Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.75 0.14 1.39 0.82 0.56 0.54 1.24 1.0 -0.0 -0.35 -0.79 -1.18 -1.33 -2.35 -0.79 -2.02 1.14 -0.45 1.51 1.12 0.72 0.69 1.03 -2.51 -0.61 -1.53 -0.7 0.14 -1.16 -0.43 -0.45 -0.15 -0.14 -0.37 -0.51 0.85 -0.56 -0.31 -1.45 -0.89 -1.69 -1.85 -0.6 -0.83 -0.95 -0.36 -0.1 -0.29
0.54 0.74 1.64 0.08 -1.11 0.25 0.17 0.19 0.68 -0.72 -3.17 -2.7 -0.79 -1.62 -0.84 -0.47 1.33 -0.13 1.59 1.43 1.28 0.65 0.67 -1.3 -0.62 -1.16 -0.75 0.07 -0.82 -0.32 -0.52 -0.2 -0.51 -0.13 -0.93 -0.36 -0.47 -0.19 -0.74 -0.66 -1.36 -1.22 -0.71 -0.36 -0.55 -0.22 0.02 -0.34
0.04 0.68 1.39 -1.2 -0.9 -0.66 -1.19 -0.74 0.68 -0.85 -1.67 -1.63 -0.65 -0.46 -1.56 -0.5 1.48 0.86 1.07 1.19 0.6 0.51 2.14 -0.98 -0.32 -0.52 -0.29 -0.64 -1.43 -0.37 -0.85 -0.72 -0.28 -0.44 -1.29 -0.87 -0.98 -0.06 -0.86 0.27 -0.15 -0.17 0.03 -0.12 -0.3 -0.01 -0.46 -0.28
-0.73 0.83 0.9 -1.68 -0.76 0.43 0.19 -0.17 -0.4 -0.13 -1.59 -1.8 -0.07 0.03 -0.54 -0.87 0.92 0.35 1.1 0.79 0.39 0.1 1.1 -1.66 0.06 -0.11 -0.23 0.15 -0.3 -0.31 -0.19 -0.15 -0.03 0.15 -0.47 -0.21 -0.17 0.17 -0.41 -0.17 -0.39 -0.22 0.01 -0.22 -0.04 0.22 -0.19 -0.15
-0.19 0.53 1.65 -0.74 -2.38 -0.06 -0.57 -0.56 -0.14 -0.05 -1.18 -1.24 -0.1 -0.39 -0.48 0.02 0.99 0.51 1.02 0.61 0.43 0.5 0.81 -0.67 -0.24 -0.51 -0.61 0.03 0.11 -0.18 -0.25 -0.05 0.06 0.24 -0.37 0.2 -0.18 0.14 -0.51 -0.39 -0.95 -0.74 -0.18 -0.26 -0.35 0.14 0.13 -0.36
0.83 0.89 1.42 -0.68 0.02 -0.42 -0.67 -0.68 0.82 -1.19 -1.69 -1.68 -0.72 -1.01 -0.93 0.64 1.08 0.8 0.9 0.82 0.33 0.56 2.43 -0.43 -0.45 -0.41 -1.09 -0.18 -0.93 -0.25 -0.83 -0.88 -0.83 -0.7 -0.93 -0.91 -0.82 -0.53 -0.61 -0.61 -1.18 -0.94 -0.29 -0.33 -0.59 -0.47 -0.41 -0.26
0.15 1.02 1.91 0.94 -1.25 -0.37 -0.46 -0.38 0.49 -1.09 -2.17 -2.47 -1.28 -1.29 -1.21 0.0 1.19 0.87 1.25 1.25 0.59 0.46 2.0 -0.82 -0.89 -1.65 -1.99 -0.39 -0.23 -0.13 -0.55 -0.87 -0.46 -0.08 -0.57 -0.56 -0.81 -0.4 -1.02 -0.54 -1.49 -0.89 -0.37 -0.5 -0.84 -0.34 -0.19 -0.67
0.3 0.96 1.54 0.25 -1.92 -0.42 -0.53 -0.83 1.71 -0.29 -1.1 -1.16 -0.05 -0.62 -0.43 -0.2 1.23 0.97 1.03 0.82 0.49 0.21 0.59 -1.22 0.03 0.28 -0.33 -0.39 -1.24 -0.53 -0.7 -0.21 -0.77 -0.25 -1.1 -0.65 -0.48 0.13 -1.38 -0.56 -1.01 -0.8 -0.63 -0.21 -0.83 0.24 -0.43 -0.44
0.5 1.37 2.19 0.56 -2.78 -1.34 -1.67 -1.59 0.7 -0.9 -1.77 -1.63 -0.25 -0.36 -0.8 0.52 0.69 1.54 0.51 0.73 0.34 0.3 2.33 0.49 -0.42 -0.28 -0.77 -0.94 -1.22 -0.56 -1.18 -1.05 -1.36 -0.89 -1.38 -1.47 -1.21 -0.05 -1.44 -0.55 -0.87 -0.51 -0.6 -0.62 -1.28 -0.03 -1.06 -0.82
-0.95 1.2 2.01 0.76 0.09 0.05 -0.24 -0.28 0.02 -0.64 -3.9 -3.94 -1.23 -2.73 -0.99 -1.26 1.49 0.73 1.18 1.34 1.18 0.81 2.06 0.5 -0.33 -1.06 -1.4 -0.3 -1.18 -0.59 -0.52 -0.75 -0.71 -0.38 -2.84 -1.42 -0.79 -0.02 -1.51 -1.16 -2.52 -1.75 -0.87 -0.63 -1.1 -0.09 -0.4 -0.7
1.54 0.59 2.15 -1.13 -3.77 -2.0 -0.2 -0.05 0.49 -1.91 -3.02 -3.43 -1.74 -3.71 -1.64 1.05 1.2 1.23 1.99 1.3 1.65 1.0 2.3 0.13 -0.41 -0.65 -1.59 -1.57 0.58 -1.34 -2.1 -1.75 -2.01 -1.29 -2.36 -2.44 -2.25 -1.51 -1.95 -1.27 -2.13 -1.38 -1.14 -1.13 -1.02 -2.02 -1.36 -2.06
-0.42 0.84 1.39 0.37 -0.3 -0.7 -1.18 -1.11 0.08 -0.19 -1.16 -1.19 -0.23 -1.28 -0.35 0.27 0.77 0.97 0.69 0.78 0.8 1.16 2.19 -0.45 -0.09 -0.12 -0.72 -0.68 -0.77 -0.18 -0.53 -0.75 -0.81 -0.54 -1.35 -0.72 -0.74 -0.15 -1.15 -0.3 -1.13 -0.79 -0.2 -0.09 -0.88 -0.12 -0.05 -0.46
-0.27 1.0 1.92 0.73 -0.02 -0.26 -0.59 -0.48 -0.35 -0.51 -3.41 -3.29 -0.84 -1.96 -0.55 0.24 1.37 0.64 1.15 1.1 1.11 0.99 1.34 -1.5 -0.85 -1.24 -1.47 -0.0 -0.73 -0.22 -0.6 -0.79 -0.4 -0.05 -0.77 -0.3 -0.62 -0.13 -1.1 -0.3 -1.88 -1.52 -0.17 -0.19 -0.54 -0.15 -0.05 -0.54
-1.0 1.93 2.29 1.78 -0.04 0.44 -0.21 0.05 -0.43 -0.55 -6.25 -7.42 -1.68 -3.16 -0.58 -1.08 1.15 0.4 1.79 1.94 1.88 1.38 2.54 0.3 -0.12 -2.33 -3.13 -2.63 -4.31 -2.59 -2.48 -4.44 -3.24 -3.02 -4.95 -3.15 -3.88 -2.46 -4.32 -2.14 -3.92 -3.57 -1.84 -2.18 -3.0 -2.75 -2.26 -4.29
0.27 0.85 1.28 1.11 0.85 0.92 1.43 1.32 0.25 -0.31 -1.82 -2.12 -0.07 -1.64 -0.17 -0.22 -0.31 -0.31 0.8 0.42 0.41 0.26 1.55 -1.3 -0.05 -1.08 -0.02 -0.19 -0.86 -0.83 -0.61 -0.09 -0.71 -0.68 -1.8 -0.14 -0.36 -0.15 -1.47 -0.9 -1.77 -2.05 -1.14 -0.51 -0.72 -0.15 -1.09 -0.43
-0.26 0.46 0.8 1.17 -0.19 -0.71 -0.95 -0.54 -0.39 -1.23 -1.36 -1.38 -1.38 -0.73 -1.04 0.11 0.93 0.88 1.12 1.16 0.68 0.19 2.79 -1.11 0.01 -0.15 0.26 -1.02 -1.93 -0.7 -1.56 -0.96 -0.63 -0.77 -1.93 -1.75 -1.33 -0.3 -0.4 -0.05 -0.5 -0.1 0.05 -0.41 -0.22 -0.31 -0.59 -0.89
0.2 1.34 1.49 -0.27 -0.19 0.5 0.75 1.03 0.01 -0.08 -2.96 -2.49 -1.02 -3.68 -0.21 -0.34 1.38 0.9 0.91 0.6 0.73 0.9 1.0 -0.27 0.11 -0.15 -0.69 0.1 -0.94 -0.48 -0.29 -0.33 -0.47 -1.11 -1.61 0.06 -0.17 0.12 -1.93 -1.64 -2.49 -3.17 -1.13 -0.31 -1.74 0.04 -0.5 -0.43
0.35 1.03 1.86 0.01 -3.66 -0.66 -0.72 -0.3 0.4 -1.33 -1.99 -1.8 -1.22 -1.39 -0.82 -0.19 1.78 0.85 1.63 1.4 1.39 0.89 2.44 -0.22 -1.03 -0.97 -1.97 -0.54 -1.55 -0.32 -1.45 -1.01 -1.09 -0.7 -1.42 -1.11 -1.77 -0.67 -1.46 -0.93 -1.88 -1.43 -0.79 -1.1 -1.29 -0.63 -0.77 -0.61
0.52 1.08 1.5 -0.65 -0.09 0.01 0.36 0.49 0.6 -0.33 -0.85 -0.74 0.43 0.4 -0.13 -0.44 0.92 0.62 -0.01 0.28 0.25 0.43 0.17 -0.92 -0.01 0.22 -0.31 -0.79 -1.34 -0.63 -0.73 -0.51 -0.7 -0.52 -0.71 -0.55 -0.44 0.15 -0.65 -0.14 -0.03 -0.05 -0.17 -0.27 -0.45 0.06 -0.76 -0.31
0.77 0.57 1.42 0.07 -1.34 0.61 0.13 0.15 -0.04 -0.12 -0.58 -0.4 0.05 -0.7 -0.47 0.89 0.9 0.3 0.85 0.67 0.57 0.46 0.69 -1.17 0.07 -0.19 -0.31 -0.27 -0.96 -0.27 -0.4 -0.25 -0.49 -0.32 -0.48 -0.39 -0.64 0.05 -1.23 -0.73 -1.01 -0.97 -0.53 -0.45 -0.8 0.12 -0.21 -0.28
0.4 1.03 1.69 1.06 0.06 0.03 -0.58 -0.71 0.9 -1.37 -2.36 -1.96 -0.94 -0.82 -1.05 1.14 1.45 1.34 0.55 0.59 0.39 -0.05 2.12 0.73 -1.19 0.34 -1.5 -0.92 -1.33 -0.44 -1.43 -1.66 -1.3 -1.16 -1.17 -1.46 -1.42 -0.38 -0.89 -0.69 -1.05 -0.64 -0.56 -0.84 -0.86 -0.41 -1.34 -0.9
-0.15 0.9 1.97 -1.01 -2.2 0.13 0.2 0.45 0.06 -0.6 -0.89 -0.92 -0.75 -1.22 -0.73 0.38 1.04 0.8 0.69 1.19 0.67 0.41 1.04 1.03 -0.31 -0.31 -0.82 -0.5 -1.56 -0.15 -1.06 -0.59 -0.97 -0.47 -1.44 -0.63 -1.14 0.17 -1.16 -0.24 -0.87 -0.37 -0.28 -0.24 -1.03 0.27 -0.46 -0.39
0.47 0.85 1.78 1.23 -2.47 0.26 -0.3 -0.24 0.57 -0.49 -1.08 -1.03 -0.19 -0.89 -0.53 0.45 0.79 0.78 1.04 0.72 0.37 0.24 0.74 -0.76 -0.21 -0.07 -0.64 -0.18 -1.05 -0.25 -0.57 -0.02 -0.6 -0.4 -0.34 -0.56 -0.63 -0.17 -1.17 -0.56 -1.15 -1.03 -0.57 -0.32 -0.88 -0.13 -0.12 -0.26
0.15 0.54 1.13 -2.36 -0.47 -1.07 -0.87 -1.1 0.51 -0.59 -1.86 -1.48 -0.24 -0.13 -0.03 0.5 1.71 0.38 1.15 0.85 0.91 0.82 1.46 -0.96 -0.63 0.02 -1.57 -0.78 -1.21 -0.09 -0.98 -0.6 -0.42 -0.29 -1.4 -1.05 -0.85 -0.34 -0.23 0.08 0.22 -0.02 0.14 -0.21 0.18 -0.36 -0.79 0.07
-0.74 0.63 1.14 2.83 0.86 0.95 0.17 0.46 0.04 -1.8 -3.75 -3.92 -2.45 -2.49 -1.9 -0.95 0.43 0.97 0.9 0.98 0.58 0.25 2.7 -1.32 -0.5 -2.08 -1.17 -1.38 -1.83 -1.09 -1.21 -1.66 -1.14 -1.39 -3.05 -2.47 -1.75 -1.08 -1.96 -0.33 -0.84 -0.6 -0.42 -0.05 -0.95 -1.06 -0.9 -1.75
-0.68 0.32 1.26 -1.38 -1.62 0.09 -0.23 0.14 -0.46 -0.34 -0.74 -0.71 0.0 -0.4 0.02 0.21 1.11 0.58 1.1 0.84 0.58 0.53 0.74 -1.45 -0.53 -0.39 -0.83 -0.25 -0.74 0.2 -0.71 -0.17 -0.31 -0.12 -0.75 -0.38 -0.48 0.38 -0.66 0.06 -0.27 -0.17 0.04 -0.07 -0.18 0.42 -0.33 0.23
0.11 0.68 1.02 0.4 -0.2 -0.39 -0.75 -1.17 -0.07 -1.16 -1.56 -1.38 -0.86 0.03 0.23 0.34 1.19 0.42 1.01 1.12 0.83 0.55 2.33 -0.85 -0.63 -0.31 -0.47 -0.57 -1.63 0.06 -1.45 -1.02 -0.75 -0.8 -1.1 -1.19 -1.44 -0.48 -0.36 -0.29 0.16 -0.11 -0.12 -0.7 -0.51 -0.47 -1.23 0.37
-1.19 0.64 1.18 0.61 0.64 -0.47 0.07 0.08 -0.25 -0.53 -0.3 -0.2 -1.03 -1.84 -0.37 -0.15 1.37 0.39 1.17 0.91 0.78 0.33 1.3 -0.73 -0.23 -0.63 -0.18 -0.01 -0.88 0.02 -0.76 0.04 -0.41 -0.14 -0.72 -0.27 -0.68 -0.11 -1.22 -0.57 -1.47 -1.33 -0.64 -0.19 -0.55 -0.05 -0.07 -0.14
-1.58 0.53 1.92 -0.51 -0.8 -0.01 0.24 -0.25 -0.17 -0.48 -2.07 -1.94 -0.6 -1.23 -0.56 0.02 1.04 0.55 1.11 1.06 0.79 0.87 2.07 -1.16 -0.6 -1.01 -0.7 -0.43 -0.59 -0.27 -0.65 -0.45 -0.39 -0.05 -1.16 -0.42 -0.7 -0.19 -0.73 -0.25 -0.85 -0.7 -0.26 -0.32 -0.5 -0.0 -0.53 -0.22
0.9 0.9 1.44 1.93 -0.25 0.43 -0.15 0.3 0.56 -1.19 -1.45 -1.33 -0.33 0.25 -0.89 0.53 0.75 0.33 0.8 0.56 -0.33 -0.48 2.33 -1.25 -1.46 -1.12 -2.02 -1.27 -0.71 -0.44 -1.23 -1.14 -1.23 -0.9 -1.24 -1.62 -1.61 -0.03 -1.11 -0.14 -0.79 -0.58 -0.11 -0.54 -0.82 0.06 -0.85 -0.89
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0.52 0.8 0.99 -0.26 -2.99 -1.04 0.31 0.64 0.03 -0.23 -1.24 -1.03 -0.74 -0.57 -0.53 -0.11 1.06 0.77 0.56 0.92 0.46 0.22 1.63 -0.13 -0.25 -0.44 -0.49 -0.29 -0.64 -0.14 -0.37 -0.56 -0.16 -0.12 -0.48 -0.47 -0.83 -0.06 -0.79 -0.26 -0.19 -0.01 -0.13 -0.3 -0.5 -0.09 -0.26 -0.31
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-0.3 1.17 2.16 0.65 1.01 -0.02 -0.25 0.43 0.7 -1.44 -1.81 -1.56 -1.8 -1.92 -1.27 -0.49 1.47 1.41 0.82 0.67 0.24 0.47 2.24 1.13 -0.67 -0.65 -1.11 -1.3 -2.59 -0.92 -1.7 -1.2 -1.23 -1.1 -1.78 -1.86 -1.51 -0.73 -1.64 -0.92 -0.99 -0.89 -0.74 -0.77 -1.09 -0.73 -1.3 -0.78
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0.74 1.11 0.95 -1.25 -0.7 -0.17 -0.31 -0.02 1.14 -0.4 -0.57 -0.5 -0.36 -0.36 -0.46 0.61 1.0 0.5 0.48 0.31 0.44 -0.03 1.74 -0.8 -0.25 0.47 -0.76 -0.42 -1.44 -0.4 -0.88 -0.69 -0.15 -0.23 -0.94 -0.64 -0.61 -0.4 -0.44 -0.23 -0.57 -0.21 -0.19 -0.16 -0.17 -0.43 -0.39 -0.76
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- 1.88 2.3 2.98 0.07 1.31 1.84 0.76 0.97 -4.05 - - -4.27 - -3.62 -2.41 -0.09 1.57 -0.68 2.45 2.0 2.4 - -1.77 -0.51 -5.39 - - -5.45 -7.37 - - - - - - - - - - - - - - - - -5.2 -
-0.14 0.16 1.0 2.22 -0.86 0.26 0.27 0.39 0.7 -0.58 -2.0 -2.04 -0.73 -1.82 -0.4 0.92 1.08 0.24 1.04 1.03 0.88 0.68 1.6 -1.2 -0.62 -0.36 -1.17 -0.66 -0.91 -0.44 -0.75 -0.92 -0.52 -0.64 -1.1 -1.06 -0.68 -0.08 -1.56 -0.85 -1.49 -1.43 -0.67 -0.66 -0.52 -0.07 -1.01 -0.64
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.