Heatmap: Cluster_175 (HCCA cluster)

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(Showing raw values)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g086893.1.1 (Solyc01g086893.1)
15.68 11.82 31.21 23.17 9.1 14.68 12.45 11.49 8.31 63.57 11.41 8.6 18.52 14.49 49.53 54.3 47.17 8.49 2.86 18.88 20.66 33.45 25.44 27.19 29.05 70.35 30.6 35.94 30.94 27.9 32.24 51.0 1.19 20.24
Solyc01g086895.1.1 (Solyc01g086895.1)
17.22 27.62 41.39 37.47 29.45 31.6 16.57 21.63 21.11 115.96 24.57 23.05 43.87 39.99 81.08 85.35 76.79 9.7 8.17 17.93 18.71 33.43 21.4 26.54 26.38 88.17 26.23 31.63 28.3 32.34 30.1 46.96 6.54 21.31
Solyc01g087336.1.1 (Solyc01g087336.1)
1.64 3.42 1.26 1.24 1.24 2.62 6.95 3.47 3.45 5.9 3.15 2.5 7.96 4.1 5.19 4.87 5.05 0.09 0.46 2.45 0.77 3.51 3.38 2.93 2.85 8.1 3.36 3.27 3.38 2.97 3.37 3.67 0.26 1.18
Solyc01g094180.3.1 (Solyc01g094180.3)
0.8 0.37 0.08 0.27 1.04 0.6 2.12 0.48 1.75 5.03 1.5 1.18 2.93 1.67 2.13 2.73 2.14 0.0 0.06 1.03 0.73 1.97 1.47 1.42 1.41 2.45 1.73 1.34 1.42 1.25 1.59 1.2 0.07 0.52
Solyc01g097155.1.1 (Solyc01g097155.1)
4.95 0.68 0.75 0.38 3.81 4.39 2.27 3.4 0.74 22.63 5.93 8.23 12.17 7.34 14.36 13.93 14.9 0.0 0.0 1.35 0.8 1.78 1.3 1.36 1.26 10.08 1.21 1.33 1.56 1.6 1.73 2.86 0.64 1.68
Solyc01g104436.1.1 (Solyc01g104436.1)
0.41 0.14 0.14 0.03 0.61 0.42 1.38 0.55 0.48 1.57 0.65 0.31 1.04 0.62 1.86 1.85 1.51 0.14 0.2 0.58 0.85 1.15 0.89 0.84 0.78 0.96 1.0 0.98 0.85 0.85 1.01 1.3 0.03 0.1
Solyc01g104437.1.1 (Solyc01g104437.1)
0.41 0.37 0.3 0.2 0.36 0.94 1.36 1.08 0.31 3.08 1.37 0.36 2.64 0.63 3.61 3.41 2.79 0.16 0.04 0.24 1.49 1.29 1.13 1.41 1.33 1.69 1.73 1.71 1.06 1.32 0.96 1.59 0.08 0.26
Solyc01g104438.1.1 (Solyc01g104438.1)
0.25 0.04 0.0 0.02 0.67 0.44 0.58 0.39 0.33 1.6 0.75 0.1 0.72 0.3 1.62 2.62 1.61 0.12 0.01 0.31 0.73 0.81 0.43 0.74 0.53 0.83 0.46 0.7 0.46 0.79 0.96 0.99 0.04 0.13
Solyc01g104442.1.1 (Solyc01g104442.1)
0.94 0.63 0.0 0.13 0.93 1.58 4.92 1.02 0.24 3.66 1.57 0.23 2.95 2.66 4.99 4.53 4.31 0.56 0.95 1.48 2.12 1.68 1.15 1.97 2.08 3.72 0.94 2.06 1.93 2.29 3.01 3.21 0.08 0.19
Solyc01g104444.1.1 (Solyc01g104444.1)
0.03 0.01 0.08 0.0 0.24 0.25 0.28 0.27 0.08 0.83 0.43 0.26 0.79 0.43 0.86 1.08 0.99 0.02 0.08 0.21 0.12 0.2 0.21 0.21 0.26 0.91 0.25 0.27 0.19 0.18 0.25 0.36 0.0 0.2
Solyc01g107933.1.1 (Solyc01g107933.1)
0.57 0.55 1.95 0.96 0.21 1.39 1.02 1.16 1.48 3.16 0.53 0.65 1.8 1.72 5.64 6.67 6.3 0.09 0.02 0.23 0.06 2.32 1.44 1.89 2.17 2.54 1.41 2.61 3.0 1.37 2.28 3.07 0.18 0.3
Solyc02g069983.1.1 (Solyc02g069983.1)
2.17 8.42 2.82 5.78 2.15 3.89 6.67 2.9 3.29 9.59 10.34 6.93 10.67 6.78 6.94 2.61 3.41 2.71 4.27 2.31 2.08 4.44 6.49 5.9 5.39 4.06 7.76 5.63 6.36 5.13 4.72 6.36 4.07 2.65
Solyc02g069987.1.1 (Solyc02g069987.1)
3.84 1.93 2.68 2.16 0.86 1.08 1.17 1.93 1.7 5.1 4.55 3.33 4.84 3.48 2.83 2.67 2.54 0.11 0.09 0.45 0.69 1.09 0.99 0.91 0.99 2.0 1.19 0.8 0.65 0.68 0.68 1.32 0.18 1.58
Solyc02g077615.1.1 (Solyc02g077615.1)
0.36 0.58 0.33 0.35 0.12 0.33 0.44 0.16 0.16 1.38 0.61 0.22 1.3 0.52 0.67 0.96 0.68 0.0 0.0 0.21 0.3 0.25 0.11 0.23 0.2 1.29 0.32 0.37 0.32 0.18 0.3 0.45 0.02 0.47
Solyc02g085837.1.1 (Solyc02g085837.1)
22.5 22.02 14.93 18.56 22.22 18.72 10.45 17.83 0.51 50.31 28.2 21.29 44.66 42.46 29.59 37.42 25.74 1.0 1.03 2.62 0.0 1.25 0.72 1.43 1.39 13.81 1.01 1.41 1.47 1.16 3.15 1.27 9.8 11.41
Solyc02g086517.1.1 (Solyc02g086517.1)
2.78 2.96 2.49 2.14 2.55 2.38 3.29 2.42 3.09 5.45 3.21 2.66 5.62 5.23 4.12 3.78 4.36 0.37 0.18 1.35 0.46 2.35 2.0 2.06 1.82 4.07 2.58 2.79 2.36 2.07 2.79 2.52 1.24 5.21
Solyc02g089295.1.1 (Solyc02g089295.1)
5.75 5.34 6.67 6.58 1.84 2.17 1.66 1.85 3.61 5.44 2.15 1.51 2.31 2.33 8.2 9.27 8.47 0.0 0.02 1.52 0.97 3.8 2.99 4.4 3.53 5.51 4.25 4.14 4.09 3.8 5.26 6.04 0.26 4.79
Solyc02g092513.1.1 (Solyc02g092513.1)
1.36 0.65 0.11 0.17 0.5 0.41 2.98 0.72 1.98 4.7 3.36 2.4 5.22 4.16 2.85 3.24 2.29 0.86 0.78 0.61 0.69 1.84 2.72 2.04 1.14 1.83 1.84 2.17 1.62 2.17 2.42 2.14 0.0 0.61
Solyc02g092515.1.1 (Solyc02g092515.1)
2.04 0.95 0.3 0.13 0.41 0.4 3.09 0.47 1.99 4.55 2.79 1.69 4.94 4.78 1.64 1.8 1.45 0.72 0.49 0.6 1.18 1.73 2.55 2.02 1.05 4.13 2.21 2.26 1.64 1.94 1.85 2.07 0.02 1.35
Solyc02g092517.1.1 (Solyc02g092517.1)
1.71 1.1 0.4 0.36 0.74 0.72 6.45 0.98 1.66 7.13 2.8 2.19 5.4 5.95 2.45 2.1 2.56 1.1 0.39 0.65 2.79 2.23 3.18 2.39 1.5 8.67 2.9 2.97 1.89 2.21 2.53 2.77 0.06 0.96
Solyc02g092520.2.1 (Solyc02g092520.2)
2.73 1.67 0.69 0.71 1.87 1.4 8.88 0.52 3.97 7.07 5.12 2.38 10.04 9.94 3.17 4.01 2.49 1.27 0.72 1.29 4.96 5.1 5.53 4.93 3.25 6.94 6.54 5.68 4.3 4.9 5.75 5.11 0.05 1.47
Solyc02g092523.1.1 (Solyc02g092523.1)
3.34 1.74 0.92 0.75 0.92 1.11 8.8 1.42 3.77 10.87 6.78 3.95 11.59 9.28 5.24 3.04 3.99 1.78 0.67 2.08 4.7 3.88 5.0 3.81 2.87 15.89 4.68 4.64 3.61 4.48 4.51 4.51 0.1 1.78
Solyc02g092527.1.1 (Solyc02g092527.1)
2.69 0.88 0.48 0.07 2.71 1.05 11.25 2.17 3.84 14.74 6.77 2.34 10.89 9.01 2.86 3.81 2.53 0.47 0.14 0.66 3.17 3.73 4.01 2.93 2.62 13.74 3.26 3.91 2.18 3.44 3.73 4.56 0.08 1.09
Solyc02g092630.2.1 (Solyc02g092630.2)
2.34 0.68 0.12 0.8 1.04 2.24 2.45 1.65 0.22 24.47 2.23 1.18 4.78 6.12 2.24 3.39 2.96 0.0 0.0 0.52 0.0 0.16 0.15 0.12 0.18 9.88 0.14 0.13 0.22 0.23 0.0 0.18 0.68 1.76
Solyc03g019873.1.1 (Solyc03g019873.1)
31.35 28.12 16.53 17.42 24.0 30.45 13.2 21.71 18.8 49.41 68.68 67.4 100.83 110.73 78.52 60.51 73.47 2.75 3.5 9.06 12.77 7.55 6.98 7.71 7.14 29.37 9.37 9.57 9.14 5.74 9.82 8.62 9.0 18.58
Solyc03g025180.2.1 (Solyc03g025180.2)
0.32 0.0 0.15 0.0 0.58 0.31 0.1 0.0 0.0 4.62 0.05 0.03 0.17 0.04 0.51 0.91 0.82 0.04 0.27 0.28 0.25 0.05 0.0 0.04 0.1 0.05 0.09 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.72
Solyc03g025927.1.1 (Solyc03g025927.1)
4.6 2.46 4.95 6.14 6.28 3.42 3.08 2.27 3.42 3.67 2.72 2.66 3.63 4.4 6.5 4.09 4.59 0.2 0.21 2.62 0.83 3.97 3.1 3.27 3.01 5.0 3.42 3.31 3.28 3.9 3.65 4.86 0.28 4.68
Solyc03g025937.1.1 (Solyc03g025937.1)
12.31 2.35 3.74 6.26 14.18 6.61 2.18 2.63 6.95 9.33 4.83 4.99 3.89 3.72 7.04 6.23 5.5 2.51 2.72 3.34 2.5 5.07 4.67 4.41 4.73 18.65 3.95 5.14 4.29 4.23 5.71 6.65 0.49 7.42
Solyc03g032130.3.1 (Solyc03g032130.3)
199.96 701.38 288.74 349.94 474.67 543.38 535.44 468.4 520.19 531.72 865.23 976.36 1170.16 1405.34 596.03 475.93 406.7 22.53 39.15 400.37 346.85 211.9 275.86 238.61 198.57 565.99 396.62 320.32 295.81 220.96 262.42 222.43 245.19 408.71
Solyc03g033370.3.1 (Solyc03g033370.3)
8.07 20.32 8.49 11.95 7.43 10.57 9.93 10.63 5.76 13.76 13.15 11.48 14.18 12.14 17.97 21.14 19.75 0.7 2.18 4.1 5.96 7.99 7.05 6.84 7.01 4.87 6.16 6.77 7.13 6.67 6.48 7.61 13.6 5.5
Solyc03g046547.1.1 (Solyc03g046547.1)
12.78 19.93 16.2 12.01 25.84 21.41 18.35 13.85 25.6 62.66 60.02 39.35 71.43 58.54 39.89 44.21 42.6 0.14 0.49 16.78 25.77 18.76 18.11 18.77 18.31 41.4 19.25 18.43 18.47 15.46 19.02 23.49 3.32 23.51
Solyc03g053000.3.1 (Solyc03g053000.3)
9.66 24.16 20.86 32.83 19.04 12.8 13.84 17.05 15.68 37.62 22.07 14.66 30.96 22.39 34.27 35.62 30.9 4.4 2.59 15.02 9.24 19.7 24.23 25.83 21.16 29.03 21.94 23.2 22.33 20.03 22.33 23.17 2.96 15.95
Solyc03g059127.1.1 (Solyc03g059127.1)
2.23 3.18 0.51 0.44 1.15 1.8 4.98 1.63 2.11 7.05 4.29 5.17 9.32 9.13 5.2 5.78 4.37 0.08 0.02 1.32 3.09 1.71 2.31 1.76 1.1 4.4 1.91 1.74 1.14 2.2 2.11 1.9 0.15 3.61
Solyc03g059150.3.1 (Solyc03g059150.3)
9.39 8.17 3.46 2.01 8.16 6.97 28.36 5.58 9.83 13.64 17.04 16.84 35.34 28.33 15.59 15.84 11.34 0.07 0.02 6.06 12.17 6.3 8.69 6.32 4.78 17.32 6.63 6.16 4.79 6.92 7.63 7.08 0.28 16.11
Solyc03g071555.1.1 (Solyc03g071555.1)
9.52 12.87 8.84 6.46 13.0 8.63 11.19 6.19 5.84 28.94 15.02 15.99 27.35 24.87 13.08 14.58 11.97 1.86 1.9 2.86 2.56 10.11 8.78 9.69 9.13 13.52 7.91 10.86 9.68 8.38 9.87 11.11 1.86 10.0
Solyc03g094050.3.1 (Solyc03g094050.3)
3.77 1.87 1.31 1.51 2.35 3.33 2.24 2.75 0.94 11.96 9.83 6.42 12.17 9.9 7.11 7.39 7.28 0.65 0.32 1.92 0.57 1.88 0.91 1.15 0.7 2.6 1.44 1.47 1.59 1.6 1.6 1.82 0.21 1.1
Solyc03g096055.1.1 (Solyc03g096055.1)
2.5 0.55 0.17 0.52 2.2 2.21 1.23 2.38 0.45 11.55 7.25 8.01 7.88 7.53 6.59 7.29 6.91 0.19 0.03 0.79 1.25 3.35 2.85 2.46 1.89 1.81 3.79 2.84 1.83 3.02 4.18 3.01 0.23 2.54
Solyc03g097710.3.1 (Solyc03g097710.3)
3.55 7.64 8.77 6.31 30.56 19.83 14.11 9.86 7.16 50.23 32.5 33.79 28.77 21.2 27.08 29.73 45.51 7.3 9.39 14.58 8.3 7.28 4.68 5.3 6.79 40.05 5.0 7.11 8.12 5.67 6.07 9.55 8.76 11.21
Solyc03g117380.3.1 (Solyc03g117380.3)
13.66 27.51 8.42 9.43 2.13 7.58 7.68 10.95 7.66 18.34 14.99 8.24 14.85 14.81 12.92 12.68 14.59 2.22 1.84 4.49 5.6 6.99 7.55 7.18 7.2 14.5 7.91 6.41 7.81 7.5 7.46 10.29 3.03 7.54
Solyc03g118995.1.1 (Solyc03g118995.1)
1.87 3.71 1.04 1.9 0.96 0.98 7.87 1.91 2.74 10.65 1.42 0.66 2.71 3.26 8.82 8.62 9.18 0.0 0.06 1.61 2.14 2.91 1.33 2.07 2.07 8.57 2.54 2.83 2.08 2.87 2.56 3.52 0.09 1.03
Solyc04g011370.3.1 (Solyc04g011370.3)
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Solyc04g014875.1.1 (Solyc04g014875.1)
9.55 2.07 4.45 4.52 8.83 7.6 6.39 7.77 9.9 14.53 2.59 2.04 2.31 2.69 9.96 7.69 8.09 0.08 0.07 4.25 2.29 10.34 8.93 10.03 6.58 7.54 9.25 11.4 9.26 9.57 8.94 11.81 2.17 13.03
Solyc04g054780.3.1 (Solyc04g054780.3)
5.6 14.66 6.93 9.32 5.81 8.82 2.93 10.02 0.73 34.83 7.48 6.54 10.09 11.62 12.39 13.45 9.25 2.49 1.16 1.1 0.2 0.49 0.55 0.67 0.58 7.23 0.34 0.76 0.86 0.71 0.76 0.72 4.93 2.14
Solyc04g057885.1.1 (Solyc04g057885.1)
2.23 4.43 5.6 4.94 2.08 3.72 3.82 4.31 5.08 9.67 5.46 2.66 5.65 5.78 13.94 11.4 12.4 2.22 3.39 3.73 3.43 3.66 5.23 5.02 3.72 11.46 8.82 6.56 4.64 3.48 4.29 3.9 0.27 2.7
Solyc04g064480.3.1 (Solyc04g064480.3)
36.21 22.9 26.01 21.7 14.2 16.78 13.62 28.72 25.11 82.97 68.88 49.35 84.52 73.71 56.97 61.8 50.85 1.12 0.76 12.81 14.05 17.63 19.62 22.13 14.95 28.54 22.5 20.12 17.69 23.39 20.59 14.53 7.24 40.87
Solyc04g078670.3.1 (Solyc04g078670.3)
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Solyc04g082565.1.1 (Solyc04g082565.1)
1.05 2.42 1.63 0.95 0.88 1.24 1.17 1.74 0.72 4.74 0.98 0.94 1.28 1.11 2.09 2.11 2.25 0.0 0.0 0.29 0.24 0.69 1.04 0.59 0.54 1.1 0.62 0.65 0.54 0.59 0.68 0.66 0.11 0.77
Solyc05g006620.3.1 (Solyc05g006620.3)
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Solyc05g008630.3.1 (Solyc05g008630.3)
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Solyc05g015290.1.1 (Solyc05g015290.1)
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Solyc06g034330.3.1 (Solyc06g034330.3)
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Solyc06g050220.3.1 (Solyc06g050220.3)
4.91 6.89 6.32 10.31 11.37 6.34 4.28 3.16 5.78 12.1 4.74 5.71 4.69 6.54 9.84 8.97 9.71 2.02 8.09 2.87 0.81 2.82 3.11 3.68 3.36 6.24 3.15 3.25 3.5 3.69 3.57 4.15 0.59 4.75
Solyc06g068215.1.1 (Solyc06g068215.1)
2.73 1.21 2.32 1.46 2.55 2.91 3.99 2.24 0.26 5.61 1.43 1.36 1.55 1.41 4.94 5.35 4.3 0.11 0.1 1.12 2.14 0.66 1.17 1.04 1.39 4.9 1.3 1.28 1.25 1.68 0.68 2.13 1.14 2.06
Solyc07g018400.3.1 (Solyc07g018400.3)
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Solyc07g041840.2.1 (Solyc07g041840.2)
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Solyc07g055020.3.1 (Solyc07g055020.3)
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Solyc07g055760.2.1 (Solyc07g055760.2)
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Solyc08g006913.1.1 (Solyc08g006913.1)
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Solyc08g006917.1.1 (Solyc08g006917.1)
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Solyc08g007755.1.1 (Solyc08g007755.1)
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Solyc08g023465.1.1 (Solyc08g023465.1)
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Solyc08g029360.3.1 (Solyc08g029360.3)
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Solyc08g067280.1.1 (Solyc08g067280.1)
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Solyc08g077827.1.1 (Solyc08g077827.1)
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Solyc09g018640.1.1 (Solyc09g018640.1)
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Solyc09g059340.2.1 (Solyc09g059340.2)
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Solyc09g061825.1.1 (Solyc09g061825.1)
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Solyc09g065955.1.1 (Solyc09g065955.1)
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Solyc09g097825.1.1 (Solyc09g097825.1)
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Solyc10g005860.3.1 (Solyc10g005860.3)
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Solyc10g006790.3.1 (Solyc10g006790.3)
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Solyc11g011530.2.1 (Solyc11g011530.2)
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Solyc11g044330.2.1 (Solyc11g044330.2)
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Solyc11g045155.1.1 (Solyc11g045155.1)
4.76 7.66 2.64 6.09 3.1 5.71 5.59 8.67 7.9 62.26 9.28 6.03 11.79 9.14 24.71 26.02 19.21 0.0 0.53 10.85 2.22 17.02 12.65 16.9 10.1 20.56 17.38 17.67 14.9 12.82 12.11 13.82 0.37 2.57
Solyc11g062030.1.1 (Solyc11g062030.1)
15.12 3.64 4.83 3.11 3.19 4.06 18.3 4.72 10.44 25.21 30.87 11.11 48.54 29.13 18.51 21.4 16.41 0.81 0.28 10.78 14.3 17.33 6.6 9.42 7.54 76.56 10.8 13.12 8.89 16.3 17.93 13.86 0.64 11.84
Solyc11g069125.1.1 (Solyc11g069125.1)
1.98 2.26 1.11 0.75 2.39 1.73 10.52 2.28 2.35 8.09 2.12 1.63 3.52 3.63 7.01 7.87 5.69 0.16 0.15 1.89 1.12 2.68 1.91 2.1 2.12 3.64 2.24 2.39 2.46 2.76 2.59 2.24 0.54 1.43
Solyc12g089325.1.1 (Solyc12g089325.1)
0.47 3.8 2.13 1.85 0.84 1.97 3.49 1.44 0.89 5.72 3.25 2.87 7.52 7.77 4.92 6.54 6.28 0.17 0.11 2.14 2.53 1.84 2.35 1.46 1.33 5.2 2.23 1.86 1.71 1.56 2.2 2.13 1.4 2.05
Solyc12g099570.2.1 (Solyc12g099570.2)
36.71 97.09 87.14 114.36 94.65 89.96 46.72 127.56 15.14 106.79 48.51 68.56 41.63 64.97 154.54 145.92 136.96 6.72 4.05 8.24 0.22 33.71 21.9 34.43 40.38 37.71 24.41 35.8 36.5 38.92 44.62 38.06 47.58 23.41

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)