Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00208820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.212)	0.0	1.0	0.83	0.34	0.18	0.0	0.05	0.0	0.14	0.12	0.45	0.18	0.05	0.09	0.02	0.04	0.15	0.16	0.22	0.08	0.56	0.05
AMTR_s00001p00257570 (IRE1A)	0.33	1.0	0.07	0.46	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.49	0.4	0.17	0.08	0.19	0.37	0.34	0.3	0.19	0.22	0.26
AMTR_s00006p00246720 (MPB2C)	0.48	1.0	0.79	0.26	0.09	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.36	0.33	0.18	0.05	0.08	0.06	0.37	0.16	0.12	0.06	0.04	0.18
AMTR_s00007p00035530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.14)	0.23	0.44	1.0	0.21	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.28	0.02	0.05	0.03	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00009p00264670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.375)	0.52	1.0	0.59	0.39	0.59	0.08	0.09	0.15	0.07	0.06	0.66	0.56	0.26	0.2	0.25	0.45	0.37	0.44	0.42	0.35	0.11	0.24
AMTR_s00010p00178800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.145)	0.62	0.51	1.0	0.88	0.5	0.01	0.08	0.01	0.06	0.07	0.67	0.59	0.51	0.33	0.33	0.32	0.68	0.5	0.42	0.31	0.41	0.31
AMTR_s00010p00257530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.403)	0.76	0.48	1.0	0.92	0.38	0.21	0.02	0.01	0.03	0.03	0.35	0.4	0.45	0.33	0.15	0.25	0.32	0.22	0.26	0.16	0.14	0.41
AMTR_s00021p00107800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.56)	0.0	1.0	0.0	0.31	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.16	0.06	0.01	0.06	0.0	0.19	0.06	0.06	0.0	0.0	0.07
AMTR_s00022p00235920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.326)	0.51	0.78	0.61	1.0	0.34	0.01	0.03	0.0	0.03	0.03	0.41	0.49	0.37	0.24	0.31	0.39	0.28	0.22	0.37	0.37	0.19	0.41
AMTR_s00023p00223110 (KIS)	0.32	1.0	0.53	0.38	0.16	0.01	0.04	0.09	0.04	0.05	0.32	0.38	0.17	0.08	0.05	0.12	0.2	0.12	0.08	0.04	0.03	0.2
AMTR_s00023p00233730 (MPK4)	0.65	0.46	1.0	0.78	0.38	0.01	0.02	0.0	0.05	0.04	0.5	0.36	0.35	0.37	0.35	0.17	0.37	0.27	0.19	0.16	0.14	0.35
AMTR_s00030p00156320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.96)	0.78	1.0	0.43	0.72	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.91	0.26	0.17	0.22	0.05	0.87	0.49	0.23	0.23	0.08	0.32
AMTR_s00033p00241730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.260)	1.0	0.67	0.57	0.65	0.41	0.23	0.2	0.03	0.16	0.14	0.59	0.48	0.36	0.37	0.31	0.4	0.85	0.45	0.39	0.34	0.3	0.39
AMTR_s00040p00224750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.263)	0.0	0.68	0.89	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.03	0.04	0.19	0.11	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00041p00203840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.187)	0.94	1.0	0.73	0.72	0.74	0.01	0.09	0.11	0.09	0.11	0.68	0.61	0.56	0.38	0.33	0.36	0.68	0.51	0.49	0.4	0.18	0.68
AMTR_s00044p00064950 (APG5)	0.19	0.93	0.05	1.0	0.32	0.01	0.13	0.02	0.09	0.1	0.99	0.77	0.48	0.31	0.18	0.28	0.48	0.65	0.77	0.34	0.32	0.25
AMTR_s00046p00089570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.45)	0.56	0.77	1.0	0.65	0.47	0.33	0.01	0.04	0.01	0.02	0.36	0.29	0.37	0.2	0.15	0.32	0.45	0.18	0.27	0.22	0.12	0.37
AMTR_s00048p00097960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.49)	0.74	0.96	1.0	0.77	0.96	0.02	0.02	0.04	0.04	0.04	0.96	0.75	0.51	0.35	0.36	0.6	0.98	0.44	0.38	0.39	0.31	0.46
AMTR_s00052p00087310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.23)	0.39	1.0	0.47	0.75	0.2	0.03	0.11	0.01	0.05	0.05	0.71	0.83	0.5	0.21	0.12	0.36	0.36	0.61	0.77	0.17	0.35	0.26
AMTR_s00053p00051430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.27)	0.53	0.69	1.0	0.8	0.2	0.18	0.01	0.04	0.01	0.01	0.48	0.36	0.42	0.34	0.18	0.31	0.3	0.3	0.3	0.24	0.23	0.35
AMTR_s00055p00148110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.65)	0.51	1.0	0.73	0.62	0.27	0.36	0.15	0.01	0.04	0.05	0.42	0.37	0.26	0.11	0.11	0.18	0.36	0.23	0.16	0.1	0.07	0.32
AMTR_s00057p00125880 (RCY1)	0.18	0.86	1.0	0.56	0.41	0.26	0.28	0.29	0.29	0.34	0.54	0.72	0.52	0.45	0.35	0.37	0.39	0.37	0.49	0.38	0.43	0.36
AMTR_s00059p00127380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.102)	0.59	0.64	1.0	0.36	0.31	0.22	0.09	0.27	0.11	0.11	0.24	0.38	0.47	0.27	0.3	0.31	0.44	0.3	0.37	0.23	0.1	0.34
AMTR_s00059p00172830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.170)	0.48	0.97	0.73	1.0	0.25	0.05	0.04	0.09	0.02	0.04	0.59	0.6	0.54	0.2	0.16	0.2	0.42	0.23	0.28	0.28	0.03	0.61
AMTR_s00059p00207160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.236)	0.93	1.0	0.67	0.96	0.57	0.06	0.22	0.15	0.16	0.21	0.77	0.48	0.44	0.49	0.38	0.5	0.75	0.42	0.36	0.32	0.2	0.48
AMTR_s00065p00168440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.134)	1.0	0.65	0.45	0.18	0.13	0.01	0.16	0.0	0.15	0.14	0.28	0.23	0.24	0.22	0.23	0.23	0.22	0.22	0.17	0.16	0.17	0.2
AMTR_s00068p00142730 (HST)	0.35	1.0	0.58	0.65	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.36	0.24	0.07	0.02	0.34	0.3	0.42	0.46	0.12	0.36	0.1
AMTR_s00069p00134710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.98)	0.25	1.0	0.05	0.68	0.04	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.68	0.5	0.24	0.1	0.08	0.44	0.67	0.63	0.49	0.17	0.15	0.18
AMTR_s00069p00186250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.185)	0.56	0.77	1.0	0.65	0.39	0.0	0.02	0.09	0.01	0.02	0.88	0.33	0.29	0.16	0.22	0.56	0.55	0.45	0.23	0.26	0.29	0.27
AMTR_s00078p00166100 (ZEU1)	0.41	1.0	0.43	0.47	0.29	0.01	0.47	0.27	0.2	0.23	0.47	0.44	0.36	0.25	0.19	0.18	0.63	0.23	0.27	0.23	0.18	0.39
AMTR_s00087p00047450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.9)	0.81	0.71	1.0	0.85	0.47	0.23	0.24	0.17	0.22	0.23	0.69	0.59	0.57	0.43	0.33	0.51	0.59	0.38	0.51	0.3	0.22	0.4
AMTR_s00087p00065310 (FKBP15-1)	0.79	1.0	1.0	0.79	0.67	0.11	0.01	0.03	0.01	0.01	0.44	0.52	0.42	0.25	0.21	0.26	0.38	0.33	0.33	0.21	0.09	0.36
AMTR_s00088p00146000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.112)	1.0	0.56	0.4	0.33	0.11	0.01	0.09	0.03	0.15	0.2	0.31	0.3	0.3	0.23	0.16	0.27	0.48	0.3	0.2	0.24	0.23	0.31
AMTR_s00088p00156860 (PBB2)	0.47	1.0	0.69	0.97	0.6	0.01	0.07	0.06	0.05	0.05	0.52	0.61	0.43	0.34	0.41	0.46	0.56	0.39	0.4	0.31	0.13	0.41
AMTR_s00089p00104350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.58)	0.78	0.96	1.0	0.68	0.39	0.14	0.21	0.18	0.14	0.14	0.38	0.45	0.39	0.3	0.15	0.23	0.11	0.5	0.42	0.2	0.14	0.42
AMTR_s00096p00035140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.14)	0.71	1.0	0.95	0.93	0.53	0.63	0.42	0.32	0.26	0.31	0.55	0.94	0.48	0.29	0.32	0.42	0.73	0.24	0.41	0.32	0.12	0.5
AMTR_s00103p00053720 (LOX1)	0.0	1.0	0.0	0.48	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.27	0.06	0.02	0.05	0.05	0.0	0.0	0.09	0.01	0.11	0.01
AMTR_s00103p00131250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.79)	0.33	1.0	0.77	0.86	0.56	0.41	0.08	0.13	0.11	0.09	0.53	0.29	0.41	0.37	0.3	0.29	0.35	0.27	0.23	0.27	0.16	0.38
AMTR_s00104p00138090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.68)	0.28	0.89	1.0	0.73	0.37	0.27	0.15	0.06	0.09	0.09	0.38	0.44	0.21	0.19	0.21	0.34	0.4	0.41	0.37	0.18	0.26	0.18
AMTR_s00112p00083400 (ALE)	0.58	1.0	0.95	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00112p00083750 (ALE)	0.95	1.0	0.89	0.0	0.13	0.02	0.13	0.0	0.1	0.11	0.0	0.88	0.0	0.02	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00116p00085310 (RPB5D)	0.72	1.0	0.36	0.48	0.42	0.2	0.08	0.07	0.03	0.03	0.65	0.62	0.32	0.14	0.14	0.24	0.51	0.25	0.32	0.25	0.23	0.26
AMTR_s00122p00142560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.78)	0.81	1.0	0.82	0.9	0.68	0.28	0.15	0.41	0.18	0.23	0.49	0.61	0.57	0.5	0.44	0.42	0.42	0.38	0.35	0.19	0.14	0.42
AMTR_s00143p00029240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00143.4)	0.38	0.64	0.61	1.0	0.14	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.72	0.64	0.25	0.21	0.07	0.24	0.37	0.55	0.42	0.19	0.32	0.21
AMTR_s00144p00067060	0.0	1.0	0.0	0.4	0.09	0.0	0.0	0.04	0.02	0.01	0.12	0.07	0.08	0.02	0.04	0.03	0.07	0.13	0.03	0.15	0.7	0.03
AMTR_s00155p00068710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.44)	0.45	0.78	1.0	0.33	0.31	0.19	0.04	0.06	0.03	0.02	0.2	0.31	0.21	0.1	0.06	0.16	0.13	0.14	0.15	0.09	0.08	0.24
AMTR_s00166p00070030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.41)	0.27	0.99	0.66	0.3	0.17	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00211p00024570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00211.3)	0.38	1.0	0.28	0.38	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.41	0.19	0.32	0.07	0.07	0.21	0.52	0.33	0.22	0.2	0.16	0.41
AMTR_s00287p00014320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00287.3)	0.38	0.96	1.0	0.34	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.17	0.21	0.04	0.04	0.16	0.41	0.33	0.12	0.04	0.03	0.18
AMTR_s01248p00001900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01248.1)	0.62	0.88	1.0	0.44	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.22	0.53	0.04	0.03	0.09	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)