Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00254220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.384)
0.0 0.06 0.0 0.04 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.42 0.58 0.86 0.34 0.14 1.0 0.51 0.23 0.38 0.22 0.25
AMTR_s00002p00271620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.633)
0.35 0.05 0.06 0.08 0.15 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.71 1.0 0.37 0.51 0.12 0.33 0.63 0.31 0.35 0.11 0.14 0.2
AMTR_s00002p00271670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.636)
0.27 0.06 0.25 0.11 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.32 0.31 0.67 0.76 1.0 0.19 0.29 0.43 0.29 0.19 0.24
AMTR_s00003p00260350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.339)
0.4 0.16 0.13 0.09 0.17 0.03 0.02 0.01 0.15 0.09 0.73 0.74 0.45 1.0 0.26 0.09 0.58 0.13 0.11 0.01 0.02 0.16
AMTR_s00004p00085780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.69)
0.1 0.38 0.09 0.02 0.05 0.0 0.14 0.05 0.27 0.26 0.54 0.21 0.67 1.0 0.2 0.15 0.52 0.35 0.08 0.18 0.22 0.18
AMTR_s00006p00255930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.189)
0.19 0.21 0.09 0.08 0.16 0.01 0.05 0.02 0.09 0.09 0.23 0.24 0.37 1.0 0.29 0.47 0.1 0.34 0.23 0.18 0.19 0.24
AMTR_s00006p00269170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.324)
0.27 0.19 0.23 0.09 0.21 0.0 0.01 0.01 0.04 0.05 0.46 0.47 0.48 1.0 0.66 0.23 0.14 0.32 0.34 0.27 0.21 0.34
AMTR_s00009p00188280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.119)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.4 0.36 0.42 1.0 0.2 0.38 0.61 0.36 0.35 0.19 0.37 0.35
AMTR_s00010p00190650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.171)
0.15 0.29 0.59 0.09 0.41 0.01 0.02 0.01 0.14 0.06 0.68 1.0 0.54 0.93 0.75 0.44 0.24 0.18 0.32 0.51 0.45 0.28
AMTR_s00010p00255200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.385)
0.53 0.01 0.05 0.05 0.09 0.0 0.02 0.0 0.1 0.08 0.93 0.96 0.8 1.0 0.43 0.51 0.93 0.64 0.52 0.25 0.33 0.68
AMTR_s00012p00263260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.341)
0.39 0.22 0.13 0.01 0.44 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.49 0.66 0.43 1.0 0.53 0.34 0.57 0.43 0.43 0.25 0.18 0.42
AMTR_s00013p00058430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.21)
0.0 0.29 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.46 0.4 0.49 1.0 0.69 0.35 0.45 0.45 0.24 0.19 0.16 0.31
AMTR_s00016p00253230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.312)
0.15 0.09 0.17 0.14 0.2 0.02 0.04 0.03 0.06 0.06 0.31 0.29 0.59 1.0 0.23 0.14 0.11 0.18 0.18 0.15 0.1 0.51
AMTR_s00017p00230690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.183)
0.39 0.12 0.39 0.01 0.49 0.04 0.29 0.1 0.35 0.3 0.75 0.95 0.98 1.0 0.89 0.49 0.91 0.62 0.58 0.44 0.29 0.63
AMTR_s00018p00151850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.80)
0.77 0.06 0.43 0.0 0.27 0.0 0.06 0.01 0.08 0.09 1.0 0.71 0.76 0.7 0.27 0.71 0.54 0.52 0.37 0.11 0.21 0.57
AMTR_s00019p00206230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.245)
0.26 0.42 0.41 0.1 0.41 0.0 0.06 0.03 0.05 0.05 0.8 0.51 0.58 1.0 0.65 0.45 0.53 0.32 0.26 0.16 0.2 0.21
AMTR_s00019p00244970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.375)
0.57 0.02 0.18 0.05 0.46 0.0 0.09 0.05 0.22 0.18 0.72 0.65 0.72 0.76 0.63 0.37 1.0 0.55 0.37 0.24 0.27 0.47
AMTR_s00022p00124760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.117)
0.24 0.0 0.22 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.52 0.89 0.43 0.45 0.58 0.23 0.19 0.14 0.23 0.11
AMTR_s00022p00183910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.195)
0.39 0.05 0.5 0.0 0.11 0.18 0.02 0.05 0.01 0.01 0.54 0.26 0.7 1.0 0.17 0.12 0.43 0.29 0.26 0.24 0.09 0.31
AMTR_s00024p00135620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.81)
0.0 0.0 0.0 0.26 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.62 0.75 0.55 1.0 0.25 0.2 0.3 0.41 0.36 0.35 0.56 0.19
AMTR_s00024p00245650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.306)
0.22 0.52 0.5 0.19 0.31 0.0 0.03 0.03 0.08 0.1 0.48 0.43 0.59 1.0 0.67 0.96 0.23 0.36 0.48 0.41 0.59 0.35
AMTR_s00025p00134170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.137)
0.31 0.12 0.0 0.01 0.23 0.2 0.15 0.0 0.23 0.19 0.69 1.0 0.66 0.56 0.3 0.2 0.79 0.58 0.63 0.28 0.3 0.26
AMTR_s00025p00137980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.144)
0.36 0.18 0.69 0.08 0.54 0.0 0.03 0.25 0.07 0.07 0.47 0.49 0.67 1.0 0.25 0.26 0.48 0.34 0.36 0.32 0.24 0.43
AMTR_s00025p00224230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.314)
0.34 0.06 0.01 0.14 0.43 0.0 0.07 0.0 0.08 0.07 0.75 0.62 0.68 1.0 0.45 0.61 0.38 0.27 0.23 0.24 0.42 0.33
AMTR_s00025p00244370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.381)
0.35 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.4 0.84 0.45 1.0 0.68 0.57 0.93 0.47 0.46 0.3 0.31 0.3
AMTR_s00029p00032490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.13)
0.04 0.0 0.28 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.43 0.43 1.0 0.24 0.09 0.13 0.26 0.32 0.22 0.08 0.51
AMTR_s00029p00227910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.358)
0.07 0.0 0.0 0.05 0.22 0.0 0.05 0.0 0.04 0.03 0.55 0.34 0.54 1.0 0.24 0.29 0.58 0.32 0.27 0.12 0.15 0.21
AMTR_s00029p00236390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.391)
0.22 0.0 0.38 0.02 0.11 0.0 0.23 0.1 0.22 0.27 1.0 0.84 0.31 0.7 0.26 0.64 0.63 0.4 0.32 0.27 0.13 0.27
AMTR_s00029p00236440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.392)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.12 0.0 0.19 0.2 1.0 0.54 0.17 0.7 0.18 0.41 0.98 0.1 0.25 0.21 0.19 0.1
AMTR_s00032p00030570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.12)
0.71 0.66 0.32 0.13 0.34 0.21 0.21 0.03 0.3 0.3 1.0 0.92 0.86 0.86 0.51 0.37 0.71 0.61 0.58 0.4 0.24 0.63
AMTR_s00036p00055660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.15)
0.44 0.32 0.45 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.66 0.51 0.66 1.0 0.19 0.23 0.72 0.46 0.44 0.37 0.17 0.24
AMTR_s00040p00154330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.128)
0.02 0.54 0.0 0.09 0.17 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.31 0.33 0.43 1.0 0.19 0.22 0.35 0.23 0.29 0.23 0.16 0.2
AMTR_s00040p00208740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.219)
0.75 0.45 0.4 0.13 0.65 0.11 0.18 0.01 0.26 0.19 1.0 0.94 0.83 0.68 0.63 0.57 0.81 0.54 0.67 0.61 0.65 0.64
AMTR_s00041p00018600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.6)
0.19 0.05 0.03 0.04 0.13 0.02 0.02 0.02 0.06 0.04 0.56 0.64 0.29 0.61 0.38 0.11 1.0 0.28 0.22 0.26 0.11 0.24
AMTR_s00041p00163280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.116)
0.14 0.1 0.09 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.22 0.46 1.0 0.49 0.11 0.1 0.31 0.32 0.15 0.03 0.35
AMTR_s00042p00113180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00042.25)
0.38 0.57 0.48 0.15 0.39 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.72 1.0 0.39 0.4 0.31 0.78 0.45 0.61 0.43 0.41 0.26 0.41
AMTR_s00043p00197540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.59)
0.25 0.52 0.4 0.34 0.58 0.01 0.1 0.0 0.08 0.11 0.79 1.0 0.81 0.95 0.67 0.49 0.7 0.64 0.5 0.32 0.25 0.54
AMTR_s00044p00113320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.86)
0.31 0.6 0.35 0.53 0.73 0.0 0.14 0.11 0.12 0.14 0.89 1.0 0.84 0.82 0.84 0.88 0.78 0.67 0.52 0.46 0.47 0.77
AMTR_s00045p00105550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.98)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.8 0.79 1.0 0.21 0.35 0.75 0.24 0.33 0.18 0.07 0.51
AMTR_s00047p00219100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.168)
0.2 0.21 0.01 0.39 0.13 0.05 0.02 0.02 0.04 0.04 0.27 0.25 0.63 1.0 0.52 0.41 0.18 0.3 0.27 0.22 0.15 0.46
AMTR_s00049p00109690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.85)
0.6 0.48 0.52 0.06 0.5 0.19 0.2 0.0 0.24 0.22 1.0 0.96 0.89 0.8 0.58 0.68 0.94 0.49 0.46 0.53 0.28 0.58
AMTR_s00049p00175800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.167)
0.19 0.32 0.17 0.39 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.59 0.61 0.62 1.0 0.7 0.69 0.34 0.92 0.57 0.31 0.23 0.41
AMTR_s00057p00151470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.137)
0.35 0.29 0.13 0.24 0.3 0.0 0.05 0.03 0.13 0.12 0.4 0.34 0.44 1.0 0.46 0.57 0.29 0.41 0.36 0.34 0.74 0.17
AMTR_s00062p00039310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.20)
0.31 0.49 0.46 0.13 0.42 0.02 0.02 0.06 0.03 0.04 0.85 1.0 0.48 0.55 0.43 0.57 0.46 0.52 0.52 0.32 0.1 0.51
AMTR_s00062p00168210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.160)
0.11 0.05 0.6 0.06 0.51 0.01 0.06 0.0 0.04 0.05 0.54 0.55 0.6 1.0 0.42 0.42 0.41 0.54 0.65 0.32 0.41 0.22
AMTR_s00066p00070660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.49)
0.02 0.11 0.03 0.06 0.09 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.45 0.47 0.46 1.0 0.31 0.18 0.18 0.14 0.3 0.39 0.07 0.17
AMTR_s00076p00140960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.43)
0.38 0.28 0.26 0.12 0.34 0.4 0.34 0.0 0.19 0.19 1.0 0.89 0.85 0.63 0.59 0.4 1.0 0.76 0.64 0.58 0.24 0.72
AMTR_s00077p00095230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.78)
0.14 0.21 0.14 0.03 0.36 0.05 0.09 0.05 0.15 0.15 0.57 0.54 0.63 1.0 0.71 0.95 0.45 0.41 0.4 0.4 0.29 0.35
AMTR_s00096p00025660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.7)
0.38 0.39 0.89 0.21 0.44 0.02 0.08 0.0 0.11 0.1 0.47 0.6 0.57 1.0 0.31 0.63 0.43 0.26 0.21 0.11 0.07 0.16
AMTR_s00098p00093790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.21)
0.67 0.7 0.3 0.04 0.64 0.01 0.04 0.0 0.04 0.06 0.89 1.0 0.66 0.61 0.51 0.63 0.92 0.59 0.67 0.44 0.33 0.7
AMTR_s00099p00058580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.40)
0.27 0.0 0.09 0.03 0.54 0.05 0.24 0.05 0.54 0.33 0.77 1.0 0.54 0.72 0.61 0.3 0.77 0.75 0.79 0.51 0.44 0.37
AMTR_s00109p00124720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.123)
0.0 0.11 0.09 0.17 0.35 0.0 0.07 0.01 0.1 0.09 0.42 0.54 0.52 1.0 0.55 0.36 0.19 0.48 0.46 0.2 0.15 0.38
AMTR_s00111p00131260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.109)
0.94 0.51 0.35 0.13 0.29 0.01 0.3 0.01 0.28 0.26 0.94 1.0 0.74 0.9 0.54 0.87 0.91 0.59 0.69 0.4 0.37 0.57
AMTR_s00111p00144320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.126)
0.3 0.14 0.06 0.1 0.26 0.0 0.03 0.02 0.03 0.04 0.4 0.48 0.5 1.0 0.56 0.18 0.42 0.54 0.46 0.44 0.23 0.19
AMTR_s00119p00110100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.85)
0.3 0.08 1.0 0.01 0.17 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.71 0.35 0.84 0.99 0.51 0.5 0.63 0.47 0.48 0.35 0.12 0.79
AMTR_s00127p00041670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.10)
0.05 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.14 0.25 1.0 0.14 0.63 0.39 0.44 0.12 0.24 0.14 0.01
AMTR_s00129p00111730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.85)
0.62 0.53 0.25 0.08 0.54 0.57 0.39 0.02 0.56 0.39 0.87 0.97 0.91 1.0 0.57 0.57 0.95 0.77 0.72 0.7 0.55 0.58
AMTR_s00131p00035560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.20)
0.63 0.2 0.17 0.21 0.3 0.02 0.44 0.07 0.32 0.39 0.88 0.9 0.84 1.0 0.52 0.88 0.9 0.53 0.56 0.52 0.42 0.61
AMTR_s00133p00099940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.45)
0.76 0.35 0.0 0.0 0.36 0.0 0.03 0.0 0.07 0.05 0.52 0.57 0.56 1.0 0.23 0.19 0.36 0.3 0.29 0.07 0.23 0.15
AMTR_s00133p00111570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.56)
0.55 0.24 1.0 0.11 0.15 0.01 0.05 0.02 0.1 0.1 0.63 0.51 0.72 0.76 0.35 0.53 0.8 0.5 0.43 0.56 0.48 0.39
AMTR_s00135p00052570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.21)
0.07 0.43 0.09 0.06 0.41 0.03 0.2 0.05 0.19 0.19 0.46 0.44 0.46 0.98 0.63 1.0 0.4 0.43 0.44 0.43 0.45 0.36
AMTR_s00135p00077960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.40)
0.09 0.0 0.03 0.13 0.28 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.49 0.48 0.4 1.0 0.44 0.36 0.5 0.34 0.4 0.42 0.27 0.28
AMTR_s00150p00035870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00150.8)
0.17 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.08 0.0 0.12 0.34 0.69 0.84 0.24 1.0 0.19 0.13 0.09 0.16 0.18 0.08 0.18 0.07
AMTR_s00159p00083590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00159.34)
0.5 0.22 0.0 0.04 0.19 0.0 0.2 0.3 0.19 0.25 0.7 0.63 0.6 1.0 0.51 0.42 0.77 0.51 0.45 0.36 0.55 0.44
AMTR_s00171p00033150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.12)
0.04 0.0 0.25 0.04 0.19 0.0 0.16 0.02 0.25 0.2 0.72 0.88 0.49 0.94 0.25 0.5 1.0 0.72 0.5 0.31 0.3 0.5
AMTR_s00171p00065800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.49)
0.77 0.77 0.48 0.05 0.38 0.01 0.12 0.02 0.12 0.11 0.91 1.0 0.65 0.48 0.43 0.59 0.62 0.56 0.65 0.53 0.39 0.57
AMTR_s00228p00023500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00228.2)
0.4 0.42 0.53 0.17 0.57 0.12 0.08 0.03 0.06 0.07 0.98 1.0 0.72 0.4 0.49 0.55 0.72 0.63 0.7 0.46 0.24 0.65
AMTR_s03609p00005290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03609.1)
0.18 0.23 0.05 0.01 0.17 0.0 0.05 0.02 0.09 0.09 0.31 0.31 0.29 1.0 0.34 0.6 0.22 0.42 0.27 0.22 0.25 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)