Heatmap: Cluster_154 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g031040.1.1 (Solyc00g031040.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g088210.2.1 (Solyc00g088210.2)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g185850.1.1 (Solyc00g185850.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011270.2.1 (Solyc01g011270.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g011300.1.1 (Solyc01g011300.1)
- - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g014770.1.1 (Solyc01g014770.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g017230.1.1 (Solyc01g017230.1)
-0.83 -1.69 - - 0.03 0.75 -1.44 - 0.08 - 2.9 -0.09 -0.39 -0.48 - -2.5 -1.45 - - 0.32 2.35 0.05 -3.65 -0.68 -0.26 - 0.17 0.27 -0.56 -2.36 -2.57 0.44 0.87 1.62
Solyc01g065590.1.1 (Solyc01g065590.1)
- - - - - 0.74 2.08 - - - 0.36 -2.06 - -1.66 0.32 -0.51 -1.71 - - 2.89 -0.09 - -1.65 - - 3.84 - -2.22 -2.69 -1.02 - - - -2.43
Solyc01g080725.1.1 (Solyc01g080725.1)
-0.72 1.67 -0.22 -1.21 0.58 -1.61 1.08 -1.11 -1.58 -0.83 0.46 0.77 1.27 0.99 -0.33 -0.07 0.22 0.18 -1.59 -1.3 -0.01 -0.31 -2.63 -1.39 -0.88 -3.66 -0.93 0.1 1.71 -0.74 -1.2 -0.16 -2.8 0.54
Solyc02g036120.1.1 (Solyc02g036120.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc03g005400.1.1 (Solyc03g005400.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g061610.1.1 (Solyc03g061610.1)
- - - - - - - - - - 4.51 - - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g063070.1.1 (Solyc03g063070.1)
- - - - - - - - - - 3.12 - - 4.21 - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - -
Solyc03g078243.1.1 (Solyc03g078243.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g079970.1.1 (Solyc03g079970.1)
- - - - -4.38 -6.16 - - 3.3 3.97 -3.77 -3.03 -5.96 -4.34 -1.28 -3.13 -3.08 0.08 0.42 -1.42 -2.44 -1.88 -4.1 -2.55 -1.99 -0.22 -3.67 -1.4 0.09 -1.59 -1.39 -0.59 - -3.47
Solyc03g095787.1.1 (Solyc03g095787.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g024790.1.1 (Solyc04g024790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g026180.1.1 (Solyc04g026180.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g028420.1.1 (Solyc04g028420.1)
- - - - 3.04 - - - - - - - - 4.12 - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g039860.1.1 (Solyc04g039860.1)
- - - - - -4.48 - - - - - - - - - - -0.33 - - 0.45 2.36 - 0.32 -0.8 -0.16 - - - 0.8 0.53 -0.58 - - 4.33
Solyc04g047800.1.1 (Solyc04g047800.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g051157.1.1 (Solyc04g051157.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016430.1.1 (Solyc05g016430.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016470.1.1 (Solyc05g016470.1)
- - - - - 0.89 - - - 5.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018797.1.1 (Solyc05g018797.1)
- - - - 3.12 1.67 2.51 - - - - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - - - - - 3.24
Solyc05g041697.1.1 (Solyc05g041697.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g045810.1.1 (Solyc05g045810.1)
- - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g045820.1.1 (Solyc05g045820.1)
- - - - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - 0.82 - - - 1.72 - - - - - -
Solyc05g045890.1.1 (Solyc05g045890.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g050436.1.1 (Solyc05g050436.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g052740.1.1 (Solyc05g052740.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g008835.1.1 (Solyc06g008835.1)
- - - - - -0.49 - - - - - - 2.44 4.77 - - - - - - - - - - - - - -0.64 - - - - - -
Solyc06g043210.1.1 (Solyc06g043210.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g065600.1.1 (Solyc06g065600.1)
- - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - -
Solyc07g032630.1.1 (Solyc07g032630.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g039625.1.1 (Solyc07g039625.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g016320.1.1 (Solyc08g016320.1)
- - - - - 2.41 - - - - 4.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g016650.1.1 (Solyc08g016650.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g048233.1.1 (Solyc08g048233.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g059780.2.1 (Solyc08g059780.2)
- - - - 2.09 1.03 - - - - 0.2 0.17 0.23 4.46 - - - - - - 1.19 - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g062080.1.1 (Solyc08g062080.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g067560.2.1 (Solyc08g067560.2)
-0.79 - - - - 1.17 - 0.35 - 3.55 - 1.27 -0.5 -0.79 - 2.14 0.59 - - - -0.77 -1.58 -1.59 -1.48 - - -1.16 -1.35 - 1.34 - 0.55 - 1.09
Solyc09g015477.1.1 (Solyc09g015477.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g037170.2.1 (Solyc09g037170.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055803.1.1 (Solyc09g055803.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059335.1.1 (Solyc09g059335.1)
5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059770.1.1 (Solyc09g059770.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g064273.1.1 (Solyc09g064273.1)
- - - - 3.76 1.07 - 0.91 - 2.69 -1.9 - - - -1.35 -1.19 0.59 1.76 0.74 - 1.07 - - - - - - -2.76 -2.47 - - - - -
Solyc09g064277.1.1 (Solyc09g064277.1)
- - - - 3.24 1.64 - - - 3.54 - -0.63 - - 1.68 - 1.32 - -0.59 - -0.46 - - - - - - - -1.4 - -0.3 - -0.27 -
Solyc09g065230.1.1 (Solyc09g065230.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g012195.1.1 (Solyc10g012195.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g018450.1.1 (Solyc10g018450.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g050055.1.1 (Solyc10g050055.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g050373.1.1 (Solyc10g050373.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g052605.1.1 (Solyc10g052605.1)
-0.2 4.58 - - - -3.11 - 2.83 0.5 - - - - - - - - - - - - - - -0.6 - - - - - - - - - -
Solyc11g012350.1.1 (Solyc11g012350.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g013360.2.1 (Solyc11g013360.2)
-0.39 - 0.1 - -0.6 1.35 - - 0.58 3.07 -0.83 - 0.26 -0.39 1.36 - 1.09 - - -1.3 1.13 - - -0.5 -0.42 - - -1.59 - -0.02 - -0.97 -1.76 2.49
Solyc11g018630.1.1 (Solyc11g018630.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g027665.1.1 (Solyc11g027665.1)
-1.88 0.74 0.94 3.11 -0.56 -1.39 2.68 - -0.31 - - - - - 1.62 -0.5 1.49 -3.02 - 0.43 0.07 -1.43 -2.16 -0.98 -2.03 - - -1.49 -0.89 - -0.52 -0.61 -2.12 -1.96
Solyc11g030585.1.1 (Solyc11g030585.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g030650.1.1 (Solyc11g030650.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g042970.1.1 (Solyc11g042970.1)
- - - - 4.95 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g015895.1.1 (Solyc12g015895.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g035822.1.1 (Solyc12g035822.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g042016.1.1 (Solyc12g042016.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g042160.1.1 (Solyc12g042160.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g042270.2.1 (Solyc12g042270.2)
- - - - 4.27 - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g062730.2.1 (Solyc12g062730.2)
3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.15 - - - - - - 3.23 - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.