Heatmap: Cluster_159 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g005950.3.1 (Solyc01g005950.3)
0.01 0.14 0.19 1.11 0.12 -0.8 0.17 -0.36 -0.04 -0.07 -0.51 -0.8 -0.53 -0.67 0.68 0.63 0.46 -2.57 -2.23 -0.64 -0.66 0.38 0.2 0.3 0.28 -0.24 -0.03 0.17 0.17 0.39 0.37 0.34 -1.36 0.12
Solyc01g006630.3.1 (Solyc01g006630.3)
-0.37 0.86 0.29 1.79 -0.73 -0.38 1.0 0.25 -0.19 -0.4 -0.18 -0.19 0.13 0.1 0.36 -0.42 -0.3 -6.57 -7.0 -1.93 -1.31 0.16 0.34 0.2 -0.13 -1.04 0.52 0.24 0.13 0.2 0.35 -0.21 -2.45 -0.06
Solyc01g007150.3.1 (Solyc01g007150.3)
0.38 0.18 -0.56 0.98 -0.72 -0.99 0.27 -0.47 -0.01 -0.42 -0.44 -0.51 -0.6 -0.97 -0.04 -0.45 -0.6 -4.05 -3.78 -0.7 -0.27 0.7 0.69 0.72 0.59 -0.46 0.61 0.64 0.49 0.66 0.65 0.62 -2.1 0.1
Solyc01g009150.3.1 (Solyc01g009150.3)
0.22 0.31 0.07 1.44 -1.33 -0.58 0.28 -0.17 -0.07 -0.15 -1.07 -1.12 -0.95 -1.11 -0.37 -0.66 -0.64 -4.62 -4.99 -0.32 -0.16 0.73 0.34 0.61 0.89 -0.57 0.0 0.33 0.53 0.46 0.56 0.71 -0.02 -0.09
Solyc01g010310.3.1 (Solyc01g010310.3)
-0.13 1.68 0.79 2.12 -1.54 -2.28 1.44 -0.65 -0.12 -1.23 -1.28 -0.76 -1.35 -0.87 -2.25 -4.73 -4.13 - - -2.99 -2.46 0.52 -0.42 0.26 0.54 -2.05 1.02 0.83 0.49 0.9 0.51 0.46 -5.6 0.04
Solyc01g011040.3.1 (Solyc01g011040.3)
0.12 -0.33 -0.24 1.13 -1.32 -1.06 -0.52 -0.48 0.22 -0.22 -0.93 -0.89 -0.76 -0.6 0.23 -0.1 -0.05 -3.31 -3.04 -0.87 -0.9 0.85 0.74 0.9 0.75 -0.4 0.36 0.52 0.43 0.71 0.72 0.68 -1.11 -0.21
Solyc01g034020.3.1 (Solyc01g034020.3)
0.06 0.39 0.25 1.07 -0.26 -0.5 0.61 -0.05 0.16 -0.51 -0.38 -0.44 -0.36 -0.24 -0.03 -0.35 -0.43 -5.44 -4.71 -0.18 -0.5 0.37 0.33 0.35 0.29 -0.26 0.46 0.41 0.39 0.4 0.35 0.15 -0.93 0.11
Solyc01g066900.3.1 (Solyc01g066900.3)
-0.29 1.41 0.02 0.72 -0.01 -0.64 1.42 0.8 0.08 -1.33 -0.21 1.32 -0.87 0.59 -1.3 -2.34 -1.8 - -10.54 -2.71 -1.78 0.41 0.7 0.41 0.22 -2.04 0.37 0.01 -0.33 0.16 0.58 -0.55 -1.82 0.31
Solyc01g067730.3.1 (Solyc01g067730.3)
-0.78 0.68 -0.35 1.16 -0.01 -0.77 -0.62 -0.24 0.31 -0.4 -0.74 -0.9 -1.37 -1.05 0.31 -0.02 0.03 -7.35 -7.45 -0.46 -0.67 0.5 0.29 0.63 0.81 -0.6 0.5 0.46 0.9 0.42 0.42 0.45 0.29 -0.73
Solyc01g067900.3.1 (Solyc01g067900.3)
-0.36 -1.03 -0.73 0.06 -1.54 -0.24 0.15 0.04 0.63 -0.33 -0.75 -0.87 -1.37 -1.21 -0.84 -0.77 -1.07 -9.51 -12.17 -0.0 -0.71 0.78 0.79 0.93 0.82 -0.02 0.96 0.87 0.54 0.92 0.85 0.47 0.11 -0.44
Solyc01g079340.3.1 (Solyc01g079340.3)
0.42 -0.14 -0.51 0.27 -0.04 -0.28 1.1 -0.12 0.17 -0.28 -0.07 -0.05 -0.22 -0.22 -0.2 -0.87 -0.71 - - -0.86 0.02 0.42 0.68 0.5 0.28 -0.23 0.31 0.22 -0.01 0.36 0.48 0.19 -0.86 0.69
Solyc01g079500.3.1 (Solyc01g079500.3)
-0.09 0.3 -0.11 1.29 -0.44 -1.0 0.31 -0.25 0.62 -0.08 -0.31 -0.49 -0.11 -0.06 -0.02 -0.76 -0.66 -3.38 -3.22 -1.26 -0.52 0.51 0.56 0.76 0.59 -0.44 0.46 0.54 0.28 0.45 0.55 0.29 -3.99 -0.45
Solyc01g080350.3.1 (Solyc01g080350.3)
-0.09 0.13 0.96 0.35 0.41 -0.21 -0.4 -0.4 0.11 -0.08 -0.59 -0.84 -0.51 -0.86 0.59 0.39 0.28 -3.2 -2.47 -1.36 -1.41 0.63 0.33 0.44 0.49 -0.66 0.28 0.4 0.31 0.59 0.65 0.57 -3.41 -0.24
Solyc01g081380.3.1 (Solyc01g081380.3)
-0.09 -0.24 0.84 0.9 -0.25 -0.81 0.36 -0.21 0.58 -0.24 -0.94 -0.58 -0.98 -0.9 0.38 -0.08 -0.01 -5.68 -5.84 -1.23 -1.24 0.67 0.47 0.61 0.49 -0.98 0.59 0.56 0.37 0.67 0.88 0.35 -2.5 -0.46
Solyc01g087600.3.1 (Solyc01g087600.3)
0.08 -0.91 0.43 0.15 -0.29 -0.58 0.54 -0.4 0.09 -0.44 -0.3 -0.29 -0.08 -0.07 -0.52 -1.12 -1.26 -11.11 - -1.01 0.18 0.64 0.85 0.96 0.68 -0.81 0.54 0.51 0.29 0.56 0.59 0.36 -1.63 0.64
Solyc01g088310.3.1 (Solyc01g088310.3)
-0.19 1.06 -0.73 0.53 0.27 -0.77 0.2 -0.36 -0.35 -1.15 0.03 0.16 0.05 0.05 -1.19 -1.69 -1.53 - -9.81 -0.53 0.52 0.57 0.57 0.71 0.6 -1.3 0.54 0.59 0.43 0.68 0.59 0.38 -1.85 0.12
Solyc01g091530.3.1 (Solyc01g091530.3)
-0.64 -0.73 0.43 0.94 0.18 -0.91 0.23 0.07 -0.3 -2.09 -0.6 -0.71 -2.18 -0.68 -2.21 -4.43 -5.5 -15.12 - -3.19 -0.87 1.06 1.03 1.12 0.96 -4.28 1.14 1.0 0.58 1.14 1.03 0.62 -0.17 -0.3
Solyc01g091640.3.1 (Solyc01g091640.3)
-0.91 -0.27 -1.02 0.95 -0.55 -0.58 0.48 0.15 0.25 -0.5 -0.2 -0.07 -0.35 -0.2 -0.2 -1.26 -1.04 -6.38 -7.03 -0.87 0.12 0.8 1.01 1.08 0.87 -1.1 0.38 0.44 0.3 0.49 0.62 0.24 -0.58 -0.49
Solyc01g093970.4.1 (Solyc01g093970.4)
-0.01 -0.43 0.04 0.78 -0.27 -1.23 0.15 -0.52 0.55 -0.4 -0.07 -0.32 -0.4 -0.55 0.19 -0.4 -0.3 -1.06 -2.0 -0.29 -0.26 0.47 0.59 0.64 0.37 0.09 0.36 0.41 0.17 0.48 0.52 0.24 -1.32 -0.01
Solyc01g094190.3.1 (Solyc01g094190.3)
-0.7 0.2 -0.8 0.32 -0.82 -0.67 0.22 0.46 0.35 -0.67 -0.68 -0.65 -0.36 -0.74 0.36 -0.02 0.06 -8.65 -8.93 -1.75 -0.81 0.88 0.95 0.78 0.6 -1.87 1.04 0.72 0.37 0.84 0.95 0.25 -1.5 -1.31
Solyc01g095290.3.1 (Solyc01g095290.3)
-0.31 -0.11 -1.16 1.03 -0.02 -0.68 0.3 0.16 -0.19 -0.45 -0.04 -0.04 -0.34 -0.68 0.02 -0.44 -0.31 -7.2 -9.06 -0.65 -0.07 0.64 0.73 0.85 0.71 -0.02 0.34 0.35 0.27 0.52 0.63 0.23 -1.01 -0.57
Solyc01g098900.3.1 (Solyc01g098900.3)
0.2 -0.48 0.24 1.42 -0.69 -1.1 -0.88 -0.61 0.25 -0.57 -0.63 -0.42 -0.26 -0.32 0.14 -0.18 -0.33 -4.36 -5.23 -0.25 -0.19 0.58 0.52 0.64 0.6 -0.38 0.33 0.47 0.43 0.56 0.57 0.38 -1.03 0.01
Solyc01g099290.3.1 (Solyc01g099290.3)
-0.69 -1.03 -1.98 -2.22 -1.9 -1.22 0.61 -0.94 1.1 -0.63 0.14 1.16 1.04 1.13 -1.27 -2.25 -2.09 -7.08 -7.48 -3.51 -0.37 0.95 0.3 0.56 0.92 -3.73 0.11 0.46 1.02 0.95 0.72 0.99 -3.83 -0.26
Solyc01g100360.3.1 (Solyc01g100360.3)
-0.97 1.0 -0.69 1.13 -0.85 -1.08 -0.41 0.07 -0.38 -1.31 -0.65 -0.3 -1.22 -0.96 0.37 -0.28 -0.44 -4.07 -3.35 -0.29 -0.97 0.75 0.57 1.02 0.98 -0.69 0.57 0.71 0.86 0.65 0.58 0.35 -1.42 -0.9
Solyc01g101040.3.1 (Solyc01g101040.3)
-0.28 -0.42 1.0 1.0 0.22 -0.83 -0.4 -0.35 0.23 -0.82 -0.33 -0.44 -0.63 -0.71 0.03 -0.1 -0.35 -9.46 -10.0 -1.03 -0.37 0.4 0.69 0.75 0.58 -0.25 0.47 0.59 0.42 0.27 0.32 -0.05 -1.31 0.69
Solyc01g103940.3.1 (Solyc01g103940.3)
-0.69 -1.61 -0.61 -0.53 0.56 -0.64 -0.51 -0.8 -0.27 -0.62 0.23 -0.14 0.17 0.03 0.22 0.3 0.26 -3.85 -4.99 -0.95 -0.12 0.75 0.16 0.68 0.8 -1.15 0.4 0.74 0.55 0.78 0.59 0.93 -2.21 0.08
Solyc01g104340.2.1 (Solyc01g104340.2)
-1.23 0.79 -0.8 -0.63 -1.4 -0.81 2.06 0.65 0.95 0.11 -0.01 -0.87 0.59 -0.09 0.45 -0.47 -0.6 -3.03 -3.78 -3.37 0.65 0.17 0.2 -0.03 -0.44 -0.27 0.15 0.09 0.44 0.11 0.55 -0.13 -3.55 -1.19
Solyc01g104345.1.1 (Solyc01g104345.1)
-1.06 0.06 -1.99 -1.22 1.04 0.25 0.35 0.24 0.18 0.3 0.26 -0.41 1.35 1.32 0.66 -0.16 -0.5 -2.3 -3.82 -4.55 0.56 -0.06 -0.23 -0.1 -1.04 -0.16 0.33 0.28 0.01 0.13 0.62 0.09 -2.75 -1.69
Solyc01g104680.3.1 (Solyc01g104680.3)
-0.37 -0.19 -0.52 -0.74 -2.0 -1.61 -1.14 -0.84 -0.24 -1.76 -0.22 0.04 -1.17 -0.44 -1.26 -1.56 -1.38 -4.88 -5.1 -0.4 0.52 1.13 0.98 1.29 1.47 -2.31 0.76 0.91 1.05 0.86 0.87 0.66 -0.76 -0.31
Solyc01g105060.3.1 (Solyc01g105060.3)
0.47 1.01 -0.48 1.25 -1.54 -0.75 -0.74 0.18 0.1 -0.7 -1.05 -1.01 -1.83 -1.62 0.45 -0.02 -0.13 -5.15 -4.47 -1.53 -1.92 0.71 0.77 0.82 0.69 -1.83 0.91 0.49 0.57 0.62 0.75 -0.01 -0.06 -0.56
Solyc01g106580.2.1 (Solyc01g106580.2)
-0.56 -0.16 -1.57 1.29 -0.55 -1.02 -0.27 -0.3 -0.13 -1.41 -0.66 -0.24 -1.38 -1.15 -1.09 -2.63 -2.16 -8.68 -9.62 -1.92 -0.49 1.15 1.02 1.18 1.1 -3.0 0.67 0.86 0.81 1.03 1.01 0.94 -0.32 -0.58
Solyc01g106585.1.1 (Solyc01g106585.1)
-1.08 -0.01 -0.82 1.56 -1.42 -0.81 -0.75 -0.23 -0.69 -1.25 -1.21 -0.56 -1.71 -1.73 -0.19 -1.5 -1.52 - -8.54 -2.64 -0.29 1.03 1.37 1.2 1.13 -3.18 0.92 0.82 0.69 1.03 0.8 0.8 -0.04 -1.6
Solyc01g106590.3.1 (Solyc01g106590.3)
-0.72 0.04 -1.64 0.76 -0.68 -0.55 0.47 0.25 0.51 -0.35 0.11 0.01 0.27 0.08 0.07 -1.02 -0.97 -4.93 -5.41 -1.36 -0.43 0.67 0.68 0.65 0.51 -0.48 0.6 0.47 0.35 0.67 0.65 0.4 -1.57 -0.34
Solyc01g108580.3.1 (Solyc01g108580.3)
0.59 -0.38 -0.61 0.94 -0.45 -0.8 -1.2 -0.77 0.05 -0.8 -0.23 -0.19 -0.61 -0.58 -1.34 -1.45 -1.63 - -9.23 0.03 0.16 0.83 0.66 0.74 0.93 -0.7 0.25 0.49 0.56 0.81 0.74 0.92 -0.59 0.44
Solyc01g109830.3.1 (Solyc01g109830.3)
-0.72 0.9 -1.4 -0.36 -0.84 -0.5 0.33 -0.1 -0.04 -0.79 -0.52 -0.76 -0.77 -0.67 -0.57 -1.15 -0.95 -5.6 -5.4 -1.18 -1.4 0.91 0.76 0.81 0.85 -0.95 0.92 0.92 0.78 0.93 0.89 0.71 0.24 -0.71
Solyc01g109930.3.1 (Solyc01g109930.3)
0.09 0.08 0.17 -0.18 -0.34 -0.77 0.48 0.22 0.44 -0.61 -0.43 -1.47 -0.41 -0.85 -0.02 -0.98 -0.8 -9.17 -8.59 -1.5 -0.81 0.95 0.47 0.64 0.53 -1.2 0.64 0.89 0.74 1.02 1.01 0.75 -2.16 -0.44
Solyc01g110120.3.1 (Solyc01g110120.3)
0.47 -0.9 1.25 1.16 -0.39 -0.62 -1.69 -0.51 -0.57 -0.5 -1.4 -0.84 -1.85 -1.75 -0.74 -0.85 -0.78 -3.24 -3.16 -0.33 -0.13 0.74 0.78 0.76 0.67 0.44 0.59 0.62 0.4 0.73 0.64 0.46 -0.89 -0.05
Solyc01g111370.3.1 (Solyc01g111370.3)
0.06 -1.36 0.23 0.71 -1.49 -0.73 -0.56 -0.29 -0.92 -0.45 -0.42 -0.29 -0.38 -0.43 -0.21 -0.19 -0.27 -6.61 -6.31 -0.08 0.36 0.74 0.42 0.51 0.54 -0.21 0.74 0.72 0.65 0.89 0.78 0.62 -0.57 -0.42
Solyc01g111760.3.1 (Solyc01g111760.3)
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Solyc01g111830.3.1 (Solyc01g111830.3)
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Solyc02g031770.3.1 (Solyc02g031770.3)
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Solyc02g032330.3.1 (Solyc02g032330.3)
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Solyc02g071160.3.1 (Solyc02g071160.3)
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Solyc03g006320.1.1 (Solyc03g006320.1)
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Solyc03g034417.1.1 (Solyc03g034417.1)
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Solyc03g082590.3.1 (Solyc03g082590.3)
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Solyc04g082340.3.1 (Solyc04g082340.3)
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Solyc04g082640.3.1 (Solyc04g082640.3)
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Solyc04g082670.3.1 (Solyc04g082670.3)
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Solyc05g005100.3.1 (Solyc05g005100.3)
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Solyc05g012680.3.1 (Solyc05g012680.3)
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Solyc05g018520.3.1 (Solyc05g018520.3)
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Solyc05g052990.3.1 (Solyc05g052990.3)
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Solyc05g055300.1.1 (Solyc05g055300.1)
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Solyc06g010260.3.1 (Solyc06g010260.3)
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Solyc06g074467.1.1 (Solyc06g074467.1)
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Solyc06g076655.1.1 (Solyc06g076655.1)
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Solyc06g083380.3.1 (Solyc06g083380.3)
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Solyc07g005600.3.1 (Solyc07g005600.3)
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Solyc07g005940.3.1 (Solyc07g005940.3)
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Solyc07g006920.3.1 (Solyc07g006920.3)
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Solyc09g059570.3.1 (Solyc09g059570.3)
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-0.53 0.65 -0.32 0.94 -1.3 -0.95 -0.22 -0.61 -0.01 0.07 -0.46 -1.0 -0.03 -0.43 1.01 0.58 0.33 -3.74 -3.85 -1.41 -0.75 0.36 0.67 0.62 0.25 -0.38 0.72 0.58 0.33 0.36 0.44 -0.06 -1.99 0.16
Solyc11g071850.2.1 (Solyc11g071850.2)
0.07 -1.1 0.87 -0.27 -0.38 -0.81 0.17 -0.58 0.42 -0.52 0.44 0.9 0.44 0.31 -0.56 -0.92 -1.2 -9.7 -8.19 -0.89 -0.18 0.48 0.78 0.5 0.11 -1.16 0.52 0.43 0.25 0.37 0.68 0.05 -1.29 0.5
Solyc11g072690.2.1 (Solyc11g072690.2)
-1.26 0.31 -0.4 1.18 -1.18 -0.78 0.07 0.05 0.88 -0.22 -0.7 -0.87 -0.82 -1.08 -0.34 -1.08 -0.88 -2.7 -1.78 -2.14 -1.14 0.98 0.78 0.91 0.77 -2.05 0.65 0.65 0.41 0.96 0.95 0.59 -1.44 -0.62
Solyc12g017450.2.1 (Solyc12g017450.2)
-0.28 -0.87 0.43 1.36 -0.76 -0.81 0.12 -0.01 0.16 -0.8 -0.54 -0.46 -0.86 -0.98 -0.07 -1.02 -0.86 -8.05 -10.95 -1.34 -0.37 0.69 0.79 0.93 0.74 -0.96 0.56 0.71 0.43 0.74 0.66 0.28 -0.91 0.34
Solyc12g055800.3.1 (Solyc12g055800.3)
-0.47 -0.53 0.99 1.29 -1.14 -0.68 -0.76 -0.39 -0.85 -0.58 -1.63 -1.07 -1.96 -1.92 -0.87 -1.36 -1.11 -6.19 -6.53 -0.23 -0.24 0.97 0.82 1.0 1.08 0.15 0.66 0.82 0.62 0.94 0.78 0.63 -1.49 -0.54
Solyc12g096290.2.1 (Solyc12g096290.2)
-0.47 -0.58 -0.94 -0.45 -0.64 -0.55 0.75 -0.2 0.17 -0.26 -0.53 -1.02 -0.17 -0.79 0.16 -0.45 -0.43 -4.52 -5.25 -1.55 -0.09 0.85 0.7 0.78 0.83 -1.28 0.48 0.68 0.81 0.86 0.72 0.8 -0.74 0.08
Solyc12g096370.2.1 (Solyc12g096370.2)
-0.38 -0.1 -0.81 -0.01 0.07 -0.67 0.55 -0.94 0.19 0.08 0.01 -0.31 0.65 0.14 0.33 0.24 0.07 -7.98 -9.32 -1.98 -0.24 0.32 0.65 0.56 0.22 -0.94 0.62 0.55 0.43 0.43 0.45 0.38 -2.51 0.34
Solyc12g098360.2.1 (Solyc12g098360.2)
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Solyc12g098370.2.1 (Solyc12g098370.2)
-0.06 -2.01 0.6 0.99 0.38 -0.55 0.73 -0.74 0.14 -0.74 1.1 0.86 -0.17 -0.5 -1.49 -2.28 -2.7 - - -1.73 -0.38 0.61 0.71 0.61 0.42 -3.06 0.4 0.54 0.29 0.6 0.55 0.2 -1.01 0.31
Solyc12g099830.2.1 (Solyc12g099830.2)
-0.06 -0.59 1.79 1.54 0.64 -0.08 -0.38 -0.11 0.22 -0.46 -0.41 -0.96 -0.31 -0.68 -1.03 -2.85 -2.22 -8.46 -7.56 -4.08 -1.79 0.79 0.44 0.42 0.2 -2.85 0.68 0.32 0.03 1.11 0.95 0.09 -2.75 0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.