Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
2.22 0.73 0.83 0.55 5.99 1.7 0.52
17.86 17.68 16.39 17.55 34.86 17.66 13.08
11.58 6.08 0.11 0.07 45.18 8.82 0.17
17.22 10.52 2.7 2.33 15.6 6.69 3.26
1.51 0.33 0.06 0.0 3.76 0.21 0.14
9.23 6.88 3.51 2.54 15.46 5.24 3.73
10.62 8.74 3.34 2.78 38.76 6.51 7.12
9.26 6.88 4.55 4.31 11.51 3.11 2.66
Aop_g01713 (RP1)
4.07 2.57 1.28 1.15 4.9 1.64 1.42
24.74 14.94 7.93 7.02 38.2 10.83 8.4
Aop_g02533 (SK13)
13.87 9.26 6.77 5.7 26.04 7.77 5.38
Aop_g03079 (ROP1)
21.93 10.47 6.47 4.85 40.45 6.27 5.9
Aop_g03463 (CYCD3;3)
2.53 0.19 0.0 0.0 5.93 1.1 1.1
70.09 47.72 4.88 3.45 83.14 9.54 3.6
Aop_g03787 (FEY)
8.74 6.78 5.54 5.77 19.21 6.75 5.19
58.72 41.99 1.23 0.56 184.82 31.41 1.8
Aop_g04211 (UGT85A1)
8.77 4.22 0.03 0.0 15.54 1.22 1.15
1.11 0.09 0.0 0.0 2.64 0.28 0.0
Aop_g04651 (PPD2)
7.06 4.99 3.68 2.66 8.41 3.27 1.18
5.88 1.37 0.19 0.29 11.82 1.85 2.31
31.88 26.38 15.49 14.66 43.29 17.13 8.45
37.46 28.63 24.2 20.37 65.77 22.51 17.09
Aop_g04779 (THFS)
24.85 14.04 3.53 3.01 47.04 4.51 7.09
Aop_g04830 (EOL1)
4.92 4.1 2.66 2.5 10.17 3.48 2.76
8.58 2.19 1.91 1.59 24.72 5.42 2.23
Aop_g05084 (CYP20-2)
116.92 93.76 57.23 48.71 205.42 68.26 49.75
Aop_g05364 (emb2726)
14.79 10.87 4.78 4.26 21.57 9.24 7.26
10.24 11.69 6.73 6.49 17.93 9.35 6.6
Aop_g05479 (SGP1)
1.52 0.86 0.06 0.02 4.59 0.43 0.77
6.27 5.31 0.2 0.21 31.75 3.09 2.11
1.36 0.1 0.0 0.0 3.12 0.44 0.05
Aop_g06385 (LAX1)
12.03 7.03 0.19 0.34 48.93 11.16 2.1
9.76 7.87 4.09 4.42 22.74 6.29 5.21
85.56 68.0 0.54 0.88 224.22 19.05 2.61
7.05 1.01 0.44 0.27 12.54 1.19 1.78
6.98 4.53 0.93 0.88 7.16 2.2 2.08
Aop_g07303 (AVP1)
61.24 37.68 15.63 11.52 114.01 36.36 22.78
Aop_g07586 (PIP5K9)
2.69 0.99 0.94 0.58 5.12 0.77 0.59
2.62 0.36 0.0 0.01 8.77 1.62 0.0
8.8 5.5 2.26 3.53 14.35 4.31 2.42
11.41 10.63 6.59 5.08 29.79 6.34 3.64
22.68 16.44 14.06 11.84 47.81 20.56 11.8
2.18 1.06 0.35 0.12 3.85 0.48 0.08
11.47 9.71 7.28 6.79 16.45 9.58 6.63
5.7 0.71 0.0 0.01 13.34 1.63 1.3
Aop_g08939 (DFB)
6.07 3.95 1.04 1.22 12.67 2.67 2.36
3.68 1.27 0.21 0.03 5.95 1.08 0.52
Aop_g09286 (EXO70G1)
2.82 1.12 0.58 0.5 5.07 0.96 1.01
2.58 1.56 0.62 0.68 3.09 0.87 0.6
Aop_g09539 (PPa1)
93.31 104.44 66.94 59.46 191.72 79.49 50.84
8.31 6.24 4.74 4.5 15.71 4.81 4.05
Aop_g09954 (AGL2)
48.96 33.56 10.79 9.85 66.61 12.82 0.49
12.59 12.54 5.03 4.49 21.49 7.86 7.26
1.48 0.42 0.02 0.09 3.77 1.28 0.3
8.11 6.33 3.84 3.11 13.87 3.92 2.49
Aop_g10815 (KCS4)
4.65 3.12 2.88 2.33 9.88 3.5 2.37
1.71 0.2 0.0 0.03 4.18 0.72 0.32
5.56 3.81 3.24 3.37 8.77 3.8 3.38
34.67 29.17 21.99 20.53 66.2 24.05 24.02
3.65 2.28 0.45 0.57 8.81 3.3 1.66
10.22 8.82 5.64 5.4 20.49 8.09 7.88
0.82 0.09 0.15 0.04 2.38 0.39 0.26
19.22 17.61 14.62 14.51 29.56 14.5 13.83
6.22 2.09 0.46 0.33 11.21 2.24 1.88
Aop_g11908 (PLDDELTA)
15.84 12.14 9.74 8.98 27.94 9.67 5.87
10.41 7.37 1.82 2.16 10.8 3.11 2.41
Aop_g12582 (ATSIK)
6.09 0.49 0.06 0.03 10.16 1.76 1.52
Aop_g12583 (GATA9)
9.97 0.41 0.17 0.12 23.42 3.46 3.57
Aop_g13446 (GGH1)
16.6 14.62 9.4 8.11 37.83 9.96 6.66
13.99 4.13 2.95 1.97 28.22 5.71 4.75
6.64 0.79 0.03 0.06 13.97 1.11 0.61
2.74 1.44 1.45 1.19 4.64 1.08 0.16
1.64 0.87 0.67 0.6 3.53 0.83 0.53
Aop_g14139 (LACS4)
26.1 18.35 11.62 11.0 49.16 8.16 4.15
40.44 32.17 18.18 22.35 51.1 18.39 16.79
10.35 7.42 5.73 5.35 20.23 6.51 4.53
Aop_g14196 (YDA)
9.21 5.9 5.67 5.27 16.49 5.31 4.01
19.05 7.21 4.84 2.88 45.21 8.55 8.94
21.65 9.6 4.16 2.97 44.41 13.21 0.75
12.03 7.57 0.86 0.79 16.71 4.39 0.96
Aop_g16124 (NUDX1)
58.57 49.16 27.25 23.68 134.96 51.09 39.83
58.41 40.65 0.78 0.56 135.71 14.24 1.2
7.79 3.63 1.17 0.96 6.48 2.65 1.97
16.27 16.19 9.63 8.94 30.89 14.27 12.46
2.51 1.75 1.65 1.64 4.92 1.58 1.51
6.95 3.3 0.69 0.53 16.95 2.53 1.07
28.56 14.8 7.15 9.16 42.22 10.34 11.39
12.72 5.08 2.88 3.08 22.02 4.01 2.08
Aop_g18671 (GID1C)
14.73 12.86 5.54 5.96 17.88 7.32 2.25
2.77 2.29 0.35 0.06 4.19 1.58 1.03
Aop_g19008 (STI)
1.79 1.09 0.15 0.13 3.42 0.85 0.18
Aop_g19027 (CKI1)
2.29 1.16 0.74 0.58 3.85 0.36 0.11
8.92 6.09 1.41 0.63 10.76 1.71 2.05
112.95 104.96 1.15 0.92 447.29 76.81 3.81
33.79 13.01 2.8 3.11 99.51 20.14 3.16
4.09 2.74 1.02 1.22 8.04 1.55 0.51
45.87 46.54 30.51 30.48 98.96 33.89 36.43
6.55 6.14 1.08 0.11 24.62 3.15 1.5
Aop_g20969 (ATY53)
0.73 0.43 0.08 0.03 2.97 0.43 0.04
12.34 5.15 1.42 1.3 26.66 4.33 2.61
Aop_g21950 (TPI)
156.83 130.46 62.54 51.58 367.45 106.6 115.82
1.29 0.55 0.42 0.0 3.48 0.66 0.42
4.45 4.03 2.0 1.9 7.86 2.66 2.17
5.46 3.68 1.39 1.41 6.26 2.27 2.29
8.03 5.58 3.17 1.73 26.14 5.42 5.62
18.82 14.66 2.53 1.6 33.39 3.81 0.68
8.98 6.83 6.71 7.25 15.99 6.89 5.93
38.0 26.25 17.14 16.05 52.98 17.26 10.61
8.35 8.28 5.74 5.53 12.6 6.91 6.06
11.15 2.7 2.73 2.6 30.16 8.24 2.59
46.16 41.03 20.76 22.68 64.94 22.19 8.12
Aop_g29166 (RSW1)
70.31 52.04 23.49 21.5 86.14 40.4 25.94
4.24 3.11 1.35 1.02 11.19 3.81 1.95
94.88 82.01 37.32 28.25 239.38 65.39 72.03
6.88 2.61 0.83 0.85 14.39 3.73 0.57
9.95 6.02 2.15 1.77 18.0 8.09 5.43
Aop_g30789 (PPD2)
5.92 4.53 3.82 2.46 7.68 2.84 1.43
244.09 216.81 4.4 2.04 930.6 66.28 11.64
83.43 17.27 4.02 4.91 171.0 11.47 4.24
0.91 0.72 0.14 0.52 2.32 0.48 0.18
5.16 4.91 2.89 3.84 10.48 4.13 3.7
6.01 0.5 0.09 0.08 13.43 1.8 0.91
139.28 127.68 85.21 96.61 219.06 118.25 77.69
17.17 17.14 12.2 12.1 24.43 13.78 12.48
Aop_g37288 (EIF4B2)
31.03 25.85 17.29 16.55 48.43 23.87 16.43
4.76 3.28 2.32 2.16 6.36 2.43 1.01
8.97 5.78 1.37 0.4 23.74 8.47 2.69
8.32 8.8 4.62 3.99 14.52 5.76 4.28
1.93 1.58 0.95 0.39 3.79 0.87 1.2
7.09 4.33 0.34 0.73 7.93 2.25 1.24
175.49 166.51 95.12 72.44 229.33 94.23 61.78
13.37 11.55 6.82 6.0 18.27 7.56 5.75
Aop_g57933 (ERL1)
1.73 1.43 0.08 0.09 6.96 0.77 0.51
Aop_g58435 (KCS11)
3.66 4.01 0.08 0.28 8.41 1.27 1.56
32.64 25.24 23.26 24.01 47.01 23.85 20.42
5.08 7.39 3.64 2.18 10.89 3.6 4.02
5.93 4.66 3.18 2.9 15.37 3.61 3.68
Aop_g62365 (NF-YA7)
5.01 4.12 0.86 1.01 7.97 2.45 0.96
Aop_g62521 (CHL)
13.68 4.99 1.85 1.89 22.61 3.26 3.62
3.1 1.9 0.48 0.3 4.19 0.93 0.97
12.58 5.84 2.58 3.37 20.46 3.64 3.4
Aop_g68497 (SCO3)
5.86 5.0 1.91 2.08 11.31 5.32 4.13
9.16 6.91 2.62 1.84 22.63 1.45 0.7
8.48 8.54 5.16 5.22 19.62 7.95 5.18
9.23 5.08 3.77 3.18 12.54 3.5 2.48
4.23 4.35 2.89 2.66 8.46 3.6 3.05
3.76 3.5 2.33 2.25 6.47 2.36 1.43

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)