Heatmap: Cluster_175 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g086893.1.1 (Solyc01g086893.1)
-0.71 -1.12 0.28 -0.15 -1.49 -0.8 -1.04 -1.16 -1.63 1.31 -1.17 -1.58 -0.47 -0.82 0.95 1.08 0.88 -1.59 -3.17 -0.44 -0.31 0.38 -0.01 0.08 0.18 1.46 0.26 0.49 0.27 0.12 0.33 0.99 -4.43 -0.34
Solyc01g086895.1.1 (Solyc01g086895.1)
-1.05 -0.36 0.22 0.08 -0.27 -0.17 -1.1 -0.72 -0.75 1.71 -0.53 -0.63 0.3 0.17 1.19 1.26 1.11 -1.87 -2.12 -0.99 -0.93 -0.09 -0.73 -0.42 -0.43 1.31 -0.44 -0.17 -0.33 -0.14 -0.24 0.4 -2.44 -0.74
Solyc01g087336.1.1 (Solyc01g087336.1)
-0.98 0.08 -1.36 -1.38 -1.38 -0.3 1.1 0.1 0.09 0.87 -0.04 -0.37 1.3 0.34 0.68 0.59 0.64 -5.17 -2.82 -0.4 -2.08 0.12 0.06 -0.14 -0.18 1.32 0.06 0.02 0.06 -0.12 0.06 0.18 -3.66 -1.46
Solyc01g094180.3.1 (Solyc01g094180.3)
-0.77 -1.9 -4.09 -2.33 -0.4 -1.19 0.63 -1.51 0.36 1.88 0.13 -0.21 1.1 0.29 0.64 1.0 0.65 - -4.49 -0.41 -0.91 0.53 0.11 0.06 0.04 0.84 0.34 -0.03 0.06 -0.13 0.22 -0.19 -4.35 -1.39
Solyc01g097155.1.1 (Solyc01g097155.1)
0.15 -2.72 -2.58 -3.53 -0.22 -0.02 -0.97 -0.39 -2.59 2.35 0.41 0.89 1.45 0.72 1.69 1.64 1.74 - - -1.72 -2.47 -1.33 -1.78 -1.71 -1.82 1.18 -1.88 -1.74 -1.51 -1.48 -1.36 -0.64 -2.8 -1.4
Solyc01g104436.1.1 (Solyc01g104436.1)
-0.92 -2.44 -2.5 -4.72 -0.34 -0.88 0.85 -0.47 -0.67 1.03 -0.24 -1.3 0.45 -0.3 1.28 1.27 0.98 -2.49 -1.95 -0.41 0.15 0.59 0.21 0.13 0.02 0.32 0.39 0.35 0.15 0.15 0.4 0.76 -4.89 -2.95
Solyc01g104437.1.1 (Solyc01g104437.1)
-1.56 -1.7 -1.99 -2.56 -1.72 -0.35 0.19 -0.15 -1.95 1.36 0.2 -1.75 1.14 -0.93 1.59 1.51 1.22 -2.86 -4.82 -2.31 0.32 0.11 -0.09 0.23 0.16 0.5 0.53 0.51 -0.17 0.14 -0.32 0.41 -3.98 -2.22
Solyc01g104438.1.1 (Solyc01g104438.1)
-1.33 -3.84 - -5.09 0.11 -0.5 -0.09 -0.68 -0.89 1.36 0.27 -2.59 0.22 -1.05 1.39 2.08 1.38 -2.32 -6.79 -0.99 0.24 0.38 -0.54 0.25 -0.22 0.41 -0.43 0.18 -0.43 0.35 0.63 0.68 -3.83 -2.27
Solyc01g104442.1.1 (Solyc01g104442.1)
-1.02 -1.6 - -3.86 -1.03 -0.27 1.37 -0.89 -3.0 0.94 -0.28 -3.06 0.63 0.49 1.39 1.25 1.18 -1.76 -1.0 -0.36 0.16 -0.18 -0.73 0.05 0.12 0.97 -1.02 0.11 0.02 0.27 0.66 0.75 -4.54 -3.3
Solyc01g104444.1.1 (Solyc01g104444.1)
-3.6 -4.47 -1.94 - -0.4 -0.34 -0.18 -0.27 -1.94 1.39 0.43 -0.32 1.32 0.42 1.43 1.77 1.64 -3.76 -1.98 -0.61 -1.45 -0.67 -0.62 -0.63 -0.3 1.51 -0.34 -0.25 -0.74 -0.79 -0.37 0.17 - -0.69
Solyc01g107933.1.1 (Solyc01g107933.1)
-1.65 -1.7 0.13 -0.9 -3.07 -0.36 -0.82 -0.62 -0.27 0.82 -1.74 -1.47 0.01 -0.06 1.66 1.9 1.82 -4.33 -6.32 -2.94 -4.94 0.38 -0.31 0.08 0.28 0.51 -0.34 0.55 0.75 -0.38 0.35 0.78 -3.27 -2.57
Solyc02g069983.1.1 (Solyc02g069983.1)
-1.25 0.7 -0.87 0.16 -1.27 -0.41 0.37 -0.83 -0.65 0.89 1.0 0.42 1.05 0.39 0.43 -0.99 -0.6 -0.93 -0.28 -1.16 -1.31 -0.22 0.33 0.19 0.06 -0.35 0.59 0.12 0.3 -0.01 -0.13 0.3 -0.34 -0.97
Solyc02g069987.1.1 (Solyc02g069987.1)
1.1 0.1 0.58 0.27 -1.06 -0.73 -0.62 0.1 -0.08 1.51 1.34 0.89 1.43 0.95 0.65 0.57 0.5 -4.02 -4.28 -1.98 -1.38 -0.72 -0.85 -0.99 -0.86 0.15 -0.59 -1.17 -1.46 -1.39 -1.4 -0.44 -3.28 -0.19
Solyc02g077615.1.1 (Solyc02g077615.1)
-0.2 0.48 -0.32 -0.25 -1.85 -0.36 0.07 -1.37 -1.36 1.72 0.54 -0.95 1.63 0.31 0.68 1.2 0.71 - - -0.97 -0.46 -0.72 -1.94 -0.87 -1.03 1.63 -0.37 -0.19 -0.4 -1.19 -0.46 0.11 -4.22 0.16
Solyc02g085837.1.1 (Solyc02g085837.1)
0.67 0.64 0.08 0.39 0.65 0.4 -0.44 0.33 -4.79 1.83 0.99 0.59 1.66 1.58 1.06 1.4 0.86 -3.83 -3.79 -2.43 - -3.5 -4.29 -3.31 -3.35 -0.04 -3.81 -3.33 -3.27 -3.61 -2.17 -3.47 -0.53 -0.31
Solyc02g086517.1.1 (Solyc02g086517.1)
-0.01 0.09 -0.16 -0.38 -0.13 -0.23 0.24 -0.2 0.15 0.97 0.21 -0.07 1.01 0.91 0.56 0.44 0.65 -2.91 -3.95 -1.05 -2.6 -0.24 -0.48 -0.44 -0.62 0.55 -0.11 0.0 -0.24 -0.43 0.0 -0.14 -1.17 0.9
Solyc02g089295.1.1 (Solyc02g089295.1)
0.58 0.48 0.8 0.78 -1.06 -0.82 -1.21 -1.05 -0.09 0.5 -0.84 -1.34 -0.74 -0.72 1.1 1.27 1.14 - -7.44 -1.34 -1.98 -0.01 -0.36 0.2 -0.12 0.52 0.15 0.11 0.09 -0.01 0.45 0.65 -3.87 0.32
Solyc02g092513.1.1 (Solyc02g092513.1)
-0.43 -1.5 -4.06 -3.41 -1.87 -2.16 0.7 -1.36 0.11 1.35 0.87 0.38 1.5 1.18 0.63 0.81 0.31 -1.1 -1.23 -1.6 -1.42 -0.0 0.56 0.15 -0.69 -0.01 0.0 0.24 -0.18 0.24 0.39 0.22 - -1.59
Solyc02g092515.1.1 (Solyc02g092515.1)
0.18 -0.93 -2.57 -3.82 -2.13 -2.19 0.78 -1.94 0.15 1.34 0.63 -0.09 1.46 1.41 -0.14 -0.0 -0.31 -1.33 -1.88 -1.59 -0.6 -0.06 0.5 0.17 -0.78 1.2 0.3 0.33 -0.13 0.1 0.04 0.2 -6.61 -0.41
Solyc02g092517.1.1 (Solyc02g092517.1)
-0.53 -1.17 -2.62 -2.77 -1.74 -1.77 1.39 -1.34 -0.57 1.53 0.18 -0.17 1.13 1.27 -0.01 -0.23 0.05 -1.16 -2.66 -1.93 0.18 -0.15 0.37 -0.04 -0.71 1.81 0.23 0.27 -0.39 -0.16 0.03 0.17 -5.34 -1.36
Solyc02g092520.2.1 (Solyc02g092520.2)
-0.54 -1.24 -2.52 -2.49 -1.08 -1.5 1.17 -2.91 0.01 0.84 0.37 -0.73 1.34 1.33 -0.32 0.02 -0.67 -1.64 -2.47 -1.61 0.33 0.37 0.48 0.32 -0.28 0.81 0.73 0.52 0.12 0.31 0.54 0.37 -6.26 -1.43
Solyc02g092523.1.1 (Solyc02g092523.1)
-0.37 -1.3 -2.23 -2.52 -2.22 -1.96 1.03 -1.6 -0.19 1.34 0.65 -0.13 1.43 1.11 0.28 -0.5 -0.11 -1.28 -2.68 -1.05 0.13 -0.15 0.22 -0.18 -0.59 1.88 0.12 0.11 -0.26 0.06 0.07 0.07 -5.5 -1.28
Solyc02g092527.1.1 (Solyc02g092527.1)
-0.53 -2.13 -3.02 -5.75 -0.52 -1.88 1.54 -0.84 -0.01 1.93 0.8 -0.73 1.49 1.22 -0.44 -0.03 -0.61 -3.06 -4.74 -2.56 -0.29 -0.06 0.05 -0.41 -0.57 1.83 -0.25 0.01 -0.83 -0.17 -0.05 0.23 -5.6 -1.83
Solyc02g092630.2.1 (Solyc02g092630.2)
0.12 -1.67 -4.13 -1.43 -1.05 0.05 0.19 -0.39 -3.26 3.51 0.05 -0.87 1.15 1.5 0.06 0.65 0.46 - - -2.04 - -3.74 -3.88 -4.17 -3.62 2.2 -3.99 -4.09 -3.27 -3.21 - -3.55 -1.67 -0.29
Solyc03g019873.1.1 (Solyc03g019873.1)
0.12 -0.03 -0.8 -0.72 -0.26 0.08 -1.12 -0.41 -0.61 0.78 1.26 1.23 1.81 1.94 1.45 1.07 1.35 -3.39 -3.04 -1.67 -1.17 -1.93 -2.04 -1.9 -2.01 0.03 -1.62 -1.59 -1.65 -2.32 -1.55 -1.74 -1.68 -0.63
Solyc03g025180.2.1 (Solyc03g025180.2)
0.01 - -1.02 - 0.88 -0.04 -1.65 - - 3.88 -2.7 -3.25 -0.87 -3.1 0.7 1.53 1.38 -3.0 -0.23 -0.18 -0.33 -2.71 - -2.86 -1.67 -2.74 -1.8 -4.57 -1.29 - - - -2.62 1.2
Solyc03g025927.1.1 (Solyc03g025927.1)
0.4 -0.5 0.51 0.82 0.85 -0.03 -0.18 -0.62 -0.03 0.08 -0.36 -0.39 0.06 0.34 0.9 0.23 0.4 -4.14 -4.02 -0.41 -2.06 0.19 -0.17 -0.09 -0.21 0.52 -0.03 -0.08 -0.09 0.16 0.07 0.48 -3.63 0.43
Solyc03g025937.1.1 (Solyc03g025937.1)
1.15 -1.24 -0.57 0.17 1.35 0.25 -1.35 -1.08 0.32 0.75 -0.2 -0.16 -0.52 -0.58 0.34 0.16 -0.02 -1.15 -1.03 -0.74 -1.16 -0.13 -0.25 -0.34 -0.23 1.74 -0.49 -0.12 -0.37 -0.4 0.04 0.26 -3.51 0.42
Solyc03g032130.3.1 (Solyc03g032130.3)
-1.16 0.65 -0.63 -0.35 0.09 0.28 0.26 0.07 0.22 0.25 0.95 1.13 1.39 1.65 0.42 0.09 -0.13 -4.31 -3.51 -0.16 -0.36 -1.08 -0.69 -0.9 -1.17 0.34 -0.17 -0.48 -0.59 -1.01 -0.77 -1.01 -0.86 -0.13
Solyc03g033370.3.1 (Solyc03g033370.3)
-0.24 1.09 -0.16 0.33 -0.36 0.15 0.06 0.16 -0.72 0.53 0.47 0.27 0.58 0.35 0.92 1.15 1.05 -3.76 -2.12 -1.21 -0.67 -0.25 -0.43 -0.48 -0.44 -0.97 -0.63 -0.49 -0.41 -0.51 -0.55 -0.32 0.52 -0.79
Solyc03g046547.1.1 (Solyc03g046547.1)
-1.02 -0.38 -0.68 -1.11 -0.01 -0.28 -0.5 -0.91 -0.02 1.27 1.21 0.6 1.46 1.17 0.62 0.77 0.71 -7.57 -5.72 -0.63 -0.01 -0.47 -0.52 -0.47 -0.51 0.67 -0.43 -0.5 -0.49 -0.75 -0.45 -0.15 -2.97 -0.15
Solyc03g053000.3.1 (Solyc03g053000.3)
-1.09 0.24 0.02 0.68 -0.11 -0.68 -0.57 -0.27 -0.39 0.87 0.11 -0.48 0.59 0.13 0.74 0.8 0.59 -2.22 -2.98 -0.45 -1.15 -0.06 0.24 0.33 0.04 0.5 0.1 0.18 0.12 -0.03 0.12 0.18 -2.79 -0.36
Solyc03g059127.1.1 (Solyc03g059127.1)
-0.39 0.13 -2.52 -2.71 -1.33 -0.69 0.78 -0.84 -0.46 1.28 0.56 0.83 1.68 1.65 0.84 0.99 0.59 -5.27 -7.27 -1.14 0.09 -0.77 -0.34 -0.72 -1.41 0.6 -0.61 -0.74 -1.35 -0.4 -0.46 -0.61 -4.29 0.31
Solyc03g059150.3.1 (Solyc03g059150.3)
-0.15 -0.35 -1.59 -2.37 -0.35 -0.58 1.45 -0.9 -0.08 0.39 0.71 0.7 1.77 1.45 0.59 0.61 0.13 -7.12 -9.08 -0.78 0.23 -0.72 -0.26 -0.72 -1.12 0.74 -0.65 -0.75 -1.12 -0.59 -0.45 -0.55 -5.2 0.63
Solyc03g071555.1.1 (Solyc03g071555.1)
-0.17 0.26 -0.28 -0.73 0.28 -0.31 0.06 -0.79 -0.88 1.43 0.49 0.58 1.35 1.21 0.29 0.44 0.16 -2.53 -2.5 -1.91 -2.07 -0.08 -0.29 -0.15 -0.23 0.34 -0.44 0.02 -0.15 -0.36 -0.12 0.05 -2.52 -0.1
Solyc03g094050.3.1 (Solyc03g094050.3)
0.17 -0.84 -1.35 -1.14 -0.51 -0.0 -0.58 -0.28 -1.84 1.84 1.56 0.94 1.86 1.57 1.09 1.14 1.12 -2.37 -3.4 -0.8 -2.54 -0.83 -1.88 -1.54 -2.26 -0.36 -1.21 -1.18 -1.07 -1.06 -1.06 -0.88 -4.01 -1.6
Solyc03g096055.1.1 (Solyc03g096055.1)
-0.39 -2.57 -4.23 -2.66 -0.57 -0.57 -1.41 -0.46 -2.86 1.82 1.15 1.29 1.27 1.2 1.01 1.15 1.08 -4.07 -6.84 -2.04 -1.39 0.03 -0.2 -0.41 -0.79 -0.86 0.21 -0.21 -0.84 -0.12 0.35 -0.12 -3.82 -0.37
Solyc03g097710.3.1 (Solyc03g097710.3)
-2.16 -1.06 -0.86 -1.34 0.94 0.32 -0.18 -0.69 -1.15 1.66 1.03 1.08 0.85 0.41 0.76 0.9 1.51 -1.13 -0.76 -0.13 -0.94 -1.13 -1.77 -1.59 -1.23 1.33 -1.67 -1.16 -0.97 -1.49 -1.39 -0.74 -0.86 -0.51
Solyc03g117380.3.1 (Solyc03g117380.3)
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Solyc03g118995.1.1 (Solyc03g118995.1)
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Solyc04g011370.3.1 (Solyc04g011370.3)
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Solyc04g014875.1.1 (Solyc04g014875.1)
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Solyc04g054780.3.1 (Solyc04g054780.3)
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Solyc06g068215.1.1 (Solyc06g068215.1)
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Solyc07g055020.3.1 (Solyc07g055020.3)
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Solyc12g089325.1.1 (Solyc12g089325.1)
-2.55 0.46 -0.38 -0.58 -1.71 -0.49 0.34 -0.94 -1.64 1.05 0.23 0.05 1.44 1.49 0.83 1.24 1.18 -4.05 -4.62 -0.37 -0.13 -0.59 -0.24 -0.92 -1.06 0.91 -0.31 -0.57 -0.69 -0.82 -0.33 -0.38 -0.98 -0.43
Solyc12g099570.2.1 (Solyc12g099570.2)
-0.65 0.76 0.6 0.99 0.72 0.65 -0.3 1.15 -1.92 0.89 -0.24 0.25 -0.46 0.18 1.43 1.34 1.25 -3.1 -3.83 -2.8 -8.01 -0.77 -1.39 -0.74 -0.51 -0.61 -1.24 -0.68 -0.65 -0.56 -0.37 -0.59 -0.27 -1.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.