Heatmap: Cluster_6 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
- -5.09 -5.1 - - - -4.41 1.01 2.23 2.97 2.88 -4.73 - -4.96 0.72 - - - -4.93 -3.7 -4.89 -0.93 -3.19 - - -0.19 -3.37 - - 0.1 -2.02 0.44 -1.84 -1.92 -5.8 0.07 3.48 1.29 -4.17 -1.85 -4.24 - -2.76 -2.83
AT1G03190 (UVH6)
0.0 -0.36 -0.21 0.67 1.57 0.41 -1.22 -0.64 -0.22 -0.4 -0.25 -1.7 1.56 -0.45 0.34 0.06 0.31 0.75 0.31 -0.26 -0.07 -0.09 -0.41 -0.29 -0.77 -1.08 0.69 0.8 0.01 - -0.35 -0.7 -0.47 -0.39 0.32 0.23 -0.22 -0.89 0.61 -0.05 -1.04 -0.48 -0.57 -0.52
AT1G04950 (TAF6)
-0.18 -1.13 0.0 0.85 0.23 0.04 -0.73 0.77 0.63 0.19 0.33 0.11 -0.42 -0.23 0.23 -0.42 -0.01 0.43 0.35 0.16 0.19 0.04 -0.14 -0.1 -0.87 -1.52 0.9 0.66 0.08 -6.41 -0.16 -0.91 -0.12 -0.96 0.86 -0.17 -0.23 -0.8 0.42 -0.44 -0.93 -0.05 0.27 -0.17
-4.73 0.99 0.39 -0.93 - -0.24 -1.1 0.1 0.7 1.11 1.11 - -1.28 0.39 2.25 -0.66 -1.69 -1.84 -2.62 -1.39 -0.08 -2.0 -1.49 -1.48 -3.51 0.24 -1.59 -3.83 -2.57 -0.32 -0.23 0.76 -0.83 0.92 -0.28 0.65 2.69 0.48 -2.35 -0.25 -1.06 -3.84 -0.31 0.43
AT1G14510 (AL7)
0.14 -0.14 0.08 0.67 0.21 0.4 -1.32 0.34 0.1 0.26 0.17 -3.16 -1.55 -0.61 0.0 0.91 0.97 1.11 0.26 -0.35 0.21 -0.53 -0.43 -0.01 -0.58 -0.72 0.91 0.66 0.2 -5.25 -0.26 -0.58 -0.77 -0.49 0.82 -0.33 -0.43 -0.58 0.41 0.39 -0.6 -0.93 -0.42 -0.18
-0.09 -0.5 0.19 1.32 -4.85 0.34 -0.53 -0.93 -1.2 -2.81 -2.0 -2.49 - 0.51 0.59 -0.34 -0.02 0.85 0.69 0.34 0.67 0.26 0.24 0.42 -0.28 -1.54 1.3 1.39 0.52 - 0.51 -2.08 0.35 -2.56 0.17 -0.02 -2.97 -1.6 1.13 0.23 -0.39 0.12 0.19 -0.33
AT1G15700 (ATPC2)
0.06 -1.07 -0.76 0.15 2.07 -0.14 -1.66 -0.36 -0.84 -1.19 -1.3 0.97 -2.08 0.18 0.61 0.31 0.38 0.62 0.57 0.22 -0.41 0.26 -0.5 -0.17 -0.42 -0.9 0.86 0.89 0.03 -4.52 -0.52 -1.13 -0.92 -2.69 1.35 0.55 -0.46 -0.69 0.62 -0.62 -1.17 -0.55 -0.46 -0.29
0.33 1.92 -0.38 2.32 - 1.11 -1.53 -6.54 -5.43 -6.53 -4.92 -6.11 -5.8 -0.7 -2.6 0.55 1.38 1.99 1.35 0.54 0.32 0.28 -0.65 -2.33 -4.81 -2.49 1.31 1.06 -1.87 - -0.66 -2.88 -1.82 - 1.3 -1.69 -2.71 -3.52 0.94 -0.75 -0.86 -0.1 -0.23 -1.02
-0.03 -0.71 -0.15 0.44 -0.11 0.02 -0.99 0.39 0.31 0.5 0.37 -4.43 -3.7 0.11 0.61 0.32 0.39 0.46 0.28 -0.08 -0.11 0.62 -0.23 0.0 -0.33 -0.88 0.46 0.26 -0.09 -5.76 0.12 -0.14 -0.14 0.08 0.09 1.05 -0.34 -0.25 0.29 0.36 -1.11 0.19 -0.21 -0.42
0.64 -1.07 1.34 1.38 -0.84 0.93 0.33 -1.98 -1.91 -2.48 -2.12 -3.18 -6.57 0.73 0.31 -0.35 -0.43 -0.49 0.21 0.32 0.44 0.72 -0.16 1.0 0.87 -2.88 0.2 0.56 -0.66 - 0.36 -2.17 0.72 -1.66 0.47 -1.85 -2.4 -2.28 0.86 0.62 -0.44 0.89 0.17 -0.28
- - - - - - -3.84 - - -2.68 -4.2 - - -3.39 -3.29 - - - - - -0.62 - -3.44 - - - -3.24 - - - 3.92 - 0.43 -3.54 - 3.06 - - 4.13 - - - -2.65 -5.04
-0.44 -0.49 -0.69 0.34 -6.12 -0.61 -0.99 0.34 0.71 0.73 0.8 -1.2 2.74 -0.86 0.11 -0.49 -0.11 0.33 -0.29 -0.48 -0.13 -0.68 -0.42 -0.58 -1.13 -1.11 0.55 0.74 -0.67 -7.73 -0.63 -0.17 -0.57 -0.41 0.84 0.06 0.05 -0.48 0.21 -0.44 -0.68 -0.96 0.01 -0.29
-0.19 -2.08 -0.35 0.34 0.4 0.14 -0.5 -1.41 -1.05 -1.23 -1.31 -3.95 -3.9 1.13 0.36 -0.27 0.04 0.66 0.77 0.32 0.22 0.49 0.16 0.89 0.28 -0.32 0.97 1.21 0.31 -5.4 0.72 -4.47 0.39 -1.17 0.17 1.46 -6.42 -4.62 1.21 -0.51 -1.43 -0.25 -0.21 -1.13
0.98 -0.89 -1.36 0.61 - 0.73 -0.54 -0.16 0.37 0.45 0.14 - - -1.21 0.88 0.71 0.54 0.31 -0.4 -0.82 -0.7 -0.64 -0.81 -0.8 -0.98 1.46 0.1 0.42 -1.61 0.47 -0.57 -1.89 -1.29 0.91 -0.81 2.31 -2.44 -2.15 -0.09 0.26 0.33 -0.98 -0.28 -0.05
0.0 -1.41 0.96 0.6 0.43 0.52 -1.25 -2.71 -4.42 -5.23 -5.41 -6.01 - -0.62 -2.27 0.3 0.22 0.62 0.19 0.21 0.09 1.45 1.06 2.16 1.94 -0.42 0.84 0.8 -0.21 -9.06 -0.27 -1.8 -0.04 -3.22 0.1 -1.1 -0.48 -2.08 0.33 -1.14 -0.77 -0.73 0.39 -1.3
-0.01 0.31 0.02 1.23 - 0.54 -0.53 -0.9 0.16 0.08 0.06 -4.43 -6.34 -0.45 0.5 0.04 0.48 0.81 0.46 0.06 0.45 0.52 -0.0 -0.67 -1.12 -0.9 0.68 0.68 -0.16 -1.43 -0.06 -0.21 -0.38 -0.58 0.73 0.51 -0.14 -0.11 0.39 0.26 -0.6 -0.18 -0.12 -0.58
AT1G52740 (HTA9)
-0.03 -1.31 -0.15 0.36 0.9 -0.04 -1.55 1.19 0.63 0.62 0.55 -1.5 -2.58 -0.28 0.22 0.62 0.94 0.89 0.12 -0.14 -0.02 -0.08 -0.49 -0.56 -0.49 -1.27 0.86 0.76 -0.31 -6.67 -0.26 -0.87 -0.64 -0.98 0.47 0.08 -0.26 -0.6 0.59 -0.08 -0.31 -0.82 -0.78 -0.04
0.5 -0.62 0.37 1.14 1.88 0.74 -0.01 -0.8 -2.05 -2.4 -1.92 -5.54 -3.84 0.71 -0.05 0.33 0.53 0.5 0.55 0.24 -0.21 -0.95 -0.32 0.09 0.14 -1.14 0.72 0.66 0.87 -3.58 -0.19 -0.67 -0.57 -2.68 0.06 0.3 -0.8 -0.85 0.68 0.56 -0.36 -1.12 -0.77 -0.37
-0.52 0.92 -0.1 -1.89 -4.41 -1.7 -2.69 -1.68 -1.0 -0.87 -0.76 -4.34 2.14 0.22 1.28 -1.95 -4.44 -3.62 -1.5 -1.51 0.12 -0.16 -0.52 0.14 0.03 0.54 -0.27 -1.04 0.67 -4.47 -0.35 1.22 -0.44 1.26 -2.58 0.5 1.92 1.37 -1.02 0.89 -1.91 -1.8 -0.96 0.84
AT1G55870 (AHG2)
0.42 -0.18 -0.38 1.37 -7.02 0.66 -0.16 -0.99 -0.25 -0.18 -0.31 -4.58 -6.81 -0.58 0.16 0.36 0.53 0.95 0.33 0.15 0.31 -0.62 -0.48 -1.01 -1.21 -0.7 0.81 1.01 -0.04 -7.09 -0.49 0.71 -0.88 -0.04 0.87 -1.21 0.41 0.37 1.03 0.38 -0.32 -0.69 -0.17 -0.41
0.02 1.92 0.83 -2.16 -8.99 -1.78 -1.69 0.65 0.51 1.02 1.13 -2.78 -4.38 0.1 0.92 -0.52 -0.81 -0.8 -0.68 -0.67 0.55 0.19 -0.45 0.45 0.46 -0.53 0.07 0.55 0.47 -6.41 0.47 -3.36 -0.38 -0.63 -1.97 1.09 -5.87 -4.53 0.94 0.53 -1.01 -1.07 -0.73 1.11
AT1G59610 (DL3)
0.47 -0.26 0.4 -0.07 1.43 -0.04 -0.83 0.08 0.34 0.49 0.66 -1.05 1.89 0.26 0.46 -0.8 -0.56 -0.3 -0.07 -0.34 -0.17 0.09 -0.52 0.17 0.04 -0.82 -0.07 0.24 0.02 -3.37 -0.32 -1.38 -0.29 0.16 -0.67 -0.23 -1.34 -1.85 0.04 -0.19 -0.46 -0.55 0.07 0.2
0.56 3.26 -1.45 -0.44 - -1.63 -0.03 -0.78 0.21 -0.14 -0.11 -0.68 -3.81 -0.31 -0.56 -0.81 -1.08 -0.54 0.76 0.75 0.3 -0.05 0.3 -0.75 -0.8 -2.31 0.35 -0.66 -0.8 -3.43 -0.61 -4.8 -0.3 -2.47 0.88 -1.66 -4.02 - -1.02 0.9 0.16 0.39 0.74 0.94
0.25 -1.83 -0.61 1.6 - 0.99 0.32 -2.36 -2.38 -2.89 -2.67 -7.34 - -0.42 -1.0 0.64 1.07 0.98 1.17 0.55 0.12 0.78 0.05 -0.48 -0.27 -1.6 0.61 0.82 0.17 - -0.15 -0.63 -0.76 -3.75 0.89 0.14 -1.36 -1.05 1.06 1.25 -0.51 0.89 -0.81 -0.73
1.44 1.15 1.35 -0.33 0.59 0.73 -0.72 -0.65 -0.31 -0.17 -0.29 -1.6 -0.72 0.26 0.21 -1.07 -0.64 -0.5 -0.22 -0.31 -0.1 -0.05 0.25 0.38 0.52 -0.31 -0.04 -0.23 0.04 -1.83 -0.07 -0.79 0.13 1.67 -1.23 -0.69 -2.43 -1.82 -0.27 0.28 -1.39 -0.81 -0.16 0.05
0.02 -0.65 -0.0 0.89 -0.85 0.43 -1.42 0.25 -0.09 -0.18 -0.25 -1.29 -0.74 -0.29 0.24 0.27 0.46 0.78 0.46 0.02 0.19 -0.51 -0.23 -0.15 -0.89 -0.41 1.15 0.87 -0.05 -2.8 0.02 -0.76 -0.34 0.13 0.98 0.76 -0.78 -1.04 0.75 -0.04 -0.76 -1.31 -0.08 -0.33
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.84 - 2.04 2.98 - 1.24 -0.55 - - - 0.79 - 2.02 4.12 - - - - - - - - - 1.18
- - - - - - -1.49 0.7 3.15 3.23 3.02 - - -0.98 3.39 - - -3.29 - - - 0.05 - - - -0.42 - - - - -6.13 - - -0.0 - - - - - -2.64 - 0.01 -1.24 -2.84
-0.33 -0.96 -0.23 0.42 1.2 -0.07 -1.22 0.04 0.37 0.56 0.41 -4.16 -3.43 -0.41 0.33 0.7 0.71 0.64 0.28 -0.41 0.09 -0.86 -0.57 -0.14 -0.01 -1.08 0.56 0.64 0.09 -7.5 -0.23 -0.69 -0.44 0.28 1.25 0.25 -0.35 -0.92 0.23 0.1 -0.81 -1.18 0.22 0.35
-0.46 0.2 -0.18 -0.18 2.21 -0.46 -0.91 -0.52 0.5 0.81 0.59 -4.52 -0.48 -0.71 0.43 -0.27 0.01 0.28 -0.27 -0.37 0.49 0.1 -0.09 0.19 -0.25 -0.65 0.43 0.55 0.14 -7.39 -0.17 -0.85 -0.19 0.58 0.11 -0.98 -1.43 -0.8 0.29 -0.03 -0.83 -0.67 0.25 -0.23
0.01 -1.51 -1.3 1.16 - 0.44 -0.51 -0.37 -0.09 -0.56 -0.39 -1.13 -6.83 0.07 0.83 0.33 0.6 0.92 1.19 0.68 0.22 0.27 -0.13 -0.4 -0.47 -1.31 1.15 1.04 -0.04 -8.14 0.0 -1.09 -0.28 -1.59 1.02 -1.32 -0.89 -0.84 0.94 0.04 -0.97 0.14 0.19 -0.61
0.55 -0.31 -0.23 0.43 1.44 0.04 -1.83 -0.3 -0.49 -0.28 -0.67 -3.58 -5.79 0.5 0.12 0.4 0.67 0.94 0.47 -0.18 0.19 0.75 -0.86 -0.16 -0.5 -1.38 0.93 1.11 -0.21 -6.22 0.07 -0.39 -0.42 -2.06 0.46 0.29 -0.76 -0.5 0.77 -0.5 -1.3 0.19 0.38 -0.79
0.22 -0.4 0.66 1.59 -1.22 0.61 -0.56 -0.53 -0.22 -0.73 -0.64 -1.24 -2.45 -0.1 -0.13 -0.24 0.41 0.89 0.56 0.18 0.59 -0.12 -0.18 -0.18 -0.61 -1.37 1.23 1.2 0.01 -5.85 -0.25 -1.71 -0.28 -1.28 0.51 0.71 -3.1 -1.57 0.89 0.03 -0.74 -0.46 0.3 -0.44
-0.27 -0.79 -0.32 1.07 - 0.39 -0.74 -1.79 -1.72 -2.09 -1.98 -4.53 -4.18 0.57 -0.03 0.13 0.39 0.94 0.74 0.4 0.06 1.3 0.16 0.38 0.26 -0.13 1.12 1.09 1.15 -4.8 0.49 -1.12 -0.1 -1.44 0.02 -0.03 -1.57 -1.87 0.95 0.23 -1.02 0.85 -0.66 -1.12
AT2G26510 (PDE135)
0.27 1.04 0.4 0.65 -0.22 -0.01 -0.74 -0.72 -0.01 0.01 0.41 -1.89 2.91 -0.17 0.6 -0.12 0.28 0.49 0.0 -0.53 0.23 -0.77 -0.62 -0.29 -1.15 -2.63 0.18 -0.33 -1.67 - -1.2 -0.4 -0.8 -0.59 0.17 -5.07 -0.46 -0.45 -0.73 0.14 -0.58 -1.35 -0.74 0.62
AT2G33610 (CHB2)
-0.14 -0.48 0.12 0.93 -1.63 0.29 -1.52 0.66 0.58 0.49 0.6 -0.74 -0.04 -0.33 0.42 0.31 0.61 0.83 0.13 -0.32 0.12 1.02 -0.63 -0.34 -0.58 -1.36 0.91 0.78 -0.01 -9.76 -0.22 -2.28 -0.51 -1.15 0.57 0.54 -2.14 -2.86 0.44 -0.43 -1.03 0.23 0.02 -0.25
AT2G35550 (BBR)
-3.49 -2.89 -2.75 -4.18 0.79 -5.84 -3.52 -0.41 0.84 1.45 1.03 -7.48 -7.17 -3.03 1.47 -3.5 -4.79 -4.43 -3.62 -3.66 -0.65 -2.29 -1.79 -3.28 -3.13 1.51 0.13 1.2 -1.33 -2.45 -0.72 1.48 -1.29 0.87 -2.24 1.48 2.98 1.65 1.01 -1.04 -2.89 -4.99 -1.15 -2.14
AT2G35740 (INT3)
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AT3G13222 (GIP1)
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AT4G21585 (ENDO4)
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AT4G30935 (WRKY32)
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-0.54 -0.7 -0.68 0.76 -7.3 -0.06 -0.76 0.69 0.57 0.44 0.4 -3.63 -3.93 -0.64 0.78 0.16 0.56 0.74 -0.13 -0.15 0.42 0.37 -0.16 -0.58 -0.88 -0.91 1.15 1.0 0.39 -3.91 -0.01 -0.94 -0.38 -1.45 0.93 -0.15 -0.01 -0.54 0.78 0.14 -0.5 -0.09 0.21 -0.25
0.27 0.48 0.05 0.22 -6.27 -0.16 -1.07 0.34 0.85 0.48 0.75 -0.93 -4.36 0.18 0.91 -1.35 -0.55 0.03 0.33 0.12 0.22 0.33 0.28 0.11 -0.53 -2.16 1.02 0.37 0.13 - 0.1 -2.45 0.12 -0.72 -0.14 1.55 -2.99 -2.07 0.34 0.14 -0.36 -0.17 0.27 0.27
- - - - - - -2.71 1.6 2.4 3.0 2.69 - - -1.25 1.96 - -5.34 -4.63 - - -2.6 - -1.09 - - -0.41 -3.55 - - - -0.52 -0.44 -0.22 3.4 - 0.78 - - -2.7 - - - -0.93 -
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-0.37 -0.28 -0.58 -0.08 - -0.32 0.49 -0.48 0.03 -0.11 -0.2 -5.95 -9.31 0.09 -0.2 -0.14 -0.02 -0.28 0.26 0.25 -0.33 1.24 0.33 -0.48 0.19 1.32 -0.22 0.23 0.07 1.29 0.17 -1.27 0.25 -0.03 0.17 -1.45 -1.33 -1.55 0.22 0.31 -0.22 1.66 -0.6 -0.55
-0.06 -0.86 0.18 1.21 -1.39 0.81 -0.4 -1.65 -1.69 -2.03 -2.14 -2.55 -6.45 -0.19 -0.31 1.08 1.36 1.25 0.39 -0.05 0.03 0.56 -0.5 -0.3 -0.61 -1.13 0.82 0.94 0.04 - 0.03 -0.06 -0.54 -1.91 0.58 0.25 0.1 -0.06 0.83 0.75 -0.88 0.32 -0.79 -0.92
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-1.03 -0.26 1.38 - 0.06 0.33 -0.61 - - - - 2.98 - 1.46 3.14 - - -3.4 - - -2.14 - -2.09 0.75 - -2.7 -1.63 - - - -1.3 2.41 -1.59 - 1.68 0.39 -0.01 - - - -2.15 0.86 -1.38 -0.04
-0.09 -0.68 -0.2 1.16 -6.78 0.45 -0.7 -1.35 -1.32 -1.61 -1.53 -5.21 -6.83 0.04 0.39 0.48 0.86 1.04 0.66 0.1 0.44 0.95 -0.17 0.08 -0.45 -1.38 0.99 1.18 0.56 -9.39 0.32 -1.02 -0.35 -0.04 0.78 -0.67 -1.3 -0.94 1.09 0.01 -0.72 0.56 -0.07 -0.8
- - - -1.31 - - -2.4 -0.01 -0.25 0.68 -0.06 - - -0.3 4.04 - -4.01 -4.15 -1.89 - 0.1 - -0.57 -0.95 - -1.84 -1.07 -1.88 -1.95 - -2.23 0.59 -2.33 0.98 -1.73 0.57 3.38 0.15 -1.81 -2.55 - - -2.14 -
AT5G55090 (MAPKKK15)
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-0.85 -0.05 -0.86 -0.24 -4.2 -1.22 -1.79 0.17 0.92 0.73 0.94 -1.95 3.08 -0.72 0.4 -0.91 -0.69 -0.22 -0.39 -0.69 0.25 -0.09 -0.2 -0.23 -0.92 -0.68 0.46 0.4 0.06 - -0.67 -1.35 -0.6 0.09 -0.65 1.42 -0.99 -1.47 0.17 -0.92 -1.41 -0.92 -0.48 -0.41
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.97 -3.69 - - - 0.02 - -1.35 - - 5.11 -0.78 - - - -1.33 2.27 - -2.32
AT5G57380 (VIN3)
- - - - - - - -6.96 -5.47 -4.21 -5.21 -5.0 - - -1.26 - -6.16 -6.07 -6.09 -5.54 0.69 4.06 -2.22 0.29 1.42 2.65 -0.58 -0.92 0.29 2.89 -1.55 -4.21 -3.01 -1.61 0.16 1.22 -4.56 -6.75 -1.96 -2.47 - - - -4.15
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-0.68 -1.18 -0.62 -0.79 0.69 -0.53 -1.68 -1.13 -0.09 -0.2 0.13 -2.01 1.93 -0.29 0.77 -0.79 -0.74 -0.35 -0.24 -0.67 -0.14 -0.17 -0.65 -0.45 -0.13 -1.11 0.01 0.26 -0.0 -5.93 -0.44 1.58 -0.48 -0.49 0.06 0.68 1.25 1.69 0.17 -0.13 -1.49 -0.86 -0.32 -0.33
ATMG01030 (ORF106E)
- - - - - - 2.51 -1.87 -0.45 -1.55 - - - - - - -0.16 - - - -0.04 - - 0.01 -0.14 - -3.28 0.2 - - -4.95 -0.02 - - 0.36 4.83 - - -2.12 - -0.82 - - -1.85

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.