Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-3.84 - - - - - 2.79
- - - - - - 2.81
Cba_g41954 (PDR4)
- -3.72 -5.1 -6.68 -6.82 - 2.78
- - - - - - 2.81
-3.41 - - - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -4.98 - - 2.8
- - - - - - 2.81
Cba_g42600 (SFH3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g42902 (SRPK4)
- - - - - - 2.81
Cba_g43207 (WES1)
-5.48 -3.9 -3.65 -3.87 -2.43 -7.04 2.72
- - - - - - 2.81
Cba_g43559 (BGLU40)
-5.56 -3.93 - - - -5.32 2.78
- - - - - - 2.81
- -6.19 - -5.36 - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -7.4 - - - - 2.81
- -3.08 - - - - 2.78
- -1.87 - - - - 2.75
Cba_g45171 (BIOB)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g47184 (PUB49)
- - - - - - 2.81
Cba_g47259 (HTA8)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g49351 (VPS28-1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -5.25 - -4.28 - - 2.79
- -6.21 - - - - 2.8
Cba_g49732 (ALS3)
- - - - - - 2.81
- -5.81 - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g50530 (PFD4)
- - - - - - 2.81
Cba_g50584 (APG12)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g51494 (CCD8)
-6.51 -8.35 - -4.78 - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g51798 (NRPE8B)
- - - - - - 2.81
Cba_g51868 (CYTC-1)
-4.54 - - -3.81 - - 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g53354 (RPL27)
-4.23 -4.18 -2.7 -2.53 -3.42 -4.23 2.68
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g55732 (PDF2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g56693 (UBC13)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g57117 (PDI5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g57466 (HTA9)
- -3.18 - - - - 2.78
Cba_g57511 (CYP71B13)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g58075 (ROF1)
- - - - - - 2.81
Cba_g58076 (ROF1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g58543 (PCK1)
-5.17 -3.64 -8.49 -6.71 - - 2.78
Cba_g58564 (scpl47)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g58722 (scpl44)
- - - - -4.49 - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g59412 (UBC35)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g60000 (CYP714A1)
- - - - - - 2.81
Cba_g60098 (PBA1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g60577 (ACT8)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g60642 (VPS60.1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g60959 (ROC7)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - -5.89 - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-5.8 - - - - - 2.8
Cba_g61486 (D6PK)
-4.07 -3.04 -6.48 -3.68 -8.2 - 2.75
- - - - - - 2.81
Cba_g61958 (CHX17)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g62364 (B5 #3)
- -4.52 - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Cba_g62820 (RPT1A)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.04 2.78
- -5.24 - -5.41 - - 2.8
- - - - - - 2.81
- -3.3 -3.59 - - - 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -5.41 -4.37 - - - 2.79

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.