Heatmap: Cluster_287 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g011350.3.1 (Solyc01g011350.3)
0.16 0.1 0.28 0.21 0.3 0.13 0.17 0.08 0.18 0.15 0.18 0.13 0.15 0.11 0.13 0.13 0.12 0.0 0.0 0.24 0.37 0.72 0.44 0.67 1.0 0.3 0.21 0.37 0.49 0.47 0.47 0.82 0.01 0.28
Solyc01g049650.3.1 (Solyc01g049650.3)
0.48 0.33 0.61 0.45 0.46 0.42 0.53 0.23 0.45 0.5 0.43 0.48 0.55 0.53 0.27 0.16 0.19 0.39 0.42 0.17 0.62 0.98 0.88 0.99 1.0 0.13 0.38 0.46 0.47 0.81 0.79 0.89 0.22 0.63
Solyc01g066740.3.1 (Solyc01g066740.3)
0.13 0.03 0.31 0.13 0.51 0.18 0.27 0.26 0.54 0.29 0.44 0.44 0.04 0.31 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.5 0.81 0.74 0.81 0.85 0.02 0.37 0.49 0.43 0.65 0.72 1.0 0.02 0.3
Solyc01g086920.3.1 (Solyc01g086920.3)
0.05 0.03 0.02 0.19 0.67 0.22 0.23 0.27 0.28 0.12 0.05 0.03 0.07 0.04 0.16 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.28 0.92 0.34 0.88 1.0 0.0 0.27 0.41 0.3 0.87 0.67 0.89 0.36 0.06
Solyc01g088660.3.1 (Solyc01g088660.3)
0.25 0.09 0.17 0.27 0.15 0.22 0.04 0.07 0.31 0.4 0.74 0.51 0.47 0.3 0.6 0.43 0.47 0.0 0.0 0.27 0.69 0.78 0.61 0.68 0.85 0.34 0.61 0.68 0.89 0.71 0.68 1.0 0.02 0.53
Solyc01g090770.3.1 (Solyc01g090770.3)
0.94 0.68 0.82 0.92 0.73 0.43 0.66 0.49 0.63 0.43 0.65 0.79 0.89 0.91 0.43 0.31 0.32 0.02 0.03 0.44 0.58 0.94 0.74 0.89 0.99 0.38 0.83 0.89 0.78 0.96 0.9 1.0 0.14 0.66
Solyc01g096150.3.1 (Solyc01g096150.3)
0.68 0.42 0.75 0.79 0.29 0.29 0.85 0.41 0.74 0.4 0.33 0.38 0.33 0.45 0.19 0.07 0.1 0.01 0.0 0.32 0.28 0.9 0.86 0.79 0.68 0.62 1.0 0.84 0.73 0.91 0.9 0.63 0.14 0.74
Solyc01g099630.3.1 (Solyc01g099630.3)
0.07 0.05 0.24 0.27 1.0 0.04 0.14 0.13 0.05 0.05 0.01 0.05 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.67 0.44 0.7 0.92 0.0 0.14 0.24 0.24 0.58 0.45 0.6 0.18 0.12
Solyc01g111110.3.1 (Solyc01g111110.3)
0.34 0.01 0.28 0.02 0.48 0.23 0.1 0.22 0.61 0.48 0.39 0.12 0.28 0.15 0.38 0.21 0.26 0.0 0.0 0.02 0.1 0.62 0.27 0.48 0.63 0.02 0.65 0.78 0.77 0.89 0.71 1.0 0.24 0.88
Solyc02g030125.1.1 (Solyc02g030125.1)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.25 0.08 0.33 0.0 0.75 0.03 0.07 0.26 0.14 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.84 0.34 0.18 0.0 1.0 0.49 0.21 0.74 0.3 0.06 0.0 0.05
Solyc02g065780.1.1 (Solyc02g065780.1)
1.0 0.0 0.25 0.03 0.12 0.06 0.02 0.05 0.2 0.12 0.17 0.12 0.09 0.08 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.08 0.48 0.24 0.38 0.56 0.0 0.18 0.26 0.3 0.46 0.4 0.81 0.12 0.49
Solyc02g081600.3.1 (Solyc02g081600.3)
0.32 0.02 0.57 0.28 0.27 0.32 0.1 0.23 0.33 0.3 0.54 0.13 0.04 0.03 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.41 0.78 0.55 0.82 1.0 0.02 0.1 0.23 0.23 0.41 0.48 0.5 0.12 0.46
Solyc02g082480.3.1 (Solyc02g082480.3)
0.42 0.19 0.4 0.12 0.39 0.34 0.71 0.39 0.57 0.34 0.24 0.23 0.32 0.28 0.21 0.1 0.11 0.0 0.0 0.17 0.34 0.79 0.66 0.68 0.59 0.17 0.58 0.56 0.48 0.67 0.71 0.65 0.05 1.0
Solyc03g007120.3.1 (Solyc03g007120.3)
0.74 0.32 0.32 0.57 0.4 0.23 0.61 0.2 0.46 0.44 0.59 0.41 0.72 0.6 0.4 0.5 0.5 0.03 0.01 0.27 0.55 0.81 0.62 0.72 0.78 0.38 0.52 0.57 0.57 0.75 0.69 1.0 0.13 0.65
Solyc03g019670.3.1 (Solyc03g019670.3)
0.74 0.2 0.25 0.28 0.27 0.43 0.26 0.44 0.58 0.3 0.59 0.38 0.16 0.09 0.08 0.01 0.04 0.0 0.0 0.13 0.94 0.79 0.88 0.94 1.0 0.14 0.35 0.53 0.8 0.5 0.56 0.91 0.56 0.36
Solyc03g078640.1.1 (Solyc03g078640.1)
0.45 0.09 0.24 0.4 0.23 0.15 0.07 0.24 0.3 0.09 0.09 0.19 0.08 0.32 0.18 0.06 0.06 0.0 0.0 0.04 0.28 0.84 0.75 0.79 0.69 0.03 0.94 1.0 0.79 0.88 0.71 0.66 0.07 0.45
Solyc03g083100.3.1 (Solyc03g083100.3)
0.16 0.0 0.03 0.0 0.06 0.57 0.06 0.54 0.39 0.17 0.21 0.14 0.04 0.06 0.1 0.05 0.05 0.0 0.0 0.12 0.29 0.78 0.63 0.8 1.0 0.03 0.15 0.26 0.27 0.51 0.56 0.54 0.21 0.12
Solyc03g093330.3.1 (Solyc03g093330.3)
0.22 0.0 0.08 0.03 0.39 0.09 0.08 0.17 0.37 0.1 0.08 0.07 0.02 0.18 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.42 0.28 0.28 0.23 0.0 1.0 0.75 0.57 0.68 0.6 0.39 0.06 0.6
Solyc03g093360.3.1 (Solyc03g093360.3)
0.09 0.11 0.27 0.52 1.0 0.03 0.03 0.07 0.13 0.06 0.01 0.02 0.03 0.06 0.11 0.04 0.03 0.03 0.01 0.01 0.18 0.47 0.32 0.39 0.57 0.0 0.44 0.35 0.45 0.44 0.38 0.62 0.02 0.14
Solyc03g095190.3.1 (Solyc03g095190.3)
0.95 0.69 0.77 0.65 0.23 0.29 0.62 0.38 0.54 0.37 0.78 1.0 0.8 0.86 0.22 0.22 0.21 0.02 0.01 0.2 0.33 0.66 0.68 0.59 0.6 0.17 0.62 0.56 0.52 0.66 0.7 0.56 0.35 0.64
Solyc03g112580.3.1 (Solyc03g112580.3)
0.42 0.45 0.61 0.88 0.24 0.24 0.17 0.52 0.21 0.13 0.1 0.06 0.07 0.06 0.27 0.08 0.08 0.01 0.03 0.03 0.14 0.74 0.36 0.6 0.58 0.01 0.95 0.98 0.6 1.0 0.75 0.77 0.19 0.38
Solyc03g119320.1.1 (Solyc03g119320.1)
0.42 0.0 0.4 0.01 0.08 0.13 0.09 0.07 0.18 0.12 0.31 0.3 0.58 0.44 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 1.0 0.42 0.79 0.83 0.28 0.39 0.6 0.6 0.93 0.83 0.94 0.07 0.28
Solyc03g120380.3.1 (Solyc03g120380.3)
0.0 0.11 0.03 0.07 0.05 0.02 0.0 0.05 0.05 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.39 0.68 0.43 0.0 0.0 0.0 0.02 0.79 0.38 0.62 1.0 0.0 0.03 0.2 0.31 0.32 0.37 0.4 0.03 0.0
Solyc04g007650.3.1 (Solyc04g007650.3)
0.17 0.21 0.14 0.17 0.08 0.02 0.18 0.03 0.11 0.23 0.15 0.08 0.13 0.08 0.61 0.51 0.53 0.0 0.0 0.08 0.3 0.63 0.23 0.47 0.65 0.08 0.41 0.58 0.57 0.6 0.51 1.0 0.0 0.28
Solyc04g015270.3.1 (Solyc04g015270.3)
0.53 0.18 0.63 0.68 0.96 0.55 0.41 0.61 0.61 0.36 0.49 0.53 0.42 0.4 0.41 0.34 0.32 0.02 0.03 0.42 0.71 0.94 0.84 1.0 0.92 0.42 0.67 0.77 0.74 0.87 0.81 0.78 0.41 0.62
Solyc04g055170.3.1 (Solyc04g055170.3)
0.63 0.26 0.77 0.6 0.57 0.13 0.3 0.11 0.32 0.27 0.3 0.26 0.41 0.37 0.25 0.11 0.14 0.01 0.0 0.19 0.57 0.83 0.64 0.81 0.98 0.12 0.71 0.87 1.0 0.8 0.7 0.92 0.04 0.74
Solyc04g072850.3.1 (Solyc04g072850.3)
0.18 0.56 0.5 0.26 0.78 0.26 0.2 0.44 0.55 0.39 0.23 0.2 0.15 0.24 0.28 0.19 0.2 0.19 0.31 0.02 0.6 0.97 0.76 0.91 1.0 0.02 0.18 0.36 0.43 0.66 0.76 0.83 0.16 0.44
Solyc05g008280.1.1 (Solyc05g008280.1)
0.02 0.08 0.08 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.16 0.15 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0 0.02 0.15 1.0 0.46 0.67 0.82 0.0 0.14 0.44 0.56 0.63 0.72 0.56 0.01 0.04
Solyc05g008900.3.1 (Solyc05g008900.3)
0.54 0.15 0.45 0.2 0.26 0.32 0.45 0.29 0.38 0.29 0.65 0.27 0.38 0.3 0.11 0.05 0.06 0.0 0.0 0.2 0.43 0.59 0.45 0.58 0.52 0.17 0.39 0.39 0.37 0.55 0.58 0.67 0.14 1.0
Solyc05g009210.1.1 (Solyc05g009210.1)
0.34 0.05 0.24 0.54 1.0 0.16 0.0 0.11 0.14 0.14 0.17 0.25 0.21 0.18 0.17 0.26 0.16 0.0 0.0 0.03 0.22 0.71 0.4 0.55 0.72 0.03 0.37 0.41 0.49 0.74 0.66 0.82 0.05 0.81
Solyc05g010710.2.1 (Solyc05g010710.2)
0.29 0.02 0.65 0.15 0.7 0.54 0.22 0.24 0.38 0.13 0.28 0.29 0.06 0.06 0.09 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.14 0.97 0.68 0.76 0.9 0.0 0.43 0.5 0.51 0.85 0.91 1.0 0.16 0.83
Solyc05g013435.1.1 (Solyc05g013435.1)
0.09 0.1 0.06 0.02 0.02 0.09 0.27 0.08 0.34 0.11 0.13 0.12 0.09 0.1 0.11 0.04 0.04 0.0 0.0 0.07 0.1 0.29 0.64 0.33 0.23 0.13 1.0 0.62 0.39 0.48 0.67 0.2 0.01 0.13
Solyc05g013440.3.1 (Solyc05g013440.3)
0.15 0.11 0.07 0.04 0.08 0.09 0.34 0.1 0.36 0.09 0.15 0.28 0.05 0.13 0.06 0.03 0.04 0.0 0.0 0.09 0.11 0.3 0.65 0.4 0.27 0.13 1.0 0.73 0.44 0.46 0.44 0.2 0.02 0.2
Solyc05g053400.2.1 (Solyc05g053400.2)
0.09 0.2 0.01 0.14 0.05 0.1 0.02 0.02 0.14 0.03 0.02 0.11 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.64 0.18 0.07 0.01 1.0 0.47 0.13 0.11 0.17 0.01 0.0 0.09
Solyc06g006090.1.1 (Solyc06g006090.1)
0.05 0.0 0.29 0.11 0.14 0.16 0.01 0.26 0.17 0.23 0.38 0.1 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05 0.31 0.8 0.61 0.78 1.0 0.0 0.04 0.33 0.35 0.58 0.51 0.43 0.07 0.11
Solyc06g008580.3.1 (Solyc06g008580.3)
0.01 0.02 0.22 0.13 0.13 0.05 0.01 0.16 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.73 0.3 0.58 0.84 0.0 0.09 0.26 0.33 0.6 0.43 1.0 0.05 0.03
Solyc06g065340.1.1 (Solyc06g065340.1)
1.0 0.2 0.38 0.59 0.3 0.07 0.05 0.15 0.28 0.2 0.23 0.3 0.15 0.07 0.11 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.73 0.97 0.61 0.42 0.0 0.29 0.27 0.22 0.73 0.75 0.53 0.05 0.48
Solyc06g071000.3.1 (Solyc06g071000.3)
0.25 0.22 0.13 0.19 0.09 0.16 0.15 0.11 0.21 0.25 0.21 0.34 0.19 0.21 0.25 0.17 0.16 0.0 0.0 0.19 0.16 0.47 0.66 0.43 0.42 0.24 1.0 0.64 0.57 0.53 0.45 0.5 0.03 0.35
Solyc06g073190.3.1 (Solyc06g073190.3)
0.75 0.33 0.47 0.22 0.12 0.04 0.05 0.03 0.09 0.07 0.46 0.9 0.19 0.23 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01 0.17 0.23 0.81 0.66 0.75 1.0 0.17 0.54 0.59 0.55 0.78 0.64 0.69 0.03 0.75
Solyc07g006680.1.1 (Solyc07g006680.1)
0.45 0.02 0.04 0.02 0.03 0.39 0.01 0.21 0.2 0.06 0.05 0.07 0.01 0.01 0.05 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.18 0.65 0.42 0.7 0.84 0.03 0.2 0.35 0.36 0.46 0.47 0.39 0.38 1.0
Solyc07g007340.3.1 (Solyc07g007340.3)
0.55 0.36 0.75 0.82 0.3 0.15 0.52 0.21 0.3 0.28 0.13 0.34 0.54 0.49 0.08 0.12 0.13 0.01 0.02 0.32 0.53 0.61 0.64 0.66 0.61 0.38 1.0 0.89 0.82 0.59 0.59 0.56 0.14 0.66
Solyc07g014640.3.1 (Solyc07g014640.3)
0.28 0.41 0.7 0.93 1.0 0.38 0.23 0.45 0.4 0.43 0.24 0.24 0.1 0.13 0.15 0.11 0.1 0.04 0.05 0.03 0.24 0.79 0.67 0.83 0.77 0.05 0.29 0.37 0.36 0.58 0.6 0.6 0.08 0.47
Solyc07g055065.1.1 (Solyc07g055065.1)
0.17 0.0 0.0 0.0 0.3 0.02 0.03 0.11 0.02 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.15 0.17 0.72 0.33 0.59 1.0 0.16 0.11 0.24 0.29 0.53 0.48 0.82 0.01 0.13
Solyc08g041710.3.1 (Solyc08g041710.3)
0.39 0.28 1.0 0.92 0.42 0.25 0.37 0.33 0.34 0.35 0.17 0.15 0.14 0.11 0.32 0.21 0.24 0.13 0.07 0.05 0.19 0.91 0.54 0.7 0.79 0.09 0.32 0.42 0.48 0.84 0.72 0.78 0.12 0.86
Solyc08g076170.1.1 (Solyc08g076170.1)
1.0 0.03 0.36 0.22 0.34 0.22 0.08 0.35 0.11 0.15 0.57 0.61 0.09 0.08 0.11 0.09 0.06 0.0 0.0 0.02 0.06 0.77 0.54 0.71 0.92 0.02 0.09 0.32 0.32 0.43 0.52 1.0 0.49 0.35
Solyc08g077060.3.1 (Solyc08g077060.3)
0.06 0.0 0.01 0.01 0.07 0.13 0.08 0.31 0.17 0.06 0.15 0.25 0.0 0.01 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.41 0.69 0.69 0.68 1.0 0.03 0.18 0.36 0.45 0.57 0.52 0.92 0.11 0.04
Solyc08g077180.3.1 (Solyc08g077180.3)
0.23 1.0 0.16 0.9 0.1 0.07 0.15 0.09 0.4 0.28 0.11 0.11 0.09 0.07 0.37 0.3 0.29 0.08 0.27 0.34 0.27 0.55 0.39 0.67 0.84 0.24 0.4 0.54 0.59 0.55 0.46 0.62 0.05 0.26
Solyc09g009020.3.1 (Solyc09g009020.3)
0.27 0.74 0.54 0.94 0.15 0.15 0.24 0.2 0.18 0.17 0.18 0.2 0.12 0.14 0.16 0.08 0.1 0.0 0.0 0.27 0.23 0.66 0.44 0.6 0.84 0.21 0.49 0.56 0.71 0.63 0.57 1.0 0.17 0.36
Solyc10g047950.2.1 (Solyc10g047950.2)
0.58 0.59 0.2 0.2 0.58 0.51 0.42 0.64 0.43 0.33 0.64 0.46 0.21 0.18 0.33 0.16 0.19 0.01 0.01 0.34 0.43 0.87 0.58 0.74 0.92 0.39 0.34 0.53 0.53 0.83 0.71 1.0 0.27 0.49
Solyc10g050110.1.1 (Solyc10g050110.1)
0.49 0.0 0.19 0.02 0.2 0.07 0.05 0.06 0.11 0.11 0.24 0.3 0.14 0.08 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.15 0.82 0.71 0.68 0.72 0.01 0.13 0.26 0.26 0.57 0.62 1.0 0.06 0.56
Solyc10g052490.2.1 (Solyc10g052490.2)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.23 0.17 0.14 0.23 0.16 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.31 0.02 0.99 0.46 0.51 0.62 0.85 0.25 0.35 0.32 1.0 0.93 0.74 0.12 0.02
Solyc10g084250.1.1 (Solyc10g084250.1)
0.56 0.32 0.73 0.76 0.82 0.31 0.44 0.4 0.37 0.22 0.69 0.74 0.18 0.28 0.3 0.09 0.15 0.0 0.0 0.08 0.37 0.56 0.7 0.63 0.5 0.09 0.82 0.53 0.36 0.62 0.69 0.34 0.09 1.0
Solyc11g005820.1.1 (Solyc11g005820.1)
0.07 0.03 0.12 0.04 0.08 0.26 0.04 0.33 0.31 0.15 0.06 0.07 0.04 0.02 0.11 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.48 0.46 0.68 0.0 0.14 0.29 0.26 0.96 0.83 0.85 0.3 0.08
Solyc11g010600.2.1 (Solyc11g010600.2)
0.25 0.15 0.22 0.14 0.49 0.46 0.21 0.31 0.48 0.33 0.56 0.36 0.2 0.15 0.3 0.19 0.18 0.0 0.0 0.1 0.37 0.74 0.56 0.77 0.86 0.17 0.31 0.42 0.5 0.65 0.57 1.0 0.54 0.42
Solyc11g013130.2.1 (Solyc11g013130.2)
1.0 0.05 0.53 0.37 0.16 0.18 0.06 0.17 0.22 0.19 0.45 0.36 0.26 0.22 0.56 0.6 0.49 0.0 0.0 0.07 0.26 0.36 0.39 0.44 0.47 0.06 0.12 0.17 0.2 0.22 0.29 0.33 0.15 0.34
Solyc11g061720.1.1 (Solyc11g061720.1)
0.42 0.05 0.18 0.09 0.3 0.08 0.16 0.09 0.23 0.05 0.4 0.34 0.09 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.59 0.68 0.54 0.48 0.01 0.99 0.54 0.35 0.64 0.68 0.64 0.06 0.9
Solyc12g005740.1.1 (Solyc12g005740.1)
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.26 0.05 0.38 1.0 0.0 0.07 0.26 0.4 0.19 0.11 0.27 0.0 0.07
Solyc12g096680.1.1 (Solyc12g096680.1)
0.19 0.2 0.05 0.11 0.12 0.11 0.13 0.05 0.09 0.19 0.23 0.25 0.3 0.14 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.16 0.25 1.0 0.41 0.66 0.97 0.21 0.18 0.35 0.34 0.79 0.65 0.88 0.07 0.13
Solyc12g096870.1.1 (Solyc12g096870.1)
0.31 0.01 0.14 0.05 0.39 0.08 0.01 0.1 0.09 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.75 0.61 0.73 1.0 0.0 0.13 0.27 0.27 0.35 0.35 0.23 0.19 0.99

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)