1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.92 10.74 11.41 4.98 2.73 1.52 131.28
0.1 3.0 1.9 1.56 0.64 0.43 31.98
Cba_g14434 (PSAD-2)
 0.08 0.88 1.24 0.34 0.27 0.14 11.84
Cba_g14929 (PSAE-2)
 0.08 1.76 1.52 1.38 0.55 0.27 22.56
0.14 0.53 0.85 0.41 0.2 0.08 11.16
Cba_g30333 (ECT4)
 0.06 0.29 0.31 0.18 0.15 0.09 2.78
Cba_g30425 (PSBR)
 0.48 5.43 5.58 2.6 3.1 0.9 73.25
Cba_g33779 (CXXS1)
 0.0 0.19 0.56 0.0 0.15 0.0 3.8
Cba_g35270 (YLS8)
 0.05 0.42 0.56 0.13 0.0 0.05 3.36
0.0 0.33 0.46 0.34 0.27 0.0 4.83
0.03 0.33 0.71 0.4 0.0 0.1 4.81
Cba_g35729 (MBF1B)
 0.09 0.9 1.33 0.03 0.37 0.24 9.64
Cba_g35879 (RS27A)
 0.0 0.0 0.32 0.07 0.0 0.0 2.74
Cba_g35976 (CCH)
 0.13 0.45 0.38 0.44 0.0 0.0 9.78
Cba_g35984 (GSTU9)
 0.05 0.11 0.32 0.12 0.34 0.0 3.23
Cba_g36064 (GSR 1)
 0.03 0.31 0.61 0.23 0.35 0.04 4.38
0.0 0.04 0.34 0.24 0.1 0.0 3.56
Cba_g36441 (FNR1)
 0.02 0.48 0.53 0.18 0.15 0.05 4.61
Cba_g37047 (PSBW)
 0.0 1.85 1.86 0.77 0.61 0.0 19.28
Cba_g37108 (OEE1)
 0.0 0.27 0.37 0.32 0.1 0.03 3.58
Cba_g37134 (PSBQ)
 0.0 1.13 0.8 0.64 0.08 0.03 8.92
0.05 3.8 2.51 2.18 0.72 0.27 33.58
Cba_g37522 (AILP1)
 0.03 0.67 1.06 0.27 0.29 0.12 8.87
0.03 1.53 1.29 0.39 0.61 0.12 18.71
0.03 0.7 0.38 0.25 0.11 0.06 6.77
Cba_g37813 (TPT)
 0.01 0.12 0.33 0.25 0.07 0.02 2.75
Cba_g37821 (PSAF)
 0.03 0.37 0.41 0.11 0.02 0.13 3.63
Cba_g37882 (LHB1B2)
 0.12 1.59 1.23 0.45 0.38 0.08 11.85
Cba_g37967 (LHCB4.1)
 0.01 0.82 0.92 0.39 0.09 0.02 8.84
Cba_g38071 (RCA)
 0.09 1.16 1.16 0.43 0.33 0.08 14.75
Cba_g38072 (RCA)
 0.04 0.46 0.68 0.19 0.28 0.13 7.53
Cba_g38096 (OLD3)
 0.07 0.39 0.17 0.22 0.18 0.04 3.31
Cba_g38133 (GAPC)
 0.03 0.76 0.77 0.75 0.31 0.46 8.03
Cba_g38350 (NADP-ME4)
 0.0 0.47 1.04 0.6 0.1 0.0 11.78
Cba_g38360 (FED A)
 0.09 1.77 1.69 1.26 0.78 0.31 19.25
Cba_g38364 (LHCB2)
 0.02 0.66 1.11 0.24 0.22 0.08 5.51
Cba_g38482 (PSAN)
 0.03 1.06 0.63 0.15 0.1 0.16 5.81
Cba_g38547 (PCAP1)
 0.07 0.57 0.69 0.25 0.24 0.02 4.12
Cba_g38633 (ASK1)
 0.18 1.14 1.81 0.77 0.49 0.07 16.18
0.09 0.18 0.42 0.13 0.09 0.0 3.79
Cba_g38968 (PIP1C)
 0.03 0.48 0.85 0.29 0.36 0.09 6.19
Cba_g38973 (PSAO)
 0.0 1.12 0.89 0.82 0.22 0.29 10.92
0.0 0.38 0.21 0.0 0.0 0.0 6.32
Cba_g41651 (LSR1)
 0.07 0.39 0.81 0.32 0.17 0.07 6.93
Cba_g42776 (PFL)
 0.04 0.47 0.61 0.25 0.36 0.04 5.34
Cba_g43140 (CRB)
 0.01 0.21 0.16 0.02 0.02 0.03 2.74
Cba_g43639 (LHCB3)
 0.0 0.37 0.27 0.07 0.16 0.04 3.01
0.27 1.65 1.98 1.38 1.1 0.2 22.96
Cba_g44007 (EIF5A)
 0.11 0.18 0.52 0.21 0.0 0.06 6.35
Cba_g44735 (PSAH2)
 0.0 1.39 1.75 0.41 0.09 0.06 10.75
Cba_g44829 (ACO3)
 0.0 0.96 0.72 0.1 0.44 0.0 9.94
Cba_g44950 (UBQ11)
 0.25 1.65 0.84 0.67 0.44 0.11 11.76
Cba_g45854 (CRT1b)
 0.05 0.2 0.17 0.26 0.09 0.02 3.1
0.0 0.48 0.46 0.6 0.0 0.0 5.4
Cba_g47715 (CCR2)
 0.0 0.56 0.24 0.0 0.0 0.0 5.87
Cba_g48049 (GST8)
 0.02 0.15 0.47 0.1 0.21 0.0 3.96
Cba_g48362 (HEL)
 0.08 0.49 0.69 0.13 0.0 0.17 4.77
Cba_g49079 (CML41)
 0.0 0.23 0.31 0.15 0.08 0.0 3.18
Cba_g49165 (SPT42)
 0.0 0.08 0.45 0.07 0.13 0.07 4.13
Cba_g49363 (TPI)
 0.03 0.34 0.62 0.32 0.3 0.07 5.07
Cba_g49496 (FRO1)
 0.0 0.18 0.21 0.16 0.0 0.03 2.42
Cba_g49542 (FLS)
 0.02 0.42 0.33 0.3 0.04 0.0 3.32
0.03 0.32 0.39 0.12 0.1 0.0 3.81
0.0 0.15 0.2 0.18 0.05 0.0 2.46
0.0 0.23 0.34 0.0 0.04 0.0 2.8
Cba_g50224 (PSAL)
 0.04 0.58 0.67 0.28 0.12 0.02 6.25
0.0 0.37 0.28 0.1 0.15 0.12 4.1
Cba_g50902 (OE23)
 0.05 0.51 0.6 0.4 0.26 0.0 6.6
Cba_g50926 (CCH)
 0.0 1.3 0.16 0.47 0.2 0.25 13.96
0.13 0.5 0.42 0.0 0.41 0.0 6.81
Cba_g51198 (XTH7)
 0.1 0.45 0.42 0.36 0.51 0.08 6.87
Cba_g51277 (MT2A)
 2.22 9.83 15.62 4.2 6.61 2.43 207.6
0.0 0.0 0.42 0.0 0.07 0.0 3.85
Cba_g51469 (2CPB)
 0.0 0.2 0.31 0.12 0.03 0.01 2.99
Cba_g51577 (RPS15A)
 0.0 0.3 0.87 0.26 0.0 0.06 7.39
0.0 0.76 0.53 0.1 0.2 0.0 6.66
0.0 0.23 0.25 0.1 0.07 0.06 2.69
Cba_g51877 (PGR1)
 0.0 0.49 0.41 0.11 0.19 0.0 3.92
Cba_g51878 (PGR1)
 0.06 0.33 0.39 0.17 0.06 0.0 4.31
Cba_g51907 (FBA1)
 0.09 0.4 0.29 0.3 0.15 0.13 6.51
Cba_g51939 (emb1303)
 0.0 0.0 0.38 0.0 0.38 0.0 3.09
Cba_g52491 (LHCB5)
 0.03 0.54 0.59 0.28 0.05 0.05 5.93
Cba_g52492 (LHCB5)
 0.03 0.48 0.41 0.31 0.17 0.05 4.9
Cba_g52797 (LHCA3)
 0.01 0.3 0.36 0.18 0.18 0.17 3.86
0.15 0.65 0.95 0.24 0.49 0.14 10.84
Cba_g52853 (GSTU8)
 0.05 0.45 0.58 0.25 0.3 0.04 4.68
0.0 0.61 1.72 0.5 0.41 0.0 12.8
Cba_g53267 (UBC2)
 0.04 0.04 0.03 0.04 0.16 0.0 2.22
Cba_g53351 (RPS15A)
 0.05 0.15 0.51 0.13 0.04 0.05 3.71
Cba_g53384 (VPS2.1)
 0.0 0.22 0.24 0.19 0.15 0.02 3.2
0.01 0.41 0.39 0.39 0.23 0.14 4.05
Cba_g53693 (WRKY67)
 0.02 0.36 0.38 0.12 0.2 0.06 4.02
Cba_g53728 (HTB11)
 0.04 0.09 0.59 0.21 0.0 0.0 3.81
Cba_g53944 (PSBY)
 0.05 0.77 0.98 0.11 0.08 0.14 6.59
Cba_g54031 (RPL10B)
 0.07 0.42 0.74 0.28 0.58 0.15 6.94
Cba_g54432 (NIC1)
 0.02 0.21 0.16 0.1 0.11 0.08 2.4
0.0 0.15 0.26 0.34 0.0 0.0 3.1
0.0 0.27 0.38 0.38 0.13 0.09 2.84
0.09 0.5 0.31 0.15 0.18 0.0 5.21
0.0 0.26 0.28 0.03 0.04 0.0 2.93
0.09 0.56 0.75 0.63 0.17 0.06 5.1
Cba_g55479 (AML1)
 0.04 0.39 0.43 0.36 0.21 0.08 6.03
0.08 0.12 0.82 0.17 0.29 0.11 4.47
Cba_g56082 (MTO3)
 0.0 0.0 0.59 0.35 0.31 0.13 11.04
Cba_g56900 (LHCA1)
 0.03 0.34 0.49 0.32 0.14 0.05 3.84
Cba_g57406 (CRK8)
 0.07 0.55 0.67 0.2 0.34 0.08 7.09
Cba_g57574 (ATM4)
 0.0 0.28 0.24 0.08 0.02 0.06 3.12
Cba_g57599 (OLI5)
 0.04 0.76 0.41 0.22 0.0 0.0 6.66
Cba_g57640 (RPL24A)
 0.0 0.51 1.1 0.18 0.12 0.03 6.79
Cba_g58488 (GS2)
 0.0 0.14 0.22 0.11 0.18 0.03 3.37
Cba_g58792 (PETE2)
 0.06 0.37 0.54 0.11 0.1 0.0 5.06
Cba_g59730 (STM)
 0.01 0.35 0.26 0.11 0.08 0.04 2.93
Cba_g60348 (LHCB2)
 0.05 0.56 0.84 0.34 0.11 0.11 5.55
Cba_g60491 (GAPA-2)
 0.05 0.67 0.41 0.44 0.2 0.05 7.1
Cba_g61451 (EFE)
 0.14 1.19 1.65 0.73 0.37 0.09 17.34
Cba_g61499 (SUT1)
 0.06 0.26 0.27 0.12 0.1 0.05 4.5
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 2.27
Cba_g62542 (ELP)
 0.03 0.16 0.26 0.15 0.16 0.06 3.06
0.0 0.45 0.65 0.26 0.21 0.05 6.68
Cba_g62744 (TUA6)
 0.1 0.68 0.44 0.42 0.22 0.1 4.75
Cba_g63161 (HSP70)
 0.12 1.2 0.69 0.21 0.51 0.18 13.49
0.0 0.28 0.1 0.12 0.18 0.0 2.9
0.0 0.37 0.66 0.12 0.21 0.0 5.2
Cba_g64921 (HS1)
 0.0 0.1 0.73 0.07 0.51 0.0 5.99
0.0 0.22 0.51 0.02 0.09 0.05 3.25
Cba_g67943 (ACT7)
 0.12 0.82 0.99 0.25 0.23 0.12 14.53
Cba_g69411 (HSP70)
 0.17 0.68 0.81 0.77 0.4 0.1 8.22
0.06 0.62 0.7 0.38 0.13 0.0 6.45
0.1 0.37 0.24 0.18 0.13 0.06 2.92
0.1 0.64 0.46 0.41 0.16 0.11 4.49
Cba_g70346 (HIR1)
 0.0 0.65 0.51 0.73 0.07 0.0 11.26
Cba_g70661 (LHCA3)
 0.0 0.36 0.33 0.11 0.02 0.0 3.24
0.26 1.28 0.16 0.21 0.09 0.0 12.41
0.0 1.28 1.11 0.26 0.13 0.35 14.38
0.0 1.37 1.0 0.89 0.66 0.43 16.03
Cba_g76726 (OEC33)
 0.0 0.72 0.48 0.32 0.0 0.12 5.48
Cba_g77121 (CAM3)
 0.41 1.09 0.69 0.47 0.38 0.04 8.96
0.0 0.24 0.42 0.13 0.0 0.0 4.53

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)