Heatmap: Cluster_258 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g030000.1.1 (Solyc00g030000.1)
3.01 - - - - 0.25 - - -0.81 4.56 -0.87 - - - - - - - - -2.91 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g056650.1.1 (Solyc01g056650.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.01 - - - 3.15 4.09 - - - - -
Solyc01g058660.1.1 (Solyc01g058660.1)
0.92 - - - - 0.62 - - - 1.94 1.61 1.44 3.37 1.61 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.05
Solyc01g058707.1.1 (Solyc01g058707.1)
2.92 - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - - - 3.02 - - -
Solyc02g061920.2.1 (Solyc02g061920.2)
- - - - - - - - - - - - - - 2.47 - 1.04 - - - 2.65 0.96 - - - - 0.71 2.93 2.62 1.45 - - - -
Solyc02g073578.1.1 (Solyc02g073578.1)
- - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - 0.81 - 3.27 - 2.68 - -
Solyc03g033940.1.1 (Solyc03g033940.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051720.1.1 (Solyc03g051720.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.79 - - - - - 4.76 - - - - - -
Solyc03g065230.1.1 (Solyc03g065230.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - - 4.77 - - - - -
Solyc03g071830.1.1 (Solyc03g071830.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 2.99 - - - - - -
Solyc03g078847.1.1 (Solyc03g078847.1)
- - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g093715.1.1 (Solyc03g093715.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.84 - - - - - - - - 2.45 - - - - - -
Solyc04g005750.1.1 (Solyc04g005750.1)
- - - - - 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.72 - - - - - - - - - -
Solyc04g017757.1.1 (Solyc04g017757.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017840.1.1 (Solyc04g017840.1)
- - - - - - - - - - - - 4.05 3.85 - - - - - - - - - - - - - 1.57 - - - - - -
Solyc04g018000.2.1 (Solyc04g018000.2)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025030.1.1 (Solyc04g025030.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 3.11 - - - - 1.96 - - - - - - - 2.44 - -
Solyc04g025375.1.1 (Solyc04g025375.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g049017.1.1 (Solyc04g049017.1)
- - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - - - - - - - - 1.27 - 3.3 1.66 - 3.23 - - - -
Solyc04g078020.2.1 (Solyc04g078020.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc05g014870.2.1 (Solyc05g014870.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g026200.1.1 (Solyc05g026200.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g041245.1.1 (Solyc05g041245.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.9 2.08 - - - - - -
Solyc05g042073.1.1 (Solyc05g042073.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - -
Solyc05g050406.1.1 (Solyc05g050406.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g009410.2.1 (Solyc06g009410.2)
4.23 - - - - 0.04 - - - - - 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g009867.1.1 (Solyc06g009867.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - 4.65 - - -
Solyc06g033990.1.1 (Solyc06g033990.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.28 - 4.87 - - - -
Solyc06g072193.1.1 (Solyc06g072193.1)
- - - - - - -0.57 - -1.16 2.37 - - -0.55 - -0.52 - -0.95 - -1.82 - - -2.37 -2.33 -1.65 -2.65 3.58 1.59 2.46 1.61 -1.54 -0.26 - - -
Solyc07g021060.1.1 (Solyc07g021060.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc07g021405.1.1 (Solyc07g021405.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032615.1.1 (Solyc07g032615.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.3 -0.23 - - 3.98 1.97 3.46 - - - - -
Solyc07g039260.2.1 (Solyc07g039260.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 4.7 - - - - -
Solyc07g045260.2.1 (Solyc07g045260.2)
- - - - - 0.99 -1.21 - 0.7 - - - - - - - - - - - 1.34 - - 2.59 0.0 1.62 0.81 0.77 3.35 - 0.08 - - 1.38
Solyc08g015631.1.1 (Solyc08g015631.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc08g029057.1.1 (Solyc08g029057.1)
- - - - 4.32 - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g059717.1.1 (Solyc08g059717.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.58 3.68 2.11 - 3.45 - - -
Solyc09g050060.1.1 (Solyc09g050060.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.15 3.56 3.73 - - - - -
Solyc09g055140.1.1 (Solyc09g055140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - 3.92 2.18 2.75 - - - - -
Solyc09g055800.1.1 (Solyc09g055800.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc09g057800.1.1 (Solyc09g057800.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.66 - 1.63 - - - - 3.68 2.79 3.0 - - - - -
Solyc09g057850.1.1 (Solyc09g057850.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.51 2.98 - - - - - - - 1.73 - - - - - - -
Solyc09g064980.2.1 (Solyc09g064980.2)
- - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - -
Solyc09g098480.1.1 (Solyc09g098480.1)
- - - - 3.75 - - - - - 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - 2.17 1.9 - - - - - -
Solyc10g018830.1.1 (Solyc10g018830.1)
- - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.22 - - - 3.28 - - - - - -
Solyc10g047160.1.1 (Solyc10g047160.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc10g050518.1.1 (Solyc10g050518.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc10g054450.1.1 (Solyc10g054450.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.79 - - - - - - - 2.5 - - - 4.42 - -
Solyc10g055010.2.1 (Solyc10g055010.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc11g013720.1.1 (Solyc11g013720.1)
- - - - - - - - - - - - 2.27 3.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 1.18 - - - - - -
Solyc11g018540.2.1 (Solyc11g018540.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc11g019890.2.1 (Solyc11g019890.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97 - - 4.91 - - - - - - -
Solyc11g028185.1.1 (Solyc11g028185.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g030640.1.1 (Solyc11g030640.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc11g040090.1.1 (Solyc11g040090.1)
- - - 4.71 - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g042770.1.1 (Solyc11g042770.1)
- - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.92 4.52 - - - - -
Solyc11g042960.1.1 (Solyc11g042960.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc12g017720.1.1 (Solyc12g017720.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g019751.1.1 (Solyc12g019751.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - -
Solyc12g035925.1.1 (Solyc12g035925.1)
- - - - - - - - - - - 3.83 - - - - - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - 3.45 -
Solyc12g038013.1.1 (Solyc12g038013.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.46 3.58 - - - - - -
Solyc12g040533.1.1 (Solyc12g040533.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.69 - - - - - - - - 3.96 2.27 0.35 2.58 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.