1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.75 6.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g20932 (P40)
 0.42 2.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 4.53 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11
0.35 2.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.27 7.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 9.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 3.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g21175 (AAC2)
 0.7 6.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.35 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 3.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 3.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 3.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.35 4.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 5.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.96 10.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 2.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 4.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.35 11.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.09 13.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
Cba_g21346 (PFL)
 0.37 2.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.29 14.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 9.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 6.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 7.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.09 4.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 5.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.67 9.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 3.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 3.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.26 3.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 4.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.65 5.82 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0
0.27 3.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 6.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 5.22 0.0 0.02 0.0 0.0 0.27
0.39 3.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
1.15 10.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g27901 (RACK1C_AT)
 0.43 3.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 3.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 12.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.99 6.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 4.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06
0.64 4.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.78 5.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.78 5.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.89 13.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 4.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 2.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 8.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.24 8.53 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03
0.89 7.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 3.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 5.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.77 5.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 7.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 3.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 4.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 3.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 5.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 3.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 19.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 2.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 3.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 4.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g65602 (VAMP726)
 0.38 5.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 2.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.15 3.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 6.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.05 3.23 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
0.43 3.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 8.56 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08
Cba_g65727 (TUB2)
 0.75 4.61 0.0 0.02 0.0 0.0 0.3
0.1 3.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 4.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 4.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 3.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 2.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g65943 (GRF12)
 0.38 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.9 6.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 11.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 9.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.92 9.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 3.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g66195 (THY-2)
 0.25 3.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 2.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 6.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.76 6.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 5.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 3.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.48 4.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56
0.29 3.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 3.99 0.0 0.1 0.0 0.02 0.05
0.38 4.24 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.0 11.74 0.0 0.13 0.0 0.0 0.08
0.0 5.82 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04
Cba_g67226 (ACT11)
 0.82 6.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.37
0.0 3.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 3.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 11.94 0.0 0.0 0.12 0.0 0.08
0.0 2.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 2.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g68057 (BBC1)
 0.53 3.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 3.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 3.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 3.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 3.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.98 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g68897 (RPL23AB)
 0.31 2.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 3.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 2.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 4.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 3.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Cba_g69569 (UBC35)
 0.45 3.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 3.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 2.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 10.2 0.0 0.08 0.0 0.03 0.41
0.3 3.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 2.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 4.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 4.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 3.55 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 2.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 3.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 6.49 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.27 2.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 2.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.1 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 6.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 2.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 3.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 2.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.16 14.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.13 2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 2.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 2.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 3.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 5.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.64 4.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.38 3.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cba_g73627 (GAPCP-1)
 0.71 3.51 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 3.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 6.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06
Cba_g73898 (EMB2296)
 0.39 3.51 0.0 0.14 0.03 0.0 0.17
0.13 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 7.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 6.49 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.4 3.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 15.73 0.0 0.53 0.74 0.21 0.36

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)