0.59 -0.88 -5.46 1.14
0.04 -0.25 -0.54 -0.33 -0.14 -0.44 1.0
0.07 0.68 -0.36 -0.03 -0.33 -4.2 0.79
-0.28 0.28 -0.28 0.06 0.09 -0.77 0.54
0.15 0.32 -0.25 -0.19 0.04 -1.55 0.64
0.08 0.19 -0.22 -0.02 0.18 -0.62 0.24
0.21 0.25 -0.26 -0.15 -0.16 -0.43 0.36
0.2 0.12 -0.15 -0.09 0.01 -0.65 0.35
Cba_g28689 (FKBP12)
0.26 0.14 -0.08 0.02 0.16 -0.78 0.06
Cba_g28721 (GST18)
0.1 -0.14 0.02 0.02 0.38 -1.05 0.28
0.37 0.1 -0.07 0.13 0.3 -2.05 0.16
0.17 0.15 -0.18 -0.05 -0.15 -0.49 0.38
-0.07 0.3 0.07 -0.01 -0.04 -1.57 0.55
Cba_g29489 (MAG1)
0.29 0.35 -0.13 -0.04 0.03 -0.73 -0.01
0.43 0.31 -0.44 -0.07 -0.41 -0.42 0.3
0.19 0.25 -0.02 0.11 0.25 -1.21 -0.03
-0.38 -0.32 -0.41 0.59 0.1 -1.58 0.83
Cba_g31223 (SAR1)
0.21 0.39 -0.23 -0.13 -0.12 -0.62 0.25
-0.17 0.34 -0.31 -0.02 0.1 -1.61 0.72
-0.46 0.4 -0.02 0.27 0.19 -1.42 0.33
Cba_g32146 (NAPRT1)
0.07 0.28 -0.18 0.01 -0.1 -1.0 0.5
0.36 0.4 -0.03 -0.02 0.01 -1.42 0.06
-0.13 0.08 0.06 0.02 0.2 -0.52 0.17
-1.35 0.31 0.03 0.25 -0.35 -1.75 1.05
Cba_g34705 (ACBP)
-0.05 0.12 0.05 -0.12 0.15 -1.06 0.49
Cba_g34752 (CHS)
-0.83 0.34 0.13 0.07 -1.07 - 1.35
Cba_g34910 (CCX4)
0.01 0.18 0.01 0.0 0.01 -0.2 -0.04
0.07 -0.14 -0.91 -0.42 -0.27 -0.44 1.14
0.12 0.15 -0.2 -0.09 -0.12 -0.3 0.33
-0.17 -0.08 -0.07 -0.07 0.22 -0.59 0.51
0.47 0.31 -0.23 -0.09 0.14 -0.95 -0.05
0.02 0.36 -0.06 -0.08 -0.08 -0.64 0.27
0.0 0.15 0.14 0.02 0.15 -1.12 0.26
Cba_g38009 (NLA)
0.03 0.4 -0.1 -0.25 -0.28 -0.62 0.49
Cba_g38140 (HSP91)
0.05 0.22 -0.11 -0.01 0.03 -0.33 0.1
-0.13 0.06 -0.08 -0.11 0.25 -0.53 0.37
Cba_g38224 (ACX3)
-0.04 0.4 -0.34 0.18 -0.28 -0.92 0.52
0.02 0.52 -0.37 0.4 0.08 -2.41 0.29
0.24 0.08 -0.33 -0.2 0.15 -0.98 0.57
0.83 0.63 -1.79 -0.49 0.09 - 0.69
0.46 0.22 -0.47 -0.46 -0.25 -1.04 0.75
0.22 0.42 -0.22 -0.06 0.06 -0.62 -0.02
Cba_g46031 (BAT1)
-0.27 0.49 -0.63 -0.34 -0.49 -1.93 1.23
-0.12 0.14 -0.05 -0.1 0.37 -1.26 0.46
Cba_g49729 (SCO2)
0.27 0.4 -0.24 -0.23 0.05 -1.09 0.35
Cba_g50202 (ATB2)
0.28 0.35 -0.07 -0.04 0.11 -1.5 0.2
0.09 0.19 0.0 -0.09 0.04 -0.48 0.14
Cba_g55676 (RAB1A)
-0.24 0.17 0.03 0.07 0.16 -0.81 0.35
0.14 0.52 -0.62 0.08 -1.0 -2.28 1.03
Cba_g56340 (SDP6)
0.06 0.09 -0.04 0.18 0.03 -0.95 0.32
0.16 0.22 -0.45 -0.24 0.16 -1.63 0.76
0.25 0.19 0.08 -0.09 -0.1 -0.45 0.0
0.31 0.43 -0.45 -0.03 0.01 -0.71 0.12
-0.13 0.15 -0.26 -0.1 -0.14 -0.63 0.73
-0.2 -0.12 0.12 0.03 0.2 -0.56 0.35
0.13 0.32 -0.02 -0.06 0.18 -1.08 0.14
0.05 0.1 -0.01 -0.0 0.24 -0.58 0.07
Cba_g67883 (RHM1)
0.24 0.22 -0.32 -0.16 -0.37 -0.32 0.47
-0.39 0.23 0.06 -0.31 0.13 -0.47 0.49
-0.21 0.17 0.01 -0.16 0.15 -1.49 0.72
-0.11 0.16 -0.22 -0.26 0.2 -0.74 0.6
0.03 0.29 -0.01 0.1 0.01 -0.35 -0.15
Cba_g71189 (WIN2)
-0.0 0.08 -0.2 -0.12 0.03 -0.06 0.23
Cba_g71891 (Phox2)
0.4 0.21 -0.05 -0.08 0.06 -1.44 0.27
0.19 0.28 -0.02 0.01 -0.11 -0.42 -0.02
-0.56 0.01 0.02 -0.26 0.39 -0.3 0.43
-0.02 0.46 -0.54 -0.17 0.09 -2.83 0.89
-0.15 -0.02 -0.41 0.38 -0.5 -1.36 0.97
0.06 0.22 -0.31 0.22 -0.08 -0.63 0.3
Cba_g76094 (CPK28)
-0.03 0.13 -0.07 -0.0 -0.26 -0.42 0.48
Cba_g77366 (PAF2)
0.03 0.19 -0.16 -0.22 0.06 -0.22 0.25
0.07 0.18 -0.18 0.0 0.01 0.02 -0.13
Cba_g78256 (ASP1)
-0.05 0.33 -0.25 -0.02 -0.22 -0.87 0.63

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.