Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.63 1.0 0.59 0.65 0.82 0.94 0.25
0.21 0.22 0.67 0.63 1.0 0.37 0.29
0.74 0.61 0.88 0.79 1.0 0.82 0.45
0.81 0.84 1.0 0.53 0.92 0.88 0.17
0.26 0.27 0.69 0.29 0.32 1.0 0.0
0.57 0.71 0.82 0.82 1.0 0.83 0.71
0.36 0.1 0.84 0.33 0.52 1.0 0.0
0.22 0.36 0.61 0.26 0.77 1.0 0.12
0.51 0.41 0.56 0.5 0.87 1.0 0.26
0.66 0.75 1.0 0.82 0.87 1.0 0.26
0.44 0.71 0.9 0.77 1.0 0.71 0.17
0.64 0.9 0.78 0.55 0.6 1.0 0.34
0.55 0.51 0.62 0.83 0.67 1.0 0.23
Cba_g04251 (CRK8)
0.41 0.63 0.81 0.83 1.0 0.44 0.24
0.47 0.83 0.9 0.77 1.0 0.57 0.32
0.28 0.56 0.84 0.7 0.74 1.0 0.17
0.85 0.77 0.9 0.74 0.72 1.0 0.2
0.52 1.0 0.61 0.75 0.65 0.8 0.27
0.46 1.0 0.82 0.43 0.82 0.46 0.36
0.69 0.59 0.75 0.56 0.87 1.0 0.27
0.63 0.66 0.64 0.7 1.0 0.94 0.33
0.66 0.87 0.65 0.74 0.94 1.0 0.27
0.87 0.84 1.0 0.92 0.99 0.87 0.62
Cba_g08052 (PRA1.A1)
0.8 0.83 0.84 0.9 1.0 0.93 0.71
0.09 0.17 0.39 0.61 0.3 1.0 0.23
0.69 0.06 0.46 0.31 0.47 1.0 0.52
0.44 0.35 0.41 0.4 0.45 1.0 0.35
0.38 0.64 1.0 0.22 0.61 0.41 0.13
0.28 0.29 0.23 0.58 0.47 1.0 0.32
0.25 0.43 0.47 0.48 0.55 1.0 0.41
0.19 0.34 0.21 0.42 0.44 1.0 0.2
0.46 0.93 0.51 0.68 1.0 0.89 0.21
0.67 1.0 0.78 0.77 0.6 0.72 0.31
Cba_g11469 (CRK)
0.67 0.85 0.6 0.52 0.76 1.0 0.46
0.58 0.7 0.59 0.51 1.0 0.85 0.48
0.68 0.81 0.85 0.88 0.4 1.0 0.21
0.36 0.57 0.51 0.51 0.46 1.0 0.14
0.54 0.91 0.62 0.58 0.62 1.0 0.2
0.78 0.52 0.93 0.76 0.81 1.0 0.29
0.58 0.74 0.72 0.84 0.34 1.0 0.4
0.78 0.65 0.85 0.78 1.0 0.84 0.36
0.38 0.41 0.58 0.6 0.65 1.0 0.31
0.72 0.84 0.6 0.76 0.82 1.0 0.68
0.6 0.73 0.54 0.77 1.0 0.75 0.5
0.33 0.71 0.53 0.73 0.63 1.0 0.72
Cba_g14903 (MFP2)
0.32 0.49 0.61 0.49 1.0 0.39 0.1
Cba_g15448 (TCP-1)
0.87 1.0 0.76 0.78 0.95 0.99 0.73
0.49 0.42 0.76 0.58 0.54 1.0 0.15
0.46 0.62 0.7 0.7 1.0 0.48 0.45
Cba_g16172 (ATG3)
0.75 0.8 0.88 0.85 1.0 0.8 0.75
0.46 0.52 0.7 0.75 0.6 1.0 0.23
0.35 0.75 1.0 0.44 0.94 0.41 0.0
0.41 0.89 1.0 0.89 0.95 0.51 0.19
0.62 0.79 0.68 0.48 0.85 1.0 0.32
0.46 0.43 0.68 0.74 0.71 1.0 0.17
0.67 0.87 0.71 0.75 1.0 0.81 0.48
0.79 1.0 0.79 0.85 0.84 0.95 0.49
0.67 0.82 0.37 0.5 1.0 0.88 0.16
Cba_g19261 (NFS1)
0.57 0.74 0.88 0.69 1.0 0.67 0.37
Cba_g20362 (TCP-1)
0.86 0.49 0.71 0.6 0.68 1.0 0.43
0.88 0.95 0.31 0.6 1.0 0.97 0.72
0.4 0.39 0.76 0.64 1.0 0.16 0.15
0.48 0.63 0.5 0.5 0.79 1.0 0.11
0.3 0.34 0.78 0.68 0.45 1.0 0.16
0.72 1.0 0.63 0.64 0.89 0.97 0.3
0.41 0.63 0.98 0.86 0.36 1.0 0.31
0.56 0.58 0.79 0.73 1.0 0.56 0.53
0.11 0.2 1.0 0.77 0.9 0.54 0.37
0.77 0.87 0.47 0.82 0.95 1.0 0.46
0.72 0.48 0.57 0.76 1.0 0.85 0.43
0.67 0.75 0.49 0.64 0.75 1.0 0.33
0.6 0.3 0.62 0.9 0.45 1.0 0.16
0.29 0.64 1.0 0.99 0.72 0.38 0.47
0.65 1.0 0.85 0.75 0.96 0.99 0.33
0.78 0.9 0.82 0.92 1.0 0.84 0.62
0.18 0.43 0.56 1.0 0.91 0.65 0.14
0.9 0.95 0.79 0.93 0.86 1.0 0.54
0.68 0.78 0.88 0.65 1.0 0.32 0.24
0.89 0.78 0.65 0.81 1.0 0.92 0.42
0.66 0.82 0.67 0.81 1.0 0.88 0.15
0.65 0.57 0.89 1.0 0.95 0.8 0.3
0.61 0.52 0.68 0.74 0.64 1.0 0.17
0.42 0.79 0.93 0.92 0.7 1.0 0.55
0.76 0.52 0.78 0.69 0.61 1.0 0.24
Cba_g33810 (ORF158)
0.51 0.59 0.67 0.59 0.67 1.0 0.56
0.79 0.65 0.57 0.56 0.73 1.0 0.43
0.46 0.06 0.41 0.53 0.55 1.0 0.04
0.35 0.48 0.79 0.7 1.0 0.64 0.52
0.17 0.16 0.4 0.53 0.36 1.0 0.29
0.76 0.57 0.76 0.69 1.0 0.83 0.35
0.85 0.71 0.86 0.63 1.0 0.87 0.38
0.94 0.8 1.0 0.9 0.99 0.81 0.57
0.63 0.78 0.74 0.87 0.92 1.0 0.4
0.6 0.68 0.93 0.78 0.95 1.0 0.53
0.3 0.34 0.46 0.49 0.45 1.0 0.42
0.7 0.83 0.77 0.89 0.81 1.0 0.73
0.72 0.15 0.62 0.5 0.85 1.0 0.08
0.56 0.62 0.82 0.7 1.0 0.64 0.42
0.8 0.78 0.47 0.69 1.0 0.84 0.44
0.76 0.71 0.8 1.0 0.95 0.65 0.29
0.29 0.49 0.83 0.86 1.0 0.35 0.27
0.42 0.47 1.0 0.75 0.69 0.73 0.35
0.68 0.53 0.49 0.62 1.0 0.91 0.23
0.97 1.0 0.87 0.98 1.0 0.8 0.41
0.64 0.69 0.73 0.79 1.0 0.81 0.36
0.94 0.53 1.0 0.74 0.99 0.98 0.36
0.79 0.95 0.9 0.88 0.97 1.0 0.54
0.36 0.45 1.0 0.61 0.82 0.83 0.69
Cba_g55705 (LPAT5)
0.72 0.74 0.81 0.78 1.0 0.8 0.7
Cba_g57427 (OPT4)
0.06 0.01 0.69 0.65 0.74 1.0 0.56
0.7 0.62 0.68 0.63 0.64 1.0 0.26
0.73 0.98 0.59 0.82 0.74 1.0 0.41
0.45 0.39 0.65 0.86 1.0 0.63 0.09
0.87 0.32 0.92 0.78 1.0 0.91 0.57
0.79 0.62 0.47 0.44 0.85 1.0 0.37
0.72 0.66 0.83 0.8 1.0 0.92 0.25
0.74 0.54 0.56 0.63 1.0 0.3 0.44
0.33 0.45 0.51 0.35 0.5 1.0 0.34
0.15 0.2 0.17 0.31 0.34 1.0 0.21
0.34 0.43 0.75 0.74 0.95 1.0 0.23
0.53 0.42 1.0 0.77 0.7 0.56 0.5
0.33 0.36 1.0 0.61 0.72 0.61 0.24
0.69 0.6 0.75 0.72 0.86 1.0 0.34
0.72 0.79 1.0 0.65 0.92 0.49 0.31
0.38 0.52 0.49 0.61 1.0 0.63 0.17
Cba_g75007 (TCP-1)
0.79 0.7 0.68 0.75 0.85 0.76 1.0
0.43 0.54 0.5 0.81 1.0 0.85 0.26
0.49 0.62 0.86 1.0 0.61 0.96 0.28
0.33 0.23 0.59 0.63 0.35 1.0 0.23
1.0 0.45 0.9 0.98 0.69 0.89 0.57
0.7 0.9 0.82 0.85 0.83 1.0 0.22
0.46 0.5 0.57 0.53 1.0 0.56 0.12
0.75 0.66 0.77 0.88 0.87 1.0 0.73
Cba_g76944 (SRD2)
0.71 0.73 0.96 0.96 1.0 0.82 0.62
0.13 0.29 0.79 0.9 0.9 1.0 0.43
0.5 0.45 0.49 0.63 1.0 0.86 0.09
0.63 0.68 0.71 1.0 0.97 0.54 0.36
0.16 0.21 1.0 0.49 0.75 0.7 0.47
0.64 0.75 1.0 0.98 0.93 0.56 0.65
0.37 0.33 0.25 0.18 0.63 1.0 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)