Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Crozier	Root
Cba_g20942	1.24	48.09	0.0	0.2	0.0	0.14	0.13
Cba_g22029	0.29	4.36	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0
Cba_g28210	0.28	17.2	0.0	0.17	0.0	0.0	0.08
Cba_g28374	0.71	12.73	0.16	0.05	0.0	0.0	0.13
Cba_g65496	0.28	31.6	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0
Cba_g65504 (ADF4)	0.04	3.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65538	0.0	14.56	0.0	0.07	0.0	0.0	0.05
Cba_g65539	0.0	3.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65589	0.0	5.62	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02
Cba_g65610 (UBC11)	0.0	12.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Cba_g65615	0.0	3.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65654	0.02	3.82	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0
Cba_g65686	0.25	31.1	0.0	0.18	0.0	0.01	0.03
Cba_g65723	0.0	8.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65733	0.05	2.41	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01
Cba_g65736 (NQR)	0.12	9.73	0.02	0.04	0.0	0.0	0.01
Cba_g65745	0.05	2.41	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03
Cba_g65772	0.19	4.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Cba_g65825	0.24	11.64	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0
Cba_g65827	0.0	2.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65875	0.0	21.67	0.12	0.28	0.0	0.0	0.0
Cba_g65920	0.0	2.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65940	0.0	7.74	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
Cba_g65941 (GSTU23)	0.01	2.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g65946	0.0	3.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Cba_g65967 (ATB2)	0.17	4.37	0.02	0.2	0.01	0.0	0.02
Cba_g65979	0.0	10.36	0.01	0.05	0.0	0.0	0.05
Cba_g65982	0.03	3.08	0.0	0.03	0.0	0.0	0.13
Cba_g66026	0.0	3.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66104	0.07	5.42	0.16	0.0	0.0	0.0	0.07
Cba_g66174	0.03	7.93	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66259	0.0	2.94	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0
Cba_g66310	0.0	11.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66326	0.0	3.23	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Cba_g66361	0.11	3.88	0.05	0.13	0.0	0.0	0.07
Cba_g66394	0.0	3.75	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0
Cba_g66399	0.24	8.27	0.02	0.11	0.0	0.0	0.04
Cba_g66413 (CAD6)	0.16	7.57	0.0	0.12	0.0	0.02	0.02
Cba_g66530 (TPX1)	0.32	10.43	0.06	0.21	0.0	0.0	0.02
Cba_g66626	0.15	9.51	0.0	0.18	0.0	0.0	0.13
Cba_g66682	0.0	10.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66706 (CKS1)	0.18	7.36	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0
Cba_g66718	0.0	6.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Cba_g66768	0.0	3.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66806	0.32	6.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g66819	0.41	4.12	0.01	0.2	0.0	0.0	0.27
Cba_g66823	0.01	2.11	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
Cba_g66941	0.0	2.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g67019	0.11	3.87	0.0	0.07	0.0	0.01	0.04
Cba_g67070	0.0	2.89	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0
Cba_g67134	0.49	14.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g67612	0.0	3.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g67663	0.0	4.39	0.07	0.0	0.0	0.0	0.09
Cba_g67741	0.0	9.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g67764	0.8	33.45	0.0	0.75	0.0	0.0	0.11
Cba_g68294	0.0	30.07	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0
Cba_g68416 (TRX2)	0.46	8.4	0.0	0.21	0.0	0.0	0.05
Cba_g68624 (CPN10)	0.33	4.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Cba_g68662	0.0	5.54	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0
Cba_g68713	0.08	3.07	0.0	0.03	0.0	0.0	0.07
Cba_g68716	0.0	6.52	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0
Cba_g68811	0.11	2.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g68872	0.14	38.3	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0
Cba_g68888	0.0	5.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g68896	1.04	44.56	0.0	0.37	0.11	0.0	0.05
Cba_g69020 (RAN1)	0.15	4.27	0.0	0.13	0.0	0.0	0.06
Cba_g69071	0.11	5.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g69118 (PFL)	0.0	8.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g69395 (ADH2)	0.0	4.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g69430	0.0	16.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29
Cba_g69493 (GLN1.3)	0.16	3.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.13
Cba_g69511	0.5	10.25	0.0	0.2	0.0	0.04	0.08
Cba_g69531	0.04	3.94	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01
Cba_g69653	0.04	2.29	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01
Cba_g69749	0.0	104.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g69839	0.0	2.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g69975	0.0	8.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70165	0.0	6.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70186	0.03	2.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70200 (SSADH)	0.07	3.84	0.0	0.04	0.0	0.01	0.02
Cba_g70333	0.0	3.15	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02
Cba_g70352	0.13	3.25	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Cba_g70395	0.03	5.33	0.0	0.03	0.0	0.0	0.06
Cba_g70400	0.0	2.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70450	0.0	2.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70476	0.0	2.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Cba_g70505	0.0	2.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70561	0.0	2.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70606	0.0	14.5	0.04	0.03	0.0	0.0	0.04
Cba_g70643 (CXIP1)	0.0	2.14	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Cba_g70688	0.0	3.57	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0
Cba_g70743	0.03	18.29	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Cba_g70776	0.0	2.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70847	0.0	3.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g70917	0.0	5.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71022 (HTA8)	0.05	3.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71066	0.03	2.62	0.0	0.04	0.01	0.0	0.06
Cba_g71077	0.04	2.41	0.0	0.04	0.0	0.03	0.02
Cba_g71303	0.0	2.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71403	0.0	10.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71417 (HTH)	0.06	10.81	0.0	0.03	0.01	0.0	0.02
Cba_g71455	0.14	5.3	0.0	0.12	0.0	0.0	0.04
Cba_g71611	0.03	9.82	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02
Cba_g71616 (B5 #1)	0.15	2.26	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0
Cba_g71621	0.0	4.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71647	0.0	4.52	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Cba_g71671	0.0	4.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71672	0.0	4.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Cba_g71682	0.0	3.84	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71750 (CAD1)	0.0	6.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g71817	0.0	19.34	0.02	0.08	0.0	0.0	0.0
Cba_g71928	0.0	2.79	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Cba_g71979	0.0	4.95	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
Cba_g71981	0.0	11.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g72239	0.0	3.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g72441	0.0	14.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39
Cba_g72453 (CPK20)	0.01	3.81	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Cba_g72454 (ACS)	0.01	2.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Cba_g72490	0.01	4.48	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0
Cba_g72598	0.2	3.94	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02
Cba_g72701	0.07	18.63	0.05	0.09	0.0	0.06	0.0
Cba_g72704	0.0	2.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g72793	0.0	2.35	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0
Cba_g73358	0.0	6.05	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0
Cba_g73500	0.0	3.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cba_g73846	0.08	5.68	0.0	0.1	0.0	0.0	0.02
Cba_g75694	0.35	17.39	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0
Cba_g76704	0.34	58.75	0.06	0.57	0.06	0.13	0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)