Heatmap: Cluster_275 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g005960.3.1 (Solyc01g005960.3)
-0.1 0.45 -0.41 -0.55 -1.06 -0.59 1.47 -0.16 0.28 0.16 0.16 -0.53 0.53 0.06 0.18 -0.1 0.1 0.97 0.38 -0.92 -0.47 -0.23 0.0 -0.17 -0.47 -0.43 0.29 0.01 -0.3 -0.1 0.11 -0.33 -2.88 -0.03
Solyc01g010440.3.1 (Solyc01g010440.3)
-0.02 0.88 -0.92 -0.09 0.28 0.14 1.4 -0.34 -0.33 0.16 0.85 0.61 1.45 0.91 -1.01 -1.59 -1.37 -5.13 -4.31 -0.48 0.21 -0.26 -0.16 -0.33 -0.38 -0.05 -0.22 -0.37 -0.29 -0.28 -0.11 -0.04 -0.85 -0.07
Solyc01g079250.3.1 (Solyc01g079250.3)
0.14 0.98 -0.67 -0.44 0.33 -0.23 1.34 -0.55 0.04 0.2 0.66 0.17 0.78 0.48 -0.07 -0.37 -0.24 -5.61 -4.91 -0.68 -0.13 0.1 -0.18 -0.13 -0.16 -0.12 -0.19 -0.15 -0.15 -0.01 0.08 0.26 -1.43 0.15
Solyc01g086980.3.1 (Solyc01g086980.3)
-0.09 -0.02 -0.62 -0.51 -0.48 -0.56 1.1 -0.75 -0.05 0.24 0.35 0.44 1.0 0.88 -0.04 -0.13 -0.13 -1.2 0.01 0.16 0.42 -0.35 -0.22 -0.3 -0.48 0.18 0.04 -0.05 -0.14 -0.24 -0.17 -0.26 -2.47 0.39
Solyc01g088740.3.1 (Solyc01g088740.3)
0.26 0.58 -0.31 0.54 0.04 -0.39 1.23 -0.39 0.25 0.6 0.38 -0.12 0.84 0.58 0.46 0.29 0.42 -1.15 -0.39 -0.63 -0.43 -0.87 -0.65 -0.7 -0.93 0.11 -0.32 -0.27 -0.32 -0.48 -0.41 -0.62 -1.95 0.24
Solyc01g095040.3.1 (Solyc01g095040.3)
0.02 -0.03 -1.37 -0.06 0.74 -0.34 1.24 -0.85 -0.03 -0.06 0.45 0.24 0.86 0.58 -0.29 -1.04 -0.94 -1.57 0.03 -0.26 0.61 -0.18 -0.01 -0.07 -0.3 0.33 -0.04 -0.08 -0.23 -0.11 -0.07 -0.12 -1.05 -0.02
Solyc01g101225.1.1 (Solyc01g101225.1)
-0.35 -0.56 -0.78 -0.83 -0.83 -0.31 1.1 -0.75 -0.12 0.18 0.61 0.49 1.21 0.74 0.23 0.14 0.12 -3.0 -2.19 0.25 -0.11 -0.42 0.12 -0.16 -0.53 0.96 0.18 -0.0 -0.22 -0.41 -0.26 -0.52 -0.84 0.34
Solyc01g102670.3.1 (Solyc01g102670.3)
1.08 0.1 -1.54 -0.71 0.05 -0.4 1.33 -0.68 0.23 0.13 0.22 0.07 0.82 0.75 -0.23 -1.01 -0.96 -5.34 -4.46 -0.82 -0.34 0.13 0.04 -0.06 -0.24 0.21 0.43 0.19 0.07 0.18 0.31 0.47 -1.88 0.08
Solyc01g109970.3.1 (Solyc01g109970.3)
-0.09 -0.69 -1.3 -1.03 -0.0 -0.1 1.01 -1.21 0.25 0.65 0.48 -0.01 1.57 0.88 0.51 0.36 0.26 -6.64 -5.72 -0.68 -0.0 -0.51 -0.38 -0.44 -0.65 0.51 0.14 0.05 0.14 -0.31 -0.19 -0.19 -2.09 0.42
Solyc01g110470.3.1 (Solyc01g110470.3)
0.21 -0.72 -1.26 -2.12 0.18 -0.15 1.37 -0.91 0.46 0.51 0.8 0.45 1.64 1.03 0.03 0.12 0.08 -5.56 -5.19 -0.47 0.33 -0.42 -0.48 -0.57 -0.54 0.17 -0.27 -0.31 -0.4 -0.32 -0.16 -0.33 -1.5 -0.02
Solyc02g030080.3.1 (Solyc02g030080.3)
0.63 1.05 -0.8 -1.08 -0.34 -0.31 1.37 -0.69 -0.4 0.15 1.07 0.28 0.99 0.5 -0.9 -1.56 -1.33 -5.29 -4.97 -0.82 -0.19 -0.1 -0.05 -0.1 -0.2 0.37 0.12 -0.04 -0.03 -0.1 0.0 0.28 -1.28 0.68
Solyc02g085470.3.1 (Solyc02g085470.3)
0.21 -1.25 -1.71 -1.92 -0.96 -0.99 0.94 -1.46 0.09 -0.0 0.69 0.56 1.53 1.17 -0.27 -0.56 -0.54 -4.75 -3.78 -0.13 0.32 0.14 0.11 0.07 -0.04 0.29 0.19 0.12 -0.07 0.25 0.4 0.33 -1.36 0.05
Solyc03g006350.3.1 (Solyc03g006350.3)
0.28 -0.59 -1.28 -1.58 1.01 0.12 0.85 -1.06 0.04 0.32 0.4 0.03 1.36 0.88 -0.03 -0.5 -0.49 -8.26 -9.26 -0.38 0.57 -0.28 -0.42 -0.28 -0.36 0.76 -0.2 -0.09 -0.02 -0.17 -0.19 0.26 -3.08 0.66
Solyc03g026190.3.1 (Solyc03g026190.3)
-0.25 -0.5 -0.73 -0.84 -0.9 -0.82 1.63 -1.25 0.15 0.45 -0.03 0.2 1.28 0.88 0.45 0.41 0.32 -0.17 0.66 -0.28 0.1 -0.62 -0.36 -0.53 -0.89 0.3 -0.33 -0.34 -0.45 -0.7 -0.46 -0.61 -2.26 0.07
Solyc03g026340.3.1 (Solyc03g026340.3)
0.82 -0.24 -0.57 0.11 -1.04 -0.75 1.62 -1.51 0.63 0.0 0.63 0.22 0.79 0.36 -0.12 -0.32 -0.51 -1.16 -0.21 -0.31 -0.19 -0.39 -0.21 -0.25 -0.46 0.36 -0.23 -0.3 -0.22 -0.37 -0.06 -0.1 -1.45 0.5
Solyc03g026345.1.1 (Solyc03g026345.1)
0.22 -0.14 -0.88 0.1 -0.23 -0.38 1.83 -1.27 0.23 0.64 0.66 0.31 0.88 0.19 0.0 -0.29 -0.31 -1.25 -0.01 -0.4 -0.14 -0.61 -0.24 -0.41 -0.7 0.41 -0.21 -0.37 -0.47 -0.63 -0.35 -0.42 -1.37 0.44
Solyc03g098160.3.1 (Solyc03g098160.3)
-0.16 -0.08 -0.5 -0.55 0.17 -0.11 1.0 -0.54 0.29 0.46 0.19 -0.03 0.92 0.63 0.16 0.03 -0.0 -3.2 -3.59 -0.71 0.28 0.02 0.23 0.14 -0.14 0.42 0.15 0.02 -0.1 -0.1 -0.06 0.05 -2.76 0.09
Solyc03g114410.3.1 (Solyc03g114410.3)
-0.09 -0.13 -1.17 -1.22 0.59 -0.31 0.29 -0.75 0.21 0.39 0.56 0.1 0.92 0.56 -0.22 -0.26 -0.29 -1.94 -0.75 -0.21 0.52 0.03 0.11 0.01 -0.3 0.54 0.36 0.19 -0.03 0.15 0.16 0.18 -3.0 -0.26
Solyc03g117820.1.1 (Solyc03g117820.1)
0.59 -0.48 -0.88 -0.38 -0.13 0.1 1.87 -0.54 0.25 -0.51 0.35 0.07 0.69 0.43 -0.4 -0.9 -0.9 -6.43 -7.44 -1.16 -0.39 0.1 0.07 -0.04 -0.29 0.8 -0.2 -0.14 -0.1 -0.06 0.25 -0.23 -1.84 1.18
Solyc03g119460.3.1 (Solyc03g119460.3)
0.53 -0.24 -1.2 -1.19 0.2 -0.53 1.37 -1.15 -0.04 -0.43 0.82 0.21 1.54 1.03 -0.77 -0.98 -0.86 -3.98 -4.44 0.55 1.06 -0.26 -0.59 -0.46 -0.3 0.32 -0.36 -0.31 -0.29 -0.23 -0.17 0.19 -1.73 0.26
Solyc04g007270.3.1 (Solyc04g007270.3)
-0.1 -0.09 -1.19 -0.63 -0.5 -0.5 1.67 -0.96 0.41 0.58 0.04 -0.04 1.0 0.71 0.34 -0.05 -0.13 -1.5 -0.68 0.41 0.21 -0.4 -0.6 -0.61 -0.69 0.62 -0.24 -0.12 -0.14 -0.36 -0.31 -0.32 -1.92 0.39
Solyc04g008380.3.1 (Solyc04g008380.3)
0.14 -0.02 0.06 0.22 0.39 -0.21 1.08 -0.4 -0.22 -0.18 0.23 0.26 0.38 0.49 0.1 -0.23 -0.2 -1.84 -2.77 -0.23 0.0 -0.11 -0.02 -0.11 -0.18 0.17 0.16 0.1 0.02 -0.04 0.05 -0.15 -0.63 0.19
Solyc04g011560.3.1 (Solyc04g011560.3)
0.14 0.2 -1.04 -1.38 -0.89 -0.69 1.55 -1.0 -0.61 0.4 0.95 0.49 1.5 1.28 -0.53 -0.76 -0.79 -8.08 -6.74 0.36 1.1 -0.48 -0.31 -0.45 -0.46 0.02 -0.19 -0.27 -0.27 -0.47 -0.4 -0.3 -0.6 -0.12
Solyc04g014560.3.1 (Solyc04g014560.3)
0.55 -0.04 -0.61 -0.5 -0.14 -0.31 0.71 -0.61 0.17 0.63 0.71 0.43 0.99 0.65 -0.23 -0.23 -0.28 -3.58 -3.8 0.1 0.6 -0.21 -0.34 -0.37 -0.6 0.69 -0.15 -0.24 -0.29 -0.18 -0.13 -0.07 -1.28 0.37
Solyc04g016510.3.1 (Solyc04g016510.3)
0.29 0.05 -1.43 -1.28 0.95 0.18 1.97 -0.92 -0.16 -0.24 0.62 0.07 1.14 0.58 -0.45 -1.11 -1.09 -7.73 -8.69 0.09 0.31 -0.29 -0.29 -0.34 -0.42 0.33 -0.01 -0.11 -0.18 -0.12 -0.12 -0.04 -0.92 -0.16
Solyc04g017710.3.1 (Solyc04g017710.3)
0.71 -0.32 -0.98 -1.16 0.39 -0.02 1.23 -1.32 -0.58 -0.74 1.02 0.75 1.27 1.13 -0.76 -0.94 -0.78 -4.29 -4.59 0.21 0.37 -0.48 -0.47 -0.41 -0.53 0.65 -0.34 -0.36 -0.37 -0.43 -0.22 -0.27 -0.72 0.94
Solyc04g028560.3.1 (Solyc04g028560.3)
0.25 -0.29 -0.05 -1.3 0.27 0.01 1.03 -0.45 -0.03 0.33 0.59 -0.17 1.06 0.45 0.15 -0.01 -0.07 -3.05 -2.78 -0.61 -0.08 -0.28 -0.02 -0.26 -0.73 0.78 0.23 -0.01 -0.17 -0.18 0.02 -0.43 -2.78 0.86
Solyc04g058140.3.1 (Solyc04g058140.3)
-0.27 0.08 -0.26 -1.27 -0.17 -0.19 1.52 -0.31 0.04 0.13 1.04 0.36 1.31 0.65 -0.15 -0.26 -0.39 -8.86 -9.49 -0.56 0.65 -0.1 0.07 -0.08 -0.35 -0.84 -0.03 -0.14 -0.34 -0.06 0.14 -0.35 -2.08 0.19
Solyc06g059755.1.1 (Solyc06g059755.1)
0.68 -0.19 -0.13 0.13 -0.98 -0.58 1.7 -0.58 -0.08 -0.04 0.01 -0.1 0.69 0.58 0.19 0.18 -0.23 -7.43 -12.09 -0.67 -0.74 -0.34 -0.11 -0.37 -0.53 0.39 0.12 -0.01 -0.2 -0.12 -0.02 -0.29 -1.87 1.41
Solyc06g060120.3.1 (Solyc06g060120.3)
-0.02 -0.57 -0.61 -0.56 -0.27 0.01 1.41 -0.82 -0.07 0.61 0.78 0.3 1.78 1.37 0.05 -0.18 -0.19 -3.09 -1.35 -0.69 0.18 -0.64 -0.58 -0.78 -1.06 0.42 -0.18 -0.42 -0.39 -0.56 -0.42 -0.52 -2.32 0.02
Solyc06g069360.3.1 (Solyc06g069360.3)
0.32 -0.93 -0.29 0.14 -0.27 0.04 0.81 -0.2 0.01 0.06 0.7 0.29 1.33 0.79 0.33 0.59 0.41 -3.65 -3.91 -0.57 -0.16 -0.51 -0.34 -0.49 -0.55 0.27 -0.08 -0.16 -0.22 -0.26 -0.19 -0.35 -0.96 0.13
Solyc06g071140.3.1 (Solyc06g071140.3)
0.55 -0.87 -0.93 -0.99 -0.02 -0.57 0.67 -1.38 0.03 -0.47 0.89 0.6 1.4 1.09 -0.86 -0.99 -0.97 -3.26 -3.72 0.15 0.31 -0.08 -0.04 -0.05 -0.29 0.95 0.16 0.09 -0.2 -0.01 0.16 0.08 -2.66 0.43
Solyc06g073650.1.1 (Solyc06g073650.1)
-0.49 -0.5 -0.31 -0.22 -0.27 -0.37 1.54 -0.68 -0.06 -0.08 0.58 0.56 0.98 0.85 -0.15 -0.46 -0.57 -1.93 -3.65 -0.07 0.47 -0.32 -0.29 -0.37 -0.36 0.05 0.24 0.22 0.28 -0.15 -0.01 -0.28 -1.27 0.33
Solyc07g025250.2.1 (Solyc07g025250.2)
-0.16 -0.07 -2.14 -2.15 -0.57 -0.45 0.62 -0.39 -0.21 0.66 0.72 0.21 1.62 1.15 0.39 0.22 0.08 -3.66 -2.25 -0.43 0.27 -0.1 -0.39 -0.15 -0.33 0.27 -0.15 -0.06 -0.12 0.03 -0.19 0.01 -2.42 0.26
Solyc07g045380.3.1 (Solyc07g045380.3)
0.07 -0.13 -1.08 -1.74 -0.01 0.04 0.94 -0.41 -0.21 0.64 0.98 0.87 1.37 0.69 -0.09 -0.15 -0.16 -5.94 -4.8 -0.55 0.49 -0.33 -0.35 -0.41 -0.56 0.63 -0.24 -0.21 -0.41 -0.26 -0.22 -0.05 -1.3 0.25
Solyc07g053060.3.1 (Solyc07g053060.3)
0.25 -0.41 -0.61 -0.73 0.0 -0.01 0.68 -0.51 -0.3 0.22 0.46 0.17 1.08 0.59 0.63 0.56 0.43 -4.76 -5.34 -0.39 0.16 -0.2 0.18 -0.08 -0.35 0.21 0.13 -0.11 -0.33 -0.31 -0.01 -0.29 -1.26 0.45
Solyc07g053870.3.1 (Solyc07g053870.3)
0.13 -0.72 -0.72 -0.76 0.56 -0.57 0.63 -0.93 0.39 0.4 0.33 -0.05 0.74 0.5 0.53 0.53 0.49 -1.02 -0.97 -0.65 -0.28 -0.09 -0.03 -0.03 -0.27 0.7 0.06 -0.0 -0.14 -0.13 -0.07 -0.2 -3.34 0.08
Solyc07g065000.3.1 (Solyc07g065000.3)
-0.29 -0.05 -1.29 -0.74 -0.27 0.03 1.66 -0.28 0.65 0.91 0.63 -0.01 0.91 0.58 0.28 0.03 0.3 -2.3 0.25 -0.56 -0.15 -0.52 -0.26 -0.38 -0.73 0.32 -0.34 -0.4 -0.62 -0.56 -0.34 -0.67 -2.33 -0.12
Solyc08g005170.3.1 (Solyc08g005170.3)
0.01 -0.08 -0.44 -0.62 -0.12 -0.2 1.36 -0.83 -0.39 -0.09 0.62 0.1 1.23 0.59 0.25 0.39 0.34 -6.99 -7.58 -0.21 0.41 -0.38 -0.26 -0.32 -0.43 0.19 -0.03 -0.05 0.09 -0.25 -0.21 -0.17 -1.47 0.43
Solyc08g077450.3.1 (Solyc08g077450.3)
0.06 -0.18 -1.24 -1.82 0.34 -0.18 1.42 -0.9 0.03 0.09 1.36 0.86 1.44 1.28 -0.85 -1.32 -1.34 -8.39 -7.91 -0.41 -0.04 -0.35 -0.36 -0.48 -0.69 -0.12 0.04 0.02 0.43 -0.16 -0.04 -0.23 -1.5 0.03
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Solyc09g007210.3.1 (Solyc09g007210.3)
-0.1 -0.16 -0.46 -1.0 0.06 -0.23 1.26 -0.85 -0.3 0.05 1.23 0.62 1.69 1.16 -0.22 -0.72 -0.59 -6.98 -6.51 -0.16 0.16 -0.51 -0.48 -0.4 -0.57 0.03 -0.53 -0.4 -0.46 -0.44 -0.27 -0.33 0.29 0.15
Solyc10g005990.3.1 (Solyc10g005990.3)
0.06 -0.2 -0.8 -0.78 0.07 -0.22 1.07 -0.57 -0.23 0.47 0.46 0.08 1.09 0.73 0.3 0.39 0.17 -4.2 -4.04 -0.23 0.24 -0.29 -0.18 -0.24 -0.48 0.42 0.11 0.01 -0.13 -0.15 -0.16 -0.13 -1.9 0.48
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0.4 1.15 -0.84 -0.74 -0.47 0.06 1.17 -0.11 -0.03 0.09 0.99 0.71 1.34 1.18 -0.2 -0.63 -0.42 -9.51 -9.02 -0.79 -0.61 -0.57 -0.17 -0.53 -0.98 0.22 0.18 -0.23 -0.37 -0.44 -0.16 -0.59 -1.28 0.02
Solyc10g009280.3.1 (Solyc10g009280.3)
0.43 -0.1 -1.12 -1.79 -0.03 -0.67 1.64 -0.81 0.62 0.05 1.44 0.79 1.72 1.01 -0.2 -0.02 -0.07 -5.81 -6.03 -0.4 0.14 -0.45 -0.8 -0.81 -0.91 0.16 -0.88 -0.73 -0.82 -0.35 -0.23 -0.07 -1.87 -0.79
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0.74 -0.56 -0.86 -0.52 0.26 0.03 1.44 -1.3 -0.42 -0.04 0.7 0.26 1.24 0.74 -0.51 -0.95 -0.91 -2.38 -2.16 0.14 0.47 -0.32 -0.58 -0.43 -0.29 0.63 -0.35 -0.44 -0.35 -0.27 -0.22 0.22 -1.1 0.71
Solyc10g081080.1.1 (Solyc10g081080.1)
0.41 -0.24 -0.14 -0.53 -0.33 -0.39 1.73 -0.59 -0.68 -0.35 0.15 -0.24 0.37 0.2 -0.04 -0.1 -0.31 -4.18 -6.18 0.45 0.57 -0.09 -0.34 -0.32 -0.29 0.81 -0.11 -0.07 -0.2 -0.02 0.1 -0.09 -0.49 0.78
Solyc10g083150.2.1 (Solyc10g083150.2)
0.37 -0.18 -1.08 -0.19 0.22 -0.18 1.28 -1.08 0.19 -0.14 0.73 0.48 1.23 0.89 -0.07 -0.1 -0.07 -3.19 -3.47 0.24 0.93 -0.62 -0.67 -0.62 -0.87 0.67 -0.53 -0.51 -0.55 -0.62 -0.38 -0.47 -2.32 0.69
Solyc11g069340.2.1 (Solyc11g069340.2)
0.07 0.68 -0.91 -0.53 -0.11 -0.27 0.71 -0.58 -0.14 0.0 1.29 0.75 0.37 0.23 -0.08 -0.26 0.27 -6.58 -7.01 -0.41 0.29 -0.16 -0.05 -0.2 -0.35 0.67 0.11 -0.07 -0.2 -0.04 0.09 0.22 -2.49 0.27
Solyc12g011050.2.1 (Solyc12g011050.2)
0.26 -0.62 -1.53 -1.18 0.04 -0.47 0.98 -0.77 -0.1 -0.14 0.57 0.72 1.19 0.6 -0.63 -0.57 -0.46 -3.59 -3.43 0.03 0.79 0.04 0.11 -0.05 -0.2 0.71 0.05 -0.01 -0.19 -0.02 0.09 0.19 -0.97 0.2
Solyc12g014540.2.1 (Solyc12g014540.2)
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Solyc12g055780.2.1 (Solyc12g055780.2)
0.03 -0.35 -1.15 -1.13 0.16 0.09 1.53 -0.76 -0.15 0.03 0.73 0.25 1.26 0.97 -0.41 -0.76 -0.75 -11.17 - 0.12 0.41 -0.27 -0.34 -0.19 -0.24 0.56 -0.1 0.03 0.27 -0.2 -0.14 0.02 -2.05 0.19
Solyc12g094490.2.1 (Solyc12g094490.2)
0.53 -0.61 -1.32 -1.39 -0.29 -0.59 1.43 -1.21 -0.09 0.68 0.44 -0.11 1.36 0.54 -0.06 -0.25 -0.22 -0.5 -0.62 -0.27 0.31 -0.35 -0.48 -0.42 -0.51 0.93 -0.24 -0.11 0.08 -0.32 -0.3 -0.04 -2.32 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.