Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_11740V3.1	-1.0	-0.48	0.34	-1.29	0.34	0.81	0.22	0.68	-1.07	-0.25	-1.56	-1.61	-0.94	-1.07	-0.64	-1.34	-0.08	-0.24	0.46	0.63	0.38	0.45	-1.24	1.08	0.06	-1.25	-0.39	0.15	0.24	-0.03	0.15	-0.05	0.33	0.7	0.27	0.12	0.25	0.35	-0.05	0.2	-0.03	-0.15	0.01	-0.02	0.01	0.49	-0.19	-0.16
Pp3c11_12990V3.1	-1.12	0.44	1.19	-1.27	0.29	-0.61	-0.91	-0.42	-0.65	0.08	-1.6	-1.41	0.32	0.11	-0.34	-0.62	0.6	0.84	-0.29	0.45	0.34	0.77	-2.27	1.52	-0.02	-0.2	-1.0	-0.75	-1.24	-0.25	-0.29	-0.55	0.09	0.17	-1.09	-0.69	-0.04	0.56	-0.1	0.44	-0.13	0.06	0.5	0.31	0.09	0.56	0.04	-0.44
Pp3c11_23530V3.1	-0.91	0.26	-0.4	-0.13	-0.41	0.68	1.3	0.77	-0.35	0.25	-0.98	-0.77	-0.12	-1.02	-0.28	-0.73	0.06	0.41	0.93	1.08	0.58	0.11	-0.84	-0.84	0.57	-0.14	0.92	0.27	-0.88	-0.17	0.06	0.14	0.01	0.03	-1.49	-0.73	0.26	0.53	-1.31	-0.19	-0.69	-0.94	-0.38	-0.5	-0.53	0.53	-1.02	-0.18
Pp3c12_17000V3.1	-2.4	-0.06	0.3	-1.91	-0.04	-0.22	-0.37	-0.35	-0.47	0.13	-0.54	-0.5	-0.49	-1.32	-0.35	0.33	0.06	-0.03	0.29	0.39	0.58	0.8	-1.49	0.7	0.43	-0.94	0.22	0.65	0.12	0.16	0.45	0.12	0.35	0.61	0.16	0.81	0.11	0.01	-0.1	-0.12	-1.54	-1.31	-0.36	0.15	-0.15	0.06	0.48	-0.02
Pp3c12_22290V3.1	-2.48	-1.29	-0.44	-3.25	0.41	0.72	0.61	0.63	-0.77	0.36	-3.19	-3.14	-0.23	-1.04	-0.07	0.58	1.41	0.22	1.66	1.01	0.57	-0.39	0.02	1.52	0.19	-1.42	-0.54	0.2	-1.15	-0.15	0.03	-0.03	-0.05	-0.32	-1.33	-0.44	0.2	0.23	-1.06	-0.32	-0.94	-1.07	-0.22	-0.12	-0.15	0.17	-0.36	-0.55
Pp3c13_10570V3.1	-0.33	0.65	0.49	0.88	0.06	0.53	1.79	1.63	0.08	0.06	-1.66	-1.98	-0.25	-1.23	-0.08	-1.56	0.43	-0.05	-0.28	-0.14	-0.34	-0.72	-1.66	-2.02	-0.49	-0.15	-0.62	0.72	0.19	-0.42	0.04	-0.1	-0.18	-0.09	1.85	0.63	-0.01	-0.09	-0.94	-1.07	-2.3	-2.33	-1.12	-0.65	-0.73	-0.1	-0.34	-0.64
Pp3c14_20060V3.1	-0.64	0.04	0.45	-1.05	-1.95	-0.25	-1.38	-1.15	-1.01	0.31	-0.02	-0.09	0.14	-0.74	-0.25	-0.56	0.72	0.2	-0.17	-0.08	0.01	0.42	-2.26	1.09	0.32	-0.23	-0.59	0.02	1.18	-0.15	0.56	-0.02	0.2	0.37	0.37	-0.09	0.32	0.59	-0.59	-0.32	-0.6	-0.26	-0.09	0.14	-0.33	0.62	0.47	-0.34
Pp3c14_22830V3.1	-0.77	-0.67	0.56	-0.76	-1.78	-0.12	0.22	0.12	-0.23	0.37	-0.15	-0.04	0.18	-0.49	-0.28	-0.83	0.34	-0.46	0.47	0.59	0.33	0.09	-1.43	0.25	0.26	-0.75	0.18	0.07	0.54	0.15	0.03	0.37	0.04	0.26	-0.17	0.05	0.02	0.48	-0.72	-0.08	-0.29	-0.08	0.08	0.11	-0.32	0.48	0.39	-0.19
Pp3c14_4680V3.1	-0.77	-0.55	0.8	-2.23	-0.71	1.03	2.23	2.31	-0.16	-0.45	-3.58	-3.4	-0.99	-2.15	-0.53	-1.71	-1.5	-2.07	1.2	-0.0	0.41	-0.65	-0.45	-3.4	-0.75	-1.6	-1.04	0.58	0.25	-0.24	0.25	-0.86	-0.6	-0.68	1.96	1.65	-0.27	0.41	-1.57	-1.59	-2.26	-2.22	-1.5	-1.42	-1.83	0.25	-0.78	0.26
Pp3c15_12420V3.1	-0.51	-0.88	-0.17	-0.94	-1.59	0.35	0.87	0.77	-0.92	0.25	-1.34	-1.38	-0.59	-2.02	-0.16	-0.51	-0.1	-0.56	0.52	1.04	1.02	0.6	0.22	0.16	0.45	-1.56	-0.19	0.39	-0.33	0.18	0.53	0.09	0.29	0.21	-3.19	0.11	0.29	0.29	-0.54	-0.02	-0.61	-0.92	0.37	0.4	0.01	0.22	0.44	-0.12
Pp3c15_21980V3.1	-2.4	-1.21	-0.47	-1.64	-2.4	0.48	1.98	2.17	-2.39	0.03	-3.12	-2.36	-0.09	-0.61	-1.19	-1.22	-1.31	-0.79	0.44	0.15	0.16	0.14	-1.25	-3.53	0.4	-1.43	0.14	0.77	0.87	-0.53	0.72	-0.27	0.0	0.37	0.23	1.17	0.64	0.58	-0.65	-0.83	-0.6	-0.85	-1.25	-0.47	-0.76	0.77	-0.02	0.07
Pp3c16_15690V3.1	-0.32	-1.05	-0.87	-4.09	0.52	0.11	0.32	0.26	-0.04	0.38	-2.19	-2.48	-0.16	-1.64	0.17	-0.94	0.18	-1.03	0.55	1.12	1.04	0.7	-0.22	1.62	0.27	-1.92	-0.51	0.19	0.02	-0.07	0.14	-0.76	0.08	0.2	-0.45	-0.53	0.19	0.47	-0.82	0.12	-0.43	-0.44	0.48	-0.01	-0.03	0.49	-0.22	-0.26
Pp3c16_16050V3.1	-0.48	-0.95	0.74	-2.73	0.26	-0.44	-0.68	-0.43	-0.18	0.46	-0.63	-0.95	-0.04	-0.92	-0.09	-0.73	0.03	-0.29	0.62	0.35	0.29	0.16	-2.32	-2.46	-0.2	-0.86	-0.27	0.46	-0.12	0.38	0.29	0.66	0.2	0.49	-0.33	0.59	0.4	0.55	-0.26	0.12	-0.41	-0.06	0.17	0.65	-0.3	0.5	0.76	0.36
Pp3c16_17800V3.1	-1.9	-1.05	-1.59	-4.41	-0.81	0.75	0.56	0.64	-0.08	1.39	-2.51	-2.57	-0.16	-0.98	0.11	-2.76	-1.1	-0.04	-0.78	-0.35	-0.92	-0.92	-1.74	-3.15	-0.1	-1.15	-1.43	1.4	0.85	0.43	0.96	-0.16	0.72	0.27	0.16	1.39	1.29	0.55	-0.04	-0.25	-0.95	-1.67	-0.29	0.21	-0.2	0.59	0.58	0.48
Pp3c16_19640V3.1	-0.53	0.55	1.1	-0.43	-0.95	0.3	0.95	0.88	-0.42	0.02	-1.63	-1.71	-0.43	-0.95	-0.65	0.08	0.25	0.36	0.38	0.46	0.37	0.25	-1.22	1.24	0.1	-0.35	-0.71	0.32	-0.35	0.24	-0.11	-0.26	-0.2	0.26	-0.02	-0.78	-0.18	0.58	-1.1	-0.25	-0.88	-0.77	-0.38	-0.02	-0.81	0.62	0.1	-0.28
Pp3c16_590V3.1	-0.63	-0.97	-0.42	-3.25	-0.28	-0.86	-0.98	-0.8	-0.82	0.11	-1.11	-1.04	-0.54	-0.67	-0.12	-1.43	0.14	-1.08	0.54	0.83	0.78	0.54	0.37	-1.87	-0.06	-1.77	-0.41	0.62	-0.24	0.13	0.4	0.44	0.87	0.64	0.89	0.81	0.34	-0.04	-0.12	0.35	-0.22	-0.36	0.56	0.11	0.52	-0.05	0.35	0.43
Pp3c17_11470V3.1	-0.85	0.19	0.55	0.58	-0.64	0.34	1.03	1.07	-0.64	0.25	-0.14	-0.15	-0.23	-1.37	-0.56	-0.72	0.51	0.04	0.54	0.26	0.36	0.21	-1.9	1.16	0.3	-0.87	-0.09	0.29	-0.22	-0.27	0.15	0.27	-0.1	0.15	-0.33	0.13	-0.0	0.09	-1.08	-0.53	-1.22	-1.38	-0.39	-0.28	-0.81	0.07	0.35	-0.58
Pp3c17_14350V3.1	-1.55	0.54	1.33	0.28	0.08	0.21	0.56	0.91	-0.65	0.35	-1.91	-1.92	-0.2	-0.59	-0.88	-0.89	0.6	0.73	0.39	0.39	-0.1	-0.06	-0.17	0.75	0.43	-0.21	-0.31	-0.37	-0.35	-0.0	-0.13	0.05	-0.3	-0.0	-1.59	-0.73	-0.07	0.7	-1.2	-0.11	-0.84	-0.54	-0.26	-0.16	-0.62	0.66	0.51	-0.4
Pp3c17_16690V3.1	-0.94	-0.46	0.22	-1.85	0.2	0.38	0.97	0.94	-0.74	0.02	-1.72	-1.8	-0.95	-2.1	-0.14	-1.17	0.23	-0.25	0.71	0.6	0.84	0.68	-1.37	0.99	-0.08	-0.8	-0.82	0.64	0.3	0.14	0.29	-0.06	0.17	0.52	-0.59	0.11	0.16	0.02	-0.29	-0.15	-1.3	-1.13	-0.05	0.35	-0.21	-0.03	0.73	-0.29
Pp3c17_2240V3.1	-0.69	-0.71	0.09	-2.02	1.25	-0.49	-0.46	-0.5	-1.38	0.59	-2.72	-2.83	0.06	-0.97	0.01	-2.07	-0.24	0.5	0.44	0.73	0.98	1.47	-1.44	0.91	0.15	-2.94	-2.97	0.07	-0.61	0.05	0.51	-0.66	0.5	0.38	-0.53	0.19	0.26	0.42	-0.21	0.47	-0.9	-0.71	0.5	0.19	0.28	0.4	0.3	-0.49
Pp3c17_23220V3.1	-0.52	-0.14	-0.04	-0.87	-0.94	0.74	0.93	0.92	-0.51	0.36	-1.15	-1.48	-0.38	-1.54	-0.09	0.62	0.34	0.13	0.97	0.86	0.78	0.49	-1.48	-1.58	0.23	-1.11	-0.66	0.16	0.29	0.03	0.21	-0.39	0.06	0.27	-0.15	0.11	-0.05	0.57	-0.86	-0.21	-1.09	-1.4	-0.06	0.09	-0.22	0.57	-0.01	-0.53
Pp3c17_2340V3.1	-1.22	-0.86	-0.28	-2.37	-0.1	0.62	1.08	1.14	-0.4	0.51	-1.45	-1.29	-0.78	-2.19	-0.17	-0.81	-0.15	-1.0	0.32	0.59	0.87	0.55	0.02	-0.85	0.34	-1.94	-0.52	0.26	-0.37	0.07	0.41	0.13	0.68	0.26	-1.15	0.04	0.31	0.37	-0.91	0.19	-0.52	-1.1	0.71	0.43	0.12	0.46	0.46	-0.23
Pp3c17_24090V3.1	-	-0.14	0.58	-3.57	0.62	1.55	0.85	0.17	-2.55	0.04	-7.7	-4.9	-0.59	-1.28	-1.0	-4.62	-0.36	-1.26	0.77	0.92	0.64	0.6	-4.03	1.48	0.19	-2.35	-0.18	1.1	-1.46	0.12	0.41	0.18	0.46	0.59	-1.55	0.13	0.63	0.33	-0.95	0.14	-0.88	-1.36	0.07	-0.18	-0.05	0.27	-0.02	0.59
Pp3c18_21970V3.1	0.03	-0.2	-0.11	-0.84	-0.59	-0.06	0.85	0.34	-1.06	0.05	-1.44	-1.39	-0.62	-0.86	-0.39	-0.8	0.12	-0.33	0.96	1.03	1.09	0.65	1.53	-0.02	0.52	-1.31	-0.05	0.13	-0.96	0.02	-0.02	-0.18	0.07	0.05	-0.61	0.06	-0.37	0.04	-0.62	-0.02	-0.35	-0.18	-0.05	-0.14	-0.36	0.06	0.13	-0.48
Pp3c18_3230V3.1	-0.37	-0.15	1.11	-2.2	0.99	-0.01	-0.7	-0.13	-0.62	0.08	-2.45	-2.3	-0.35	-1.15	-0.18	-1.34	0.22	0.46	0.33	0.39	0.14	0.49	-0.72	1.63	-0.08	-0.95	-1.2	-0.26	-0.53	0.07	-0.13	-0.95	0.32	-0.1	-2.24	-1.08	-0.05	1.06	-0.86	0.3	0.1	0.08	0.52	0.38	0.31	1.1	-0.15	-0.4
Pp3c19_4870V3.1	-0.95	-0.87	-0.43	-1.83	1.63	-0.22	-0.73	-0.68	-0.35	0.26	-4.42	-4.55	-0.69	-0.99	0.0	-1.3	-0.27	-0.58	-0.02	0.02	0.41	0.47	-1.11	1.69	-0.37	-2.45	-1.86	0.44	0.26	0.39	0.59	-1.63	0.72	0.46	-0.01	-0.5	-0.01	0.77	-0.52	0.61	-0.01	0.07	0.72	0.35	0.35	0.83	-0.14	-0.43
Pp3c1_32040V3.1	0.51	-0.04	0.89	0.2	0.2	0.7	0.83	0.95	-0.76	0.15	-1.77	-1.81	-0.27	-0.85	-0.64	-0.15	-0.04	0.47	0.05	0.47	0.49	0.6	-2.75	1.29	0.2	-0.93	-0.38	-0.18	-0.21	-0.38	0.1	-0.14	-0.14	-0.1	-0.47	-0.43	-0.19	0.57	-0.92	-0.26	-0.68	-0.6	-0.31	-0.26	-0.69	0.61	-0.01	-0.8
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Pp3c3_36280V3.1	-1.58	-0.7	0.6	-0.96	-0.22	-0.34	-0.37	-0.32	-0.85	0.12	-0.3	-0.26	0.02	-0.87	-0.2	-0.94	0.26	0.05	0.51	0.42	0.36	0.63	-0.23	-0.06	0.29	-0.2	0.21	0.39	0.06	0.04	0.02	0.4	0.12	0.38	-0.03	0.2	0.32	0.33	-0.47	-0.01	-0.72	-0.36	0.04	0.41	-0.02	0.3	0.44	-0.15
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Pp3c5_3140V3.1	-0.88	-0.23	0.77	0.77	0.31	0.04	0.71	1.12	-0.85	0.1	-4.12	-3.81	-1.09	-2.23	-0.29	-2.02	0.39	-0.3	0.94	0.43	1.01	1.57	-1.36	1.58	-0.62	-3.42	-3.0	0.59	-0.93	0.04	-0.04	-1.01	0.15	0.69	-1.16	-0.01	-0.38	0.45	-0.38	0.15	-1.76	-1.48	-0.05	-0.03	-0.43	0.53	0.09	-1.14
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Pp3c5_8910V3.1	-0.37	-0.69	0.21	-2.07	0.58	0.15	0.34	0.14	-0.59	0.2	-1.91	-1.63	0.09	0.23	-0.01	-0.56	0.4	-0.28	0.63	0.69	0.57	0.43	-0.64	1.44	0.25	-0.05	0.12	-0.31	-0.96	-0.12	-0.11	-0.59	0.12	-0.2	-2.61	-0.84	-0.09	0.42	-0.6	0.23	0.15	0.29	0.36	0.14	-0.04	0.45	-0.46	-0.33
Pp3c7_11490V3.1	-1.64	0.01	0.5	1.54	-1.75	0.66	1.33	1.33	-0.26	-0.14	-2.2	-2.04	-0.03	-0.3	-0.74	-0.53	0.24	0.61	0.68	0.4	-0.12	-0.07	0.25	0.95	0.3	-0.07	-0.31	0.32	-0.45	-0.52	-0.07	-0.02	-0.5	-0.4	-1.38	-0.52	-0.1	0.41	-1.1	-0.65	-0.56	-0.24	-0.59	-0.67	-1.0	0.29	-0.32	-0.57
Pp3c7_13400V3.1	-0.37	0.34	0.61	1.61	-1.34	0.83	1.01	0.85	0.15	-0.03	-0.58	-0.86	0.06	-0.58	-0.2	-0.28	0.3	0.63	-0.02	0.12	-0.15	-0.15	0.26	1.2	-0.11	1.05	-0.85	-0.16	-0.34	-0.5	0.22	-0.54	-0.52	-0.4	-1.38	0.02	-0.15	-0.14	-1.21	-0.8	-0.74	-0.58	-0.74	-1.37	-0.96	-0.35	-0.8	-0.08
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.