Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00190810 (LGT1)	0.16	0.34	0.46	0.26	0.22	0.01	0.19	0.08	0.29	0.32	0.87	1.0	0.46	0.28	0.24	0.5	0.84	0.78	0.45	0.25	0.33	0.46
AMTR_s00003p00109530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.75)	0.08	0.33	0.4	0.32	0.14	0.04	0.2	0.12	0.32	0.29	0.92	0.95	0.46	0.41	0.37	0.56	1.0	0.88	0.66	0.43	0.39	0.41
AMTR_s00005p00230200 (ATNTH1)	0.54	0.0	0.0	0.48	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.66	0.34	0.11	0.06	0.5	1.0	0.7	0.4	0.19	0.67	0.23
AMTR_s00007p00250280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.281)	1.0	0.1	0.07	0.28	0.26	0.04	0.11	0.0	0.13	0.12	0.48	0.42	0.42	0.29	0.29	0.3	0.77	0.3	0.38	0.28	0.23	0.31
AMTR_s00009p00203940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.132)	1.0	0.22	0.34	0.2	0.02	0.14	0.03	0.04	0.08	0.06	0.47	0.35	0.29	0.04	0.04	0.01	0.36	0.25	0.22	0.05	0.03	0.17
AMTR_s00010p00123310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.78)	0.44	0.07	0.0	0.24	0.08	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.55	0.47	0.4	0.24	0.19	0.54	1.0	0.55	0.52	0.26	0.27	0.3
AMTR_s00011p00260520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.192)	0.33	0.01	0.19	0.4	0.1	0.0	0.03	0.04	0.05	0.05	0.78	0.67	0.37	0.16	0.06	0.41	1.0	0.7	0.68	0.22	0.37	0.25
AMTR_s00012p00117440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.59)	0.18	0.0	0.0	0.35	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.67	0.44	0.23	0.13	0.48	1.0	0.49	0.5	0.29	0.2	0.36
AMTR_s00013p00155880 (SAE1B)	0.68	0.35	0.46	0.51	0.26	0.01	0.05	0.01	0.06	0.05	1.0	0.83	0.76	0.43	0.3	0.52	1.0	0.71	0.5	0.42	0.24	0.55
AMTR_s00018p00150330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.78)	0.58	0.56	0.55	0.53	0.16	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.72	0.93	0.3	0.1	0.08	0.41	1.0	0.49	0.45	0.27	0.16	0.39
AMTR_s00022p00175580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.184)	0.11	0.86	0.24	0.53	0.21	0.09	0.05	0.0	0.06	0.06	1.0	0.7	0.61	0.35	0.26	0.3	0.72	0.55	0.49	0.36	0.3	0.46
AMTR_s00022p00214560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.254)	1.0	0.51	0.13	0.24	0.1	0.0	0.04	0.01	0.28	0.1	0.62	0.58	0.34	0.13	0.23	0.13	0.65	0.25	0.21	0.14	0.18	0.27
AMTR_s00023p00202520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.142)	1.0	0.1	0.32	0.27	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.64	0.32	0.01	0.04	0.0	0.81	0.24	0.14	0.01	0.01	0.25
AMTR_s00023p00247850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.228)	0.57	0.46	0.17	0.45	0.22	0.01	0.15	0.0	0.1	0.14	0.5	0.59	0.51	0.24	0.16	0.43	1.0	0.37	0.47	0.28	0.38	0.31
AMTR_s00024p00076160 (IAR1)	0.25	0.57	0.55	0.37	0.21	0.01	0.15	0.07	0.19	0.18	1.0	0.91	0.54	0.41	0.29	0.46	0.7	0.78	0.69	0.33	0.46	0.41
AMTR_s00027p00202830 (CDC2)	0.66	0.61	0.92	0.59	0.3	0.17	0.05	0.0	0.04	0.05	0.79	0.78	0.62	0.14	0.15	0.28	1.0	0.55	0.46	0.29	0.2	0.73
AMTR_s00029p00149250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.176)	0.24	0.0	0.52	0.22	0.15	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.54	0.6	0.47	0.35	0.19	0.23	1.0	0.44	0.38	0.24	0.31	0.47
AMTR_s00031p00122700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.55)	0.11	0.24	0.0	0.54	0.17	0.0	0.02	0.0	0.03	0.03	1.0	0.99	0.73	0.44	0.26	0.34	0.67	0.49	0.73	0.54	0.28	0.47
AMTR_s00032p00072680 (PEX6)	0.08	0.77	0.35	0.36	0.06	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	1.0	0.93	0.49	0.48	0.19	0.44	0.5	0.78	0.82	0.41	0.85	0.38
AMTR_s00037p00218460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.121)	0.49	0.17	0.26	0.5	0.14	0.0	0.05	0.0	0.08	0.07	0.73	0.43	0.37	0.18	0.13	0.31	1.0	0.45	0.4	0.24	0.19	0.28
AMTR_s00037p00227630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.136)	0.27	0.21	0.2	0.3	0.11	0.0	0.08	0.02	0.08	0.07	0.43	0.32	0.62	0.24	0.24	0.19	1.0	0.5	0.35	0.36	0.15	0.41
AMTR_s00040p00091880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.52)	0.18	0.02	0.41	0.5	0.32	0.0	0.08	0.0	0.26	0.18	0.72	0.79	0.71	0.54	0.46	0.46	1.0	0.67	0.55	0.61	0.41	0.75
AMTR_s00047p00217500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.166)	0.47	0.77	0.46	0.44	0.12	0.01	0.07	0.0	0.2	0.15	0.75	0.58	0.64	0.47	0.16	0.55	1.0	0.82	0.65	0.5	0.31	0.44
AMTR_s00048p00189520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.144)	0.0	0.48	0.0	0.56	0.28	0.0	0.15	0.0	0.17	0.17	1.0	0.96	0.59	0.35	0.21	0.58	0.82	0.68	0.69	0.47	0.46	0.39
AMTR_s00058p00170360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.155)	0.31	0.13	0.49	0.42	0.08	0.07	0.02	0.0	0.02	0.03	0.72	0.52	0.27	0.05	0.03	0.21	1.0	0.22	0.18	0.11	0.21	0.29
AMTR_s00060p00085440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.34)	0.45	0.69	0.71	0.35	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.78	0.46	0.14	0.21	0.74	1.0	0.6	0.63	0.59	0.47	0.43
AMTR_s00063p00109930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.23)	0.24	0.61	0.25	0.43	0.06	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.99	0.77	0.57	0.2	0.28	1.0	0.83	0.76	0.85	0.53	0.55	0.45
AMTR_s00066p00092960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.74)	0.05	0.13	0.69	0.16	0.25	0.01	0.02	0.0	0.03	0.02	0.39	0.35	0.34	0.18	0.21	0.47	1.0	0.28	0.32	0.3	0.22	0.27
AMTR_s00066p00136320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.133)	0.06	0.21	0.44	0.27	0.2	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.37	0.33	0.63	0.39	0.23	0.35	1.0	0.4	0.37	0.41	0.25	0.46
AMTR_s00072p00179290 (VPS33)	0.82	0.48	0.31	0.43	0.26	0.0	0.15	0.05	0.19	0.18	0.96	1.0	0.5	0.41	0.35	0.69	0.79	0.88	0.7	0.49	0.56	0.56
AMTR_s00076p00023200 (THO5)	0.74	0.21	0.91	0.48	0.25	0.02	0.06	0.05	0.1	0.07	1.0	0.83	0.38	0.3	0.3	0.5	0.79	0.52	0.4	0.37	0.53	0.44
AMTR_s00077p00159550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.165)	0.4	0.17	0.41	0.28	0.25	0.0	0.04	0.0	0.07	0.1	0.67	0.52	0.54	0.36	0.27	0.33	1.0	0.57	0.33	0.34	0.38	0.51
AMTR_s00079p00127490 (ABA4)	1.0	0.11	0.49	0.35	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.72	0.73	0.08	0.06	0.38	0.82	0.29	0.3	0.12	0.13	0.54
AMTR_s00079p00153610 (AMSH1)	0.39	0.06	0.77	0.46	0.45	0.02	0.09	0.05	0.16	0.15	1.0	0.76	0.59	0.48	0.26	0.49	0.86	0.64	0.58	0.31	0.63	0.44
AMTR_s00079p00191320 (APG10)	0.58	0.35	0.34	0.58	0.12	0.0	0.06	0.0	0.11	0.11	0.86	1.0	0.34	0.22	0.08	0.39	0.93	0.93	0.81	0.28	0.38	0.25
AMTR_s00090p00136440 (CPFTSZ)	0.32	0.22	0.71	0.51	0.2	0.0	0.02	0.01	0.03	0.04	0.68	0.72	0.43	0.15	0.12	0.51	1.0	0.61	0.56	0.31	0.2	0.26
AMTR_s00095p00092040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.54)	0.1	0.23	0.45	0.35	0.17	0.04	0.02	0.0	0.03	0.03	1.0	0.87	0.44	0.2	0.11	0.37	0.82	0.67	0.66	0.14	0.45	0.28
AMTR_s00095p00175220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.153)	0.5	0.31	0.8	0.35	0.26	0.02	0.07	0.0	0.07	0.08	1.0	0.83	0.65	0.42	0.33	0.53	0.97	0.63	0.61	0.5	0.38	0.62
AMTR_s00098p00100110 (G18F)	0.51	0.74	0.52	0.29	0.18	0.01	0.07	0.0	0.14	0.11	1.0	0.76	0.69	0.45	0.42	0.6	0.82	0.51	0.52	0.63	0.45	0.54
AMTR_s00106p00153400 (PSD1)	0.28	0.28	0.5	0.5	0.15	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.52	0.48	0.47	0.23	0.24	0.41	1.0	0.38	0.47	0.53	0.36	0.35
AMTR_s00119p00133730 (EMB1241)	0.29	0.37	0.0	0.29	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.34	0.31	0.12	0.13	0.68	1.0	0.69	0.51	0.41	0.18	0.27
AMTR_s00127p00050750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.13)	0.06	0.76	0.11	0.27	0.27	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	1.0	0.55	0.33	0.25	0.21	0.32	0.57	0.32	0.26	0.33	0.18	0.3
AMTR_s00130p00080480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.37)	0.25	0.04	0.43	0.2	0.21	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.53	0.51	0.38	0.12	0.22	0.5	1.0	0.52	0.36	0.23	0.29	0.29
AMTR_s00137p00083250 (QWRF2)	0.17	0.0	0.0	0.33	0.06	0.0	0.04	0.0	0.06	0.07	0.53	0.55	0.48	0.17	0.15	0.25	1.0	0.4	0.31	0.3	0.37	0.53
AMTR_s00146p00043700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.22)	0.28	0.28	0.08	0.23	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.21	0.31	0.19	0.11	0.43	1.0	0.42	0.6	0.27	0.16	0.39
AMTR_s00158p00082100 (CPK3)	0.27	0.76	0.39	0.28	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.92	0.44	0.37	0.28	0.74	0.88	0.49	0.39	0.3	0.27	0.4
AMTR_s00173p00012350 (SYP32)	0.03	0.7	1.0	0.26	0.29	0.02	0.23	0.15	0.28	0.27	0.52	0.61	0.75	0.53	0.36	0.29	0.99	0.4	0.41	0.32	0.33	0.53
AMTR_s00174p00042990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00174.17)	1.0	0.53	0.01	0.5	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.9	0.46	0.13	0.15	0.53	0.91	0.47	0.5	0.6	0.41	0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)