Heatmap: Cluster_250 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.01 0.2 0.7 0.11 0.1 0.49 0.62 0.25 0.24 0.23 0.05 0.03 0.19 0.16 0.2 0.15 0.28 0.24 0.33 0.36 0.27 0.26 0.19 0.08 0.17 0.17 0.2 1.0 0.42 0.54 0.42 0.43 0.51 0.89 0.3 0.55 0.47 0.3 0.38 0.25 0.09 0.11 0.21 0.35 0.38 0.29 0.52 0.51
0.03 0.12 0.49 0.19 0.38 0.37 0.42 0.43 0.14 0.13 0.02 0.02 0.07 0.05 0.05 0.05 0.52 0.32 0.52 0.73 0.66 0.6 0.21 0.09 0.41 0.24 0.27 1.0 0.55 0.55 0.57 0.41 0.58 0.83 0.32 0.53 0.65 0.41 0.42 0.3 0.19 0.23 0.24 0.43 0.48 0.46 0.55 0.51
0.18 0.2 0.18 0.11 1.0 0.49 0.26 0.34 0.22 0.16 0.22 0.18 0.1 0.08 0.11 0.15 0.32 0.02 0.79 0.52 0.32 0.26 0.47 0.01 0.08 0.05 0.04 0.52 0.54 0.34 0.48 0.47 0.63 0.43 0.16 0.43 0.4 0.41 0.21 0.43 0.19 0.14 0.4 0.31 0.48 0.42 0.28 0.29
0.28 0.23 0.35 0.05 1.0 0.27 0.22 0.31 0.39 0.23 0.02 0.01 0.12 0.07 0.17 0.35 0.27 0.02 0.46 0.63 0.62 0.27 0.38 0.02 0.06 0.03 0.03 0.57 0.33 0.35 0.55 0.05 0.41 0.31 0.23 0.27 0.29 0.52 0.23 0.52 0.18 0.16 0.5 0.48 0.3 0.53 0.39 0.11
0.01 0.06 0.03 0.01 0.13 0.16 0.07 0.13 0.02 0.26 0.25 0.26 0.23 0.15 0.13 0.03 0.13 0.3 0.27 0.64 0.77 1.0 0.03 0.26 0.31 0.33 0.27 0.15 0.09 0.36 0.31 0.33 0.47 0.24 0.09 0.51 0.39 0.63 0.18 0.54 0.28 0.13 0.3 0.4 0.25 0.61 0.24 0.28
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.07 0.02 0.0 0.14 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.11 0.21 0.08 0.4 0.52 0.33 0.02 0.38 0.04 0.13 0.01 0.91 0.17 0.31 0.56 0.08 0.32 0.57 0.34 0.23 0.46 0.96 0.25 0.29 0.47 0.28 0.34 0.2 0.13 1.0 0.33 0.46
0.19 0.02 0.03 0.01 0.48 0.49 0.41 0.34 0.12 0.21 0.04 0.04 0.16 0.05 0.06 0.09 0.08 0.0 0.49 0.31 0.19 0.06 0.19 0.0 0.03 0.01 0.0 1.0 0.71 0.29 0.66 0.11 0.23 0.15 0.05 0.22 0.25 0.43 0.11 0.44 0.41 0.36 0.72 0.4 0.08 0.46 0.51 0.25
0.0 0.05 0.18 0.07 0.14 0.28 0.26 0.2 0.12 0.15 0.0 0.0 0.04 0.01 0.06 0.0 0.05 0.18 0.11 0.43 0.67 0.54 0.13 0.08 0.1 0.03 0.0 1.0 0.29 0.48 0.52 0.04 0.54 0.72 0.39 0.47 0.82 0.56 0.19 0.2 0.3 0.18 0.19 0.32 0.15 0.56 0.52 0.42
0.31 0.19 0.22 0.04 0.69 0.34 0.32 0.25 0.3 0.31 0.01 0.0 0.36 0.17 0.3 0.17 0.3 0.32 0.31 0.57 0.8 0.6 0.09 0.18 0.32 0.26 0.16 0.61 0.48 0.25 0.42 0.09 0.36 0.54 0.08 0.6 0.71 0.26 1.0 0.38 0.12 0.1 0.39 0.33 0.33 0.23 0.52 0.41
0.16 0.02 0.0 0.0 0.26 0.08 0.06 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.05 0.04 0.37 0.04 0.36 0.59 1.0 0.47 0.37 0.02 0.06 0.02 0.01 0.59 0.24 0.26 0.36 0.07 0.25 0.4 0.1 0.31 0.3 0.05 0.41 0.28 0.05 0.04 0.33 0.19 0.19 0.05 0.25 0.26
0.2 0.21 0.3 0.28 1.0 0.26 0.14 0.25 0.13 0.16 0.02 0.01 0.05 0.02 0.21 0.06 0.23 0.03 0.16 0.38 0.68 0.26 0.08 0.01 0.04 0.02 0.0 0.24 0.08 0.23 0.27 0.25 0.18 0.2 0.04 0.18 0.09 0.14 0.11 0.26 0.03 0.03 0.1 0.58 0.18 0.13 0.41 0.1
0.44 0.51 0.2 0.06 0.23 0.29 0.34 0.38 0.61 0.43 0.02 0.02 0.29 0.19 0.33 0.33 0.73 0.48 1.0 0.87 0.79 0.69 0.92 0.18 0.48 0.25 0.46 0.85 0.5 0.41 0.38 0.34 0.48 0.66 0.47 0.47 0.56 0.38 0.45 0.41 0.17 0.13 0.41 0.39 0.47 0.36 0.5 0.63
0.62 0.0 0.01 0.22 0.76 0.36 0.29 0.33 0.19 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.15 0.06 0.19 0.09 0.11 0.04 0.07 0.02 0.13 0.09 0.08 0.01 0.9 0.42 0.23 0.11 0.03 0.17 0.47 0.14 1.0 0.2 0.02 0.21 0.06 0.01 0.01 0.03 0.16 0.1 0.01 0.22 0.17
0.2 0.23 0.35 0.07 0.61 0.27 0.28 0.22 0.09 0.26 0.07 0.07 0.14 0.07 0.16 0.22 0.43 0.27 0.76 0.79 0.95 1.0 0.14 0.31 0.39 0.12 0.31 0.77 0.26 0.54 0.67 0.33 0.66 0.62 0.12 0.66 0.54 0.55 0.32 0.49 0.13 0.11 0.47 0.58 0.41 0.55 0.74 0.38
0.33 0.15 0.17 0.06 0.47 0.34 0.44 0.37 0.14 0.25 0.01 0.01 0.2 0.26 0.2 0.38 0.36 0.04 0.32 0.38 0.4 0.25 0.23 0.02 0.22 0.29 0.63 0.81 0.8 0.49 0.63 0.04 0.39 0.7 0.16 0.26 0.59 0.75 0.62 1.0 0.46 0.56 0.85 0.8 0.39 0.84 0.42 0.44
0.29 0.24 0.38 0.18 1.0 0.66 0.65 0.52 0.54 0.12 0.04 0.03 0.12 0.06 0.19 0.23 0.35 0.1 0.27 0.3 0.32 0.22 0.33 0.15 0.15 0.08 0.03 0.43 0.4 0.2 0.45 0.11 0.34 0.35 0.15 0.33 0.42 0.09 0.16 0.33 0.13 0.16 0.3 0.28 0.24 0.09 0.31 0.18
0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.24 0.18 0.28 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.03 0.13 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 1.0 0.11 0.42 0.31 0.21 0.37 0.29 0.01 0.47 0.36 0.63 0.23 0.24 0.01 0.05 0.03 0.45 0.28 0.78 0.71 0.12
0.01 0.15 0.12 0.07 0.98 0.45 0.19 0.43 0.16 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.15 0.08 0.07 0.12 0.49 0.51 0.03 0.02 0.04 0.03 0.01 1.0 0.11 0.36 0.39 0.16 0.38 0.27 0.13 0.05 0.21 0.38 0.17 0.16 0.09 0.1 0.17 0.25 0.28 0.38 0.21 0.07
0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.05 0.02 0.03 0.01 0.27 0.03 0.02 0.14 0.27 0.16 0.0 0.17 0.15 0.18 0.43 0.85 1.0 0.1 0.06 0.16 0.02 0.01 0.43 0.2 0.44 0.44 0.18 0.66 0.72 0.11 0.29 0.52 0.77 0.45 0.62 0.42 0.59 0.47 0.63 0.79 0.82 0.5 0.33
0.03 0.06 0.02 0.0 0.2 0.09 0.18 0.07 0.05 0.09 0.01 0.01 0.05 0.07 0.03 0.18 0.12 0.06 0.35 0.46 0.81 1.0 0.18 0.1 0.23 0.04 0.03 0.65 0.47 0.32 0.46 0.1 0.41 0.35 0.09 0.31 0.51 0.2 0.26 0.57 0.11 0.21 0.53 0.32 0.26 0.18 0.6 0.32
0.04 0.03 0.06 0.66 0.59 0.57 0.5 0.41 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.66 0.17 0.03 0.02 0.36 0.98 0.12 1.0 0.0 0.31 0.41 0.21 0.73 0.79 0.01 0.17 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.07 0.01 0.13 0.06
0.23 0.41 0.51 0.03 0.67 0.55 0.45 0.41 0.2 0.3 0.0 0.0 0.17 0.1 0.17 0.52 0.45 0.34 0.98 1.0 0.82 0.76 0.27 0.35 0.48 0.08 0.35 0.61 0.12 0.36 0.49 0.15 0.56 0.44 0.09 0.46 0.47 0.61 0.26 0.44 0.18 0.2 0.43 0.47 0.41 0.61 0.37 0.24
0.03 0.02 0.12 0.16 1.0 0.27 0.19 0.17 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.1 0.04 0.03 0.02 0.04 0.01 0.04 0.05 0.02 0.01 0.72 0.33 0.19 0.55 0.07 0.24 0.22 0.05 0.35 0.4 0.01 0.15 0.04 0.04 0.02 0.08 0.1 0.1 0.01 0.34 0.16
0.07 0.18 0.29 0.03 0.48 0.45 0.41 0.41 0.18 0.23 0.02 0.02 0.07 0.03 0.16 0.06 0.55 0.37 1.0 0.87 0.77 0.69 0.53 0.18 0.19 0.12 0.06 0.79 0.28 0.45 0.78 0.28 0.47 0.73 0.2 0.24 0.62 0.38 0.52 0.59 0.16 0.15 0.35 0.85 0.39 0.4 0.74 0.26
0.11 0.21 0.07 0.02 0.37 0.09 0.01 0.12 0.08 0.23 0.04 0.04 0.1 0.19 0.2 0.17 0.34 0.18 1.0 0.36 0.77 0.39 0.06 0.13 0.02 0.11 0.04 0.82 0.55 0.48 0.59 0.19 0.62 0.65 0.22 0.58 0.62 0.56 0.5 0.52 0.3 0.38 0.45 0.58 0.64 0.56 0.49 0.43
0.08 0.06 0.04 0.02 0.12 0.1 0.05 0.04 0.0 0.18 0.01 0.01 0.25 0.18 0.07 0.1 0.17 0.04 0.4 0.4 0.43 0.41 0.03 0.01 0.19 0.14 0.27 0.15 0.11 0.18 0.26 0.04 0.16 1.0 0.39 0.13 0.1 0.16 0.14 0.19 0.56 0.56 0.25 0.16 0.14 0.16 0.16 0.18
0.07 0.13 0.04 0.14 0.44 0.46 0.62 0.42 0.04 0.19 0.05 0.05 0.07 0.06 0.07 0.08 0.2 1.0 0.16 0.16 0.34 0.65 0.07 0.5 0.78 0.24 0.27 0.95 0.44 0.46 0.95 0.43 0.59 0.55 0.71 0.72 0.97 0.24 0.28 0.17 0.22 0.14 0.27 0.29 0.24 0.24 0.56 0.76
0.26 0.04 0.25 0.04 0.7 0.47 0.24 0.19 0.06 0.44 0.04 0.05 0.28 0.16 0.3 0.05 0.45 0.15 0.41 0.78 0.86 1.0 0.0 0.1 0.59 0.05 0.33 0.86 0.24 0.38 0.63 0.31 0.58 0.66 0.14 0.54 0.74 0.28 0.37 0.3 0.31 0.18 0.55 0.48 0.38 0.3 0.56 0.52
0.01 0.05 0.19 0.09 0.5 0.37 0.56 0.54 0.14 0.18 0.0 0.0 0.05 0.01 0.1 0.01 0.04 0.16 0.02 0.05 0.03 0.23 0.01 0.24 0.16 0.1 0.01 1.0 0.22 0.47 0.44 0.04 0.52 0.77 0.22 0.44 0.5 0.65 0.18 0.14 0.47 0.25 0.17 0.35 0.21 0.68 0.31 0.29
0.2 0.39 0.61 0.09 0.12 0.3 0.2 0.21 0.21 0.22 0.05 0.04 0.07 0.1 0.21 0.25 0.59 0.36 0.65 0.83 0.75 0.88 0.69 0.28 0.24 0.02 0.01 0.21 0.22 0.45 0.43 0.07 0.57 0.4 0.17 0.24 0.22 0.94 0.18 0.54 0.22 0.14 0.59 0.34 0.39 1.0 0.5 0.37
0.03 0.08 0.2 0.14 1.0 0.25 0.31 0.41 0.09 0.06 0.0 0.0 0.03 0.07 0.02 0.18 0.06 0.04 0.07 0.16 0.6 0.59 0.24 0.04 0.17 0.04 0.13 0.72 0.19 0.38 0.56 0.09 0.4 0.35 0.06 0.36 0.36 0.42 0.22 0.38 0.19 0.18 0.29 0.44 0.23 0.43 0.31 0.19
0.17 0.14 0.07 0.02 0.32 0.22 0.19 0.19 0.03 0.34 0.07 0.04 0.24 0.3 0.29 0.04 0.08 0.13 0.16 0.33 0.45 0.84 0.34 0.04 0.14 0.06 0.07 0.8 0.36 0.53 0.57 0.29 0.85 0.78 0.28 0.91 0.67 0.58 0.57 1.0 0.54 0.33 0.8 0.96 0.67 0.64 0.67 0.37
0.17 0.1 0.2 0.0 0.24 0.17 0.11 0.11 0.07 0.13 0.01 0.01 0.08 0.05 0.06 0.05 0.32 0.12 0.47 0.42 0.38 0.3 0.25 0.05 0.26 0.06 0.3 1.0 0.44 0.41 0.7 0.19 0.54 0.66 0.19 0.53 0.65 0.4 0.4 0.38 0.18 0.16 0.32 0.43 0.37 0.42 0.43 0.32
0.52 0.38 0.51 0.04 1.0 0.92 0.77 0.67 0.23 0.13 0.06 0.05 0.05 0.02 0.08 0.14 0.2 0.08 0.32 0.35 0.23 0.17 0.79 0.04 0.1 0.01 0.02 0.53 0.45 0.29 0.5 0.48 0.32 0.33 0.21 0.2 0.4 0.2 0.14 0.18 0.03 0.05 0.18 0.32 0.22 0.21 0.4 0.17
0.03 0.04 0.11 0.01 0.36 0.13 0.18 0.15 0.06 0.08 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.1 0.34 0.01 0.29 0.7 1.0 0.67 0.28 0.0 0.06 0.0 0.0 0.73 0.38 0.33 0.78 0.06 0.42 0.29 0.09 0.2 0.4 0.7 0.25 0.39 0.32 0.27 0.44 0.27 0.23 0.71 0.56 0.47
0.1 0.19 0.35 0.04 1.0 0.33 0.25 0.29 0.14 0.23 0.04 0.05 0.21 0.24 0.22 0.14 0.15 0.1 0.24 0.23 0.22 0.28 0.12 0.24 0.17 0.04 0.3 0.56 0.1 0.29 0.27 0.38 0.27 0.25 0.24 0.42 0.28 0.15 0.42 0.44 0.35 0.25 0.35 0.35 0.25 0.16 0.47 0.18
0.28 0.43 0.42 0.25 0.86 0.41 0.34 0.27 0.13 0.33 0.07 0.05 0.17 0.22 0.28 0.26 0.42 0.23 1.0 0.95 0.73 0.55 0.14 0.16 0.37 0.08 0.14 0.58 0.42 0.52 0.8 0.25 0.47 0.49 0.2 0.29 0.56 0.4 0.33 0.59 0.61 0.56 0.55 0.48 0.43 0.38 0.62 0.34
0.02 0.11 0.42 0.06 1.0 0.54 0.72 0.46 0.12 0.12 0.03 0.02 0.08 0.03 0.07 0.08 0.1 0.05 0.28 0.3 0.23 0.25 0.1 0.15 0.18 0.01 0.0 0.83 0.47 0.26 0.19 0.02 0.21 0.28 0.11 0.58 0.12 0.16 0.16 0.23 0.01 0.05 0.23 0.28 0.14 0.15 0.19 0.09
0.13 0.37 0.48 0.11 1.0 0.34 0.31 0.3 0.14 0.22 0.01 0.01 0.14 0.06 0.25 0.07 0.13 0.11 0.17 0.25 0.32 0.31 0.08 0.08 0.28 0.07 0.41 0.47 0.54 0.3 0.42 0.13 0.39 0.44 0.24 0.31 0.47 0.26 0.23 0.23 0.09 0.1 0.24 0.34 0.33 0.25 0.25 0.26
0.39 0.4 0.42 0.04 0.87 0.51 0.56 0.54 0.33 0.28 0.05 0.05 0.27 0.27 0.27 0.5 0.63 0.06 0.5 0.6 0.62 0.32 0.3 0.02 0.07 0.06 0.08 0.38 0.73 0.44 0.68 0.49 0.93 1.0 0.29 0.64 0.7 0.27 0.65 0.7 0.14 0.15 0.59 0.55 0.98 0.26 0.39 0.35
0.27 0.07 0.05 0.02 0.3 0.18 0.18 0.16 0.15 0.2 0.07 0.06 0.24 0.16 0.12 0.04 0.33 0.19 0.68 0.83 0.95 0.63 0.67 0.1 0.75 0.14 0.57 1.0 0.49 0.34 0.77 0.08 0.56 0.69 0.36 0.38 0.56 0.17 0.24 0.78 0.64 0.49 0.63 0.56 0.37 0.2 0.13 0.38
0.23 0.15 0.27 0.53 0.36 0.41 0.63 0.31 0.16 0.09 0.03 0.03 0.05 0.02 0.1 0.1 0.14 0.53 0.35 0.56 1.0 0.69 0.07 0.38 0.51 0.08 0.1 0.74 0.51 0.53 0.73 0.3 0.55 0.76 0.25 0.62 0.57 0.3 0.38 0.51 0.21 0.15 0.34 0.48 0.5 0.27 0.58 0.49
0.45 0.43 0.64 0.39 1.0 0.37 0.31 0.43 0.17 0.28 0.03 0.03 0.18 0.12 0.21 0.09 0.32 0.3 0.38 0.46 0.31 0.37 0.47 0.23 0.25 0.14 0.22 0.58 0.36 0.4 0.45 0.29 0.39 0.46 0.25 0.2 0.42 0.42 0.33 0.37 0.16 0.16 0.33 0.51 0.38 0.38 0.46 0.26
0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.14 0.0 0.0 0.08 0.12 0.06 0.02 0.16 0.3 0.28 0.35 0.61 1.0 0.05 0.07 0.16 0.01 0.04 0.24 0.06 0.32 0.39 0.05 0.38 0.4 0.02 0.16 0.19 0.58 0.15 0.31 0.28 0.24 0.34 0.24 0.24 0.6 0.25 0.14
0.03 0.0 0.16 0.0 0.01 0.04 0.03 0.02 0.0 0.1 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.06 0.12 0.01 0.03 0.32 1.0 0.3 0.0 0.06 0.04 0.05 0.01 0.76 0.57 0.41 0.6 0.28 0.57 0.43 0.51 0.36 0.74 0.46 0.24 0.35 0.52 0.44 0.29 0.42 0.33 0.43 0.54 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)