Heatmap: Cluster_301 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g007870.3.1 (Solyc01g007870.3)
-2.77 -2.67 -4.07 -5.52 0.51 -1.27 2.47 -1.43 1.07 -1.5 0.5 -1.58 1.34 0.09 -0.07 -3.36 -2.69 - - -4.48 -0.35 -0.03 1.29 0.39 -0.52 -2.0 1.23 1.05 1.3 -0.29 0.55 -0.22 -2.1 -3.24
Solyc01g057090.3.1 (Solyc01g057090.3)
0.16 0.1 -0.76 -0.96 -0.91 -0.59 1.27 -0.91 0.16 0.52 0.19 -0.18 1.0 0.62 0.33 0.29 0.3 -1.51 -0.89 -0.01 -0.08 -0.27 -0.39 -0.4 -0.43 1.11 -0.13 -0.13 0.01 -0.28 -0.22 0.0 -2.95 0.03
Solyc01g068050.3.1 (Solyc01g068050.3)
-0.24 1.14 -0.59 0.45 -0.4 -0.18 1.18 0.07 0.21 0.02 0.48 0.13 0.65 0.35 0.07 -0.81 -0.69 -5.8 -9.06 -1.26 -0.37 0.21 0.36 0.3 0.19 -0.58 0.06 -0.08 -0.18 0.01 0.27 0.07 -1.63 0.1
Solyc01g081010.3.1 (Solyc01g081010.3)
0.07 0.54 -1.64 -1.37 1.58 -0.21 1.28 -1.2 -0.79 -0.55 0.91 0.33 1.08 0.71 -1.49 -2.51 -2.47 -6.2 -6.76 0.15 0.32 -0.04 -0.59 -0.24 0.09 0.73 -0.53 -0.17 0.18 -0.06 -0.14 0.6 -2.03 0.36
Solyc01g088680.3.1 (Solyc01g088680.3)
-0.26 0.7 -0.13 -0.94 -0.39 -0.47 2.03 -0.24 0.11 -0.13 1.46 0.22 1.33 0.93 -0.39 -1.33 -1.38 - -8.33 -1.67 -0.16 -0.28 -0.18 -0.19 -0.33 -0.59 0.09 -0.21 -0.11 -0.06 0.04 -0.11 -3.63 -0.49
Solyc01g091000.3.1 (Solyc01g091000.3)
-2.36 -5.03 -5.1 -9.7 -1.72 -3.13 3.1 -2.98 -0.24 -0.07 2.44 0.82 2.66 1.75 -3.05 -5.76 -5.03 - - -6.58 -3.42 -1.8 0.22 -0.43 -1.17 -4.18 0.02 -0.95 -1.48 -1.68 -1.15 -3.01 -5.28 -2.74
Solyc01g094480.3.1 (Solyc01g094480.3)
0.52 0.01 -1.01 -0.94 -0.83 -0.52 0.98 -0.89 0.42 0.2 0.43 -0.14 0.97 0.44 0.42 0.03 0.1 -2.07 -1.94 -0.46 -0.45 0.24 -0.26 -0.08 -0.14 0.57 -0.15 0.0 -0.09 0.27 0.29 0.47 -1.19 -0.21
Solyc01g100730.3.1 (Solyc01g100730.3)
0.16 1.51 -0.19 0.33 -0.96 -0.62 1.12 -0.38 0.45 -0.23 0.28 0.07 0.76 0.54 -0.51 -1.41 -1.49 -5.11 -4.79 -0.55 -0.33 0.14 0.3 0.12 -0.14 -0.02 0.35 0.27 0.08 0.18 0.26 0.01 -2.42 -0.31
Solyc01g103560.3.1 (Solyc01g103560.3)
0.26 1.21 -0.51 -0.63 -0.64 -0.45 1.58 0.04 -0.18 -0.04 0.76 0.28 0.9 0.44 -0.32 -0.85 -0.96 -6.04 -4.01 -1.01 0.03 0.06 0.32 0.06 -0.02 -1.38 0.25 0.02 -0.12 0.16 0.31 0.01 -1.07 -0.67
Solyc01g104990.3.1 (Solyc01g104990.3)
-0.28 0.12 -1.6 -1.71 -0.26 -0.18 1.62 -0.08 0.5 0.12 0.4 -0.27 1.3 1.17 0.95 0.9 0.94 -4.04 -5.7 -1.87 -1.11 -0.17 -0.0 -0.42 -0.85 -2.92 0.15 -0.08 -0.06 -0.1 0.16 -0.65 -2.49 -0.71
Solyc01g106055.1.1 (Solyc01g106055.1)
0.36 0.82 -3.0 -1.38 -0.5 -1.74 1.88 -1.69 0.6 0.42 0.05 -0.31 1.55 0.99 0.79 0.5 0.41 -3.39 -3.71 -2.26 -1.09 -0.12 -0.73 -0.68 -0.63 -1.84 0.26 0.15 0.14 0.1 0.11 -0.08 -3.9 -0.19
Solyc02g069980.3.1 (Solyc02g069980.3)
0.29 0.32 -1.15 -0.31 -0.32 -0.15 1.43 -0.79 -0.3 0.59 0.19 -0.01 0.58 0.09 0.14 -0.58 -0.33 -1.12 -0.51 -0.35 0.04 -0.14 -0.29 -0.28 -0.1 0.54 -0.12 -0.08 0.15 -0.12 -0.11 0.34 -1.05 0.3
Solyc02g081840.3.1 (Solyc02g081840.3)
-0.33 1.76 0.46 0.78 -0.4 -0.42 0.83 0.12 -0.43 0.25 0.29 -0.11 0.68 0.36 0.54 -0.07 -0.24 -5.8 -5.19 -2.3 -1.14 0.21 0.22 -0.02 -0.37 -1.7 0.38 0.07 -0.26 0.17 0.18 -0.18 -3.14 -0.72
Solyc02g084020.3.1 (Solyc02g084020.3)
-0.79 1.17 -0.93 -0.6 -0.56 -0.21 1.65 0.15 0.04 -0.4 0.9 0.82 1.2 1.03 -0.51 -1.37 -1.35 -8.81 -7.94 -0.88 -0.53 -0.14 0.09 -0.22 -0.43 -1.26 0.5 0.12 -0.09 0.05 0.15 -0.26 -0.76 -0.52
Solyc02g086645.1.1 (Solyc02g086645.1)
-0.12 1.7 -0.04 -0.03 -0.19 -0.33 1.31 -0.17 -0.36 -1.17 -0.15 0.27 -0.21 0.05 -2.02 -2.24 -2.61 -7.73 -9.26 -0.27 -0.69 0.02 0.86 0.35 0.03 0.38 0.71 0.34 0.24 0.1 0.33 -0.07 -0.84 0.29
Solyc02g087130.3.1 (Solyc02g087130.3)
0.27 -0.03 -0.31 -0.45 -0.31 -0.26 1.4 -0.6 0.32 0.44 0.27 -0.06 0.76 0.49 0.41 0.3 0.3 -6.05 -5.34 -0.58 -0.64 -0.15 -0.17 -0.17 -0.36 0.47 0.14 0.1 0.02 -0.16 0.0 -0.06 -2.15 0.26
Solyc03g005310.3.1 (Solyc03g005310.3)
-0.48 0.71 -1.35 -1.42 -1.05 -0.71 2.41 -0.36 0.46 -0.91 0.13 -0.22 1.16 1.29 -0.59 -1.14 -1.14 -3.83 -3.04 -1.32 -0.42 -0.08 0.29 -0.12 -0.52 -0.88 0.59 0.27 0.33 0.04 0.27 -0.35 -2.13 -0.53
Solyc03g005315.1.1 (Solyc03g005315.1)
-0.4 0.47 -1.34 -1.44 -1.77 -1.0 2.44 -0.55 0.57 -1.3 0.51 0.14 1.45 1.31 -0.65 -1.32 -1.57 -4.19 -2.85 -1.31 0.01 -0.05 0.19 -0.12 -0.62 -1.17 0.55 0.17 0.18 -0.09 0.23 -0.36 -1.92 -0.79
Solyc03g033310.3.1 (Solyc03g033310.3)
-0.18 0.42 -0.77 -0.59 -1.06 -0.63 1.58 -0.46 0.03 0.14 0.8 0.47 1.61 1.46 0.38 0.32 0.17 -4.44 -4.1 -0.77 -0.24 -0.53 -1.1 -0.87 -1.04 0.18 -0.1 0.03 -0.27 -0.39 -0.31 -0.46 -3.18 -0.16
Solyc03g033600.3.1 (Solyc03g033600.3)
-0.61 1.0 -0.24 0.02 0.28 -0.05 0.93 0.08 0.31 -0.11 0.62 0.77 0.71 0.81 -0.16 -0.35 -0.36 -8.27 -7.86 -0.4 -0.59 -0.66 0.37 -0.01 -0.3 -0.28 0.63 0.18 -0.02 -0.6 -0.37 -0.88 -0.62 -0.28
Solyc03g111593.1.1 (Solyc03g111593.1)
-0.25 0.93 -0.62 0.2 0.18 -0.27 1.75 -0.26 0.45 -0.51 0.44 0.13 1.0 0.67 0.59 0.28 -0.01 -6.88 -8.24 -0.61 -0.49 -0.43 -0.04 -0.36 -0.61 -0.25 0.17 -0.14 -0.5 -0.05 -0.26 -0.5 -2.55 -0.52
Solyc03g112350.3.1 (Solyc03g112350.3)
-0.48 0.29 -1.07 -0.53 -1.81 -0.71 2.07 -0.45 0.02 0.67 0.55 -0.11 1.44 0.92 -0.35 -0.53 -0.5 -1.72 -2.94 -0.27 0.48 -0.27 -0.1 -0.21 -0.57 0.2 0.05 0.05 -0.21 -0.31 -0.2 -0.35 -2.88 -0.71
Solyc03g112353.1.1 (Solyc03g112353.1)
-1.1 0.64 -0.49 -0.19 -0.52 -0.5 1.42 -0.29 -0.16 0.31 0.12 -0.53 1.1 0.45 0.11 -0.03 0.02 -1.07 -2.48 -0.84 -0.21 0.01 0.03 -0.08 -0.38 0.97 0.18 0.15 -0.02 -0.1 0.03 -0.05 -2.44 -0.16
Solyc03g119010.3.1 (Solyc03g119010.3)
0.23 0.65 -0.54 -0.21 -0.04 -0.15 1.26 -0.09 0.28 0.02 0.87 0.76 0.54 0.79 -0.45 -1.06 -0.85 -7.32 -7.61 -0.12 0.26 -0.27 -0.52 -0.41 -0.29 0.07 -0.09 -0.17 -0.0 -0.19 -0.05 0.13 -1.43 0.46
Solyc03g119730.3.1 (Solyc03g119730.3)
-0.63 1.0 -0.42 -0.12 -0.44 -0.29 1.84 0.11 0.53 -0.04 0.22 -0.1 0.65 0.49 0.19 0.03 -0.04 -6.34 -5.5 -1.82 -0.93 0.07 0.23 0.01 -0.31 -0.71 0.33 0.09 -0.07 0.08 0.23 -0.31 -1.47 -0.55
Solyc03g121650.3.1 (Solyc03g121650.3)
-0.91 -0.18 -0.91 -1.1 -0.48 -0.26 1.21 -0.46 0.02 -0.13 -0.02 -0.43 0.82 0.82 0.8 0.69 0.47 -3.34 -5.36 -0.25 0.37 -0.07 -0.09 0.01 -0.02 0.68 0.0 0.16 0.32 -0.04 -0.05 -0.03 -2.56 -0.2
Solyc03g121980.3.1 (Solyc03g121980.3)
-0.07 0.3 -0.61 -0.28 0.26 -0.04 0.86 -0.34 -0.24 0.09 0.48 0.06 0.81 0.47 -0.18 -0.62 -0.5 -2.01 -1.91 -0.15 0.11 0.02 0.1 0.02 -0.07 0.57 0.07 -0.0 -0.12 0.06 0.02 0.21 -0.95 0.11
Solyc04g008750.3.1 (Solyc04g008750.3)
-0.13 0.29 -0.48 -0.65 0.43 -0.25 1.8 -0.48 0.26 -0.08 0.74 0.42 0.84 0.8 -0.01 -0.4 -0.49 -5.28 -5.92 -0.58 -0.86 -0.03 -0.48 -0.39 -0.36 -0.26 -0.14 -0.01 0.04 0.14 0.06 0.06 -0.98 0.02
Solyc04g009820.3.1 (Solyc04g009820.3)
-2.61 1.71 -2.58 -1.3 -0.99 -1.94 3.48 -2.33 1.27 -2.18 0.27 1.78 1.21 1.77 -2.97 -7.53 -5.14 - - -3.89 -0.34 -1.53 -0.35 -1.21 -1.68 -3.45 -1.27 -2.05 -1.9 -2.13 -1.05 -3.47 -4.05 -3.01
Solyc04g072690.3.1 (Solyc04g072690.3)
-0.11 -0.01 -0.27 -1.15 -1.46 -0.73 2.02 -0.65 0.54 0.05 0.39 0.43 0.79 0.6 -0.34 -1.05 -0.83 -8.24 -8.73 -0.05 -0.02 0.0 0.62 0.26 -0.06 -0.17 0.43 0.08 0.08 -0.02 0.21 -0.36 -3.15 -0.23
Solyc04g077560.3.1 (Solyc04g077560.3)
0.14 0.49 -0.03 0.18 -0.42 -0.55 1.15 -0.51 -0.13 0.3 0.25 0.02 0.98 0.93 0.38 0.01 0.12 -4.65 -3.29 0.22 0.33 -0.36 -0.37 -0.37 -0.47 0.66 -0.22 -0.28 -0.03 -0.47 -0.31 -0.2 -2.56 -0.04
Solyc04g078320.3.1 (Solyc04g078320.3)
-0.3 -0.19 -0.68 -0.94 0.32 -0.31 1.56 -0.87 -0.02 0.02 0.65 0.8 1.23 1.32 -0.08 -0.06 -0.02 -4.28 -3.91 -0.12 0.3 -0.59 -0.43 -0.62 -0.86 0.22 0.05 -0.09 -0.06 -0.54 -0.36 -0.58 -2.75 0.4
Solyc05g012190.3.1 (Solyc05g012190.3)
0.48 1.24 -0.79 -1.41 -0.61 -0.31 1.51 0.3 0.21 -0.83 0.42 -0.16 0.92 0.56 -1.78 -3.08 -2.9 - - -0.52 0.23 0.12 0.29 0.2 0.08 0.19 0.47 0.24 0.1 0.21 0.36 0.19 -2.17 -0.12
Solyc05g012360.3.1 (Solyc05g012360.3)
-3.34 0.56 -3.96 -0.51 -3.63 -2.7 2.18 -0.81 0.88 0.9 0.11 -0.84 1.25 0.01 1.51 0.04 0.37 - -7.06 -5.78 -2.49 0.16 0.58 0.3 -0.25 -3.02 0.61 0.36 0.34 0.13 0.57 -0.64 -6.29 -3.14
Solyc05g051515.1.1 (Solyc05g051515.1)
-0.44 0.38 -1.68 -0.63 -2.51 -0.47 2.15 0.01 -0.12 0.39 1.27 0.98 1.72 1.6 0.14 -0.04 -0.23 -6.92 -7.34 -1.59 -1.76 -1.09 -0.38 -0.91 -1.52 -0.98 0.29 -0.28 -0.85 -0.68 -0.34 -1.28 -0.96 -0.83
Solyc05g052690.3.1 (Solyc05g052690.3)
-0.11 1.87 -0.09 0.7 -0.24 0.01 0.59 0.43 0.26 -0.18 0.61 0.23 0.36 0.28 -0.01 -0.38 -0.67 -3.81 -2.61 -0.74 -0.38 -0.31 0.04 -0.16 -0.34 -0.69 -0.1 -0.2 -0.14 -0.25 -0.05 -0.35 -1.46 0.09
Solyc06g007780.3.1 (Solyc06g007780.3)
-0.66 0.26 -1.31 -1.95 -1.47 -0.73 2.04 -0.67 1.1 0.61 0.4 0.38 1.05 0.97 0.49 0.2 0.36 -9.29 -10.67 -2.4 -1.36 -0.17 0.3 -0.15 -0.56 -1.17 0.33 0.18 -0.01 -0.02 0.15 -0.47 -2.46 -0.93
Solyc06g008110.3.1 (Solyc06g008110.3)
0.29 0.06 -0.79 -0.73 0.35 -0.17 1.1 -0.42 0.2 0.25 0.46 -0.06 1.08 0.94 0.25 0.18 0.1 -2.77 -3.28 -0.05 0.53 -0.47 -0.33 -0.35 -0.62 0.53 -0.21 -0.23 -0.43 -0.34 -0.24 -0.4 -1.45 0.15
Solyc06g009060.3.1 (Solyc06g009060.3)
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Solyc06g082390.3.1 (Solyc06g082390.3)
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Solyc06g082510.3.1 (Solyc06g082510.3)
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Solyc06g083300.3.1 (Solyc06g083300.3)
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Solyc06g083540.3.1 (Solyc06g083540.3)
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Solyc07g005700.3.1 (Solyc07g005700.3)
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Solyc07g065840.2.1 (Solyc07g065840.2)
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Solyc08g007990.3.1 (Solyc08g007990.3)
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Solyc08g014040.3.1 (Solyc08g014040.3)
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Solyc08g041890.3.1 (Solyc08g041890.3)
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-0.53 0.84 -0.93 -0.68 0.7 0.17 1.21 -0.49 0.07 0.06 0.65 0.52 1.29 1.08 0.18 -0.05 -0.19 -4.72 -3.91 -0.3 0.08 -0.64 -0.42 -0.57 -0.83 0.42 -0.15 -0.3 -0.37 -0.47 -0.4 -0.45 -2.46 0.19
Solyc11g010240.2.1 (Solyc11g010240.2)
-0.1 -0.63 0.04 -0.18 -1.39 -0.07 1.86 -0.33 0.2 0.26 0.32 -0.35 1.19 0.76 0.49 0.33 0.24 -3.97 -4.36 -0.49 -1.09 -0.48 -0.39 -0.48 -0.78 0.14 0.16 0.02 -0.29 -0.29 -0.19 -0.75 0.3 -0.13
Solyc11g012820.2.1 (Solyc11g012820.2)
-0.24 0.46 -1.44 -1.5 -0.57 -0.83 1.55 -0.35 0.17 -0.35 0.36 -0.23 0.73 0.61 -0.36 -0.6 -0.91 -4.42 -5.7 -0.05 -0.39 0.29 -0.06 0.02 -0.04 0.37 0.53 0.51 0.42 0.54 0.5 0.45 -2.29 -0.01
Solyc11g013520.2.1 (Solyc11g013520.2)
-0.16 -0.63 -1.46 -1.38 -0.78 -0.58 1.56 -1.02 0.05 0.4 0.81 0.46 1.79 1.28 0.46 0.29 0.35 -5.76 -5.13 -0.52 -0.08 -0.49 -0.51 -0.51 -0.76 0.36 -0.13 -0.23 -0.31 -0.37 -0.32 -0.4 -1.89 -0.1
Solyc11g017300.2.1 (Solyc11g017300.2)
0.09 0.71 -0.91 -0.0 0.95 0.06 1.85 -0.69 -0.24 -0.57 0.51 0.47 0.99 1.05 -0.38 -1.02 -0.88 -6.73 -5.56 -0.3 0.34 -0.38 -0.23 -0.46 -0.54 -0.37 -0.09 -0.35 -0.25 -0.28 -0.17 -0.16 -1.35 -0.18
Solyc11g033260.2.1 (Solyc11g033260.2)
0.1 1.19 -0.15 0.84 -1.41 -0.73 1.44 0.02 0.2 -0.75 -0.25 -0.5 -0.32 -0.42 -0.06 -0.31 -0.3 -5.23 -6.62 -1.04 -1.51 0.44 0.48 0.39 0.25 0.2 0.38 0.13 -0.13 0.5 0.64 0.18 -2.8 -0.03
Solyc11g066480.2.1 (Solyc11g066480.2)
-0.93 0.47 -0.78 -0.07 -0.24 -0.44 1.59 -0.37 -0.17 -0.11 0.15 0.25 0.4 0.73 -0.02 -0.22 -0.28 -1.82 -2.36 -0.87 -0.18 0.05 0.34 0.06 -0.18 -0.79 0.63 0.3 0.3 0.13 0.33 -0.2 -0.48 -0.38
Solyc11g066840.2.1 (Solyc11g066840.2)
0.0 2.19 -0.82 -0.3 -0.39 -0.82 0.83 -0.9 -1.14 -0.87 1.38 1.08 1.59 1.4 -2.45 -3.8 -3.73 -4.85 -4.38 -0.02 1.24 -0.82 -1.12 -0.91 -0.31 -1.34 -1.03 -0.75 -0.18 -0.91 -0.95 0.21 -1.69 0.04
Solyc11g069910.2.1 (Solyc11g069910.2)
-0.74 0.52 -0.98 -0.52 -0.08 -0.42 1.64 -0.47 0.75 -0.04 0.53 0.41 0.83 1.06 0.37 0.19 0.06 -4.17 -4.55 -0.58 -1.0 -0.14 -0.41 -0.43 -0.6 -1.07 0.23 0.06 0.04 0.08 0.15 -0.16 -0.62 -0.54
Solyc11g072090.2.1 (Solyc11g072090.2)
-0.16 1.18 -0.12 -0.0 -1.48 -0.78 0.89 0.1 0.16 -0.4 0.28 0.08 0.84 0.58 0.08 -0.41 -0.5 -8.3 -10.91 -0.82 -0.48 0.2 0.29 0.18 -0.05 -0.38 0.59 0.33 0.18 0.3 0.32 0.19 -1.77 -0.35
Solyc11g072615.1.1 (Solyc11g072615.1)
-0.2 0.15 -2.17 -2.34 -0.7 -0.32 1.73 -0.01 0.57 0.26 -0.36 -0.7 0.67 0.19 0.31 -0.42 -0.19 -7.86 -8.18 -0.68 -1.15 0.55 0.01 0.1 0.06 0.45 0.32 0.52 0.56 0.55 0.57 0.63 -3.37 -1.23
Solyc12g008420.2.1 (Solyc12g008420.2)
0.28 -2.29 -3.17 -3.28 1.2 -0.13 2.43 0.27 0.72 0.56 0.35 -0.41 -0.62 -1.39 0.03 -0.31 -0.26 - - -1.18 0.06 0.32 0.55 0.43 0.01 -0.74 -0.55 -0.47 -0.66 -0.05 0.37 0.07 -4.09 0.21
Solyc12g049410.2.1 (Solyc12g049410.2)
0.07 0.98 -0.5 -0.44 -0.7 -0.55 1.67 -0.19 0.21 0.05 -0.06 -0.57 0.38 -0.17 -0.0 -0.32 -0.32 -10.73 -11.46 -0.92 -0.93 0.24 0.47 0.29 -0.05 0.38 0.54 0.42 0.22 0.24 0.34 0.02 -3.17 -0.14
Solyc12g088730.2.1 (Solyc12g088730.2)
-0.54 1.81 0.11 0.68 -0.47 -0.29 0.58 0.16 -0.25 -0.6 -0.23 -0.31 -0.1 0.03 0.2 -0.1 -0.25 -1.96 -7.81 -0.64 -0.54 0.11 0.19 0.13 -0.0 -0.19 0.39 0.26 0.08 0.21 0.18 0.0 -1.48 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.