Heatmap: Cluster_167 (HCCA cluster)

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(Showing raw values)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g006070.2.1 (Solyc01g006070.2)
0.44 1.2 1.21 1.66 0.16 0.29 0.0 0.13 1.58 0.23 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.06 0.04 0.0 0.03 0.03 0.02 0.09 0.12 0.05 0.03 1.22
Solyc01g068140.3.1 (Solyc01g068140.3)
9.65 0.72 19.57 6.62 5.48 3.43 0.9 4.23 2.91 1.04 1.09 1.14 1.26 1.0 1.95 1.26 1.38 0.0 0.0 1.09 2.36 1.53 1.49 1.26 0.92 0.97 1.18 0.98 0.9 1.43 1.77 1.3 2.17 13.41
Solyc01g100100.3.1 (Solyc01g100100.3)
12.78 5.76 20.62 9.21 17.54 4.11 1.08 0.2 0.53 1.22 0.81 2.35 0.41 0.69 1.14 0.29 0.41 0.0 0.0 0.03 0.04 0.64 1.04 0.62 0.58 0.0 0.11 0.34 0.44 0.05 0.26 0.6 2.62 28.88
Solyc01g101120.3.1 (Solyc01g101120.3)
58.8 11.84 13.28 14.27 67.76 14.08 32.26 14.09 31.59 14.86 17.41 28.14 0.76 7.88 18.45 10.98 11.97 0.0 0.0 4.35 27.05 17.0 7.45 9.95 8.69 11.28 15.44 9.56 6.43 22.14 23.23 34.5 12.43 68.02
Solyc01g102900.3.1 (Solyc01g102900.3)
165.91 0.0 0.0 0.0 0.06 0.23 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.2 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 116.34
Solyc01g103700.3.1 (Solyc01g103700.3)
1.22 0.06 10.7 1.4 2.7 2.74 0.01 5.12 3.64 1.69 0.63 0.6 0.05 0.2 0.95 0.33 0.19 0.0 0.0 0.01 0.01 1.08 1.89 0.96 0.4 0.0 0.68 0.41 0.33 1.25 1.36 0.82 0.77 3.27
Solyc01g111840.3.1 (Solyc01g111840.3)
9.12 0.54 118.23 8.33 37.26 8.94 0.25 15.68 9.75 10.66 2.69 1.77 1.41 1.45 4.9 3.32 4.08 0.0 0.0 0.28 1.93 12.0 3.1 5.31 4.5 0.86 4.52 5.55 2.86 18.32 17.08 15.42 1.52 24.06
Solyc02g014470.3.1 (Solyc02g014470.3)
1.53 6.08 14.96 6.26 7.84 5.12 0.0 5.85 2.34 1.49 0.38 0.03 0.09 0.01 0.93 0.27 0.29 0.0 0.0 0.08 0.08 0.6 0.55 0.56 0.34 0.0 0.36 0.27 0.18 0.63 0.72 0.72 1.0 8.69
Solyc02g062650.3.1 (Solyc02g062650.3)
7.65 0.0 23.08 1.42 12.27 2.01 0.03 8.81 0.59 1.76 1.09 0.1 0.09 0.0 0.59 0.11 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 1.63 0.73 0.95 0.42 0.0 0.37 0.6 0.32 2.09 2.23 1.02 3.48 5.43
Solyc02g062655.1.1 (Solyc02g062655.1)
3.84 0.04 8.48 0.4 1.59 0.49 0.0 3.85 0.09 1.4 0.42 0.04 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.71 0.48 0.24 0.13 0.0 0.3 0.37 0.12 1.0 0.92 0.44 2.22 2.09
Solyc02g084580.2.1 (Solyc02g084580.2)
1.27 0.26 7.51 8.9 1.11 8.98 0.11 21.22 17.95 14.5 0.28 0.0 0.0 0.0 6.87 1.92 2.81 0.0 0.0 0.0 0.0 8.47 10.74 8.18 4.87 0.0 4.49 3.69 1.85 8.81 12.12 5.57 5.12 2.5
Solyc02g085120.3.1 (Solyc02g085120.3)
16.67 0.01 14.77 0.76 7.9 5.27 0.08 8.98 4.37 3.65 1.46 0.17 0.06 0.03 1.34 0.48 0.28 0.0 0.0 0.0 0.04 2.91 2.54 2.32 1.44 0.0 1.26 1.09 0.4 2.96 3.22 2.14 4.73 14.2
Solyc02g091300.3.1 (Solyc02g091300.3)
22.3 0.0 30.64 10.56 2.02 1.52 0.05 2.38 1.01 1.05 1.31 0.27 0.3 0.0 0.2 0.17 0.18 0.0 0.0 0.15 0.0 0.21 0.15 0.13 0.07 0.0 0.21 0.12 0.07 0.13 0.44 0.13 5.58 37.35
Solyc02g091950.3.1 (Solyc02g091950.3)
22.64 15.98 11.47 5.99 27.86 14.25 26.44 15.18 12.98 14.35 15.64 12.69 15.17 12.83 9.21 5.83 9.89 0.02 0.03 1.71 7.63 16.4 13.52 12.86 12.02 1.4 18.55 15.66 13.68 18.72 21.51 17.46 2.48 18.2
Solyc02g094050.3.1 (Solyc02g094050.3)
10.9 0.11 72.35 11.77 37.35 19.99 0.11 28.17 12.38 9.15 1.44 0.2 0.23 0.05 4.16 1.57 2.17 0.0 0.03 0.01 0.07 6.4 5.63 4.42 3.19 0.2 2.78 2.09 1.38 6.77 7.32 5.52 7.92 37.56
Solyc03g005160.3.1 (Solyc03g005160.3)
0.99 0.04 1.01 1.38 0.15 1.03 0.0 2.0 1.69 0.36 0.17 0.0 0.01 0.0 0.23 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.08 0.03 0.0 0.03 0.01 0.01 0.04 0.12 0.02 0.29 0.47
Solyc03g005330.1.1 (Solyc03g005330.1)
34.14 1.62 2.72 2.47 5.19 2.46 1.01 1.24 0.78 0.63 1.74 2.08 1.85 1.28 0.26 0.1 0.21 0.14 0.15 3.78 3.59 1.38 0.5 0.88 1.68 2.03 1.01 1.11 1.5 1.4 1.21 1.9 1.73 2.85
Solyc03g006220.3.1 (Solyc03g006220.3)
18.19 11.01 151.69 40.48 63.74 11.68 1.01 24.12 7.66 1.71 0.14 0.8 0.02 0.08 2.43 2.33 9.73 0.23 0.07 0.02 0.89 20.66 9.28 10.65 10.7 0.15 4.8 7.12 5.82 22.27 16.95 15.13 2.72 32.11
Solyc03g006810.3.1 (Solyc03g006810.3)
24.65 0.5 57.53 6.99 13.58 6.39 1.7 11.31 7.24 8.29 2.59 0.96 1.43 0.54 2.86 1.89 1.72 0.17 0.03 0.78 1.45 2.99 1.5 1.91 1.37 0.34 1.41 1.7 1.11 3.1 3.75 2.75 5.73 10.87
Solyc03g033550.3.1 (Solyc03g033550.3)
3.81 0.19 16.68 1.83 10.93 3.31 0.1 2.68 1.87 1.1 1.1 0.29 0.43 0.18 0.84 0.36 0.51 0.0 0.0 0.07 0.16 0.88 0.85 0.68 0.55 0.14 0.57 0.39 0.27 0.57 0.65 0.82 0.49 10.54
Solyc03g079880.3.1 (Solyc03g079880.3)
533.35 0.0 105.18 3.0 115.35 1.6 0.0 0.28 0.56 0.62 0.07 0.0 0.05 0.01 0.69 0.65 0.31 0.0 0.0 0.0 0.07 2.24 0.0 0.47 0.4 0.0 0.17 0.41 0.56 2.7 3.21 12.31 0.62 1692.25
Solyc03g117070.1.1 (Solyc03g117070.1)
16.67 0.42 4.74 2.92 2.71 0.92 2.27 0.63 1.96 0.51 0.2 0.07 0.25 0.08 0.21 0.33 0.34 0.0 0.01 0.12 0.48 0.24 0.04 0.24 0.15 0.0 0.06 0.2 0.28 0.23 0.17 0.42 0.67 68.74
Solyc03g121470.3.1 (Solyc03g121470.3)
3.7 0.5 18.5 3.51 3.4 2.59 0.35 2.76 1.78 1.86 1.03 0.47 1.01 0.88 1.02 0.55 0.55 0.0 0.0 0.84 1.2 1.14 1.46 1.15 0.77 0.61 0.91 0.81 0.51 1.58 1.92 1.17 0.4 3.71
Solyc04g008940.3.1 (Solyc04g008940.3)
3.63 0.89 5.57 5.93 36.87 3.37 0.0 1.93 4.53 7.23 0.87 11.33 0.35 1.19 6.8 4.84 5.57 0.0 0.0 3.43 8.52 8.63 6.57 7.72 7.84 4.61 9.63 8.29 11.19 11.43 8.02 24.49 1.08 3.89
Solyc04g055130.1.1 (Solyc04g055130.1)
6.6 0.0 0.13 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21.92
Solyc04g055140.1.1 (Solyc04g055140.1)
16.57 0.0 0.31 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19.45
Solyc04g055150.1.1 (Solyc04g055150.1)
9.99 0.0 0.49 0.04 0.35 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 22.3
Solyc04g077190.3.1 (Solyc04g077190.3)
14.21 0.37 15.73 3.6 5.1 4.93 3.73 6.9 5.16 5.68 1.93 0.76 1.05 0.81 2.19 0.57 0.51 0.07 0.03 0.1 3.23 9.65 5.02 5.87 4.56 0.27 4.88 5.15 4.59 10.86 10.6 8.07 1.33 17.84
Solyc04g081560.3.1 (Solyc04g081560.3)
6.08 0.3 9.4 4.11 5.71 0.93 10.77 1.44 0.65 0.29 0.12 11.41 0.21 0.23 0.52 0.49 0.49 0.1 0.22 0.15 0.97 11.39 7.15 7.25 5.85 0.0 2.47 3.66 4.22 7.41 7.86 7.74 0.77 7.24
Solyc04g082710.3.1 (Solyc04g082710.3)
40.99 0.6 119.3 43.54 74.51 80.18 0.14 79.98 51.51 42.16 11.02 1.47 1.59 0.61 14.41 3.88 4.17 0.7 0.05 0.28 0.55 15.86 16.97 13.01 8.65 0.41 9.92 7.55 3.23 14.87 17.24 14.3 47.63 135.37
Solyc05g005877.1.1 (Solyc05g005877.1)
6.55 1.88 8.56 2.41 15.05 10.07 2.46 7.37 6.84 5.18 4.43 3.01 3.61 1.95 4.89 4.28 3.47 0.0 0.03 0.84 2.33 4.02 3.88 3.36 2.81 1.68 3.17 2.58 2.02 3.87 4.37 3.78 1.63 19.62
Solyc05g006210.3.1 (Solyc05g006210.3)
0.6 0.13 3.26 1.54 3.05 0.57 0.04 0.34 0.49 0.35 0.3 1.91 0.16 0.36 0.23 0.04 0.09 0.0 0.01 0.34 1.35 2.45 0.92 1.12 1.04 0.65 0.59 0.84 0.86 2.12 2.27 4.16 0.22 2.39
Solyc05g009170.2.1 (Solyc05g009170.2)
40.31 0.1 5.46 9.17 8.5 1.34 0.36 0.28 2.74 5.62 32.78 44.52 0.49 5.32 0.26 0.01 0.52 0.03 0.0 2.55 3.93 22.56 29.27 23.97 19.62 0.0 9.51 9.54 8.9 13.92 21.73 16.0 0.29 88.63
Solyc05g009640.3.1 (Solyc05g009640.3)
8.31 0.0 4.76 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.14 0.45 0.41 0.0 0.0 0.3 0.11 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.25 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.38
Solyc05g050870.3.1 (Solyc05g050870.3)
17.66 0.0 13.34 0.6 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.44 0.32 0.05 0.48 0.31 4.47 13.4 6.42 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.13 0.09 0.17 0.97 4.19 8.59 0.02 0.02 0.54 0.0 10.83
Solyc05g050890.2.1 (Solyc05g050890.2)
6.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.26 0.0 0.03 0.49 0.19 0.0 0.33 0.07 2.84 5.21 4.54 0.0 0.0 0.0 0.06 0.22 0.14 0.32 0.28 0.0 2.21 8.61 17.56 0.52 0.1 0.24 0.0 9.98
Solyc05g053050.1.1 (Solyc05g053050.1)
3.79 0.6 2.02 2.03 0.54 0.41 0.25 0.17 0.75 0.37 0.51 0.11 0.49 0.24 0.1 0.0 0.12 0.0 0.04 0.03 0.06 0.48 0.17 0.38 0.23 0.0 0.3 0.43 1.66 0.45 0.3 0.91 0.12 0.43
Solyc05g054590.3.1 (Solyc05g054590.3)
46.33 6.02 196.37 49.63 73.09 24.38 0.36 27.84 30.85 93.64 14.62 7.49 107.79 71.0 24.38 24.39 24.13 5.0 2.01 7.97 14.12 11.46 10.17 9.77 8.32 3.87 16.08 36.83 61.84 13.02 12.23 13.78 13.66 183.78
Solyc05g054620.3.1 (Solyc05g054620.3)
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Solyc06g034340.2.1 (Solyc06g034340.2)
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Solyc06g054250.3.1 (Solyc06g054250.3)
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Solyc06g054660.1.1 (Solyc06g054660.1)
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Solyc06g065410.3.1 (Solyc06g065410.3)
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Solyc06g066160.3.1 (Solyc06g066160.3)
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Solyc06g066170.3.1 (Solyc06g066170.3)
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Solyc08g074980.3.1 (Solyc08g074980.3)
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Solyc11g065010.1.1 (Solyc11g065010.1)
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Solyc12g096490.2.1 (Solyc12g096490.2)
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Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)