Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.19 5.46 0.08 0.52 0.0 0.15 4.85
0.92 8.54 0.13 1.06 0.0 0.0 1.49
0.6 5.99 0.0 0.28 0.0 0.0 1.54
0.43 3.61 0.03 0.39 0.0 0.0 0.26
0.7 6.63 0.0 1.07 0.0 0.0 1.39
Cba_g21229 (CAM4)
0.27 4.94 0.07 1.25 0.0 0.0 3.49
0.53 7.26 0.0 0.91 0.0 0.0 3.03
0.69 7.88 0.07 1.31 0.0 0.0 1.57
0.98 6.2 0.0 0.54 0.02 0.0 4.19
0.28 4.72 0.0 0.47 0.0 0.0 0.5
0.85 7.12 0.0 1.54 0.0 0.01 5.43
Cba_g21916 (LOS1)
0.36 3.69 0.02 0.74 0.0 0.0 2.3
Cba_g23060 (HSP81-3)
0.6 4.54 0.0 0.68 0.01 0.0 0.55
0.45 4.95 0.0 0.51 0.0 0.0 0.96
0.46 3.61 0.06 0.37 0.0 0.0 2.98
1.12 14.47 1.07 4.42 0.0 0.0 7.37
0.67 5.79 0.0 0.41 0.0 0.0 2.69
Cba_g24456 (EMB2296)
0.45 3.02 0.0 0.62 0.0 0.0 2.68
Cba_g25140 (AML1)
0.41 4.6 0.0 0.52 0.0 0.0 2.89
0.51 5.54 0.0 1.02 0.0 0.0 1.77
0.3 4.93 0.0 1.15 0.0 0.0 0.48
0.51 6.59 0.0 0.7 0.0 0.0 5.78
0.73 12.41 0.0 1.58 0.0 0.0 4.11
0.78 7.02 0.0 1.03 0.11 0.0 1.53
1.24 9.32 0.09 1.11 0.0 0.0 2.68
0.72 5.58 0.0 0.26 0.0 0.0 4.08
Cba_g28091 (PFL2)
1.01 15.04 0.0 2.55 0.16 0.0 4.69
0.76 11.06 0.17 0.44 0.09 0.24 8.25
0.33 4.55 0.0 0.49 0.0 0.0 1.75
0.32 7.01 0.0 1.78 0.0 0.0 4.48
0.76 8.46 0.0 1.22 0.0 0.0 1.01
0.34 4.36 0.0 0.29 0.02 0.0 1.31
0.43 4.71 0.0 0.5 0.0 0.0 3.16
7.2 162.4 2.67 9.43 3.64 7.44 64.71
4.44 143.34 3.32 6.53 3.59 5.98 90.75
0.0 5.07 0.26 0.15 0.11 0.0 2.02
7.52 99.49 2.5 8.3 3.85 4.23 90.75
0.2 6.43 0.07 0.22 0.07 0.06 2.96
0.49 9.66 0.0 0.94 0.0 0.0 9.74
0.18 4.33 0.05 0.09 0.04 0.13 1.73
1.69 33.67 0.38 1.08 0.43 1.61 19.78
1.31 42.32 2.01 1.87 0.41 1.0 14.26
4.17 24.33 0.46 6.12 0.0 0.0 10.9
0.76 8.56 0.36 0.34 0.12 0.51 4.85
0.37 16.73 0.0 0.08 0.0 0.0 4.89
0.0 10.92 0.1 0.24 0.0 0.0 2.35
0.2 15.58 0.17 0.09 0.17 0.0 8.33
2.39 50.79 4.04 3.31 3.84 0.62 22.76
0.81 57.02 6.26 6.13 0.66 2.77 43.78
0.78 18.73 0.3 0.76 0.08 1.6 13.94
0.68 31.62 0.22 0.86 0.77 1.29 13.48
8.27 221.44 4.17 6.77 4.04 5.49 92.48
Cba_g65029 (CYTC-2)
0.0 24.94 0.0 0.11 0.32 0.18 7.38
0.13 32.6 0.0 0.0 0.39 0.0 8.65
0.0 2.37 0.11 0.05 0.0 0.1 1.66
0.23 2.84 0.01 0.27 0.0 0.0 0.34
0.32 2.89 0.0 0.51 0.0 0.0 0.57
0.0 6.75 0.0 0.0 0.0 0.0 2.38
0.73 5.43 0.0 0.97 0.0 0.0 1.19
0.18 3.44 0.0 0.3 0.0 0.0 0.75
0.28 2.5 0.0 0.34 0.0 0.0 0.44
0.08 2.86 0.02 0.36 0.0 0.0 1.57
Cba_g66622 (HSP70)
0.26 3.09 0.03 0.23 0.0 0.0 1.47
0.24 2.82 0.0 0.12 0.0 0.0 1.43
0.2 3.64 0.0 0.53 0.0 0.0 1.38
0.26 4.79 0.0 0.98 0.07 0.0 0.6
0.38 4.77 0.02 0.79 0.0 0.0 0.84
0.41 3.32 0.0 0.66 0.02 0.0 2.58
0.16 5.2 0.0 0.87 0.0 0.0 2.26
Cba_g67197 (OLI5)
0.31 4.43 0.0 0.44 0.0 0.0 0.56
0.16 2.43 0.01 0.54 0.0 0.0 0.77
0.66 8.08 0.0 0.93 0.0 0.0 1.45
0.42 3.84 0.0 0.49 0.0 0.0 1.3
Cba_g67433 (TOR2)
0.42 6.57 0.02 1.58 0.05 0.0 4.17
Cba_g67602 (FDH)
0.0 2.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65
0.54 4.05 0.0 0.47 0.0 0.0 1.32
0.0 2.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77
0.06 7.56 0.0 0.0 0.05 0.05 2.53
0.17 70.29 0.0 0.72 0.6 0.2 27.57
0.09 3.07 0.0 0.16 0.0 0.0 1.14
0.0 2.99 0.03 0.03 0.0 0.0 1.12
1.82 30.92 0.31 1.2 1.45 0.47 14.42
5.62 299.23 3.54 6.35 5.05 5.21 124.62
0.37 4.77 0.0 0.64 0.0 0.0 2.08
0.62 9.4 0.05 1.47 0.0 0.0 2.33
0.23 3.28 0.0 0.52 0.0 0.0 1.7
0.08 3.49 0.0 0.41 0.0 0.0 0.78
0.07 7.54 0.0 0.16 0.0 0.06 2.29
0.3 3.59 0.0 0.57 0.0 0.0 0.31
Cba_g68490 (HSP70)
0.27 3.22 0.17 0.49 0.04 0.0 1.83
0.22 2.15 0.0 0.29 0.0 0.0 1.06
1.7 17.46 0.0 3.54 0.0 0.0 9.96
0.0 3.34 0.19 0.0 0.0 0.0 1.19
Cba_g68734 (PAG1)
0.12 2.25 0.0 0.38 0.0 0.0 0.74
Cba_g68782 (RPS15A)
0.29 4.47 0.0 0.29 0.0 0.0 0.76
0.41 6.88 0.0 0.79 0.0 0.0 1.22
0.51 3.69 0.0 0.75 0.0 0.0 2.63
0.6 4.92 0.0 0.26 0.0 0.0 1.34
0.42 8.67 0.0 0.88 0.0 0.0 1.42
0.24 4.88 0.0 0.0 0.13 0.0 2.91
0.26 4.59 0.07 0.0 0.0 0.0 2.81
0.59 3.46 0.0 0.81 0.0 0.0 1.13
Cba_g69599 (ROF1)
0.2 5.73 0.0 0.81 0.0 0.0 1.95
0.21 2.26 0.0 0.2 0.04 0.0 2.04
Cba_g69708 (PRO2)
0.52 5.33 0.0 0.75 0.0 0.0 2.37
Cba_g69968 (P40)
0.29 3.07 0.0 0.47 0.0 0.0 1.91
Cba_g70011 (RACK1C_AT)
0.3 3.45 0.01 0.47 0.0 0.0 0.5
0.12 2.57 0.0 0.44 0.0 0.0 1.22
2.59 23.83 1.95 2.36 0.1 2.15 21.64
0.32 3.44 0.0 0.31 0.0 0.0 0.4
0.11 6.77 0.18 0.11 0.0 0.0 1.84
106.27 520.52 11.82 21.25 11.19 14.52 152.81
0.57 10.91 0.0 3.21 0.0 0.0 1.98
0.54 5.41 0.0 0.54 0.0 0.0 1.65
0.21 3.65 0.0 0.63 0.01 0.0 3.12
0.38 4.29 0.03 0.83 0.0 0.0 0.64
0.15 3.74 0.15 0.22 0.0 0.0 0.85
0.03 3.36 0.0 0.33 0.0 0.0 1.36
0.42 3.25 0.0 0.64 0.0 0.0 0.97
0.43 5.54 0.0 0.86 0.0 0.0 2.56
0.04 3.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9
0.33 6.37 0.06 1.25 0.05 0.0 3.61
0.9 6.61 0.03 1.1 0.0 0.0 4.76
Cba_g71559 (RPL34)
0.11 2.56 0.0 0.6 0.0 0.0 0.67
0.0 16.47 0.1 0.38 0.0 0.09 9.95
0.41 30.81 0.03 0.87 0.34 0.85 15.27
Cba_g72204 (AML1)
0.07 6.92 0.0 1.54 0.0 0.0 4.1
0.43 2.72 0.0 0.15 0.0 0.0 0.83
Cba_g72863 (PIP5K9)
14.22 54.53 3.38 3.72 1.18 5.23 13.77
0.39 5.51 0.0 0.66 0.0 0.0 1.27
Cba_g73064 (ARP2)
0.24 2.86 0.0 0.41 0.0 0.0 1.26
0.27 13.62 0.23 0.22 0.32 0.55 4.19
0.42 15.15 0.23 0.42 0.25 0.38 12.83
0.24 12.13 0.0 0.58 0.0 0.0 4.28
0.57 23.11 0.54 0.97 0.98 0.66 7.8
0.0 8.75 0.0 0.0 0.0 0.0 3.49
1.4 35.02 0.1 1.39 0.59 2.58 22.73
0.0 3.21 0.0 0.44 0.0 0.0 0.48
0.36 14.47 0.0 0.0 0.09 0.09 3.92
0.21 6.62 0.11 0.24 0.11 0.0 3.09
0.51 6.84 0.0 0.98 0.0 0.0 1.44
1.22 45.24 0.51 0.27 0.11 0.14 13.16
0.03 4.28 0.0 0.07 0.0 0.0 3.67
0.66 28.27 0.48 0.62 0.21 0.18 14.48
0.0 3.57 0.0 0.09 0.0 0.0 2.03
0.11 8.5 0.11 0.19 0.0 0.0 2.09
0.0 2.59 0.0 0.0 0.09 0.0 0.57
0.0 2.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4
13.93 114.43 11.65 13.27 6.18 18.6 82.78
0.17 2.98 0.0 0.21 0.0 0.0 0.92
0.0 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.43
0.86 11.18 0.0 0.4 0.94 0.95 4.43
0.24 3.78 0.04 0.04 0.0 0.04 1.57
0.0 4.02 0.06 0.0 0.0 0.0 2.12
0.99 14.88 0.34 0.6 0.77 0.4 13.14
0.31 8.3 0.0 0.46 0.0 0.0 2.26
0.48 15.17 0.42 0.36 0.1 0.54 6.62
2.8 37.69 0.93 0.15 1.33 0.76 10.85
0.12 3.64 0.1 0.13 0.05 0.06 1.53
0.11 5.77 0.0 0.38 0.0 0.0 3.0
0.0 3.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71
0.17 9.7 0.0 0.36 0.08 0.12 4.04
0.13 4.88 0.0 0.0 0.0 0.0 2.23
0.34 8.24 0.45 1.07 0.12 0.52 1.92
0.12 8.52 0.0 0.18 0.0 0.0 3.64
0.3 4.3 0.0 0.79 0.0 0.0 2.27
0.17 4.31 0.0 0.64 0.0 0.0 0.98
0.51 6.53 0.0 0.54 0.0 0.0 1.45
0.13 2.82 0.0 0.32 0.0 0.0 0.29
0.0 2.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.32
0.13 27.98 1.24 1.71 0.92 0.89 7.94
0.24 8.91 0.0 0.7 0.0 0.0 6.63
0.27 3.28 0.0 0.42 0.02 0.0 1.13
0.19 4.55 0.0 0.9 0.0 0.0 1.06
0.3 8.09 0.0 1.06 0.0 0.0 1.79
Cba_g77136 (UBQ11)
2.01 15.84 0.0 2.75 0.06 0.0 9.39
Cba_g77137 (UBQ14)
1.37 9.43 0.1 1.24 0.0 0.0 1.4
0.34 6.66 0.09 1.31 0.0 0.0 1.32
0.0 3.41 0.0 0.51 0.0 0.0 1.4
0.07 2.97 0.0 0.34 0.0 0.0 0.47
Cba_g77422 (TUB6)
0.56 5.56 0.06 1.34 0.01 0.0 3.42
0.13 3.23 0.0 0.37 0.0 0.0 0.44
0.18 4.38 0.0 0.74 0.0 0.0 0.48
Cba_g77828 (AAC3)
0.41 3.99 0.07 0.63 0.0 0.0 2.6
1.04 12.98 0.0 3.28 0.0 0.0 4.5
0.77 6.12 0.04 0.97 0.0 0.0 1.29
0.12 2.99 0.0 0.42 0.0 0.0 1.59
Cba_g78279 (RPL23AB)
0.38 2.79 0.0 0.19 0.0 0.0 1.37
Cba_g78290 (BBC1)
0.73 7.39 0.08 1.44 0.0 0.0 1.33
0.44 6.6 0.0 1.35 0.0 0.0 0.97
0.1 2.3 0.0 0.21 0.0 0.0 0.27
Cba_g78739 (RPL16A)
0.25 3.63 0.0 0.41 0.0 0.0 1.65
0.12 2.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.33
0.5 9.54 0.0 0.67 0.0 0.0 3.65
0.41 3.14 0.0 0.49 0.0 0.0 0.55
0.36 5.67 0.0 0.61 0.0 0.0 0.56
0.29 4.15 0.0 0.64 0.0 0.0 0.66

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)