Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Aop_g10774 (CML42)
1.4 1.12 1.62 2.16 1.0 5.02 32.72
0.41 0.41 0.14 0.23 0.14 1.31 16.11
9.12 11.02 7.58 6.1 0.73 4.62 121.78
0.36 0.39 0.28 0.25 0.67 2.39 13.4
0.59 0.36 1.86 1.45 0.23 3.08 30.48
0.24 0.35 1.06 1.99 0.5 4.13 39.8
0.0 0.02 0.06 0.05 0.0 0.57 3.13
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 1.09 12.66
0.11 0.23 0.06 0.26 0.07 1.14 11.6
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.52 4.21
Aop_g33848 (OPR2)
0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.6 5.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 10.24
1.69 2.86 2.23 1.16 0.75 2.51 70.34
Aop_g33943 (ALDH10A9)
0.0 0.01 0.18 0.1 0.02 0.29 2.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 3.23
0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.47 4.09
Aop_g34334 (BI1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 8.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 15.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 4.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 11.74
1.43 5.01 5.01 2.67 2.14 4.67 90.57
0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.47 6.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.54 114.86
Aop_g37734 (RABA6b)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 3.02
0.27 0.49 0.0 0.0 0.0 1.25 11.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.76 9.17
0.0 0.0 0.14 0.12 0.0 0.49 2.72
1.03 0.79 1.19 0.82 0.15 0.72 26.83
Aop_g39130 (FDH)
0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.63 3.17
0.04 1.04 0.37 0.12 0.06 2.73 34.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 4.27
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.4 6.21
0.49 0.48 0.41 0.41 0.53 0.33 3.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 3.22
0.0 0.0 0.17 0.0 0.2 2.09 26.78
Aop_g40580 (STA1)
0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.28 2.32
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.23 3.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 6.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 2.93
0.13 0.43 0.0 0.0 0.05 1.56 13.22
Aop_g42148 (HSP70)
0.0 0.3 0.0 0.03 0.0 0.03 5.1
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.72 6.85
0.12 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 8.92
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.65 7.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 3.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 5.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 2.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 3.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.54
0.12 0.13 0.21 0.0 0.0 0.11 3.04
0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.12 3.15
Aop_g46089 (NF-YA7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 3.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.39
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.69 11.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 2.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 6.91
Aop_g47287 (GS2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.33
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 2.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.52
0.15 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 2.68
7.19 4.51 2.23 3.99 0.0 3.27 100.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 3.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 8.85
0.0 0.0 0.13 0.09 0.0 0.3 3.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 6.64
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 3.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.43 6.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.13
Aop_g50005 (RPS5B)
0.43 0.97 0.12 0.49 0.0 1.95 14.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 3.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 4.73
0.0 0.0 0.85 0.23 0.0 0.1 9.44
Aop_g50809 (SVB)
0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 2.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 3.12
0.09 0.19 0.16 0.15 0.0 0.21 5.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 4.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.73
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.11 2.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 9.55
0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 2.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 9.07
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.13 26.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.2
Aop_g53961 (TRX1)
0.14 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 2.54
0.12 0.0 0.19 0.0 0.0 0.2 3.66
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 2.96 118.6
0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.19 3.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 3.09
0.42 0.1 0.52 0.38 0.26 0.79 43.75
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.29 3.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.28
0.14 0.75 0.0 0.0 0.0 0.25 7.52
Aop_g55792 (ATG8F)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 19.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 5.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 2.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 2.91
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 2.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 16.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 3.75
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 7.83
0.15 0.0 0.25 0.14 0.14 0.46 8.01
0.38 0.66 0.14 0.95 0.25 1.22 33.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 6.98
0.69 0.38 0.0 0.11 0.0 0.0 13.34
0.21 0.39 0.35 0.51 0.0 0.55 8.54
0.95 0.52 2.74 2.57 0.29 2.48 59.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 25.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.7
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 2.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 3.55
1.19 0.21 1.46 0.9 0.09 0.72 28.03
0.62 0.66 0.4 0.43 0.17 0.0 15.62
0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 1.14 5.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 3.33
Aop_g62041 (RAP2.11)
0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 2.45
Aop_g62435 (SAC52)
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.8
Aop_g63063 (ATB2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 4.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 5.35
Aop_g63206 (SAM2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 3.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 4.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 6.91
0.0 0.52 0.85 0.47 0.1 1.28 33.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.25
0.58 0.76 0.39 0.33 0.15 0.34 8.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 5.69
0.0 0.13 0.03 0.01 0.06 0.13 7.12
0.12 0.13 0.43 0.11 0.28 0.37 5.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 3.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 3.03
0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.8
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 2.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 3.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 8.7
0.11 0.98 0.7 1.14 0.0 1.08 28.71
1.14 1.46 1.53 0.79 0.7 1.08 19.65

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)