Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
Cba_g12819 (MDR1)
40.52 38.53 2.95 5.18 4.01 2.52 7.7
7.16 4.77 0.47 0.57 0.43 1.64 0.6
2.86 2.51 0.14 1.51 0.0 0.0 0.13
3.05 2.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
7.77 7.23 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0
8.2 6.04 0.0 0.56 0.0 0.0 0.14
3.53 1.83 0.04 0.63 0.01 0.0 0.45
2.67 2.74 0.08 0.81 0.0 0.0 0.07
2.77 2.33 0.09 0.24 0.05 0.11 0.23
4.36 4.26 0.09 1.63 0.09 0.0 0.61
3.25 3.05 0.23 1.34 0.03 0.0 0.03
1.98 2.38 0.19 0.57 0.05 0.0 0.17
4.09 6.21 0.0 3.42 0.0 0.0 0.39
4.38 4.1 0.38 1.09 0.0 0.0 0.08
7.57 5.99 0.09 0.47 0.1 0.08 0.0
2.08 1.57 0.02 0.45 0.03 0.0 0.12
2.74 2.66 0.0 1.3 0.0 0.0 0.25
2.76 4.14 0.58 0.82 0.0 0.0 0.4
4.96 7.89 0.29 0.77 0.0 0.0 0.39
86.44 96.75 0.02 1.51 0.1 0.0 0.07
Cba_g21603 (CAT1)
1.73 2.71 0.05 0.73 0.01 0.0 0.16
6.51 4.72 0.12 0.55 0.13 0.12 0.19
5.77 7.72 0.4 2.89 0.05 0.0 0.36
49.7 46.65 3.72 17.63 4.63 0.0 0.0
Cba_g21744 (CAD7)
3.55 5.81 0.22 1.58 0.04 0.0 0.62
5.49 4.1 0.5 1.08 0.33 0.27 0.18
9.35 5.23 0.48 2.16 0.1 0.0 0.99
3.0 1.31 0.21 1.17 0.0 0.0 0.21
2.26 1.72 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0
33.12 29.5 2.63 7.64 1.8 2.19 0.75
Cba_g22403 (PXY)
4.77 4.72 0.22 0.88 0.14 0.05 0.04
3.21 1.78 0.0 1.42 0.14 0.0 0.63
3.02 5.23 0.47 1.18 0.03 0.0 0.55
6.44 5.97 0.27 0.86 0.28 0.0 0.66
3.61 5.31 0.63 1.26 0.0 0.0 0.43
1.96 1.58 0.0 0.06 0.02 0.0 0.43
3.06 2.94 0.04 1.29 0.0 0.0 0.32
2.12 3.44 0.12 1.24 0.04 0.0 0.16
2.49 3.33 0.21 0.96 0.0 0.0 0.22
12.54 12.38 0.59 3.52 0.24 0.0 0.58
Cba_g23698 (FDH)
4.31 5.62 0.2 1.94 0.05 0.0 0.58
2.01 1.55 0.1 0.79 0.2 0.19 0.32
2.41 2.61 0.18 1.46 0.01 0.0 0.24
2.88 2.97 0.07 0.21 0.01 0.0 0.01
2.46 3.11 0.19 1.07 0.05 0.0 0.21
4.06 3.88 0.25 1.3 0.0 0.0 0.36
4.01 4.15 1.02 1.18 0.0 0.0 0.45
3.28 3.54 0.0 3.25 0.0 0.0 0.0
2.7 2.48 0.32 0.53 0.04 0.0 0.08
5.32 4.22 1.08 2.3 0.0 0.0 0.24
2.2 2.11 0.1 0.67 0.0 0.0 0.0
5.05 6.86 0.0 2.83 0.27 0.0 0.13
3.57 3.86 0.06 1.43 0.0 0.0 0.37
2.92 3.68 0.07 2.19 0.0 0.0 0.7
4.44 5.41 0.12 2.39 0.0 0.0 0.16
2.78 3.25 0.14 0.46 0.0 0.0 0.18
2.88 3.53 0.05 1.3 0.0 0.0 0.08
3.07 0.97 0.0 0.69 0.0 0.0 0.07
2.24 1.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
61.89 70.02 4.58 12.24 4.11 0.25 4.53
2.19 1.16 0.1 1.09 0.0 0.0 0.11
4.55 5.17 0.14 3.71 0.07 0.0 0.51
2.31 1.9 0.13 0.09 0.13 0.0 0.0
3.0 2.99 0.12 0.49 0.0 0.0 0.23
4.02 4.01 0.12 0.83 0.0 0.0 0.0
4.12 4.37 0.3 0.44 0.16 0.0 0.67
7.31 5.06 2.39 3.11 1.84 1.18 0.79
3.36 4.73 0.23 1.4 0.03 0.0 0.78
Cba_g26755 (CYN)
3.55 5.47 0.29 1.06 0.08 0.0 0.34
3.38 2.76 0.47 0.84 0.0 0.0 0.54
4.64 5.08 0.23 1.79 0.0 0.0 0.19
3.34 1.68 0.08 0.72 0.17 0.0 0.45
3.58 4.3 0.37 1.36 0.0 0.0 0.27
2.2 2.65 0.21 0.89 0.0 0.0 0.14
1.91 0.88 0.0 0.66 0.14 0.0 0.53
2.47 2.87 0.05 0.05 0.01 0.72 0.4
1.85 4.15 0.0 0.65 0.0 0.0 0.42
8.77 6.6 0.0 3.02 0.0 0.0 0.13
1.15 3.5 0.16 0.05 0.0 0.0 0.23
1.92 3.03 0.0 0.42 0.1 0.0 0.0
3.06 1.2 0.59 1.56 0.0 0.0 0.0
13.46 15.63 0.84 2.83 0.15 0.0 0.42
13.2 9.36 1.41 2.06 1.04 1.82 1.4
3.52 4.57 0.0 0.38 0.39 0.22 0.23
9.06 8.57 0.37 3.46 0.0 0.0 0.69
33.75 32.51 2.16 4.36 1.9 6.54 4.71
14.5 17.43 3.11 6.17 3.45 1.55 2.87
9.09 10.61 0.19 0.87 0.11 0.09 0.0
9.02 13.44 0.45 1.56 0.7 0.0 0.35
7.91 7.62 0.31 2.6 0.13 0.0 1.15
Cba_g49497 (LUP2)
2.77 2.3 0.04 0.18 0.04 0.05 0.55
Cba_g58278 (RR12)
18.61 20.08 1.22 2.97 0.98 0.15 0.96
11.18 10.25 3.62 3.54 2.94 4.3 3.29
Cba_g63806 (ALDH2B)
3.39 5.19 0.11 2.8 0.13 0.0 1.54
6.97 8.45 0.0 1.06 0.1 0.0 0.7
8.86 5.12 1.59 2.38 1.39 1.26 3.27
5.41 12.63 0.24 1.79 0.0 0.0 0.58
1.18 3.69 0.0 0.07 0.0 0.11 0.36
3.9 4.5 0.0 1.15 0.0 0.0 0.13
3.74 4.31 0.67 1.68 0.1 0.0 0.42
9.77 8.98 0.0 0.36 0.26 0.0 0.0
Cba_g66833 (NTT1)
4.58 3.83 0.04 0.1 0.01 0.09 0.67
6.97 6.45 1.13 0.98 0.8 0.83 0.38
7.47 7.93 0.26 3.85 0.14 0.0 0.53
3.51 9.85 0.52 2.62 0.19 0.0 0.49
4.57 3.81 0.07 0.32 0.14 0.0 0.0
Cba_g67282 (ELF5A-3)
4.76 6.51 0.7 1.94 0.0 0.0 1.93
17.99 15.92 1.75 2.82 1.37 4.13 1.4
5.19 3.77 0.26 1.04 0.02 0.0 0.24
3.95 4.26 0.25 2.44 0.0 0.0 0.67
2.83 3.58 0.17 0.84 0.03 0.06 0.03
50.25 51.38 2.8 22.99 1.32 0.0 4.67
9.84 7.87 1.06 2.62 0.0 0.0 0.0
4.78 6.53 0.08 0.53 0.0 0.0 0.19
2.25 2.87 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0
4.35 4.88 0.2 2.38 0.0 0.0 0.22
5.92 2.14 0.12 1.57 0.0 0.0 0.15
Cba_g69764 (ACBP)
2.88 3.41 0.0 1.67 0.0 0.0 0.41
2.37 3.13 0.0 1.31 0.0 0.0 0.0
2.76 5.52 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0
5.78 4.03 0.26 1.77 0.0 0.0 0.74
3.24 2.61 0.96 1.23 0.0 0.0 0.22
4.36 2.55 0.22 1.1 0.0 0.0 0.0
2.36 3.31 0.0 1.67 0.0 0.0 0.49
11.07 20.15 0.75 6.91 0.0 0.0 0.46
3.57 5.39 0.28 2.75 0.0 0.0 0.07
1.51 2.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
51.42 57.0 3.56 22.73 1.19 0.0 1.76
2.25 2.43 0.44 1.21 0.0 0.0 0.04
17.49 13.27 0.76 7.54 0.42 0.0 0.71
2.04 3.5 0.39 0.64 0.0 0.0 0.23
3.53 3.2 0.1 1.1 0.06 0.0 0.14
3.04 2.02 0.07 0.52 0.03 0.0 0.31
3.5 4.38 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0
185.54 140.23 26.14 42.99 11.73 7.58 3.66
2.26 4.28 0.31 0.97 0.05 0.0 0.12
1.9 1.74 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0
8.9 9.11 0.21 0.29 0.89 1.29 0.14
10.27 8.36 0.17 0.37 0.08 0.12 0.14
3.32 3.31 0.0 1.37 0.23 0.0 0.64
166.62 195.29 1.12 5.18 2.17 0.36 0.26
Cba_g75324 (ALDH2)
8.1 10.23 0.5 3.31 0.0 0.0 0.99
Cba_g75365 (ALDH2)
3.84 3.41 0.11 2.28 0.02 0.0 0.24
3.63 4.0 0.41 3.03 0.0 0.0 0.18
2.8 1.68 0.0 1.23 0.0 0.0 0.06
26.38 27.94 0.97 6.76 0.0 0.0 1.28
3.16 2.61 0.0 0.79 0.0 0.0 0.39
25.55 21.3 2.31 7.14 1.49 0.38 0.31
24.2 28.11 1.51 6.79 0.79 0.0 1.92
2.92 5.27 0.26 2.02 0.0 0.0 0.45
Cba_g77357 (ALDH2B)
9.0 10.73 0.5 3.18 0.07 0.0 0.55
25.54 21.48 5.27 9.84 7.35 10.75 4.53
5.09 8.46 0.0 2.91 0.05 0.0 0.71
4.59 2.48 0.04 1.01 0.0 0.0 0.1
3.42 2.29 0.16 2.63 0.0 0.0 0.15
1.9 2.17 0.05 0.71 0.0 0.0 0.0
4.61 7.53 0.31 2.27 0.0 0.0 1.9
4.15 4.67 0.16 1.42 0.01 0.0 0.13
Cba_g78602 (CYTC-2)
6.86 5.97 0.12 2.92 0.0 0.0 0.0
2.13 3.28 0.0 1.32 0.06 0.0 0.0
6.19 3.21 0.26 3.55 0.13 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)