Heatmap: Cluster_170 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g009000.3.1 (Solyc01g009000.3)
0.75 0.22 0.77 0.23 0.65 0.41 0.55 0.23 0.44 0.39 0.51 0.65 0.73 0.68 0.32 0.25 0.28 0.01 0.01 0.5 0.63 0.63 0.67 0.61 0.62 0.6 1.0 0.93 0.76 0.82 0.73 0.61 0.34 0.87
Solyc01g058670.3.1 (Solyc01g058670.3)
0.35 0.09 0.48 0.66 0.42 0.1 0.25 0.14 0.3 0.28 0.18 0.12 0.21 0.24 0.64 0.28 0.41 0.01 0.01 0.25 0.51 0.67 0.22 0.46 0.51 0.31 0.72 0.88 0.7 1.0 0.79 0.82 0.13 0.6
Solyc01g080910.2.1 (Solyc01g080910.2)
0.07 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.06 0.02 0.12 0.09 0.24 0.89 0.71 0.74 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.2 1.0 0.42 0.23 0.28 0.34 0.08 0.51 0.63 0.72 0.58 0.45 0.69 0.02 0.01
Solyc01g096040.3.1 (Solyc01g096040.3)
0.14 0.06 0.12 0.33 0.12 0.15 0.19 0.2 0.21 0.4 0.84 0.4 0.88 0.28 0.19 0.16 0.46 0.0 0.0 0.27 0.52 0.69 0.28 0.49 0.5 0.18 0.84 0.84 0.73 0.95 1.0 0.84 0.12 0.15
Solyc01g098645.1.1 (Solyc01g098645.1)
0.2 0.01 0.4 0.09 0.24 0.1 0.03 0.12 0.13 0.15 0.08 0.03 0.04 0.03 0.1 0.04 0.07 0.0 0.0 0.2 0.2 0.62 0.2 0.38 0.53 0.25 0.37 0.5 0.66 0.82 0.63 1.0 0.17 0.34
Solyc01g103120.3.1 (Solyc01g103120.3)
0.03 0.02 0.01 0.03 0.04 0.06 0.04 0.06 0.21 0.55 0.06 0.05 0.07 0.04 0.26 0.33 0.22 0.45 0.1 0.31 0.53 0.56 0.55 0.61 0.65 0.43 1.0 0.89 0.65 0.78 0.63 0.59 0.01 0.05
Solyc01g105350.2.1 (Solyc01g105350.2)
0.03 0.01 0.42 0.38 0.02 0.05 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.47 0.04 0.13 0.21 0.0 0.49 0.63 0.46 0.72 0.46 1.0 0.0 0.02
Solyc01g107800.3.1 (Solyc01g107800.3)
0.2 0.05 0.34 0.09 0.25 0.07 0.5 0.15 0.43 0.11 0.13 0.18 0.37 0.23 0.21 0.11 0.17 0.0 0.0 0.09 0.83 1.0 0.68 0.84 0.82 0.17 0.61 0.71 0.59 0.94 0.87 0.96 0.07 0.73
Solyc01g109880.3.1 (Solyc01g109880.3)
0.05 0.04 0.05 0.13 0.04 0.05 0.02 0.04 0.27 0.34 0.31 0.22 0.14 0.09 0.23 0.21 0.22 0.0 0.0 0.39 0.54 0.57 0.19 0.3 0.46 0.5 0.66 0.68 0.9 0.77 0.57 1.0 0.0 0.11
Solyc02g064795.1.1 (Solyc02g064795.1)
0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.11 0.37 0.66 0.34 0.26 0.25 0.51 0.44 0.42 0.05 0.11 0.09 0.2 0.83 0.27 0.43 0.47 0.2 0.51 0.55 0.5 1.0 0.99 0.9 0.01 0.02
Solyc02g067380.3.1 (Solyc02g067380.3)
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.11 0.13 0.08 0.01 0.02 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.52 0.55 0.59 0.67 0.0 0.85 0.95 1.0 0.62 0.59 0.28 0.12 0.04
Solyc02g078620.1.1 (Solyc02g078620.1)
0.03 0.0 0.15 0.21 0.67 0.08 0.0 0.06 0.07 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.51 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.58 0.37 0.41 0.47 0.0 0.56 0.75 1.0 0.72 0.35 0.75 0.13 0.09
Solyc02g080165.1.1 (Solyc02g080165.1)
0.22 0.53 0.1 0.08 0.57 0.32 0.56 0.34 0.28 0.48 0.5 0.44 0.56 0.54 0.32 0.2 0.18 0.0 0.0 0.17 0.17 0.78 0.8 0.59 0.5 0.27 0.82 0.61 0.58 0.8 1.0 0.65 0.2 0.15
Solyc02g087840.3.1 (Solyc02g087840.3)
0.05 0.0 0.07 1.0 0.78 0.02 0.0 0.02 0.11 0.12 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.17 0.11 0.0 0.0 0.01 0.51 0.51 0.05 0.27 0.58 0.02 0.37 0.68 0.8 0.71 0.44 0.88 0.01 0.13
Solyc02g088380.3.1 (Solyc02g088380.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.49 0.06 0.28 0.58 0.06 0.4 0.63 0.59 0.76 0.46 1.0 0.0 0.0
Solyc02g092045.1.1 (Solyc02g092045.1)
0.02 0.0 0.0 0.08 0.03 0.01 0.0 0.02 0.02 0.17 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.17 0.36 0.06 0.2 0.25 0.0 0.34 0.83 0.72 1.0 0.37 0.75 0.01 0.05
Solyc03g031800.3.1 (Solyc03g031800.3)
0.04 0.03 0.31 0.9 0.13 0.02 0.01 0.08 0.05 0.04 0.03 0.03 0.01 0.06 0.1 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.66 0.13 0.42 0.62 0.0 0.54 0.95 0.96 0.8 0.55 1.0 0.02 0.1
Solyc03g065340.3.1 (Solyc03g065340.3)
0.22 0.18 0.2 0.35 0.32 0.2 0.16 0.21 0.29 0.22 0.24 0.24 0.24 0.2 0.25 0.15 0.18 0.0 0.0 0.18 0.9 0.73 0.45 0.69 0.81 0.18 0.52 0.85 1.0 0.76 0.62 0.91 0.03 0.26
Solyc03g071533.1.1 (Solyc03g071533.1)
0.05 0.1 0.05 0.06 0.02 0.04 0.18 0.06 0.13 0.26 0.19 0.17 0.25 0.16 0.68 0.37 0.36 0.01 0.01 0.01 0.15 0.8 0.42 0.42 0.46 0.03 0.55 0.6 0.56 1.0 0.99 0.66 0.0 0.03
Solyc03g120420.3.1 (Solyc03g120420.3)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.16 0.02 0.09 0.09 0.31 0.21 0.52 0.44 0.31 0.18 0.18 0.0 0.01
Solyc04g006970.3.1 (Solyc04g006970.3)
0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.05 0.05 0.11 0.06 0.08 0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.49 0.76 0.25 0.54 0.67 0.14 0.68 0.95 0.86 0.87 0.7 1.0 0.0 0.04
Solyc04g074165.1.1 (Solyc04g074165.1)
0.19 0.13 0.24 0.6 0.32 0.07 0.1 0.22 0.2 0.16 0.06 0.06 0.1 0.06 0.28 0.09 0.11 0.0 0.0 0.01 0.05 0.6 0.28 0.44 0.54 0.03 0.93 0.91 0.78 1.0 0.69 0.68 0.11 0.24
Solyc04g081250.1.1 (Solyc04g081250.1)
0.06 0.04 0.54 0.72 0.02 0.01 0.05 0.05 0.19 0.12 1.0 0.52 0.06 0.1 0.36 0.18 0.13 0.15 0.05 0.06 0.37 0.67 0.15 0.35 0.47 0.01 0.23 0.3 0.23 0.91 0.67 0.71 0.0 0.05
Solyc05g053860.3.1 (Solyc05g053860.3)
0.02 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.34 0.16 0.3 0.49 0.17 0.63 0.74 0.7 0.39 0.33 0.47 0.0 0.01
Solyc06g007215.1.1 (Solyc06g007215.1)
0.03 0.05 0.01 0.07 0.02 0.01 0.07 0.0 0.02 0.08 0.08 0.21 0.24 0.22 0.09 0.14 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.63 0.25 0.33 0.45 0.02 0.29 0.42 0.46 0.59 0.62 1.0 0.01 0.06
Solyc06g035970.3.1 (Solyc06g035970.3)
0.5 0.17 0.61 0.59 0.66 0.27 0.24 0.29 0.36 0.37 0.31 0.16 0.21 0.17 0.57 0.63 0.44 0.0 0.0 0.42 0.78 0.67 0.44 0.72 0.85 0.57 0.89 1.0 0.99 0.77 0.66 0.72 0.83 0.58
Solyc06g063295.1.1 (Solyc06g063295.1)
0.42 0.09 0.09 0.05 0.24 0.24 0.56 0.14 0.37 0.28 0.47 0.43 1.0 0.92 0.12 0.06 0.07 0.0 0.0 0.3 0.32 0.51 0.45 0.42 0.37 0.47 0.59 0.59 0.53 0.5 0.49 0.37 0.17 0.45
Solyc06g068870.3.1 (Solyc06g068870.3)
0.14 0.11 0.04 0.03 0.22 0.4 0.49 0.26 0.33 0.45 0.44 0.46 0.8 0.73 0.2 0.12 0.17 0.0 0.0 0.43 0.43 0.75 0.48 0.55 0.62 0.66 0.92 0.72 0.66 0.89 0.91 1.0 0.1 0.13
Solyc06g071180.3.1 (Solyc06g071180.3)
0.42 0.11 0.07 0.04 0.15 0.27 0.48 0.19 0.43 0.34 0.42 0.65 0.35 0.21 0.21 0.15 0.26 0.0 0.0 0.76 0.58 0.68 0.37 0.52 0.55 1.0 0.82 0.82 0.73 0.86 0.76 0.93 0.12 0.29
Solyc06g072840.3.1 (Solyc06g072840.3)
0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.25 0.16 0.23 0.34 0.33 0.63 0.23 0.45 0.77 1.0 0.3 0.15 0.3 0.0 0.03
Solyc06g074710.1.1 (Solyc06g074710.1)
0.12 0.0 0.19 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.04 0.77 0.31 0.45 1.0 0.13 0.47 0.65 0.83 0.66 0.55 0.99 0.0 0.06
Solyc07g041245.1.1 (Solyc07g041245.1)
0.12 0.45 0.19 0.31 0.14 0.17 0.17 0.35 0.21 0.37 0.16 0.09 0.26 0.13 0.19 0.14 0.12 0.03 0.04 0.09 0.18 1.0 0.38 0.53 0.69 0.07 0.39 0.57 0.69 0.85 0.94 0.91 0.47 0.11
Solyc07g062530.3.1 (Solyc07g062530.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.57 0.5 0.11 0.44 0.61 0.09 0.52 1.0 0.96 0.67 0.47 0.72 0.0 0.0
Solyc07g065220.2.1 (Solyc07g065220.2)
0.43 0.03 0.32 0.06 0.36 0.28 0.33 0.1 0.13 0.14 0.27 0.15 0.48 0.35 0.1 0.07 0.11 0.0 0.0 0.38 0.56 0.72 0.27 0.46 0.45 0.43 0.8 0.77 0.57 1.0 0.81 0.93 0.06 0.52
Solyc08g016720.1.1 (Solyc08g016720.1)
0.06 0.0 0.04 0.05 0.02 0.07 0.02 0.01 0.08 0.12 0.24 0.25 0.1 0.32 0.06 0.14 0.17 0.0 0.0 0.03 0.41 0.54 0.1 0.34 0.44 0.1 0.33 0.36 0.38 0.58 0.48 1.0 0.01 0.07
Solyc08g016770.3.1 (Solyc08g016770.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.34 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.24 0.05 0.11 0.17 0.01 1.0 0.56 0.87 0.34 0.3 0.16 0.0 0.0
Solyc08g029050.3.1 (Solyc08g029050.3)
0.24 0.04 0.4 0.26 0.26 0.03 0.22 0.06 0.05 0.13 0.01 0.01 0.0 0.0 0.16 0.12 0.11 0.0 0.0 0.16 0.32 0.43 0.07 0.2 0.4 0.19 0.12 0.31 0.56 0.47 0.36 1.0 0.0 0.32
Solyc08g076310.3.1 (Solyc08g076310.3)
0.25 0.03 0.23 0.21 0.12 0.18 0.07 0.19 0.1 0.11 0.11 0.11 0.29 0.17 0.1 0.07 0.07 0.0 0.0 0.05 0.1 0.79 0.41 0.45 0.45 0.08 0.95 0.94 0.64 1.0 0.86 0.96 0.07 0.45
Solyc08g076480.3.1 (Solyc08g076480.3)
0.08 0.09 0.08 0.05 0.09 0.24 0.17 0.25 0.39 0.39 0.21 0.21 0.29 0.21 0.36 0.28 0.28 0.01 0.01 0.29 0.32 0.53 0.39 0.58 0.64 0.17 0.72 1.0 0.9 0.64 0.54 0.45 0.2 0.07
Solyc08g082370.1.1 (Solyc08g082370.1)
0.19 0.04 0.19 0.23 0.09 0.28 0.0 0.11 0.08 0.19 0.15 0.2 0.05 0.18 0.18 0.16 0.15 0.0 0.0 0.02 0.12 0.66 0.31 0.37 0.39 0.01 0.96 1.0 0.83 0.89 0.88 0.87 0.13 0.41
Solyc09g018280.1.1 (Solyc09g018280.1)
0.22 0.03 0.08 0.04 0.15 0.06 0.12 0.04 0.24 0.15 0.04 0.17 0.16 0.26 0.15 0.12 0.19 0.0 0.0 0.29 0.31 0.86 0.49 0.64 0.58 0.4 0.85 0.75 0.53 1.0 0.93 0.92 0.0 0.59
Solyc10g007570.3.1 (Solyc10g007570.3)
0.1 0.0 0.01 0.0 0.09 0.11 0.0 0.02 0.03 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.27 0.36 0.0 0.0 0.14 0.35 0.6 0.14 0.41 0.68 0.11 0.46 0.82 1.0 0.66 0.48 0.71 0.01 0.07
Solyc10g011730.3.1 (Solyc10g011730.3)
0.08 0.0 0.18 0.42 0.02 0.06 0.0 0.15 0.16 0.04 0.06 0.08 0.01 0.03 0.09 0.05 0.06 0.0 0.0 0.02 0.07 0.56 0.11 0.28 0.36 0.0 0.88 0.9 0.83 1.0 0.69 0.7 0.06 0.01
Solyc10g054010.1.1 (Solyc10g054010.1)
0.06 0.01 0.01 0.0 0.3 0.1 0.06 0.04 0.46 0.31 0.17 0.17 0.07 0.11 0.16 0.15 0.22 0.0 0.0 0.03 0.16 0.55 0.34 0.32 0.32 0.06 0.56 0.78 0.78 0.8 0.6 1.0 0.01 0.36
Solyc10g074790.2.1 (Solyc10g074790.2)
0.08 0.05 0.06 0.07 0.05 0.06 0.08 0.04 0.11 0.1 0.08 0.09 0.08 0.08 0.05 0.03 0.06 0.01 0.01 0.24 0.63 0.84 0.33 0.64 1.0 0.23 0.37 0.69 0.67 0.76 0.59 0.8 0.02 0.12
Solyc10g085400.2.1 (Solyc10g085400.2)
0.36 0.22 0.09 0.18 0.19 0.09 0.51 0.07 0.31 0.12 0.05 0.06 0.19 0.26 0.09 0.04 0.05 0.0 0.0 0.14 0.3 0.81 0.23 0.44 0.74 0.18 0.17 0.39 0.54 0.71 0.59 1.0 0.02 0.31
Solyc10g087010.2.1 (Solyc10g087010.2)
0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.05 0.09 0.0 0.0 0.19 0.81 0.2 0.06 0.19 0.2 0.4 0.59 1.0 0.88 0.33 0.18 0.32 0.01 0.01
Solyc12g005350.2.1 (Solyc12g005350.2)
0.24 0.41 0.45 0.39 0.07 0.0 0.17 0.01 0.22 0.11 0.12 0.06 0.02 0.18 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.29 0.46 0.53 0.16 0.35 0.51 0.26 0.36 0.49 0.59 0.63 0.52 1.0 0.0 0.27
Solyc12g019700.1.1 (Solyc12g019700.1)
0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.05 0.02 0.27 0.35 0.22 0.17 0.07 0.06 0.33 0.32 0.19 0.0 0.0 0.18 0.2 0.67 0.57 0.57 0.52 0.04 0.49 0.51 0.44 0.77 0.71 1.0 0.0 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)