Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.47 -0.19 0.36 0.11 0.97 0.54 0.47 0.51 -0.61 -0.36 1.17 1.25 -0.21 -0.97 -0.67 -0.38 -0.17 0.35 -0.17 0.37 0.54 0.3 -2.33 -0.26 1.13 -0.01 1.02 0.01 -0.06 -0.32 -0.16 -0.06 -0.52 -0.32 -0.07 -0.01 -0.3 -0.44 -1.06 -0.88 -0.46 -0.44 -0.84 -0.58 -1.19 -0.43 -0.34 -0.4
-0.28 -0.02 0.55 -1.51 1.07 0.48 0.58 0.57 -0.07 0.0 0.5 0.44 0.03 -0.5 0.01 -0.27 0.41 -0.17 0.84 0.5 0.12 0.03 -0.96 -1.27 0.12 -0.42 -0.02 -0.6 -0.54 -0.27 -0.64 0.23 -0.15 0.01 0.51 0.18 -0.34 0.17 -0.95 -0.44 -0.19 -0.27 -0.26 -0.3 -0.36 0.17 -0.77 -0.22
-0.5 0.1 0.95 1.7 0.62 -0.24 0.22 0.93 -0.72 -0.22 0.48 0.44 0.4 0.38 -0.39 -0.06 0.41 0.31 0.02 0.43 -0.25 -0.36 -0.4 -0.74 0.49 0.76 0.99 -0.68 -1.23 -0.72 -1.19 -0.17 -0.86 -0.59 -1.21 -0.71 -0.35 0.43 -1.39 -0.89 -0.39 0.1 -0.94 -1.07 -1.01 0.38 -1.51 -0.44
0.11 -0.07 -0.23 -2.31 1.83 -0.12 0.09 0.01 0.12 -0.13 0.31 0.29 0.42 0.33 -0.1 -0.28 0.49 -0.28 -0.31 -0.29 -0.49 -0.47 -1.67 -1.91 -0.14 0.15 -0.26 0.01 0.56 -0.17 -0.04 0.0 -0.31 -0.15 0.81 -0.26 -0.1 0.1 -0.5 -0.08 0.18 0.05 0.1 -0.28 -0.65 0.15 -0.39 -0.07
-0.18 -0.03 0.06 1.73 0.88 0.49 0.65 0.14 0.42 -0.01 1.45 1.49 -0.55 -1.49 -0.64 -0.5 -0.61 -0.21 -0.6 -0.59 -0.72 -0.41 -1.72 -0.84 0.5 -0.28 0.48 -0.09 0.31 -0.17 -0.07 0.61 -0.55 -0.35 -0.07 -0.53 -0.57 -0.12 -1.47 -0.79 -0.8 -1.1 -0.81 -0.46 -0.9 -0.13 -0.14 0.01
0.56 -0.49 -0.97 -2.57 1.59 -0.44 -0.2 -0.26 0.48 -0.03 0.91 0.86 -0.26 -0.02 -0.2 0.94 -0.07 -1.61 -0.35 -0.23 -0.15 -0.38 -4.13 0.69 -0.83 -1.47 -1.83 -0.84 0.87 -0.04 -0.53 0.26 0.36 0.53 0.11 -1.13 0.12 0.37 -1.45 0.02 0.28 0.15 0.36 -0.32 0.18 0.31 -1.38 0.13
-0.41 0.02 0.05 -1.17 1.26 0.31 0.8 0.67 0.02 -0.13 0.57 0.4 -0.51 -0.97 -0.36 0.0 0.51 -0.35 0.32 0.41 0.32 0.25 -1.08 -0.28 0.32 -0.05 0.15 -0.22 -0.25 -0.36 -0.12 -0.26 -0.04 0.01 -0.34 -0.16 -0.24 -0.16 -0.5 -0.33 -0.43 -0.29 -0.16 -0.22 -0.29 -0.12 -0.03 0.07
-1.48 0.99 0.5 1.17 1.94 -1.0 -1.2 -0.95 -1.69 -0.29 0.21 0.15 0.21 -0.59 0.05 -1.76 -0.63 -0.35 -0.25 -0.39 0.18 0.45 -2.11 -0.99 0.84 1.62 1.45 -1.64 -2.18 -1.54 -1.55 -1.04 -1.09 -1.45 -1.63 -2.05 -1.21 -0.73 -0.93 -0.59 1.58 1.84 -0.16 -0.26 -1.0 -0.68 -0.53 -0.23
-0.42 -0.07 0.53 -1.63 1.36 0.11 0.58 0.4 -0.12 -0.13 0.46 0.47 0.11 -0.63 -0.31 -0.03 0.57 0.09 0.49 0.54 0.63 0.7 0.26 -0.04 0.43 0.02 0.16 -0.43 -0.18 -0.55 -0.42 -0.54 -0.37 -0.55 -0.05 -0.56 -0.4 -0.35 -0.93 -0.43 -0.57 -0.43 -0.2 -0.35 -0.58 -0.34 -0.41 -0.36
-0.17 0.01 1.3 -2.57 0.49 0.53 -0.11 0.72 -0.26 -0.15 0.68 0.78 -0.5 -0.46 -0.67 -0.78 1.26 0.14 1.11 1.3 1.14 0.45 0.0 -1.29 -0.71 -0.61 0.19 -0.55 -1.3 -0.8 -1.1 0.17 -0.46 -0.42 -0.81 -0.72 -0.97 0.04 -1.1 -0.48 -0.3 -0.47 -0.1 -0.55 -0.36 0.07 -0.81 -0.58
-1.08 -1.23 -1.81 0.24 0.71 1.01 1.39 1.38 -0.33 0.25 1.16 0.98 1.04 -0.29 -0.04 -0.88 -2.15 -0.97 -1.43 -0.84 -0.96 -1.2 -4.59 -2.97 0.2 -0.76 1.2 -0.92 0.55 -0.18 0.42 1.19 -0.41 -0.81 1.04 0.18 0.3 0.18 -1.81 -0.51 -1.0 -1.81 -1.23 -0.59 -0.94 0.21 -1.03 -0.07
-2.34 -3.66 -2.73 1.54 3.43 1.4 0.8 0.96 -1.06 -2.42 1.7 1.42 -3.09 -3.23 -2.46 -2.21 0.07 -1.33 1.13 1.89 1.54 -0.42 -3.18 -2.78 -0.73 -4.89 -2.16 -2.83 -1.64 -2.74 -3.67 2.38 -2.81 -3.16 -0.4 -3.89 -3.95 -2.73 -3.94 -2.42 -4.38 -4.41 -2.98 -3.36 -2.89 -2.95 -3.43 -2.74
-1.22 0.21 0.43 2.02 -0.45 0.91 0.52 0.58 0.14 -0.02 0.78 1.13 0.08 -0.56 -1.59 -0.19 -0.17 0.02 -0.14 -0.52 -1.95 -1.62 -3.42 -0.45 0.63 -0.19 0.74 -0.13 -0.42 0.31 0.4 1.89 -0.61 -0.6 -0.55 -1.18 -0.56 0.56 -2.2 -1.71 -1.28 -1.61 -1.53 -1.37 -1.76 0.61 -0.66 -0.82
0.14 -0.91 0.04 1.44 -0.63 0.88 0.43 0.52 -1.18 -0.2 1.18 1.48 -1.3 -2.06 -0.9 -0.58 -0.06 -1.16 0.02 0.52 0.14 -0.32 -2.09 -0.69 0.11 -1.06 -0.44 0.29 0.54 0.28 -0.93 -0.16 -0.04 0.07 0.24 -0.03 -0.81 -0.03 -0.55 -0.36 -0.79 -0.48 -0.36 0.33 -0.4 0.04 0.37 0.4
-0.46 -0.99 0.0 -2.77 1.14 0.35 0.4 0.36 -0.59 0.36 0.7 0.63 -0.12 -0.97 0.07 -0.23 -0.22 0.06 -0.11 0.2 0.89 0.69 -1.63 -0.85 1.0 -0.19 0.5 -0.32 0.18 -0.23 -0.11 0.31 0.08 -0.05 0.2 -0.32 0.08 -0.38 -0.81 -0.63 -0.46 -0.4 -0.05 -0.45 -0.39 -0.35 -0.26 -0.11
-3.61 1.53 0.28 -0.51 -0.72 -0.55 - - - -1.1 1.6 0.82 0.34 0.3 -1.19 -0.75 0.95 -1.57 - -0.58 -1.39 0.93 - 1.07 -0.77 0.71 2.58 -1.47 -2.95 0.27 -0.33 0.91 -3.42 - -1.79 - - 1.03 -1.47 -0.01 1.85 -0.15 0.42 -0.39 - 0.9 -0.72 -1.92
- - -6.38 3.55 0.3 1.54 0.32 0.64 -0.08 -1.96 - - -2.97 -3.69 -0.89 -4.56 -0.77 -1.62 -4.02 -3.35 -2.63 -2.03 -2.35 -0.21 3.84 1.92 2.45 -3.2 -6.69 -3.85 -3.72 -6.3 -5.25 -3.27 -5.2 -5.29 -4.87 -3.52 - -3.77 - -5.01 -3.05 -3.52 -6.51 -2.82 -2.77 -5.45
-1.58 1.61 0.78 0.41 1.79 -0.73 -1.56 -1.3 -2.66 0.03 0.61 0.53 -0.79 -2.17 -1.0 -1.42 -5.23 -4.8 -2.28 -0.72 -3.95 -3.75 - -10.45 -0.62 0.36 2.11 -1.17 -1.26 0.1 0.16 1.28 0.12 -1.07 -1.27 0.44 -0.65 -0.89 -1.85 -0.47 1.57 1.76 -0.66 0.86 0.52 -1.15 0.37 -0.52
0.23 0.76 0.43 1.86 -0.69 -0.31 -0.76 -0.51 0.56 -0.68 -3.59 -3.58 -1.47 -2.47 -0.87 0.29 0.57 0.16 -0.05 -0.14 -0.08 0.03 -0.02 -1.79 -1.48 -2.82 -2.85 1.08 1.15 0.64 0.04 -0.26 0.16 0.89 -0.18 0.21 0.16 -0.47 0.18 -0.1 -3.02 -2.12 0.03 0.69 0.2 -0.63 1.18 -0.31
-0.3 -0.52 0.51 0.21 2.26 1.09 0.83 0.7 0.24 -0.6 1.32 1.45 -1.07 -1.83 -0.96 -0.41 -0.03 -0.62 -0.08 0.1 0.1 0.08 -0.82 -1.62 0.33 -0.99 1.0 -0.92 -1.51 -0.79 -0.5 1.38 -0.73 -0.95 -2.02 -1.31 -0.65 -0.47 -1.68 -0.46 -0.8 -1.02 -0.56 -0.66 -0.87 -0.48 -0.53 -0.3
-1.47 - 0.2 2.69 -1.53 1.14 2.03 1.74 -0.77 -0.8 -1.24 -0.75 - -1.77 -1.99 -2.62 -2.59 -2.75 - -1.65 -3.25 -0.87 - 3.32 1.07 -1.7 0.57 -1.46 0.6 -2.23 -1.87 -2.62 -4.02 -1.43 2.85 -1.34 - -1.39 - -2.69 - -1.6 - - -3.28 -3.58 -2.15 -3.25
- - -0.83 1.67 -0.82 2.14 2.46 3.34 - -2.19 -1.12 -1.71 -2.8 -1.51 -1.54 -0.58 -0.42 - - -4.8 - - -2.45 2.3 0.5 -0.42 1.17 -0.92 -2.04 -2.32 -2.97 -1.25 -2.21 -0.22 2.57 -2.3 -1.78 - - -2.97 -1.4 -0.69 - -2.77 - - -1.43 -2.4
-0.79 -0.59 0.22 0.18 -0.04 -0.27 0.02 -0.18 -0.94 0.07 0.22 0.25 -0.24 -1.26 -0.11 -0.93 -0.06 -0.17 0.77 0.85 0.41 0.38 -0.7 -1.49 0.39 -0.02 0.73 0.33 0.05 0.25 0.21 -0.01 0.24 0.32 -0.74 -0.14 0.25 -0.1 -0.4 0.26 -0.78 -0.9 0.14 0.23 0.15 -0.14 0.19 0.03
-0.85 -1.46 0.54 0.27 2.03 0.77 1.25 1.5 0.57 -0.37 1.11 1.21 -0.87 -1.06 -0.54 -0.74 -0.06 -0.47 0.56 0.75 -0.04 -0.42 -0.66 -0.11 0.3 -0.57 -0.15 -0.46 -2.03 -0.47 -0.41 -0.86 -0.43 -0.7 -2.24 -1.02 -0.59 0.05 -1.43 -0.41 -0.75 -0.58 -0.29 -0.53 -0.8 0.13 -0.7 -0.82
-0.68 0.34 0.55 0.31 1.12 0.6 -0.28 0.55 -1.31 -0.4 1.69 1.75 -0.56 -0.46 -0.39 0.2 0.2 0.53 0.59 0.62 0.56 0.05 -1.22 0.11 0.58 -0.59 0.54 -0.64 -1.47 -0.97 -1.19 2.02 -1.31 -0.85 -2.69 -0.87 -1.15 -1.09 -1.97 -1.2 -1.74 -1.02 -1.58 -0.93 -1.29 -0.8 -1.94 -0.13
-3.02 -0.56 -0.23 -1.71 1.42 -0.44 0.06 -0.3 -1.11 0.06 1.74 1.89 -0.05 -0.63 -0.47 -0.73 0.14 -0.55 0.06 0.17 0.26 -0.03 0.09 -1.63 0.13 -0.35 0.2 -0.23 -0.37 -0.34 -0.11 0.45 0.1 -0.11 -0.8 -0.22 -0.04 -0.15 -0.57 -0.32 -0.13 -0.19 -0.14 -0.21 -0.21 -0.12 -0.11 -0.04
- 1.05 -0.72 0.31 -1.63 -0.25 -0.89 -0.77 - 0.94 1.39 1.01 1.06 -0.94 -0.54 2.13 -0.79 -2.65 - -3.68 - -2.82 - -3.69 0.71 -0.47 2.81 1.92 -1.59 0.57 0.04 0.43 -1.3 -1.0 -1.26 -2.85 -0.36 -0.75 - -0.79 0.84 0.59 -0.7 -1.49 -1.54 -1.52 -1.06 -1.51
-0.55 -0.02 -0.52 1.45 0.75 1.52 0.82 0.94 0.54 -0.5 1.8 1.89 -0.43 -1.5 0.27 -0.73 -0.4 0.5 -0.95 -0.9 -0.82 -0.5 -2.18 -0.95 0.22 1.27 0.83 -1.64 -1.26 -0.42 -0.94 0.02 -1.34 -1.0 -1.15 -1.79 -1.27 -0.96 -1.54 -1.1 -0.11 -0.15 -0.83 -0.65 -1.44 -0.88 -0.88 -0.04
0.04 0.16 0.36 -0.75 1.5 0.61 0.39 0.61 -0.41 -0.16 1.24 1.1 -0.18 -1.08 -0.35 -0.26 0.45 -0.7 0.52 0.5 0.23 -0.17 -0.66 -1.08 0.21 -0.13 0.45 -0.64 -0.35 -0.38 -0.24 0.48 -0.52 -0.57 0.37 -0.63 -0.15 -0.21 -1.36 -0.53 -0.84 -0.96 -0.5 -0.43 -0.68 -0.19 -0.37 -0.26
- 0.81 -1.42 2.87 0.74 2.11 2.26 1.96 1.8 -2.09 -1.28 -1.9 -2.82 -3.88 -0.71 -0.02 -0.35 -0.97 - - -1.19 0.32 - -0.54 3.41 -0.57 -2.57 -5.1 -5.74 -5.21 -2.86 -5.35 -7.19 -4.55 - - - -0.27 - -2.62 -3.24 - -5.33 -2.43 -3.17 -0.41 -4.13 -3.89
-0.38 -0.35 0.24 0.59 0.8 0.48 1.07 1.01 0.51 -0.06 0.99 1.0 0.27 -0.26 -0.17 -1.28 -0.31 -0.1 -0.77 -0.44 -0.46 -0.59 -3.2 -1.11 0.43 0.53 0.79 -0.44 0.11 -0.51 -0.01 0.65 -0.33 -0.29 -0.16 -0.52 -0.1 -0.3 -0.99 -0.44 -0.09 -0.31 -0.71 -0.57 -0.69 -0.29 -0.52 -0.33
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-0.68 -0.39 0.53 -1.48 1.35 -0.18 0.14 0.02 -0.06 0.2 0.67 0.55 -0.01 -0.7 -0.06 -0.45 0.43 0.35 0.16 0.25 0.2 0.26 0.05 -0.39 0.61 0.51 0.04 -0.32 -0.66 -0.25 -0.07 0.08 -0.15 -0.34 -1.32 -0.15 -0.35 0.04 -0.76 -0.26 -0.09 -0.12 -0.13 -0.12 -0.68 0.09 -0.02 -0.23
-0.68 -1.84 -2.11 -0.13 0.71 1.76 1.53 1.28 -0.32 -0.15 0.1 -0.09 0.4 -1.15 0.12 -1.14 -2.14 -1.55 -2.27 -2.28 -1.94 -2.09 -6.3 0.69 0.89 0.36 1.77 -0.32 0.58 -0.15 0.37 1.77 -0.49 -0.96 0.69 -0.3 0.24 -0.61 -1.94 -0.64 -0.41 -1.29 -1.06 -0.83 -1.35 -0.56 -1.02 -0.22
-0.13 0.41 -0.08 0.99 1.55 0.47 0.24 -0.09 0.65 -0.45 1.21 1.07 -0.3 -0.5 -0.87 0.44 -0.55 -0.45 -1.23 -0.27 0.39 -0.34 -1.89 -1.32 0.51 0.09 0.47 -0.55 0.21 -0.51 -0.55 -0.36 -0.43 -0.32 -0.0 -0.73 -0.37 -0.46 -0.7 -0.27 0.05 -0.13 -0.12 -0.19 -0.38 -0.38 -0.49 -0.27
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0.56 0.15 -0.25 0.77 1.2 0.55 0.51 0.31 -0.24 -0.11 0.9 0.77 -0.41 -1.7 -0.19 0.76 0.54 0.06 -0.45 0.13 0.13 -0.13 -1.07 -0.6 0.74 -0.11 0.2 -0.48 0.29 -0.28 -0.01 -0.18 -0.27 -0.33 -0.02 -0.24 -0.21 -1.05 -1.07 -0.67 -0.3 -0.31 -0.5 -0.4 -0.85 -1.15 -0.27 -0.33
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-1.35 -0.12 -0.28 1.53 1.27 0.32 0.34 0.27 -1.37 0.08 0.11 0.17 0.03 -0.41 -0.14 -0.67 0.31 0.07 0.16 0.33 0.21 0.72 -0.03 -0.58 1.28 -0.07 1.44 -0.73 -0.92 -0.13 -0.58 -0.18 -0.49 -0.38 -1.31 -0.68 -0.53 -0.18 -1.04 -0.84 -0.77 -0.59 -0.42 -0.42 -0.51 -0.2 -0.42 -0.15
-1.1 0.11 0.99 -1.73 0.53 -0.17 -0.56 0.08 0.23 -0.04 0.89 0.98 -0.08 -0.91 -0.3 -0.68 0.72 -0.57 1.02 0.91 0.95 0.48 -0.22 -1.13 -0.03 -0.65 -0.82 -0.27 -0.28 -0.23 -0.15 0.57 -0.24 -0.02 -2.46 -0.92 0.1 0.23 -0.9 -0.34 -0.74 -0.58 -0.05 -0.1 -0.44 0.08 0.0 0.29
-0.29 0.1 0.12 -1.47 1.25 0.07 -0.24 -0.14 0.28 -0.23 1.08 1.1 -0.52 -0.39 -0.63 -0.03 0.26 -1.04 0.26 0.54 0.29 -0.14 -0.06 -1.26 -0.15 -1.04 -0.0 -0.21 -0.93 -0.14 -0.59 0.68 0.04 -0.23 -0.71 -0.27 -0.66 0.02 -0.59 0.18 -0.16 -0.25 0.08 0.71 0.05 -0.11 0.4 -0.34
-1.89 -1.75 -0.23 -0.42 1.59 0.01 0.45 0.32 -0.62 -0.0 1.5 1.56 -0.19 -0.67 -0.17 -1.18 -0.58 -1.04 0.03 0.42 0.34 0.09 -0.6 -2.23 0.43 -0.92 0.89 -0.08 -0.21 -0.1 -0.38 0.59 0.02 -0.29 -0.63 -0.24 -0.11 -0.15 -0.98 -0.23 -0.2 -0.49 -0.15 -0.22 -0.15 -0.19 -0.42 0.09
-1.04 -0.4 -0.12 0.64 0.68 0.39 0.93 0.76 -0.55 0.19 1.03 0.93 -0.23 -1.48 -0.05 -1.28 -0.22 0.19 0.0 0.05 -0.03 0.06 -2.29 -0.98 0.28 -0.35 0.33 -0.32 0.1 -0.11 0.15 0.58 0.03 -0.01 -0.53 -0.39 0.09 -0.16 -0.84 -0.18 -0.31 -0.48 -0.1 -0.05 -0.37 -0.15 0.22 -0.24
-0.53 -0.3 0.45 -0.58 -0.02 -1.87 -1.32 -1.89 -0.18 -0.53 1.47 1.57 -0.71 -0.76 -0.46 -0.33 0.65 -0.21 0.54 0.69 0.35 -0.12 0.32 -0.5 -0.05 -0.39 0.15 0.03 -0.46 -0.04 -0.52 0.54 0.04 0.21 0.09 -0.17 -0.43 -0.15 -0.52 0.14 -0.49 -0.4 -0.07 0.2 0.09 -0.17 0.18 -0.16
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-1.09 -1.58 -0.82 1.37 1.8 0.75 1.43 1.49 0.44 -0.27 1.34 1.31 -0.09 -0.24 -0.38 -0.37 -0.78 -0.73 -0.12 -0.29 -0.62 -0.25 -2.7 -1.64 0.08 -0.81 -0.19 -0.44 -0.41 -0.58 0.3 0.6 -0.39 -0.76 -1.09 -0.36 0.13 -1.11 -1.04 -0.45 -0.47 -0.92 -0.5 -0.47 -1.08 -0.99 -0.35 -0.47
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-3.86 -0.01 0.59 2.73 2.18 1.94 2.31 1.6 -1.22 -4.02 3.14 2.81 -2.44 -2.96 -3.31 -4.04 -3.25 -1.46 -2.72 -4.51 -6.14 -5.08 -5.84 -5.09 -1.53 -3.52 0.09 - -5.1 -5.24 -8.66 1.61 -9.27 - -4.29 -8.81 - - -8.71 -5.42 -7.58 - -6.97 - -7.23 - - -2.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.