Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00151920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.136)	0.22	0.22	0.32	0.38	1.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.05	0.1	0.1	0.17	0.16	0.44	0.05	0.07	0.04	0.09	0.18	0.05	0.2
AMTR_s00002p00227760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.255)	0.59	0.72	0.22	0.41	1.0	0.36	0.04	0.09	0.04	0.05	0.28	0.31	0.43	0.27	0.29	0.04	0.06	0.27	0.12	0.1	0.07	0.12
AMTR_s00003p00266840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.381)	0.0	0.0	0.0	0.4	1.0	0.0	0.02	0.01	0.04	0.03	0.0	0.12	0.03	0.01	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03
AMTR_s00009p00186290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.117)	0.42	0.67	0.25	0.4	1.0	0.5	0.65	0.15	0.33	0.31	0.51	0.45	0.47	0.4	0.37	0.24	0.47	0.49	0.36	0.37	0.21	0.45
AMTR_s00010p00069750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.38)	0.44	0.19	0.47	0.58	1.0	0.0	0.06	0.08	0.09	0.08	0.23	0.32	0.27	0.25	0.42	0.07	0.36	0.23	0.11	0.07	0.06	0.22
AMTR_s00011p00239880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.134)	0.01	0.0	0.05	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.08	0.14	0.22	0.42	0.2	0.06	0.09	0.06	0.08	0.05	0.28
AMTR_s00013p00100640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.52)	0.19	0.11	0.1	0.38	1.0	0.01	0.15	0.09	0.23	0.22	0.15	0.17	0.33	0.43	0.72	0.01	0.11	0.09	0.15	0.13	0.04	0.21
AMTR_s00016p00254890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.330)	0.0	0.74	0.0	0.45	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.12	0.07	0.04	0.32	0.02	0.19	0.16	0.05	0.02	0.02	0.7
AMTR_s00016p00256020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.339)	0.35	0.41	0.47	0.42	1.0	0.46	0.15	0.12	0.08	0.06	0.54	0.42	0.38	0.47	0.24	0.46	0.24	0.41	0.37	0.24	0.34	0.16
AMTR_s00019p00248000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.396)	0.36	0.7	0.32	0.63	1.0	0.04	0.06	0.14	0.07	0.07	0.29	0.16	0.29	0.27	0.21	0.33	0.12	0.1	0.14	0.11	0.11	0.24
AMTR_s00024p00189140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.153)	0.14	0.15	0.11	0.83	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.12	0.47	0.1	0.37	0.45	0.09	0.23	0.19	0.08	0.18	0.43
AMTR_s00025p00058860 (ATDAD1)	0.65	0.8	0.63	0.25	1.0	0.56	0.34	0.24	0.19	0.2	0.33	0.37	0.54	0.38	0.33	0.35	0.2	0.23	0.24	0.38	0.16	0.48
AMTR_s00025p00145710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.160)	0.0	0.0	0.0	0.88	1.0	0.0	0.04	0.0	0.05	0.02	0.12	0.0	0.09	0.06	0.15	0.0	0.0	0.0	0.08	0.03	0.98	0.3
AMTR_s00027p00144540 (HB-7)	0.2	0.83	0.75	0.33	1.0	0.0	0.02	0.31	0.08	0.07	0.06	0.05	0.34	0.23	0.31	0.08	0.11	0.08	0.12	0.29	0.16	0.25
AMTR_s00029p00223960 (SETH1)	0.26	0.33	0.24	1.0	0.65	0.02	0.13	0.19	0.26	0.22	0.42	0.44	0.39	0.31	0.52	0.24	0.37	0.35	0.36	0.19	0.08	0.26
AMTR_s00029p00226370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.353)	0.18	0.35	0.52	0.74	1.0	0.2	0.11	0.13	0.07	0.08	0.58	0.64	0.62	0.41	0.5	0.26	0.5	0.42	0.35	0.28	0.13	0.41
AMTR_s00030p00110130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.52)	0.5	0.8	0.58	0.37	1.0	0.67	0.15	0.0	0.08	0.08	0.59	0.71	0.6	0.41	0.26	0.84	0.22	0.63	0.68	0.6	0.2	0.69
AMTR_s00032p00182850 (ZIP7)	0.0	0.0	0.0	0.3	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.06	0.07	0.21	0.04	0.26	0.01	0.01	0.0	0.01	0.07	0.01	0.3
AMTR_s00034p00047350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.10)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00036p00224120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.163)	0.62	0.17	0.19	0.91	1.0	0.21	0.18	0.21	0.18	0.19	0.42	0.42	0.4	0.31	0.39	0.15	0.34	0.21	0.25	0.38	0.15	0.24
AMTR_s00037p00037580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.11)	0.0	0.0	0.0	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00042p00142880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00042.36)	0.0	0.0	0.0	0.56	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00045p00091680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.84)	0.55	0.85	0.7	0.44	1.0	0.09	0.17	0.55	0.16	0.16	0.35	0.32	0.41	0.32	0.27	0.12	0.14	0.19	0.23	0.13	0.04	0.51
AMTR_s00047p00083900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.30)	0.33	0.23	0.28	0.77	1.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.5	0.52	0.69	0.3	0.76	0.23	0.21	0.22	0.23	0.15	0.13	0.37
AMTR_s00056p00204920 (MYB36)	0.08	0.11	0.0	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.18	0.13	0.12	0.28	0.06	0.07	0.04	0.03	0.04	0.01	0.27
AMTR_s00060p00031820 (LHCA5)	0.03	0.01	0.16	0.23	1.0	0.01	0.05	0.05	0.06	0.04	0.14	0.09	0.25	0.17	0.28	0.12	0.31	0.12	0.12	0.32	0.17	0.13
AMTR_s00060p00204200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.146)	0.0	0.31	0.0	0.74	1.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.02	0.37	0.0	0.19	0.08	0.06	0.41	0.4	0.26	0.32	0.14	0.24	0.09
AMTR_s00061p00068850 (UBC11)	0.4	0.42	0.54	0.45	1.0	0.12	0.09	0.24	0.14	0.13	0.28	0.26	0.5	0.3	0.53	0.13	0.26	0.13	0.19	0.34	0.03	0.51
AMTR_s00061p00136430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.114)	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00061p00199660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.239)	0.0	0.01	0.0	1.0	0.99	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.17	0.26	0.47	0.45	0.98	0.14	0.05	0.23	0.27	0.69	0.58	0.47
AMTR_s00061p00199750 (CSLE1)	0.03	0.0	0.02	0.64	1.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.27	0.41	0.8	0.45	0.87	0.32	0.07	0.24	0.37	0.43	0.31	0.36
AMTR_s00062p00187930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.189)	0.0	0.0	0.0	0.97	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00067p00139050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.126)	0.24	0.7	0.56	1.0	0.77	0.0	0.07	0.02	0.1	0.1	0.28	0.3	0.2	0.16	0.38	0.26	0.2	0.16	0.13	0.19	0.16	0.21
AMTR_s00067p00139470 (PP2-B1)	0.31	1.0	0.71	0.51	0.92	0.02	0.11	0.09	0.13	0.14	0.4	0.41	0.32	0.2	0.54	0.3	0.12	0.25	0.25	0.32	0.14	0.27
AMTR_s00071p00042730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.22)	0.0	0.0	0.33	0.62	1.0	0.05	0.15	0.0	0.09	0.08	0.45	0.5	0.85	0.33	0.56	0.1	0.13	0.38	0.35	0.45	0.08	0.52
AMTR_s00074p00135680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.47)	0.0	0.0	0.0	0.81	0.9	0.0	0.05	0.0	0.04	0.07	0.0	0.0	0.04	0.05	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03
AMTR_s00077p00103150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.86)	0.0	0.97	0.22	1.0	0.5	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
AMTR_s00078p00077700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.50)	0.04	0.48	0.14	0.95	1.0	0.0	0.09	0.11	0.18	0.18	0.5	0.34	0.54	0.56	0.38	0.11	0.09	0.43	0.41	0.21	0.01	0.38
AMTR_s00085p00099740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.60)	0.18	0.33	0.15	0.26	1.0	0.1	0.08	0.16	0.06	0.07	0.25	0.23	0.38	0.28	0.36	0.25	0.17	0.17	0.18	0.17	0.09	0.27
AMTR_s00095p00137540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.100)	0.23	0.26	0.26	0.15	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.21	0.15	0.26	0.16	0.31	0.17	0.16	0.09	0.09	0.14	0.05	0.19
AMTR_s00103p00113520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.67)	0.37	0.31	0.15	0.78	1.0	0.0	0.11	0.0	0.39	0.34	0.27	0.35	0.49	0.4	0.7	0.15	0.26	0.15	0.19	0.39	0.3	0.3
AMTR_s00109p00132480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.138)	0.42	0.67	0.72	1.0	0.78	0.01	0.13	0.14	0.06	0.07	0.26	0.21	0.21	0.18	0.24	0.08	0.44	0.11	0.12	0.11	0.04	0.25
AMTR_s00119p00034140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.17)	0.0	0.5	0.0	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00119p00136700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.114)	0.25	1.0	0.36	0.51	0.75	0.53	0.33	0.17	0.19	0.19	0.46	0.47	0.37	0.41	0.38	0.36	0.24	0.34	0.38	0.27	0.16	0.3
AMTR_s00129p00079480 (ALAAT2)	0.09	0.25	0.36	0.0	1.0	0.01	0.09	0.03	0.1	0.1	0.1	0.12	0.17	0.31	0.44	0.14	0.25	0.07	0.06	0.11	0.07	0.21
AMTR_s00129p00080070 (AlaAT1)	0.06	0.27	0.37	0.02	1.0	0.04	0.14	0.07	0.1	0.13	0.12	0.12	0.25	0.35	0.46	0.13	0.18	0.09	0.08	0.11	0.07	0.21
AMTR_s00129p00119770 (RAP2.2)	0.49	0.76	0.6	0.44	1.0	0.09	0.05	0.0	0.05	0.06	0.63	0.89	0.42	0.32	0.66	0.19	0.11	0.27	0.15	0.08	0.01	0.72
AMTR_s00129p00125450 (AIP2)	0.56	0.35	0.34	0.2	1.0	0.17	0.09	0.21	0.1	0.12	0.13	0.15	0.3	0.14	0.22	0.14	0.15	0.1	0.12	0.1	0.06	0.13
AMTR_s00131p00047750 (JAZ12)	0.9	0.65	0.63	0.26	1.0	0.48	0.12	0.16	0.14	0.15	0.32	0.66	0.61	0.32	0.61	0.12	0.21	0.16	0.14	0.35	0.14	0.25
AMTR_s00136p00089480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00136.46)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.07	0.05	0.19	0.0	0.18	0.07	0.23	0.0	0.33	0.0	0.07	0.09	0.27	0.11
AMTR_s00148p00035770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.16)	0.54	0.8	0.55	0.24	1.0	0.3	0.25	0.37	0.12	0.15	0.25	0.28	0.27	0.19	0.22	0.36	0.24	0.26	0.34	0.25	0.13	0.36
AMTR_s00149p00083940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.68)	0.39	0.18	0.18	0.55	1.0	0.0	0.03	0.06	0.07	0.06	0.18	0.26	0.29	0.21	0.37	0.1	0.16	0.15	0.16	0.14	0.1	0.21
AMTR_s00159p00023000 (SPMS)	0.05	0.07	0.04	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.14	0.19	0.23	0.2	0.31	0.15	0.12	0.04	0.06	0.06	0.04	0.2
AMTR_s00163p00076750 (B5 #4)	0.86	0.62	0.79	0.52	1.0	0.17	0.26	0.3	0.31	0.33	0.36	0.44	0.41	0.32	0.39	0.1	0.14	0.31	0.2	0.07	0.07	0.42
AMTR_s00164p00050110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.19)	0.42	0.39	0.63	0.36	1.0	0.39	0.25	0.23	0.19	0.22	0.31	0.27	0.36	0.29	0.43	0.2	0.22	0.19	0.27	0.26	0.08	0.36
AMTR_s00204p00016280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00204.14)	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.1	0.0	0.2	0.09	0.08	0.69	0.3	0.19	0.38	0.09	0.1	0.12	0.23	0.23	0.54	0.19
AMTR_s00256p00017450 (BLOS1)	0.34	0.89	0.02	0.46	0.78	0.35	0.27	0.0	0.19	0.19	0.68	0.71	0.51	0.47	0.16	0.57	0.39	1.0	0.45	0.21	0.14	0.37
AMTR_s00888p00003850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00888.1)	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.0	0.21	0.0	0.09	0.07	0.0	0.0	0.02	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.41	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)