Heatmap: Cluster_107 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00270050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.454)	0.03	0.12	0.14	0.19	0.57	0.86	0.63	0.27	0.59	0.48	0.68	0.78	0.7	0.68	1.0	0.5	0.9	0.34	0.34	0.33	0.19	0.54
AMTR_s00002p00258790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.428)	0.5	0.32	0.03	0.03	0.68	1.0	0.82	0.11	0.44	0.38	0.71	0.64	0.42	0.45	0.28	0.27	0.84	0.43	0.37	0.22	0.2	0.18
AMTR_s00002p00269840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.560)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.24	0.0	0.35	0.29	0.2	0.27	0.17	0.22	0.08	1.0	0.36	0.57	0.26	0.11	0.07	0.26
AMTR_s00003p00098390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.63)	1.0	0.21	0.44	0.02	0.1	0.61	0.48	0.0	0.53	0.4	0.32	0.32	0.58	0.51	0.47	0.2	0.41	0.23	0.25	0.31	0.21	0.41
AMTR_s00003p00210080 (NAP9)	0.3	0.18	0.16	0.05	0.35	1.0	0.82	0.22	0.55	0.54	0.53	0.52	0.58	0.6	0.37	0.36	0.5	0.42	0.39	0.3	0.16	0.34
AMTR_s00003p00264810 (ULT)	0.35	0.21	0.12	0.06	0.62	0.7	0.37	0.1	0.49	0.58	0.5	0.59	0.44	0.65	0.52	1.0	0.47	0.43	0.39	0.25	0.23	0.45
AMTR_s00004p00042590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.22)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.37	0.01	0.37	0.58	0.03	0.0	0.02	0.06	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00004p00131810 (SYP132)	0.25	0.57	0.46	0.01	0.44	1.0	0.7	0.37	0.49	0.52	0.7	0.54	0.45	0.46	0.37	0.34	0.49	0.27	0.31	0.31	0.09	0.3
AMTR_s00006p00130300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.48)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.38	0.0	0.21	0.17	0.0	1.0	0.11	0.07	0.03	1.0	0.26	0.0	0.0	0.03	0.08	0.2
AMTR_s00007p00206520 (PYD4)	0.31	0.01	0.11	0.13	0.13	0.03	0.43	0.2	0.51	0.49	0.5	0.4	0.29	0.17	0.18	1.0	0.28	0.2	0.21	0.12	0.08	0.24
AMTR_s00014p00234760 (KCS4)	0.11	0.07	0.0	0.01	0.14	0.29	0.43	0.08	0.49	0.61	0.28	0.32	0.23	0.5	0.46	1.0	0.11	0.17	0.14	0.1	0.11	0.19
AMTR_s00016p00260090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.375)	0.34	0.33	0.36	0.05	0.27	0.54	0.48	0.23	0.39	0.42	0.25	0.3	0.32	0.5	0.27	1.0	0.19	0.42	0.4	0.25	0.24	0.21
AMTR_s00021p00221210 (KAS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.28	0.0	0.15	0.17	0.33	1.0	0.23	0.1	0.36	0.72	0.05	0.26	0.12	0.01	0.0	0.49
AMTR_s00021p00221400 (KAS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.01	0.32	0.15	0.13	0.17	0.24	1.0	0.25	0.1	0.36	0.69	0.04	0.24	0.17	0.01	0.0	0.46
AMTR_s00021p00224370 (SSI)	0.39	0.15	0.42	0.07	0.21	0.31	0.81	0.08	0.45	0.47	0.32	0.33	0.31	0.47	0.22	1.0	0.08	0.17	0.13	0.2	0.16	0.07
AMTR_s00022p00027620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.11)	0.04	0.0	0.01	0.23	0.38	0.35	0.28	0.02	0.31	0.32	0.32	0.39	0.31	0.32	0.29	1.0	0.36	0.57	0.45	0.37	0.3	0.24
AMTR_s00024p00147790 (PTR2)	0.3	0.13	0.16	0.09	0.54	1.0	0.57	0.12	0.61	0.55	0.56	0.52	0.47	0.7	0.57	0.47	0.39	0.5	0.43	0.3	0.43	0.39
AMTR_s00024p00222740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.220)	0.05	0.2	0.25	0.0	0.21	0.0	0.18	0.17	0.18	0.22	0.0	0.02	0.05	0.12	0.13	1.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.17
AMTR_s00029p00199510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.276)	0.31	0.53	0.53	0.05	0.57	0.62	0.37	0.35	0.48	0.52	0.58	0.73	0.58	0.67	0.72	0.23	1.0	0.32	0.32	0.22	0.08	0.8
AMTR_s00034p00238200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.122)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.15	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0
AMTR_s00039p00234040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.223)	0.0	0.1	0.15	0.0	0.18	0.0	0.07	0.0	0.65	0.26	0.1	0.08	0.22	0.04	0.03	1.0	0.06	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03
AMTR_s00045p00030700 (ACLA-3)	0.5	0.67	0.28	0.11	0.63	1.0	0.87	0.28	0.88	0.86	0.8	0.65	0.8	0.98	0.79	0.6	0.56	0.65	0.43	0.64	0.41	0.81
AMTR_s00045p00083360 (NPSN13)	0.64	0.74	0.17	0.21	0.62	0.53	0.59	0.2	0.66	0.55	0.89	0.83	0.8	0.78	0.74	0.49	0.8	0.52	0.49	0.42	0.3	1.0
AMTR_s00045p00166680 (UBC32)	1.0	0.37	0.42	0.1	0.38	0.69	0.7	0.23	0.64	0.71	0.39	0.47	0.39	0.55	0.79	0.67	0.32	0.26	0.34	0.51	0.19	0.42
AMTR_s00048p00180940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.134)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.16	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1
AMTR_s00059p00123280 (PMT5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.08	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.01	0.1
AMTR_s00060p00141650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.83)	0.73	0.74	0.13	0.0	0.1	0.32	0.47	0.02	0.48	0.4	0.27	0.27	0.24	0.37	0.19	1.0	0.16	0.29	0.3	0.23	0.14	0.17
AMTR_s00061p00094480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.70)	0.43	0.04	0.57	0.24	0.82	1.0	0.85	0.22	0.55	0.55	0.83	0.71	0.8	0.92	0.64	0.47	0.78	0.53	0.49	0.43	0.24	0.44
AMTR_s00068p00103110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.51)	0.25	0.13	0.22	0.0	0.54	1.0	0.38	0.25	0.43	0.47	0.47	0.36	0.51	0.45	0.36	0.31	0.53	0.31	0.33	0.49	0.19	0.39
AMTR_s00075p00034690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00075.7)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.13	0.0	0.67	0.01	0.65	0.78	0.21	0.23	0.68	0.16	0.15	1.0	0.08	0.18	0.07	0.03	0.05	0.46
AMTR_s00092p00147500 (UXS5)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.22	0.67	0.02	0.81	0.82	0.32	0.31	0.08	0.2	0.27	1.0	0.02	0.07	0.08	0.03	0.06	0.04
AMTR_s00092p00171180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.156)	0.19	0.07	0.32	0.09	0.26	0.34	0.44	0.06	0.31	0.4	0.15	0.19	0.25	0.38	0.43	1.0	0.17	0.22	0.22	0.37	0.19	0.29
AMTR_s00105p00088160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.48)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.13	0.0	0.37	0.28	0.17	0.3	0.11	0.12	0.17	1.0	0.0	0.0	0.12	0.05	0.0	0.04
AMTR_s00109p00017280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.31	0.0	0.49	0.33	0.56	0.65	0.38	0.78	0.3	0.33	0.27	0.43	0.48	0.49	0.26	0.62
AMTR_s00110p00065160 (BCCP)	0.15	0.14	0.17	0.0	0.13	0.05	0.43	0.08	0.43	0.37	0.22	0.32	0.21	0.18	0.11	1.0	0.24	0.3	0.22	0.08	0.06	0.23
AMTR_s00141p00029880 (KAS1)	0.37	0.42	0.39	0.08	0.29	0.13	0.53	0.12	0.24	0.25	0.21	0.29	0.21	0.19	0.22	1.0	0.51	0.23	0.17	0.18	0.09	0.24
AMTR_s00146p00045810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.24)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.54	0.0	1.0	0.84	0.0	0.0	0.12	0.24	0.45	0.89	0.3	0.0	0.0	0.12	0.0	0.32
AMTR_s00162p00030050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00162.9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.26	0.0	0.05	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0
AMTR_s00171p00047680 (BETA-TIP)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.3	0.0	0.17	0.23	0.0	0.0	0.0	0.03	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00177p00047570 (GAPC2)	0.49	0.6	0.55	0.03	0.42	0.18	0.28	0.05	0.2	0.23	0.23	0.29	0.25	0.25	0.3	1.0	0.36	0.19	0.11	0.18	0.07	0.41
AMTR_s00180p00048820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00180.29)	0.32	0.46	0.52	0.24	0.58	0.62	0.86	0.31	0.68	0.65	0.71	0.76	1.0	0.86	0.77	0.6	0.93	0.66	0.52	0.51	0.38	0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)