Heatmap: Cluster_93 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g005084.1.1 (Solyc00g005084.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc00g006540.1.1 (Solyc00g006540.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.56 4.57 - - 2.12 - -
Solyc00g006863.1.1 (Solyc00g006863.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 3.78 - - 3.11 - -
Solyc00g007990.1.1 (Solyc00g007990.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g027660.2.1 (Solyc00g027660.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g188750.1.1 (Solyc00g188750.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g266110.1.1 (Solyc00g266110.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc01g009977.1.1 (Solyc01g009977.1)
- - - - 4.83 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g010501.1.1 (Solyc01g010501.1)
- - - - - 4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.61 - - - - - -
Solyc01g014640.1.1 (Solyc01g014640.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g017060.2.1 (Solyc01g017060.2)
- - - - - 1.68 - - - - - - - - 3.0 - - - 2.19 1.51 3.44 - - - - - - - - - - - 2.18 -
Solyc01g017280.1.1 (Solyc01g017280.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc01g020408.1.1 (Solyc01g020408.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g065624.1.1 (Solyc01g065624.1)
- - - - 2.37 2.03 - - - - - - 3.6 2.22 - - - - - - - - - -0.2 - - - 1.92 1.73 - - - - -
Solyc01g086880.2.1 (Solyc01g086880.2)
- - - - 4.96 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g150003.1.1 (Solyc01g150003.1)
- - - - - 0.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.31 1.42 - - 3.24 3.26 - - 3.03 - -
Solyc02g031680.1.1 (Solyc02g031680.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g031820.1.1 (Solyc02g031820.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc02g033035.1.1 (Solyc02g033035.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g055390.2.1 (Solyc02g055390.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.92 3.6 - 3.83 - - -
Solyc02g055445.1.1 (Solyc02g055445.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g094770.2.1 (Solyc02g094770.2)
- - - - - - - - - - -0.85 - 0.59 - - - - - - - 1.55 -0.66 - - -0.68 - 0.19 2.33 3.95 0.3 -0.99 2.15 - -
Solyc03g058935.1.1 (Solyc03g058935.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.24 1.59 4.43 - - - - -
Solyc03g063305.1.1 (Solyc03g063305.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g078075.1.1 (Solyc03g078075.1)
- - - - 3.79 1.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.28 3.85 - - - - -
Solyc03g078433.1.1 (Solyc03g078433.1)
- - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - 0.88 1.68 1.2 1.91 - 1.95 1.48 2.36 - 0.89 2.37 - -
Solyc03g078560.1.1 (Solyc03g078560.1)
- - - 2.68 - 0.84 - - - - 1.43 - - - 4.03 - - - - - - - - - 0.95 - - - 2.29 - - - - -
Solyc03g119225.1.1 (Solyc03g119225.1)
4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025735.1.1 (Solyc04g025735.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.5 - - - - - 1.24 3.97 3.37 - - - -
Solyc04g026023.1.1 (Solyc04g026023.1)
- - - - - - - - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.19 4.1 - - - - -
Solyc04g054750.2.1 (Solyc04g054750.2)
- - - - - 1.28 - 1.9 - - - - - - 2.32 - - - - 2.26 - 0.95 - - 1.67 2.89 - -0.11 - 1.57 - 0.68 - -
Solyc04g071803.1.1 (Solyc04g071803.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g081830.1.1 (Solyc04g081830.1)
- - - - 2.75 1.92 - - - - 4.39 - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g006833.1.1 (Solyc05g006833.1)
- - 3.24 - - 2.02 - - - - - 2.01 - - - - - - - - - - - 0.7 - - - 1.57 - - - - - 3.57
Solyc05g010396.1.1 (Solyc05g010396.1)
- - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - - -
Solyc05g014840.2.1 (Solyc05g014840.2)
- - - - - - - - - - - - - 1.88 - - - - - - - - - - - - 2.09 2.76 3.35 3.18 - - - -
Solyc05g014845.1.1 (Solyc05g014845.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.04 - - 4.13 - -
Solyc05g015847.1.1 (Solyc05g015847.1)
- - - - 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12
Solyc05g016344.1.1 (Solyc05g016344.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - - 4.05 3.25 - - - - -
Solyc05g026150.1.1 (Solyc05g026150.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.75 - 2.43 0.67 - - - - 2.96 2.23 1.69 - - 2.99 - -
Solyc05g050402.1.1 (Solyc05g050402.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc06g024325.1.1 (Solyc06g024325.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 1.38 4.35 - - 2.6 - -
Solyc06g034205.1.1 (Solyc06g034205.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g035680.2.1 (Solyc06g035680.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g014705.1.1 (Solyc07g014705.1)
- - - - - 0.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.55 - - 2.69 3.53 - - 3.07 - -
Solyc07g015830.1.1 (Solyc07g015830.1)
- - - - - 1.49 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - -0.19 - - 2.09 4.38 - 0.31 1.56 - -
Solyc07g019480.1.1 (Solyc07g019480.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g019560.1.1 (Solyc07g019560.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - -
Solyc07g021385.1.1 (Solyc07g021385.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032493.1.1 (Solyc07g032493.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.92 - 3.47 - - - - - 2.96 - - - - - -
Solyc07g040847.1.1 (Solyc07g040847.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - - - - 3.41 3.17 - - - - -
Solyc07g040915.1.1 (Solyc07g040915.1)
- - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - -
Solyc07g044885.1.1 (Solyc07g044885.1)
- - - - - -1.89 - - - - - - - - - - - - - - 0.89 0.26 - 0.07 - - - 3.04 3.68 2.93 -0.06 - - -
Solyc08g016120.1.1 (Solyc08g016120.1)
- - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - 3.38 - - - 2.91 - - - - - -
Solyc08g029345.1.1 (Solyc08g029345.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc08g029346.1.1 (Solyc08g029346.1)
- - - - - - 3.42 - - - - - - - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g059765.1.1 (Solyc08g059765.1)
- - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - 3.83 - -
Solyc08g065537.1.1 (Solyc08g065537.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc08g074865.1.1 (Solyc08g074865.1)
-0.96 -2.01 -2.0 -0.79 -2.85 -2.59 -6.9 0.21 -0.34 2.41 -1.67 -1.08 -5.15 -5.37 1.35 1.89 1.41 - - -0.68 -0.55 0.5 1.29 0.95 0.56 0.3 -1.69 -1.02 -0.58 -0.61 0.26 0.09 -6.76 -0.18
Solyc09g017990.2.1 (Solyc09g017990.2)
- - - - - - - - - - - - - 0.48 - - - - -0.37 2.13 - - - - - - 2.53 2.72 3.66 - - 1.26 - -
Solyc09g055960.1.1 (Solyc09g055960.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 4.34 - - - - -
Solyc09g055995.1.1 (Solyc09g055995.1)
- - - - 3.54 0.37 - - - 1.91 - 0.89 2.81 -0.71 - - - - - 0.39 - -0.31 -0.6 -2.32 -1.29 - - 0.16 -1.38 0.22 - - - 0.86
Solyc09g056250.1.1 (Solyc09g056250.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g057715.1.1 (Solyc09g057715.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059320.2.1 (Solyc09g059320.2)
- - - - 3.96 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059330.2.1 (Solyc09g059330.2)
- - - - 4.45 3.18 - - - - - - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - -
Solyc09g059736.1.1 (Solyc09g059736.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - 2.3 4.48 - - - - -
Solyc09g059738.1.1 (Solyc09g059738.1)
- - - - - -0.99 - - - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - 0.97 1.76 4.42 - - - - -
Solyc09g064365.1.1 (Solyc09g064365.1)
2.07 - 3.88 2.99 - - - - - - 0.54 - - - - - 0.99 - - - - - - - - - - -0.8 - - - - 0.17 1.0
Solyc09g075770.2.1 (Solyc09g075770.2)
- - - - - 1.41 - 3.62 - - - - - - - - - - - - - 2.69 - 1.6 - - - - 1.6 - 2.71 - - -
Solyc10g012255.1.1 (Solyc10g012255.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.36 - 3.75 - - - - - - - - - -
Solyc10g017753.1.1 (Solyc10g017753.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g018635.1.1 (Solyc10g018635.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc10g045260.1.1 (Solyc10g045260.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045623.1.1 (Solyc10g045623.1)
- - - - - - - - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - - - - 4.15 2.82 - - - - 1.87
Solyc10g049240.1.1 (Solyc10g049240.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g052805.1.1 (Solyc10g052805.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.36 4.09 - - - - - - - 2.75 - - - - -
Solyc10g055150.1.1 (Solyc10g055150.1)
- - - - 4.92 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g062035.1.1 (Solyc10g062035.1)
- - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g062113.1.1 (Solyc10g062113.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.16 - - 0.85 - - 1.73 3.12 2.4 2.58 - - -
Solyc11g017474.1.1 (Solyc11g017474.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 3.9 - - - - - - - - -0.41 1.33 - - - - -
Solyc11g028160.1.1 (Solyc11g028160.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g039410.2.1 (Solyc11g039410.2)
- - - - 4.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.19 - - - - - - - - - -
Solyc11g039815.1.1 (Solyc11g039815.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - 4.2 - - - - -
Solyc11g039917.1.1 (Solyc11g039917.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.23 - 3.93 - - -
Solyc11g045125.1.1 (Solyc11g045125.1)
- - - - - - 2.45 - - - - - - 4.17 - - - - - - - - - - - - - 2.45 2.34 - - - - -
Solyc11g050934.1.1 (Solyc11g050934.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g056633.1.1 (Solyc11g056633.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g061913.1.1 (Solyc11g061913.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - -
Solyc11g066170.2.1 (Solyc11g066170.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.99 1.17 - - - - - -
Solyc12g009730.2.1 (Solyc12g009730.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g011460.1.1 (Solyc12g011460.1)
- - - - 4.4 0.65 - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - 2.17 - - - - - -
Solyc12g015980.1.1 (Solyc12g015980.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.47 - 0.01 - 0.81 - - 0.25 3.5 4.04 - - -0.11 - -
Solyc12g020030.1.1 (Solyc12g020030.1)
- - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - -
Solyc12g035522.1.1 (Solyc12g035522.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc12g035524.1.1 (Solyc12g035524.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g035905.1.1 (Solyc12g035905.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc12g039110.1.1 (Solyc12g039110.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 3.97 - - - -
Solyc12g042385.1.1 (Solyc12g042385.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.