1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_288 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
Cba_g00392 (NDF6)
 1.0 0.68 0.05 0.15 0.04 0.06 0.02
1.0 0.65 0.22 0.28 0.24 0.26 0.19
1.0 0.61 0.11 0.19 0.09 0.12 0.06
1.0 0.64 0.22 0.24 0.21 0.17 0.15
1.0 0.61 0.12 0.17 0.1 0.08 0.05
Cba_g01004 (HEMB1)
 1.0 0.66 0.24 0.28 0.25 0.25 0.27
1.0 0.6 0.06 0.15 0.06 0.06 0.02
Cba_g01251 (SCO1)
 1.0 0.66 0.11 0.14 0.11 0.06 0.05
1.0 0.61 0.17 0.24 0.18 0.06 0.08
1.0 0.71 0.35 0.38 0.32 0.29 0.34
1.0 0.76 0.24 0.31 0.26 0.05 0.18
Cba_g01831 (NPQ4)
 1.0 0.62 0.02 0.11 0.01 0.01 0.0
Cba_g01874 (HEMC)
 1.0 0.7 0.26 0.29 0.25 0.17 0.2
Cba_g01898 (PCB2)
 1.0 0.57 0.13 0.2 0.14 0.22 0.11
Cba_g01909 (TPT)
 1.0 0.66 0.12 0.21 0.12 0.04 0.06
Cba_g01961 (PHR2)
 1.0 0.73 0.15 0.23 0.14 0.12 0.06
Cba_g01974 (ASE1)
 1.0 0.67 0.2 0.24 0.15 0.05 0.09
Cba_g01993 (NTRC)
 1.0 0.74 0.23 0.3 0.24 0.25 0.16
Cba_g01997 (FC2)
 1.0 0.66 0.24 0.29 0.25 0.29 0.15
1.0 0.6 0.04 0.2 0.09 0.1 0.02
1.0 0.71 0.14 0.2 0.14 0.12 0.07
Cba_g02302 (PSBR)
 1.0 0.62 0.04 0.14 0.03 0.01 0.0
1.0 0.66 0.03 0.08 0.02 0.04 0.03
1.0 0.63 0.19 0.24 0.19 0.19 0.13
1.0 0.74 0.23 0.29 0.22 0.18 0.13
1.0 0.62 0.09 0.15 0.06 0.08 0.02
Cba_g03831 (HPR)
 1.0 0.61 0.04 0.11 0.04 0.03 0.02
Cba_g03880 (CYP38)
 1.0 0.66 0.17 0.21 0.15 0.28 0.12
Cba_g03951 (HCF173)
 1.0 0.56 0.08 0.18 0.07 0.05 0.07
Cba_g03997 (SIGB)
 1.0 0.57 0.17 0.21 0.14 0.19 0.11
Cba_g04188 (GGT2)
 1.0 0.72 0.13 0.23 0.11 0.07 0.14
Cba_g04477 (AGT)
 1.0 0.65 0.04 0.13 0.04 0.01 0.01
Cba_g04585 (GCH)
 1.0 0.77 0.31 0.37 0.31 0.29 0.4
1.0 0.73 0.27 0.33 0.32 0.2 0.21
1.0 0.57 0.14 0.22 0.1 0.1 0.02
1.0 0.67 0.28 0.31 0.24 0.21 0.19
1.0 0.6 0.03 0.07 0.03 0.07 0.02
Cba_g07831 (PSAD-1)
 1.0 0.63 0.12 0.21 0.11 0.06 0.05
1.0 0.75 0.26 0.31 0.26 0.24 0.19
1.0 0.69 0.16 0.23 0.17 0.1 0.1
1.0 0.69 0.29 0.31 0.31 0.17 0.21
1.0 0.74 0.27 0.34 0.25 0.14 0.28
1.0 0.8 0.3 0.36 0.29 0.28 0.25
1.0 0.69 0.13 0.19 0.12 0.09 0.08
Cba_g08438 (FKBP13)
 1.0 0.67 0.09 0.15 0.09 0.1 0.11
1.0 0.63 0.25 0.28 0.26 0.18 0.17
1.0 0.63 0.16 0.22 0.19 0.1 0.08
Cba_g08697 (TLP18.3)
 1.0 0.65 0.2 0.26 0.18 0.14 0.07
1.0 0.59 0.03 0.12 0.01 0.0 0.0
1.0 0.7 0.16 0.23 0.18 0.08 0.1
1.0 0.64 0.16 0.19 0.15 0.13 0.09
1.0 0.66 0.1 0.18 0.11 0.01 0.08
1.0 0.61 0.26 0.32 0.3 0.27 0.18
Cba_g10062 (RPL27)
 1.0 0.63 0.11 0.19 0.11 0.07 0.07
1.0 0.66 0.18 0.24 0.16 0.21 0.12
Cba_g10743 (CCB1)
 1.0 0.64 0.1 0.18 0.11 0.05 0.08
1.0 0.56 0.08 0.12 0.07 0.03 0.03
1.0 0.65 0.24 0.29 0.23 0.33 0.25
Cba_g10933 (CRB)
 1.0 0.64 0.03 0.11 0.02 0.0 0.0
Cba_g11053 (RPL9)
 1.0 0.65 0.14 0.19 0.14 0.08 0.09
Cba_g11611 (EGY2)
 1.0 0.65 0.21 0.28 0.24 0.14 0.16
Cba_g11616 (emb1138)
 1.0 0.66 0.12 0.2 0.11 0.09 0.09
1.0 0.57 0.15 0.2 0.12 0.15 0.11
1.0 0.7 0.23 0.28 0.28 0.3 0.17
1.0 0.54 0.15 0.22 0.13 0.18 0.06
1.0 0.73 0.22 0.29 0.21 0.14 0.11
Cba_g12674 (STM)
 1.0 0.59 0.13 0.2 0.11 0.04 0.07
Cba_g12990 (CAT2)
 1.0 0.64 0.03 0.07 0.02 0.01 0.02
1.0 0.69 0.1 0.19 0.12 0.07 0.14
1.0 0.66 0.23 0.32 0.25 0.19 0.15
Cba_g13474 (BCA3)
 1.0 0.57 0.13 0.21 0.12 0.0 0.06
1.0 0.62 0.1 0.16 0.11 0.15 0.1
1.0 0.67 0.13 0.2 0.12 0.14 0.08
1.0 0.61 0.13 0.2 0.14 0.1 0.12
Cba_g14150 (GGT1)
 1.0 0.71 0.08 0.11 0.08 0.03 0.05
1.0 0.75 0.08 0.15 0.1 0.14 0.08
1.0 0.7 0.12 0.19 0.12 0.09 0.08
1.0 0.61 0.04 0.11 0.03 0.03 0.01
Cba_g16776 (RPS1)
 1.0 0.58 0.14 0.18 0.12 0.07 0.04
Cba_g16777 (RPS1)
 1.0 0.59 0.1 0.15 0.11 0.1 0.07
1.0 0.69 0.21 0.26 0.26 0.13 0.23
Cba_g18045 (GC1)
 1.0 0.67 0.1 0.21 0.08 0.03 0.03
1.0 0.74 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
Cba_g19279 (HDR)
 1.0 0.84 0.18 0.24 0.2 0.17 0.15
Cba_g19514 (HCF136)
 1.0 0.64 0.13 0.21 0.13 0.04 0.06
Cba_g20079 (FdC1)
 1.0 0.68 0.15 0.21 0.14 0.05 0.1
1.0 0.66 0.03 0.13 0.02 0.0 0.0
Cba_g22191 (RABE1b)
 1.0 0.71 0.12 0.22 0.13 0.11 0.08
Cba_g22253 (CHLM)
 1.0 0.64 0.2 0.27 0.18 0.2 0.09
Cba_g23205 (emb2726)
 1.0 0.7 0.18 0.27 0.16 0.2 0.08
1.0 0.68 0.18 0.2 0.21 0.09 0.05
1.0 0.72 0.15 0.23 0.15 0.19 0.09
Cba_g23972 (Deg1)
 1.0 0.59 0.23 0.33 0.26 0.29 0.19
Cba_g23980 (FTRA2)
 1.0 0.74 0.18 0.24 0.21 0.15 0.13
Cba_g24926 (CDS4)
 1.0 0.73 0.08 0.2 0.1 0.15 0.11
1.0 0.53 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01
1.0 0.58 0.02 0.08 0.02 0.02 0.1
1.0 0.7 0.12 0.18 0.11 0.05 0.03
1.0 0.61 0.17 0.26 0.19 0.11 0.1
Cba_g26607 (LHCA1)
 1.0 0.56 0.07 0.13 0.07 0.05 0.04
Cba_g26743 (PDS)
 1.0 0.58 0.05 0.09 0.05 0.02 0.01
1.0 0.64 0.12 0.2 0.12 0.04 0.07
1.0 0.55 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.56 0.07 0.13 0.05 0.05 0.03
Cba_g27843 (ZKT)
 1.0 0.6 0.1 0.16 0.1 0.17 0.08
Cba_g29645 (ACHT1)
 1.0 0.77 0.26 0.29 0.26 0.27 0.24
Cba_g30019 (GLU1)
 1.0 0.66 0.19 0.22 0.22 0.16 0.11
1.0 0.65 0.19 0.25 0.17 0.26 0.19
Cba_g33046 (CSD2)
 1.0 0.62 0.17 0.24 0.16 0.2 0.16
Cba_g33776 (ATPRX Q)
 1.0 0.5 0.02 0.11 0.01 0.03 0.0
1.0 0.77 0.06 0.09 0.06 0.02 0.03
1.0 0.58 0.04 0.15 0.02 0.01 0.0
Cba_g36211 (ANTR2)
 1.0 0.55 0.17 0.25 0.13 0.06 0.04
1.0 0.59 0.06 0.14 0.05 0.05 0.01
1.0 0.65 0.14 0.22 0.12 0.04 0.04
1.0 0.69 0.03 0.11 0.02 0.0 0.0
Cba_g38068 (BAC2)
 1.0 0.65 0.06 0.17 0.06 0.12 0.03
1.0 0.72 0.2 0.22 0.21 0.09 0.15
1.0 0.62 0.16 0.23 0.15 0.06 0.08
1.0 0.65 0.16 0.24 0.17 0.18 0.19
1.0 0.69 0.1 0.23 0.13 0.09 0.11
1.0 0.66 0.13 0.19 0.13 0.07 0.08
1.0 0.73 0.18 0.17 0.19 0.16 0.17
1.0 0.53 0.04 0.11 0.07 0.1 0.01
1.0 0.75 0.12 0.16 0.05 0.11 0.11
Cba_g70167 (OVA1)
 1.0 0.76 0.27 0.32 0.3 0.23 0.17
Cba_g71747 (FTSH1)
 1.0 0.63 0.14 0.24 0.12 0.08 0.09
1.0 0.69 0.04 0.13 0.02 0.01 0.01
Cba_g78057 (WCRKC2)
 1.0 0.62 0.05 0.1 0.04 0.01 0.01
1.0 0.65 0.05 0.09 0.02 0.04 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)