Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 1.33 3.2 -0.05 1.68 - - - - - - - - -3.08 3.22 2.86 2.56 - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.06 3.13 3.23 -0.51 - - - - 3.33 - - - - - - 2.54 1.45 -1.76 - - - - - 1.99 - 2.16 -1.45 - - -2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.5
- - 0.42 4.06 - - - - 2.22 - - - - - -4.06 0.64 3.56 - - - - - - - - 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.51 -1.94 -2.36 2.48 -2.72 -0.33 -1.87 -0.96 1.28 -4.55 -5.74 -6.04 -4.32 -3.29 -6.1 -2.26 3.94 -2.16 0.51 -2.3 -4.94 -2.05 1.02 -4.08 3.04 -1.14 2.84 -3.99 -2.91 -3.55 -6.78 -6.76 -4.13 -2.09 -3.04 -6.14 -4.53 -6.1 -4.63 -5.53 -5.23 -3.98 -4.17 -4.23 -4.96 -5.35 -6.41 -2.16
3.05 - 3.02 0.11 - - - - 2.41 - - - - - -2.14 3.15 2.69 - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.33 2.66 -1.79 3.24 - - - - - - - - - - -1.18 4.56 2.82 -1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.45 0.31 - 0.17 -0.2 -0.56 -0.29 1.81 1.26 - - - - - -2.25 4.23 2.9 0.05 -0.29 -1.26 - - - - - 2.82 - - - -2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.31 0.61 0.74 - - - - - - - - - - -2.35 4.05 3.17 -0.51 - - - - - - - 3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.52 3.26 - - 1.38 2.4 3.56 - - - - - - 2.76 1.04 - - - - - - - - 3.05 - - - -2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.13 4.16 - - - - - - - - - - - - 3.66 0.73 - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.7 1.16 2.65 -1.11 1.11 0.22 2.36 2.63 - - -1.54 - -2.24 -4.54 1.89 2.23 0.69 - -2.12 - - - -0.54 -2.17 1.99 - - - -1.88 -2.86 -0.87 - -2.43 - - - -2.19 - 0.23 -0.87 - -0.96 -1.66 - 0.04 -2.18 -2.12
- - - 2.91 2.27 - - - - - 3.24 - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.56 -1.18 0.23 2.48 3.03 -0.51 1.11 1.25 2.97 -6.58 -7.81 -5.8 -6.39 -7.53 -6.67 -1.16 0.58 1.72 0.83 0.01 -0.21 -0.7 2.32 1.05 -0.96 0.53 -3.27 -7.27 -7.86 -5.85 -8.55 -6.84 -6.16 -8.04 -7.01 -7.24 -6.65 -5.71 - -6.34 -6.01 -6.46 -7.39 -8.1 -8.05 -6.05 -7.61 -6.8
- - - 2.58 - - - - - - - - - - - 4.67 3.2 0.38 - - - - - - - 2.56 - - - -2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 2.78 1.6 2.85 -1.78 -2.81 - - 2.72 -4.63 - - - - -5.98 3.12 2.31 -0.61 - - - - - -0.63 - 3.0 - - -3.98 - - -3.59 - - - - - - - - - - - - - - - -4.42
- 3.0 3.36 2.92 0.98 - - - - - - - - - -0.24 1.21 2.45 - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.04 1.5 2.53 - - - -0.86 - - - - - - - 4.85 0.91 0.73 - - - - - -0.65 - 0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.3 3.66 - - - - - - - - - - - - 4.55 1.23 - - - - - - - 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.39 -0.18 -0.47 2.86 1.6 0.8 1.28 1.68 1.38 0.52 -2.25 - -4.23 -3.63 -2.84 3.62 0.27 -2.89 - - -2.48 -0.87 - -2.54 -0.95 2.07 -1.5 - - -2.78 -0.08 - - - - - - -0.71 - -2.67 -3.41 - -1.88 - - 0.03 -0.2 -3.89
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.78 3.12 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.87 - - 2.39 2.61 0.92 - - - -0.57 - - 3.92 0.22 -0.88 - - - - - - - 1.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.01 - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.16 - 1.5 1.36 - - - - - - - - 4.61 3.09 - - - - - - - - -0.47 - - - -3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.03 - - - - 1.25 - - - - - - 4.04 3.41 - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.05 1.81 - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - 3.97 - - - -0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.93 - - - - - - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.48 3.2 - - - - 0.84 - 2.0 3.25 - - - - 2.98 - - - - - - - 0.57 2.0 - - 0.9 -2.31 - 0.92 - - - 1.52 - 0.95 - - - - - - - - - -
- - 2.85 - - - - - 3.86 - - - - - - 0.98 4.2 1.01 - - - - - - - 1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.32 - - - - - 0.16 - - - - - - 4.81 2.52 - - - - - - - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - -
- - 1.45 4.36 - - - - - - - - - - -2.66 - 3.03 3.16 - - - - - 1.68 - - - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.56 - - - - 0.02 - - - - - - 4.29 3.92 - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.56 - - - - 2.2 - - - - - - 4.52 2.88 2.31 - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.73 - - - - - - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - 3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.07 - 0.51 - - - 4.37 - - - - - - - - 1.49 - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.44 -0.23 2.68 - - - - - -2.7 1.59 -0.33 -1.17 - -1.66 3.17 1.64 -2.22 - - - - - -1.38 1.24 1.99 2.05 - -0.35 -1.28 -2.06 -1.67 -0.97 -1.87 - - -1.36 -1.64 0.62 -1.74 - - -0.41 2.07 -0.88 -1.66 -0.29 -0.41
0.74 0.61 0.41 3.44 3.33 -0.06 1.22 1.35 2.66 -0.87 -1.87 -1.05 -3.49 -6.27 -3.84 0.92 -1.03 -0.43 -1.52 -6.32 -3.37 -1.75 - -4.99 -4.6 0.04 -4.8 -2.58 - -2.44 -0.33 -0.82 -4.47 -3.87 - - -4.73 -0.96 -3.89 -2.5 -2.69 -3.79 -2.33 -5.4 -7.09 -1.51 -1.22 -4.74
- - - 3.42 - - - - - - - - - - - 3.88 3.76 - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.51 2.14 2.22 1.67 1.13 0.95 1.52 -1.93 -0.16 -0.32 -1.17 -0.46 -2.06 -0.34 -0.67 3.28 -6.1 -0.72 -1.97 -4.96 -4.61 -2.27 -4.91 1.71 1.43 1.07 -8.18 -5.21 -4.68 -5.3 -0.14 -6.7 -6.88 - -5.19 -5.26 -3.61 -6.2 -5.39 -4.78 -6.58 -3.22 -4.96 -7.36 -3.43 -4.71 -0.71
-0.39 - - 3.39 3.94 2.36 1.3 3.25 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.66 1.79 - - - - - - - - - - - - 4.02 2.39 - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.14 1.25 - - - - 3.89 - - - - 1.69 0.63 - 3.03 - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.64 - -3.82 3.91 2.63 0.77 -0.16 -0.39 -0.2 -8.41 -7.34 -7.5 -5.44 - -4.17 -3.04 -5.75 -1.81 - -4.85 - -5.49 -4.17 1.84 0.69 3.96 -0.05 - -7.4 -7.68 -7.76 - -9.21 - -7.05 - - - - - -5.54 - - - - - - -5.42
- - - - - - - - - - - - - - - 4.73 3.98 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.27 - - 3.27 - 2.9 - - - - - -0.99 - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - - - - - - - 3.52 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.29 - - - 0.32 - - - - - - - 5.11 1.21 - - - - - - - - - - - - -2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.17 - - - - - - - - - - - - 3.94 2.85 0.73 2.24 - - 0.5 - - 0.19 3.02 1.67 - -0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.23 1.93 4.57 - - - - - - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.23 1.3 0.02 1.83 0.36 1.38 1.16 1.11 0.51 0.14 -0.9 -1.44 -0.18 0.0 -0.01 3.0 0.84 0.74 -2.1 -0.05 0.2 0.04 1.16 -0.83 -0.47 0.94 -1.37 -1.29 -1.2 -1.63 -2.08 -2.89 -1.46 -1.96 -4.57 -2.53 -2.25 -0.81 -3.41 -1.81 -1.85 -2.16 -1.55 -1.26 -1.08 -2.2 - -2.31
- - 3.29 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.47 3.95 - - - - - - - - - - - - 2.53 1.89 - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.39 -1.59 -0.73 0.97 1.04 0.88 0.81 0.81 0.01 -0.2 -0.14 -1.1 -1.15 -2.01 -0.12 -1.12 2.89 -1.14 0.33 0.58 0.34 0.24 -1.75 -1.57 2.26 -0.12 0.65 0.14 -1.42 -0.84 -1.38 -0.35 -0.68 -0.41 -1.7 -1.05 -0.75 -1.58 -1.14 -1.12 -2.58 -1.87 -0.81 -0.46 -1.07 -1.53 -0.76 -0.59
- - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.16 1.37 4.01 - 0.87 1.81 1.25 - - - - - - - 3.84 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.31 2.85 -1.21 -1.76 - - - - - - - - - -4.78 3.67 3.28 1.23 - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.66 -0.77 -0.27 3.13 -2.72 -1.47 -0.31 -0.68 2.36 -2.57 -4.08 - -2.7 -3.35 -3.07 2.95 0.67 0.75 -2.52 -1.85 -1.27 -2.01 - -3.56 0.3 2.28 2.36 -0.22 -2.6 -1.99 -2.15 -0.98 -3.4 -1.89 -2.94 -3.27 -2.62 -1.9 -2.78 -1.64 -1.93 -3.78 - -1.77 -1.98 -3.0 -1.36 -2.38
3.92 - 3.57 0.67 - - - - - - - - - - - 2.93 2.46 - - 0.47 - - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.74 - 3.05 - - - - - - - - -3.05 - 3.43 2.48 - - - - 2.1 2.91 - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.85
- 4.03 3.02 - - - - - - - - - - - 0.93 3.01 2.3 - - - - - - - - - - 1.52 1.88 -1.88 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.31 2.6 4.41 -0.5 - - - - - - - - - -5.11 1.61 3.16 -0.95 - - - - - - - 2.27 - - - -4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.68 - - - - - - - - - - -0.57 - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.09 -0.34 - - - - 3.66 - - - - - - - 4.22 - - - - - - 1.2 - 2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.32 0.71 1.96 2.77 -0.45 0.53 0.35 0.47 1.04 -0.59 -1.95 -1.85 -0.41 -0.89 -0.94 1.64 1.04 0.99 1.34 0.78 0.36 -0.18 0.06 0.99 -0.56 -0.15 -1.22 -1.76 -3.1 -1.23 -1.68 -1.65 -2.48 -2.59 -2.6 -1.4 -1.79 -0.7 -3.09 -1.96 -1.57 -1.68 -1.73 -1.82 -2.32 -0.62 -1.74 -1.58
- - - 3.48 - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.22 - 1.42 - 1.01 - - - - - - - 4.9 1.8 - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.35 - - - - - - - - - - -1.91 - 4.63 1.52 - - - - - 2.35 - 2.11 - - - -0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.18 0.44 4.43 - - - - - - - - - - - - 3.36 -1.14 - 0.01 - - - -0.3 - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.58 - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.4 0.85 - 3.18 - - - - 0.08 - - - - - - 4.5 2.61 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.41 - 3.12 - - - - - 0.66 2.75 2.42 - - - 3.77 1.24 - - - - - - - - 2.19 - - - -1.96 - - - - - - - - - - - - 1.13 - - - - -
- - - 4.04 - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.28 2.9 0.71 - - - - - - - - - - -0.24 - 3.32 - 2.12 - - - - - - 3.97 - 1.14 - -0.41 - - - - - 1.43 - - - - - - - - - - - -
- 0.28 3.06 4.58 -0.97 - - - - - - - - - -2.1 - 2.91 0.01 - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.23 2.92 2.8 - - - - - - - - - - - 1.45 1.44 2.65 - - - - - - 3.22 2.77 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.58 - - - - 3.04 - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.46 0.84 3.44 - - - - - - - - - - - 2.9 3.32 0.61 - - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.04 - - - - - 1.05 - - - - - - 4.59 3.43 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.71 - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.19 -1.82 2.8 4.12 1.34 0.61 0.79 2.84 - - - - - -3.65 - 2.52 -0.81 - - - - - - - 1.17 - - - -2.99 - - - - - - - - - - - - - - -1.13 - - -
- 2.51 -0.08 3.64 0.67 0.51 2.26 2.52 3.06 - - - - - -7.19 1.68 1.15 -2.45 - - - - - - - 0.41 - - - -3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.45 - - - - - 3.28 - - - - - - 3.93 2.62 - - 0.79 - - - 0.6 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.95 2.34 1.69 2.44 1.6 - - 2.08 2.57 -1.29 -0.47 -2.25 -1.33 -3.56 -1.68 -2.96 0.9 0.46 0.22 0.09 0.57 -0.52 -4.85 -1.53 -0.95 -3.86 -1.18 -1.54 0.72 -1.04 -0.49 -1.41 -1.68 -1.08 -0.83 -0.75 0.12 -1.59 -2.1 -2.27 -4.82 -4.07 -2.19 -1.78 -2.49 -2.09 -1.94 -0.79
0.17 -7.0 -0.19 2.61 -1.88 2.81 0.91 2.66 2.96 - - - -4.92 -7.04 -7.25 -3.08 1.46 -3.31 -0.03 -3.42 -5.75 - 0.57 -4.71 0.99 2.8 1.01 -6.96 -7.6 -9.17 -6.27 - - - - - - - - - - -7.02 - -7.47 - - -6.99 -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.2 3.87 1.11 2.29 1.07 - - - - - - - - 3.95 1.7 - - - - - - - - 2.12 - - - -4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.85 - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.22 3.84 - - - 2.82 1.18 - - - - - - 3.44 3.09 - - - - - - 1.07 - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.53 1.0 3.66 -2.28 -0.44 2.23 1.39 -0.29 - - - - - - 3.25 2.56 -1.31 - - - - - -0.73 - 2.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.61 - - - - - 4.09 - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.84 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.73 1.53 3.05 -2.28 0.35 1.49 0.44 0.8 -0.84 -4.96 -1.93 0.75 1.16 -0.92 2.05 1.05 0.87 0.57 0.82 0.3 -0.09 -0.73 0.41 -0.97 0.18 -2.21 -3.54 - -5.22 -3.83 -3.09 -2.46 -3.33 -3.88 -2.13 -1.9 -1.78 -0.62 -1.54 -2.0 -0.59 -1.45 -0.31 -2.61 -1.27 -3.61 -3.74
- - 3.98 - - - - - 4.6 - - - - - - - 1.71 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.27 4.43 -0.19 - - - - - - - - - - - 2.05 0.95 - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.55 4.15 1.17 - - - - - - - - - - 1.77 3.11 - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.05 - - - - - - - - - - - - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.97 4.4 - - - - - - - - - - - - 3.79 1.82 - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.17 - - 4.25 - - - 1.45 3.38 - - - - - -2.08 1.71 2.25 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.